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基于月季微卫星标记的7个遗传相似系数比较 被引量：8
1
作者 黄平 崔娇鹏 +1 位作者 郑勇奇 张川红 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第1期68-76,共9页
以月季品种的微卫星标记数据为基础,选择7个遗传相似系数对月季品种间遗传相似度进行计算,并采用非加权组平均法(UPGMA)建立相应的系统树。通过遗传相似系数相关性、聚类结果一致性以及拟合优度等分析方法,探讨不同的遗传相似系数在微... 以月季品种的微卫星标记数据为基础,选择7个遗传相似系数对月季品种间遗传相似度进行计算,并采用非加权组平均法(UPGMA)建立相应的系统树。通过遗传相似系数相关性、聚类结果一致性以及拟合优度等分析方法,探讨不同的遗传相似系数在微卫星遗传分析中的适用性。分析数据显示7个系数之间相关系数介于0.726～1.000。共表型相关系数rc介于0.85～0.93,表明品种间遗传差异在基于UPGMA方法的聚类树状图中有良好体现。系统树之间的CIc指数范围为0.468～1.000,表明采用不同相似系数进行聚类分析时,结果存在较大差异。7个遗传相似系数的S统计值介于16.24%～29.90%,RusselandRao系数最低,SimpleMatching等3个系数S值均大于20%。综合考虑分子标记特点、物种杂合度、Kruskal拟合优度等因素,并结合聚类分析与品种谱系比较结果,研究认为Dice系数和Jaccard系数适用于月季的微卫星遗传分析,其次是SimpleMatching系数。 展开更多
关键词 月季 品种 多倍体 微卫星标记 遗传相似系数 聚类分析
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基于SSR标记的桃品种遗传多样性分析及遗传相似系数比较 被引量：14
2
作者 叶宇芸 王清明 +4 位作者 马建伟 张银平 陈其阳 汤浩茹 张勇 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期39-45,共7页
【目的】利用NCBI数据库中桃的EST信息开发SSR引物,分析成都平原主栽桃品种的遗传多样性,探讨各遗传相似系数在桃SSR分析中的适用性,以期为桃种质资源的研究提供参考。【方法】利用来自NCBI-EST数据库的100对SSR引物对12个不同形态的桃... 【目的】利用NCBI数据库中桃的EST信息开发SSR引物,分析成都平原主栽桃品种的遗传多样性,探讨各遗传相似系数在桃SSR分析中的适用性,以期为桃种质资源的研究提供参考。【方法】利用来自NCBI-EST数据库的100对SSR引物对12个不同形态的桃品种进行PCR扩增,分析筛选20对多态性好、稳定性高且均匀分布于桃8个连锁群的引物对40个桃品种进行PCR扩增,并采用5个遗传相似系数分别对扩增结果进行分析。【结果】使用20对引物共检测出68个多态性等位基因位点,每对引物的等位基因数在2~5之间,平均为3.4。多态信息含量在0.36~0.73间变化,平均为0.54。Jaccard相似系数为0.106~1.000;Jaccard系数的共表型相关系数rc最高,为0.772;Dice系数次之,为0.719;Jaccard和Dice系数的系统树一致性最高,CI_c为1。Nei’s基因多样性指数在种级水平上和类群水平上分别为0.603和0.374,相应的Shannon’s信息指数分别为1.041和0.591。40个桃品种在聚类中首先分为观赏桃和食用桃2大类,再细分为各类群,聚类结果与传统系谱基本吻合。【结论】基于NCBI数据库中桃的EST信息开发的SSR引物多态性较好,可用于桃的SSR分析。Jaccard和Dice系数适合桃的SSR分析。桃品种总体遗传多样性较丰富,但水蜜桃品种仍需加强种质创新。 展开更多
关键词 桃 遗传多样性 遗传相似系数 EST—SSR 引物筛选
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基于SSR标记分析31份甘薯品种(系)的遗传多样性 被引量：3
3
作者 罗密 尹旺 +3 位作者 吴巧玉 付梅 邓仁菊 陈运良 《种子》 北大核心 2024年第3期34-40,共7页
