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羊源多杀性巴氏杆菌sodA基因的克隆、表达及其生物信息学分析
被引量：
5
1
作者
安琪
黄海峰
+10 位作者
张振兴
李宝宝
张萌萌
郑义盈
王成强
章泸尹
杨小健
曹瑞勇
聂鑫
杜丽
王凤阳
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2018年第8期2067-2075,共9页
为了解羊源多杀性巴氏杆菌超氧化物歧化酶(SOD)的生物学功能,本试验对该菌sodA基因进行克隆及原核表达,并对克隆的sodA基因进行遗传进化树分析,对其表达的SOD蛋白进行生物信息学分析。参照GenBank中多杀性巴氏杆菌HN06株基因组中sodA基...
为了解羊源多杀性巴氏杆菌超氧化物歧化酶(SOD)的生物学功能,本试验对该菌sodA基因进行克隆及原核表达,并对克隆的sodA基因进行遗传进化树分析,对其表达的SOD蛋白进行生物信息学分析。参照GenBank中多杀性巴氏杆菌HN06株基因组中sodA基因序列信息设计引物进行PCR扩增,将产物与pET-28a(+)载体相连,构建pET-28a(+)-sodA重组质粒,将该质粒转化E.coli DH5α感受态细胞进行克隆,再转化E.coli BL21(DE3)感受态细胞进行表达,经IPTG诱导后对表达蛋白进行SDS-PAGE和Western blotting鉴定分析。结果显示,本试验成功扩增出大小为645bp的目的片段,并表达出大小约28ku的目的蛋白。遗传进化树分析表明,该基因与HN07(GenBank登录号:CP007040.1)和Pm70(GenBank登录号:AE004439.1)株亲缘关系较近,重组蛋白生物信息学分析显示,该融合蛋白为稳定的酸性亲水可溶性蛋白,分子式为C1085H1651N293O309S9,分子质量为24 032.36u,理论等电点为6.19,消光系数为45 170,不稳定系数为26.87(<40),在哺乳动物网织红细胞的半衰期预计为30h,疏水指数为82.15,总平均疏水性(GRAVY)为-0.282,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。以上研究结果为后续深入研究多杀性巴氏杆菌在羊体内的存活机制及研发预防巴氏杆菌病的疫苗提供了参考。
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关键词
多杀性巴氏杆菌
sodA基因
克隆
原核表达
遗传进化树分析
生物信息学
分析
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职称材料
新疆红枣软腐病病原菌的鉴定
被引量：
5
2
作者
白剑宇
宋峰惠
+3 位作者
吴正保
刘正兴
崔燕华
史彦江
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第8期1475-1480,共6页
【目的】鉴定枣软腐病的致病病原,为有针对性的开展病害防治奠定基础。【方法】采用病原菌常规分离技术获取疑似病原物,通过形态学特征和回接验证对病原进行鉴定;利用PCR技术获取病原菌的ITS基因的序列片段,通过与Gen Bank中已有的相关...
【目的】鉴定枣软腐病的致病病原,为有针对性的开展病害防治奠定基础。【方法】采用病原菌常规分离技术获取疑似病原物,通过形态学特征和回接验证对病原进行鉴定;利用PCR技术获取病原菌的ITS基因的序列片段,通过与Gen Bank中已有的相关序列进行比对分析,构建遗传进化树,结合形态学鉴定和致病性实验验证,鉴定病原。【结果】新疆枣软腐病病原的形态学特征与米根霉(Rhizopus oryzae)相似。枣软腐病的病原与Gen Bank中已知的米根霉菌株的ITS序列显示99%~100%的相似性,在遗传进化树分析中并聚在同一组。【结论】基于形态学特征、致病性试验以及分子鉴定结果,新疆枣软腐病病原被鉴定为Rhizopus oryzae。
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关键词
枣软腐病
RDNA-ITS
病原鉴定
遗传进化树分析
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职称材料
题名
羊源多杀性巴氏杆菌sodA基因的克隆、表达及其生物信息学分析
被引量：
5
1
作者
安琪
黄海峰
张振兴
李宝宝
张萌萌
郑义盈
王成强
章泸尹
杨小健
曹瑞勇
聂鑫
杜丽
王凤阳
机构
海南大学热带农林学院动物科技学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2018年第8期2067-2075,共9页
基金
海南省重大科技计划项目(ZDKJ2016017-01)
国家肉羊产业技术体系(CARS-38)
