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温热玉米种质间穗长基因RSH2的遗传结构变异与优异单倍型分析
1
作者
涂亮
郭向阳
+5 位作者
刘鹏飞
蒋喻林
王安贵
祝云芳
吴迅
陈泽辉
《种子》
北大核心
2024年第4期1-7,共7页
鉴定穗长相关基因并揭示其遗传结构变异和优异单倍型,对深度剖析玉米产量形成的遗传机制和基于分子辅助的产量性状改良具有十分重要的理论意义和实践应用价值。本研究在前期图位克隆穗长相关基因RSH2的基础上,以西南地区玉米育种实践中...
鉴定穗长相关基因并揭示其遗传结构变异和优异单倍型,对深度剖析玉米产量形成的遗传机制和基于分子辅助的产量性状改良具有十分重要的理论意义和实践应用价值。本研究在前期图位克隆穗长相关基因RSH2的基础上,以西南地区玉米育种实践中广泛利用的120份温热玉米自交系组成的关联分析群体为材料,利用传统测序技术鉴定RSH2基因在该群体中的遗传结构变异,并结合该群体在不同环境条件下的穗长表型数据,剖析该基因的遗传结构变异和优异单倍型类型。结果表明,在RSH2基因外显子区域中共检测出28个变异位点,包括24个SNPs和4个InDel,共形成17个单倍型,其中Hap_5为优势单倍型,在35份材料中均存在。候选基因关联分析发现,3个突变位点与穗长显著关联(p<0.05),位于外显子区3946 bp处存在G/A突变,编码半胱氨酸(Cysteine,C)的密码子TGC突变成编码酪氨酸(Tyrosine,Y)TAC密码子,穗长显著提高。研究表明,位点S_3946可能是RSH2基因控制穗长变异的关键功能位点,可用于后续基于分子辅助的玉米穗长性状改良。
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关键词
玉米
穗长
遗传结构变异
RSH2
优异单倍型
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职称材料
埃及品系尼罗罗非鱼不同选育世代mtDNA D-loop区遗传多样性分析
被引量：
6
2
作者
肖炜
王腾
+4 位作者
李大宇
邹芝英
祝璟琳
韩珏
杨弘
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期29-34,共6页
为评价现有选育方式下的遗传结构现状及选育潜力,采用mt DNA D-loop序列差异分析技术,对埃及品系尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）的3个选育世代群体共80尾鱼开展世代间遗传结构变异分析。结果显示：1）3个世代群体中个体序列长度为...
为评价现有选育方式下的遗传结构现状及选育潜力,采用mt DNA D-loop序列差异分析技术,对埃及品系尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）的3个选育世代群体共80尾鱼开展世代间遗传结构变异分析。结果显示：1）3个世代群体中个体序列长度为552~555 bp,包括52个变异位点、12个单倍型,平均单倍型多样度（H）为0.569;2）3个世代群体的核苷酸多态性（Pi）分别为0.021 9、0.040 3和0.039 7,各世代具备较高的多态性;3）3个世代中,F1具有5个单倍型,F2和F3均具有7个单倍型,F1、F2和F3共享2个单倍型,F1与F2共享1个单倍型,3个选育世代群体的单倍型在NJ系统树上相互交叉,无独立的进化枝。表明在目前选育方式下埃及品系尼罗罗非鱼世代间遗传信息较为稳定,选育并没有对罗非鱼选育群体的遗传结构造成大影响。
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关键词
埃及品系尼罗罗非鱼
选育世代
MTDNA
D-LOOP
遗传结构变异
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职称材料
题名
温热玉米种质间穗长基因RSH2的遗传结构变异与优异单倍型分析
1
作者
涂亮
郭向阳
刘鹏飞
蒋喻林
王安贵
祝云芳
吴迅
陈泽辉
机构
贵州省农业科学院旱粮研究所
农业农村部喀斯特山区作物基因资源与种质创新重点实验室
出处
《种子》
北大核心
2024年第4期1-7,共7页
基金
国家自然科学基金项目(32060460、32160451)
国家重点研发计划(2023YFD1201103)
+6 种基金
黔农科青年基金(2024)19号
贵州省科技支撑计划(黔科合支撑[2022]重点029)
贵州省山地农业关键核心技术攻关项目(GZNYGJHX-2023012)
贵州省育种科研基础平台创新能力建设(黔科合服企[2022]014)