为了解不同甘薯资源材料之间的亲缘关系,以收集保存的31份甘薯品种(系)为研究对象,采用SSR标记分析不同材料之间的遗传多样性。结果表明,基于筛选获得的多态性较好的21对SSR标记,共检测到405个多态性等位位点,平均每对引物等位位点数为1... 为了解不同甘薯资源材料之间的亲缘关系,以收集保存的31份甘薯品种(系)为研究对象,采用SSR标记分析不同材料之间的遗传多样性。结果表明,基于筛选获得的多态性较好的21对SSR标记,共检测到405个多态性等位位点,平均每对引物等位位点数为19.3个。31份甘薯材料遗传相似性系数在0.2829~0.9758之间,平均值为0.430419,说明遗传多样性丰富。聚类分析表明,在遗传距离为0.638时,可将31份甘薯品种(系)分为四个类群。 展开更多
关键词 甘薯 遗传多样性 SSR标记 遗传相似系数
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广东高州普通野生稻(Oryza rufipogon Griff)的遗传多样性和居群遗传分化研究 被引量：34
4
作者 杨庆文 张万霞 +2 位作者 时津霞 任军方 苗晗 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 2004年第4期315-319,共5页
利用 30对SSR引物对广东高州普通野生稻 3个群体进行了遗传多样性分析和居群遗传分化研究。结果表明 ,30对引物中只有 2 0对表现出多态 ,多态位点比率P为 6 6 7% ;在 2 0个多态位点中共检测出 81个等位变异 ,平均等位变异数(Ap)为 4 ... 利用 30对SSR引物对广东高州普通野生稻 3个群体进行了遗传多样性分析和居群遗传分化研究。结果表明 ,30对引物中只有 2 0对表现出多态 ,多态位点比率P为 6 6 7% ;在 2 0个多态位点中共检测出 81个等位变异 ,平均等位变异数(Ap)为 4 0 5个 ;3个群体总的遗传多样性 (Ht)为 0 6 1,其中 ,居群内的遗传多样性为居群间的遗传多样性的 3倍多 ,说明总的遗传多样性主要来自居群内 ;虽然居群间的遗传分化系数 (GST)较低 ,仅为 0 2 4 2 7,但当遗传相似系数临界值增加时 ,3个群体在聚类图上相对独立 ,说明 3个群体既存在着高度的遗传相似性 ,又具有一定程度的遗传分化 ,可以作为 3个居群进行原生境保护。 展开更多
关键词 遗传多样性 居群 普通野生稻 等位变异 遗传分化 群体 多态位点 遗传相似系数 生境 遗传相似性
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浙江杨梅品种遗传差异的RAPD和ISSR分析 被引量：17
5
作者 谢小波 求盈盈 +3 位作者 戚行江 郑锡良 邱立军 张跃建 《浙江农业学报》 CSCD 2008年第1期1-5,共5页
为了解浙江杨梅品种的遗传差异，采用RAPD和ISSR分析方法对浙江4大杨梅良种东魁、荸荠种、晚稻杨梅、丁岙梅和其它7个品种（类型）进行了研究。结果表明，这些杨梅品种（类型）有着一定程度的遗传差异，遗传相似系数为0，710～0．992。... 为了解浙江杨梅品种的遗传差异，采用RAPD和ISSR分析方法对浙江4大杨梅良种东魁、荸荠种、晚稻杨梅、丁岙梅和其它7个品种（类型）进行了研究。结果表明，这些杨梅品种（类型）有着一定程度的遗传差异，遗传相似系数为0，710～0．992。采用类平均分类法（UPGMA）分析表明，在遗传相似系数为0．830处可将这11个杨梅品种（类型）分成5类，4大良种各归于不同的类。亲缘关系分析显示，东魁与黑晶最近，与早色最远；荸荠种与晚荠蜜梅最近，与黑晶最远；丁岙梅与采自同一果园的实生雌株最近，也与黑晶最远；晚稻杨梅则与荸荠种中发现的一个两性植株亲缘关系最近，同样与黑晶最远。分子标记数据反映的这11个杨梅品种（类型）之间的相互亲缘关系与其地理分布情况基本相符，两种不同分子标记所作的分类趋势也基本相同。 展开更多
关键词 杨梅 RAPD ISSR 遗传差异 遗传相似系数 浙江
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河北省小麦品种基于SSR标记的遗传多样性研究 被引量：17
6
作者 李远 赵檀 +4 位作者 王睿辉 陈景堂 刘桂茹 温树敏 谷俊涛 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期1-5,共5页
