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利用邻近生物素标记技术结合质谱分析鉴定核仁相关蛋白
被引量：
1
1
作者
臧春燕
姚礼萍
+1 位作者
邢鸣
张军
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期1750-1755,共6页
目的:在小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cell,mESC)中,基于抗坏血酸过氧化物酶(engineered ascorbate peroxidase,APEX2)的邻近标记技术和质谱鉴定核仁相关蛋白。方法:构建稳定过表达APEX2-FBL细胞系,通过APEX2邻近标记技术获得...
目的:在小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cell,mESC)中,基于抗坏血酸过氧化物酶(engineered ascorbate peroxidase,APEX2)的邻近标记技术和质谱鉴定核仁相关蛋白。方法:构建稳定过表达APEX2-FBL细胞系,通过APEX2邻近标记技术获得生物素标记蛋白,用链酶亲和素包裹的磁珠对生物素标记的蛋白进行富集,随后运用液相色谱-串联质谱(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)鉴定,并对数据进行生物信息学分析,筛选差异蛋白。结果:成功构建稳定高表达APEX2-FBL细胞系;Western blot结果显示,通过APEX2邻近标记技术获得大量生物素标记蛋白;质谱鉴定出837个差异蛋白,且生物学过程多与核仁相关。结论:利用邻近生物素标记技术结合质谱分析是一种可行的鉴定核仁相关蛋白的方法。
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关键词
邻近生物素标记
核仁蛋白
核仁纤维蛋白
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职称材料
题名
利用邻近生物素标记技术结合质谱分析鉴定核仁相关蛋白
被引量：
1
1
作者
臧春燕
姚礼萍
邢鸣
张军
机构
南京医科大学生殖医学国家重点实验室
出处
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期1750-1755,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31871445)
文摘
目的:在小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cell,mESC)中,基于抗坏血酸过氧化物酶(engineered ascorbate peroxidase,APEX2)的邻近标记技术和质谱鉴定核仁相关蛋白。方法:构建稳定过表达APEX2-FBL细胞系,通过APEX2邻近标记技术获得生物素标记蛋白,用链酶亲和素包裹的磁珠对生物素标记的蛋白进行富集,随后运用液相色谱-串联质谱(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)鉴定,并对数据进行生物信息学分析,筛选差异蛋白。结果:成功构建稳定高表达APEX2-FBL细胞系;Western blot结果显示,通过APEX2邻近标记技术获得大量生物素标记蛋白;质谱鉴定出837个差异蛋白,且生物学过程多与核仁相关。结论:利用邻近生物素标记技术结合质谱分析是一种可行的鉴定核仁相关蛋白的方法。
关键词
邻近生物素标记
核仁蛋白
核仁纤维蛋白
Keywords
proximate biotin labeling
nucleolar protein
fibrillarin
分类号
Q243 [生物学—细胞生物学]
O657.63 [理学—分析化学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用邻近生物素标记技术结合质谱分析鉴定核仁相关蛋白
臧春燕
姚礼萍
邢鸣
张军
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
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