-
题名酵母基因组尺度遗传相互作用网络的拓扑性质
- 1
-
-
作者
崔幼一
张卓
-
机构
吉林铁道职业技术学院
第二军医大学长海医院心血管内科
-
出处
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第9期1009-1012,共4页
-
文摘
目的分析酵母遗传相互作用的基因组尺度的总体性质。方法用网络的图论方法,计算酵母遗传相互作用网络的拓扑性质。结果酵母全基因组的遗传相互作用中,基因的相互作用个数服从幂律分布,幂指数接近3。平均相互作用的基因为87,约2/3的基因只需通过1个基因就有遗传相互作用,约1/3只需通过2个基因就有遗传相互作用。遗传相互作用网络的平均聚集系数是0.047。结论酵母的基因通常具有多种而不是单一的功能,而且基因之间遗传相互作用高度密集。
-
关键词
酵母菌
遗传相互作用
基因组尺度
拓扑学
-
Keywords
yeasts
genetic interaction
genome-scale
topology
-
分类号
R394.21
[医药卫生—医学遗传学]
-
-
题名sgf73＋在裂殖酵母中的大规模遗传筛选
- 2
-
-
作者
郭雨辰
雷秉坤
邓小龙
余垚
吕红
-
机构
复旦大学生命科学学院
-
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第7期723-731,共9页
-
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(编号:2009CB825601)
国家自然科学基金项目(编号:31200961)资助
-
文摘
遗传相互作用(Genetic interaction,GI)直接提示了生物体内各个基因在功能上的关联性,为研究一个基因的潜在功能提供了线索。遗传筛选是研究基因遗传相互作用的重要方法。文章以SAGA(Spt-Ada-Gcn5 acetyltransferase)复合物去泛素化模块亚基基因sgf73+为查询基因,在裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)中进行了大规模遗传筛选。结果显示,164个基因与sgf73+具有负遗传相互作用,42个基因具有正遗传相互作用。GO(Gene ontology)分析结果表明,这些基因富集于染色质修饰、DNA损伤修复、压力应答、RNA转录等生物过程。通过组蛋白修饰检测实验首次发现,sgf73+的缺失导致组蛋白H3K9、H4K16位点乙酰化水平下降,H3K4位点甲基化修饰水平上升。此外,系列稀释实验显示sgf73?菌株对DNA损伤试剂HU和CPT的敏感性提高,并且Sgf73参与高氧胁迫应答。这些结果显示sgf73+参与了染色质修饰、DNA损伤修复和高氧压力应答过程。
-
关键词
遗传相互作用
裂殖酵母
sgf73+
组蛋白修饰
DNA损伤修复
压力应答
-
Keywords
genetic interaction
fission yeast
sgf73＋
histone modification
DNA damage repair
response to stress
-
分类号
Q78
[生物学—分子生物学]
-