为了研究河北省小麦品种的遗传多样性,试验选用分布于小麦21条染色体上的86对多态性微卫星(SSR)引物,对建国近60年以来在河北省审(认)定的125个小麦品种进行了遗传多样性分析。结果表明:86对SSR引物共检测到296个等位变异,每对引物检测... 为了研究河北省小麦品种的遗传多样性,试验选用分布于小麦21条染色体上的86对多态性微卫星(SSR)引物,对建国近60年以来在河北省审(认)定的125个小麦品种进行了遗传多样性分析。结果表明:86对SSR引物共检测到296个等位变异,每对引物检测到的等位基因数变幅为2～7个(平均3.83个),以B基因组具有最高的平均等位基因数(3.94),A(3.81)、D(3.78)基因组次之;每个SSR位点的多态性信息量(PIC)变化范围为0.094～0.877(平均0.573),3个基因组的PIC值顺序依次为B基因组(0.593)>D基因组(0.579)>A基因组(0.528)。125个品种间的遗传相似系数(GS)变幅为0.409～0.909(平均0.615),基于遗传相似系数(GS)的聚类分析得出,供试小麦品种在GS值0.52处聚为3类,其中20世纪90年代后的114份品种(91.2%)被聚为1类,表明河北省小麦品种的遗传多样性水平较低,品种间的亲缘关系较近,其遗传基础需要进一步拓宽。 展开更多
关键词 小麦 SSR 遗传多样性 遗传相似系数
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广西原产和引种荔枝种质资源的遗传多样性分析及核心种质构建 被引量：12
7
作者 李冬波 徐宁 +6 位作者 秦献泉 李鸿莉 侯延杰 邱宏业 张树伟 朱建华 彭宏祥 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期1537-1544,共8页
【目的】利用SSR分子标记对广西荔枝种质资源进行遗传多样性分析并构建核心种质,为广西荔枝种质资源的保存、遗传改良及创新利用提供理论依据。【方法】以广西原产和引种的88份荔枝种质资源为研究对象,利用40对SSR引物对其进行遗传多样... 【目的】利用SSR分子标记对广西荔枝种质资源进行遗传多样性分析并构建核心种质,为广西荔枝种质资源的保存、遗传改良及创新利用提供理论依据。【方法】以广西原产和引种的88份荔枝种质资源为研究对象,利用40对SSR引物对其进行遗传多样性和聚类分析,在此基础上按原始群体50.00%、25.00%和12.50%的取样比例,采用逐步聚类法优先选择性状优良材料的原则构建广西荔枝核心种质。【结果】40对SSR引物从88份荔枝种质资源中共扩增出282条清晰的条带,每对引物扩增条带数2~13条,平均7.05条,其中,多态性条带182条,每对引物扩增的多态性条带数1~13条,平均4.55条,每对引物扩增条带的多态性比率为14.29%~100.00%,平均64.54%。88份荔枝种质资源的遗传相似系数为0.83~0.96,说明其遗传多样性较低;在遗传相似系数0.86处,88份荔枝种质资源可分为七大类群,第Ⅰ~Ⅶ类群分别包含3、12、6、6、1、2和58份种质,其中第Ⅰ类群均为龙荔种质资源,第Ⅱ类群主要为早熟种质,第Ⅳ类群主要为早熟实生种质,表明荔枝种质间的亲缘关系与熟期存在一定的相关性。88份荔枝种质资源在40个SSR位点的平均观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Shannon指数(I)和期望杂合度(He)分别为3.2750、2.1137、0.8092和0.5107。核心种质-1、核心种质-2和核心种质-3的种质资源数量分别为44、22和11份,其中,核心种质-2的Ne、I和He 3个遗传多样性参数均最高,分别为2.1774、0.8452和0.5271;仅核心种质-3的Na与原始群体存在极显著差异(P<0.01),3组核心种质的其余遗传多样性参数与原始群体无显著差异(P>0.05),表明核心种质-1和核心种质-2均能充分代表原始群体的遗传多样性,根据核心种质构建的原则,最终选择核心种质-2作为广西荔枝核心种质。【结论】SSR分子标记是一种适用于荔枝资源遗传多样性分析和核心种质构建的理想分子标记。广西荔枝种质资源遗传背景相对较窄,遗传多样性较低,今后应加强荔枝种质资源的引进与利用。 展开更多
关键词 荔枝 SSR分子标记 遗传多样性 遗传相似系数 核心种质 聚类分析
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柱花草RAPD反应体系的建立及其8个品种遗传多样性分析 被引量：16