贵州省自然科学基金项目(黔科合基础[2022]一般236)、黔农科院国基后补助([2021]16号、[2022]02号和[2022]09号)
贵州喀斯特山区重要作物生物育种平台建设(黔科合中引地[2023]033)
科研机构创新能力建设项目([2022]007)
文摘
鉴定穗长相关基因并揭示其遗传结构变异和优异单倍型,对深度剖析玉米产量形成的遗传机制和基于分子辅助的产量性状改良具有十分重要的理论意义和实践应用价值。本研究在前期图位克隆穗长相关基因RSH2的基础上,以西南地区玉米育种实践中广泛利用的120份温热玉米自交系组成的关联分析群体为材料,利用传统测序技术鉴定RSH2基因在该群体中的遗传结构变异,并结合该群体在不同环境条件下的穗长表型数据,剖析该基因的遗传结构变异和优异单倍型类型。结果表明,在RSH2基因外显子区域中共检测出28个变异位点,包括24个SNPs和4个InDel,共形成17个单倍型,其中Hap_5为优势单倍型,在35份材料中均存在。候选基因关联分析发现,3个突变位点与穗长显著关联(p<0.05),位于外显子区3946 bp处存在G/A突变,编码半胱氨酸(Cysteine,C)的密码子TGC突变成编码酪氨酸(Tyrosine,Y)TAC密码子,穗长显著提高。研究表明,位点S_3946可能是RSH2基因控制穗长变异的关键功能位点,可用于后续基于分子辅助的玉米穗长性状改良。
关键词
玉米
穗长
遗传结构变异
RSH2
优异单倍型
Keywords
maize
ear length
genetic structure variation
RSH2
excellent haplotype
分类号
S513 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
埃及品系尼罗罗非鱼不同选育世代mtDNA D-loop区遗传多样性分析
被引量：
6
2
作者
肖炜
王腾
李大宇
邹芝英
祝璟琳
韩珏
杨弘
机构
中国水产科学研究院淡水渔业研究中心
南京农业大学无锡渔业学院
出处
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期29-34,共6页
基金
现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-49)
中央级公益性科研院所基本科研业务费项目(2013JBFM01)
现代农业人才支撑计划项目(2130106)
文摘
为评价现有选育方式下的遗传结构现状及选育潜力,采用mt DNA D-loop序列差异分析技术,对埃及品系尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）的3个选育世代群体共80尾鱼开展世代间遗传结构变异分析。结果显示：1）3个世代群体中个体序列长度为552~555 bp,包括52个变异位点、12个单倍型,平均单倍型多样度（H）为0.569;2）3个世代群体的核苷酸多态性（Pi）分别为0.021 9、0.040 3和0.039 7,各世代具备较高的多态性;3）3个世代中,F1具有5个单倍型,F2和F3均具有7个单倍型,F1、F2和F3共享2个单倍型,F1与F2共享1个单倍型,3个选育世代群体的单倍型在NJ系统树上相互交叉,无独立的进化枝。表明在目前选育方式下埃及品系尼罗罗非鱼世代间遗传信息较为稳定,选育并没有对罗非鱼选育群体的遗传结构造成大影响。
关键词
埃及品系尼罗罗非鱼
选育世代
MTDNA
D-LOOP
遗传结构变异
Keywords
Egyptian strain of Oreochromis niloticus
selected generations
mitochondrial DNA D-loop
genetic structure variation
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
温热玉米种质间穗长基因RSH2的遗传结构变异与优异单倍型分析
涂亮
郭向阳
刘鹏飞
蒋喻林
王安贵
祝云芳
吴迅
陈泽辉
《种子》
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
埃及品系尼罗罗非鱼不同选育世代mtDNA D-loop区遗传多样性分析
肖炜
王腾
李大宇
邹芝英
祝璟琳
韩珏
杨弘
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015
6
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职称材料
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