中央引导地方科技发展专项资金项目(ZY2017HN07)
文摘
为了解羊源多杀性巴氏杆菌超氧化物歧化酶(SOD)的生物学功能,本试验对该菌sodA基因进行克隆及原核表达,并对克隆的sodA基因进行遗传进化树分析,对其表达的SOD蛋白进行生物信息学分析。参照GenBank中多杀性巴氏杆菌HN06株基因组中sodA基因序列信息设计引物进行PCR扩增,将产物与pET-28a(+)载体相连,构建pET-28a(+)-sodA重组质粒,将该质粒转化E.coli DH5α感受态细胞进行克隆,再转化E.coli BL21(DE3)感受态细胞进行表达,经IPTG诱导后对表达蛋白进行SDS-PAGE和Western blotting鉴定分析。结果显示,本试验成功扩增出大小为645bp的目的片段,并表达出大小约28ku的目的蛋白。遗传进化树分析表明,该基因与HN07(GenBank登录号:CP007040.1)和Pm70(GenBank登录号:AE004439.1)株亲缘关系较近,重组蛋白生物信息学分析显示,该融合蛋白为稳定的酸性亲水可溶性蛋白,分子式为C1085H1651N293O309S9,分子质量为24 032.36u,理论等电点为6.19,消光系数为45 170,不稳定系数为26.87(<40),在哺乳动物网织红细胞的半衰期预计为30h,疏水指数为82.15,总平均疏水性(GRAVY)为-0.282,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。以上研究结果为后续深入研究多杀性巴氏杆菌在羊体内的存活机制及研发预防巴氏杆菌病的疫苗提供了参考。
关键词
多杀性巴氏杆菌
sodA基因
克隆
原核表达
遗传进化树分析
生物信息学
分析
Keywords
Pasteurella multocida
soda gene
cloning
prokaryotic expression
evolutionary analysis
bioinformatics analysis
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
新疆红枣软腐病病原菌的鉴定
被引量：
5
2
作者
白剑宇
宋峰惠
吴正保
刘正兴
崔燕华
史彦江
机构
新疆农业大学林学与园艺学院博士流动站
新疆林业科学院经济林研究所
阿克苏地区农业技术推广中心
出处
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第8期1475-1480,共6页
基金
中国博士后科学基金面上项目“新疆红枣黑斑病菌的田间追踪检测技术研究”(2014M552565XD)
新疆维吾尔自治区林业发展补助资金项目“南疆红枣主产区红枣主要病害普查鉴定及田间追踪监测技术研究”(XJLKY2016056)~~
文摘
【目的】鉴定枣软腐病的致病病原,为有针对性的开展病害防治奠定基础。【方法】采用病原菌常规分离技术获取疑似病原物,通过形态学特征和回接验证对病原进行鉴定;利用PCR技术获取病原菌的ITS基因的序列片段,通过与Gen Bank中已有的相关序列进行比对分析,构建遗传进化树,结合形态学鉴定和致病性实验验证,鉴定病原。【结果】新疆枣软腐病病原的形态学特征与米根霉(Rhizopus oryzae)相似。枣软腐病的病原与Gen Bank中已知的米根霉菌株的ITS序列显示99%~100%的相似性,在遗传进化树分析中并聚在同一组。【结论】基于形态学特征、致病性试验以及分子鉴定结果,新疆枣软腐病病原被鉴定为Rhizopus oryzae。
关键词
枣软腐病
RDNA-ITS
病原鉴定
遗传进化树分析
Keywords
jujube soft rot
rDNA - ITS
pathogens identification
phylogenetic analysis
分类号
S436.64 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
羊源多杀性巴氏杆菌sodA基因的克隆、表达及其生物信息学分析
安琪
黄海峰
张振兴
李宝宝
张萌萌
郑义盈
王成强
章泸尹
杨小健
曹瑞勇
聂鑫
杜丽
王凤阳
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2018
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
新疆红枣软腐病病原菌的鉴定
白剑宇
宋峰惠
吴正保
刘正兴
崔燕华
史彦江
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017
5
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职称材料
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