8
作者 蒋昌顺 葛琴雅 +2 位作者 邹冬梅 梁英彩 张义正 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期243-247,i004,共6页
采用两种不同的方法分别从柱花草嫩叶及种子萌发芽中提取了高质量的DNA ,并对柱花草RAPD反应中的各组分浓度及热循环因素进行优化 ,建立了柱花草RAPD反应的最佳条件。在此基础上 ,用 2 0条随机引物对 8个柱花草品种进行了RAPD扩增 ,结... 采用两种不同的方法分别从柱花草嫩叶及种子萌发芽中提取了高质量的DNA ,并对柱花草RAPD反应中的各组分浓度及热循环因素进行优化 ,建立了柱花草RAPD反应的最佳条件。在此基础上 ,用 2 0条随机引物对 8个柱花草品种进行了RAPD扩增 ,结果表明 ,其多样性达 5 1 .9% ,品种间的遗传相似系数在 0 .5 3～0 .88之间 ;根据非加权成对平均数法 (UPGMA)进行分类 ,获得了品种聚类树形图 ,8个柱花草品种均被明显分开。 展开更多
关键词 柱花草 RAPD反应体系 品种 遗传多样性 遗传相似系数
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利用分子标记筛查小麦相似品种(系) 被引量：10
9
作者 王立新 李宏博 +6 位作者 廖琴 邱军 常利芳 刘丽华 任立平 高新欢 赵昌平 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期1490-1497,共8页
在每年的小麦区域试验中均发现一些参试品系高度相像或与审定品种高度相像,为此需建立从大量品种中筛查相似品种的方法。本文比较了547个国家冬小麦区域试验品系及134个国审品种的分子标记遗传相似系数(GS)和主要农艺性状及表型,发现绝... 在每年的小麦区域试验中均发现一些参试品系高度相像或与审定品种高度相像,为此需建立从大量品种中筛查相似品种的方法。本文比较了547个国家冬小麦区域试验品系及134个国审品种的分子标记遗传相似系数(GS)和主要农艺性状及表型,发现绝大多数相似品种(系)间的GS大于0.90,依此确立了用分子标记筛查相似品种的方法体系,解决了无法从大量品种中查找相似品种(系)的问题。 展开更多
关键词 小麦品种 分子标记 遗传相似系数
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滇杨优树遗传多样性的AFLP分析 被引量：11
10
作者 纵丹 员涛 +4 位作者 周安佩 刘东玉 郑元 段安安 何承忠 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2014年第4期103-108,213,共7页
以收集于云南和四川的52株滇杨优树为试验材料,并以1株大叶杨、1株北京杨和2株黑杨做类外对照,采用AFLP分子标记技术进行基因组DNA水平检测。结果表明,筛选出的8对EcoRⅠ+3/MseⅠ+3引物组合对52株滇杨优树共扩增出264条带,其中多态性条... 以收集于云南和四川的52株滇杨优树为试验材料,并以1株大叶杨、1株北京杨和2株黑杨做类外对照,采用AFLP分子标记技术进行基因组DNA水平检测。结果表明,筛选出的8对EcoRⅠ+3/MseⅠ+3引物组合对52株滇杨优树共扩增出264条带,其中多态性条带174条,多态带百分率为64.52%,检测到有效等位基因数(Ne)为1.184,基因多样度(H)为0.121,Shannon信息指数为0.201,平均遗传相似系数为0.877;对56份杨树样本共扩增出325条带,其中多态性条带共247条,多态带百分率为75.21%,检测出有效等位基因数(Ne)为1.185,基因多样度(H)为0.122,Shannon信息指数为0.209,平均遗传相似系数为0.876。UPGMA聚类分析结果显示,除滇杨优树QXB007与QXJ030外,其余杨树分析样本均能够被鉴别。基于采集地和遗传相似系数的模糊聚类分析表明,52株滇杨优树除开远采集地外,丽江采集地样本与其他采集地样本之间均有交集,说明丽江可能是滇杨的分布中心和起源中心。该研究结果为滇杨人工选择育种、遗传改良、种质资源收集与保存等提供了理论依据。 展开更多
关键词 滇杨优树 AFLP 遗传多态性 遗传相似系数 UPGMA聚类分析
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仲彬草属物种的RAPD遗传变异分析 被引量：7
11
作者 张利 郑有良 +2 位作者 魏育明 刘世贵 周永红 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期11-16,共6页
采用随机扩增多态性DNA (RAPD)技术 ,对仲彬草属Kengyilia 14个种、1个变种 ,共 32份材料进行了遗传多样性研究 .4 6个引物产生的 341条DNA扩增片段中 ,32 7条 (95 9% )具有多态性 .每个引物可扩增出 1～ 13条多态性带 ,平均 7 1条 .利... 采用随机扩增多态性DNA (RAPD)技术 ,对仲彬草属Kengyilia 14个种、1个变种 ,共 32份材料进行了遗传多样性研究 .4 6个引物产生的 341条DNA扩增片段中 ,32 7条 (95 9% )具有多态性 .每个引物可扩增出 1～ 13条多态性带 ,平均 7 1条 .利用 341个RAPD标记 ,计算Jaccard遗传相似系数 ,建立UPGMA聚类图 .结果表明 :①K .melanthera (Y2 70 8)与K .melanthera (Y2 70 9a)的GS值最大 (0 82 9) ,遗传关系最近 ;K .hirsuta(Y2 86 0 )与K .tahelaca na (Y0 5 99)间GS值最小 (0 16 4 ) ,遗传关系最远 ;②物种内不同居群都聚在一起 ,遗传相似系数较大 ,亲缘关系较近 ;③形态相似、地理分布一致的物种有一定的亲缘关系 ,聚类在一起 ;④物种间遗传差异明显 ,且种间的遗传变异大于种内不同居群间的遗传变异 ;⑤RAPD结果与形态学和细胞学等分析结果基本一致 .据此 ,RAPD分析方法可为仲彬草属植物的系统学研究提供分子水平上的丰富资料 . 展开更多
关键词 仲彬草属 RAPD分析 遗传变异 遗传相似系数 亲缘关系 形态学
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部分耐盐小麦品种(系)SSR位点遗传多样性研究 被引量：13
12
作者 杨德光 翁跃进 +2 位作者 董玉琛 魏湜 胡正 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 2005年第1期9-14,共6页
选择有多态性的32对SSR引物对80个小麦耐盐品种(系)进行遗传差异研究,共检测出155个等位变异,平均每个位点上有4.75个等位变异;供试80份耐盐小麦品种(系)来源广泛,遗传基础丰富,表现出较高的遗传多样性,遗传相似系数范围在0.26-0.81;聚... 选择有多态性的32对SSR引物对80个小麦耐盐品种(系)进行遗传差异研究,共检测出155个等位变异,平均每个位点上有4.75个等位变异;供试80份耐盐小麦品种(系)来源广泛,遗传基础丰富,表现出较高的遗传多样性,遗传相似系数范围在0.26-0.81;聚类分析结果显示,冬性小麦品种(系)聚为一大类;春性小麦品种(系)也聚为一大类;一些系谱相同或相近的品种(系)遗传相似系数较大;A、B、D基因组中SSR位点平均等位变异差异不大,以B基因组较高。 展开更多
关键词 小麦品种(系) 多样性研究 SSR位点 耐盐 遗传相似系数 SSR引物 遗传多样性 遗传差异 等位变异 遗传基础 分析结果 D基因组 B基因组 多态性 平均 冬性 春性 系谱
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利用RAPD标记分析大麦种质资源的遗传多样性 被引量：14
13
作者 侯永翠 颜泽洪 +1 位作者 魏育明 郑有良 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 2005年第2期145-150,共6页
利用RAPD标记对19份西藏近缘野生大麦材料、33份我国不同省市的地方品种以及8份国外引进大麦品种共6 0份大麦种质资源的遗传多样性进行检测。结果表明材料间遗传差异明显。32个RAPD引物中,有2 5个引物(占78 13% )可扩增出清晰且具多态... 利用RAPD标记对19份西藏近缘野生大麦材料、33份我国不同省市的地方品种以及8份国外引进大麦品种共6 0份大麦种质资源的遗传多样性进行检测。结果表明材料间遗传差异明显。32个RAPD引物中,有2 5个引物(占78 13% )可扩增出清晰且具多态性的条带,另外7个引物能扩增出1～3条清晰但无多态性的条带。每个引物可扩增出1～8条多态性带,平均为3 72条。32个引物共产生119条DNA片段,其中87条具有多态性,多态性比率(PPB)为73 11% ,平均多态信息量(PIC)为0 4 34;每个位点平均有效等位基因数(Ne)为2 30 4 ;材料间遗传相似系数GS变化范围为0 75 7～0 981,平均值为0 871。19份来源于西藏的近缘野生大麦材料间GS值变幅为0 818～0 96 9,平均为0 892 ;33份我国栽培大麦地方品种间的GS值变化范围为0 783～0 981,平均为0 879;8份分别来自8个国家的栽培大麦品种间的GS值变幅为0 82 0～0 95 6 ,平均为0 882。根据RAPD标记分析的结果,对6 0份大麦种质资源进行聚类分析,在平均GS值0 871水平上6 0份大麦材料可聚为5类,聚类结果能在一定程度上反应材料的地理分布关系,但某些相同地理来源的材料也较分散地分布在整个聚类树中。本研究从分子水平上进一步证明了我国栽培大麦丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 栽培大麦 RAPD标记 遗传多样性 聚类分析 RAPD标记分析 近缘野生大麦 种质资源 有效等位基因数 遗传相似系数 平均值
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蚕豆种质资源清蛋白遗传多样性分析 被引量：6
14
作者 石建斌 侯万伟 +1 位作者 刘玉皎 马晓岗 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期22-28,共7页
利用SDS-PAGE对101份蚕豆种质资源进行了清蛋白遗传多样性分析,共检测出蛋白带2625条。除共有带外,迁移率不同的谱带类型36种,其中相对分子量为92kD、75kD、62kD、40kD、34kD、17kD、13kD的谱带在检测的种质材料中出现的频率最高,分别为... 利用SDS-PAGE对101份蚕豆种质资源进行了清蛋白遗传多样性分析,共检测出蛋白带2625条。除共有带外,迁移率不同的谱带类型36种,其中相对分子量为92kD、75kD、62kD、40kD、34kD、17kD、13kD的谱带在检测的种质材料中出现的频率最高,分别为92.08%、90.10%、99.01%、95.05%、95.05%、98.02%、95.05%。其余29种谱带类型具有较强的多态性,多态性谱带平均为16.09条,多态性比例为44.69%。每份种质材料的清蛋白谱带数介于21～31条之间,平均25.99条;供试种质间遗传相似系数0.6111～0.9722,平均0.7122。3个地理类群内多样性指数0.9879,类群间多样性指数0.0121,表明蚕豆清蛋白的变异主要来源于类群内。聚类分析将参试种质分为6类,与以往蚕豆种质分类研究结果类似,表明清蛋白能在一定程度上反映种质间的亲缘关系。研究结果对于蚕豆蛋白质品质育种具有一定的参考价值。 展开更多
关键词 蚕豆 清蛋白 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳 遗传相似系数 聚类分析
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三个鸡品系遗传关系的RAPD分析 被引量：3
15
作者 霍金龙 苗永旺 +7 位作者 李莲军 王荣平 叶朗惠 娄义洲 赵平 刘丽仙 潘伟荣 毕保良 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 2006年第2期222-227,共6页
为了从分子水平上阐明快羽系、绿壳蛋宗和合成系3个鸡品系之间的遗传差异及其遗传关系，为进一步开展这3个鸡品系的杂交配套利用提供依据，本文采用RAPD标记对3个品系的血样进行了群体遗传关系分析。实验共筛选出27条随机引物。对3个鸡... 为了从分子水平上阐明快羽系、绿壳蛋宗和合成系3个鸡品系之间的遗传差异及其遗传关系，为进一步开展这3个鸡品系的杂交配套利用提供依据，本文采用RAPD标记对3个品系的血样进行了群体遗传关系分析。实验共筛选出27条随机引物。对3个鸡品系的池DNA进行了RAPD分析。27条引物共产生235种扩增片段，扩增产物片段的长度大小在277—2441bp范围内。利用电泳分析数据分别计算了3个品系群体之间的遗传相似系数和遗传距离指数。结果表明：快羽系与绿壳蛋系问的遗传关系最近；而快羽系与合成系间的遗传关系最远。 展开更多
关键词 鸡 品系 RAPD标记 遗传相似系数 遗传距离指数
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烟草靶斑病菌(Rhizoctonia solani)ISSR反应体系的优化及遗传多样性分析 被引量：3
16
作者 赵秀香 苏燕妮 +4 位作者 伏颖 赵艳琴 孙宏伟 孙剑萍 吴元华 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期97-102,共6页
以烟草靶斑病菌(Rhizoctonia solani)基因组DNA为模板,采用单因素和正交设计L_(16)(4~5)相结合的方法对影响ISSR-PCR反应的主要因子进行优化,并对采自东北三省烟区的20个烟草靶斑病菌菌株进行ISSR分析,建立了适宜于病菌的ISSR分子标记... 以烟草靶斑病菌(Rhizoctonia solani)基因组DNA为模板,采用单因素和正交设计L_(16)(4~5)相结合的方法对影响ISSR-PCR反应的主要因子进行优化,并对采自东北三省烟区的20个烟草靶斑病菌菌株进行ISSR分析,建立了适宜于病菌的ISSR分子标记的最佳反应体系,即20μL的反应体系中含有模板DNA 30ng,Mg^(2+)浓度2.0mmol·L^(-1),d NTP浓度0.20 mmol·L^(-1),Taq酶1.0U,引物浓度0.4μmol·L^(-1)。利用优化的反应体系从20个ISSR引物中筛选出13个多态性和重复性好的引物,对20个烟草靶斑病菌菌株进行ISSR分析,共扩增出132条带,多态条带比率为73.48%,在相似系数0.74处将其划分为3个类群,其中LTL-7、HLK-1、HBX-2、HBX-4、LFC-9、LTL-5、LTL-9和JLH-1共8个菌株被划分在IGⅠ中;IGⅡ中包括LTL-6、LKD-8、HLK-3、LTL-115、LTL-2、LFC-4和LTL-8共7个菌株;其余5个菌株分别为LTL-66、LTL-111、HLK-4、JLH-3和LTL-22被划分到IGⅢ中。分析结果表明ISSR遗传聚类组群与菌株的地理来源具有一定的相关性,而与菌株的致病性无明显的相关性。 展开更多
关键词 烟草靶斑病 立枯丝核菌 ISSR反应体系 遗传相似系数 聚类分析
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大汉梅猪群体遗传结构及繁殖性能的RAPD分析 被引量：3
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作者 周胜花 贺东昌 +3 位作者 刘文忠 赵武恒 李文刚 焦福林 《家畜生态学报》 2008年第1期44-48,共5页
选用20对引物在大汉梅群体中进行RAPD扩增，共检测出185个位点，其中多态性位点39个，群体的多态频率为21．1％。数据分析结果显示：群体内个体之间的遗传相似系数为0．566～0．979，平均值为0．846，遗传信息较为稳定。通过对群体遗传... 选用20对引物在大汉梅群体中进行RAPD扩增，共检测出185个位点，其中多态性位点39个，群体的多态频率为21．1％。数据分析结果显示：群体内个体之间的遗传相似系数为0．566～0．979，平均值为0．846，遗传信息较为稳定。通过对群体遗传结构特点及繁殖性能生产记录进行分析，群体总产仔数和活产仔数均达到显著水平（P〈0．05），可为其建系和选育提供依据，并为以后进一步研究提供理论基础。 展开更多
关键词 大汉梅 遗传相似系数 RAPD 遗传距离
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基于AFLP标记的薄壳山核桃种质资源遗传多样性分析 被引量：4
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作者 梁燕 韩传明 +4 位作者 孙超 王翠香 闵旭峰 王静 王清海 《江苏林业科技》 2022年第1期1-7,共7页
利用荧光AFLP分子标记技术,对引种到山东地区的30份薄壳山核桃品种(系)的遗传多样性和亲缘关系进行分析,旨在加深山东地区引进的薄壳山核桃品种资源遗传背景的认识,为以后山东地区薄壳山核桃的品种选育在分子层面提供理论基础。总体上,... 利用荧光AFLP分子标记技术,对引种到山东地区的30份薄壳山核桃品种(系)的遗传多样性和亲缘关系进行分析,旨在加深山东地区引进的薄壳山核桃品种资源遗传背景的认识,为以后山东地区薄壳山核桃的品种选育在分子层面提供理论基础。总体上,9对引物组合共扩增出1425个条带,多态性条带1381个,平均多态性比例为96.9%,其中有4个引物组合的多态性比率达到100%。30个薄壳山核桃品种(系)利用9对引物组合所检测到的不同位点的等位基因数范围在1.6528—1.8889之间,平均为1.7103;有效等位基因数范围在1.1821—1.3068之间,平均为1.2403;基因多样度范围在0.1201—0.1909之间,平均为0.1522;Shannon信息指数范围在0.2000—0.3048之间,平均为0.2455。30个供试样品遗传相似系数范围为0.7464—0.8853,变异范围为小(0.1389),表明30个品种遗传背景宽度较窄。在遗传相似系数0.796处,30个薄壳山核桃品种分为3个组,小糙皮系列聚为一类,与其他品种遗传相似系数整体较小,是很好的亲本,值得更深一步研究与利用。 展开更多
关键词 AFLP分子标记 薄壳山核桃 遗传多样性 遗传相似系数 山东
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RAPD多态位点数变化对小豆遗传变异信息估计的影响 被引量：1
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作者 文自翔 金文林 +4 位作者 濮绍京 赵波 卢为国 李海朝 李金英 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2010年第1期75-79,共5页
以163份来自于中国、日本、韩国、不丹、尼泊尔和越南6国的各种类型小豆种质资源的大样本群体为材料,利用27条RAPD引物检测该群体得到的261个等位基因数据构建成＂总群体＂,采用完全随机抽样方法,研究不同样本容量（样本位点数）与系统... 以163份来自于中国、日本、韩国、不丹、尼泊尔和越南6国的各种类型小豆种质资源的大样本群体为材料,利用27条RAPD引物检测该群体得到的261个等位基因数据构建成＂总群体＂,采用完全随机抽样方法,研究不同样本容量（样本位点数）与系统遗传相似系数（Jaccard系数）变化的关系,并进一步配置出不同引物数量、多态位点与Jaccard系数的变异系数曲线方程,通过分析回归曲线的相应切点,确定在一定精度下适合的引物数量及多态位点数。研究结果表明：不同引物数量之间的Jaccard系数的标准差、平均数、变异系数差异极显著。不同引物数量、不同多态位点与Jaccard系数的变异系数、标准差回归方程为Y=a＋b/X形式,决定系数均在0.95以上。RAPD遗传信息分析精度控制在5%-10%时的最适样本容量为15-32条随机引物或120-230个多态性位点。 展开更多
关键词 小豆 遗传相似系数 RAPD 多态位点数
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44份杂交粳稻亲本遗传多样性的SSR分析 被引量：1
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作者 程保山 罗伯祥 杨加银 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2012年第9期1625-1629,共5页
利用58对SSR引物所检测出的158个等位基因位点对44份三系杂交粳稻亲本品种(系)进行遗传相似性分析,44个粳稻品种(系)间遗传相似系数的变异范围为0.54～0.96。采用非加权类平均法进行聚类分析,在相似系数0.71处,可将44个粳稻品种(系)分为... 利用58对SSR引物所检测出的158个等位基因位点对44份三系杂交粳稻亲本品种(系)进行遗传相似性分析,44个粳稻品种(系)间遗传相似系数的变异范围为0.54～0.96。采用非加权类平均法进行聚类分析,在相似系数0.71处,可将44个粳稻品种(系)分为4类,绝大多数品种(系)都聚为第四类群,第四类群在遗传相似系数0.75处,又可分为5个亚群,所有的保持系和不育系单独聚为E亚群。 展开更多
关键词 杂交粳稻 亲本 SSR标记 遗传相似系数
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