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广西药用野生稻遗传多样性分析及SSR引物数量对遗传多样性结果的影响研究
被引量：
15
1
作者
苏龙
徐志健
+12 位作者
乔卫华
郑晓明
梁云涛
丁膺宾
刘莎
齐兰
公婷婷
梁新霞
王君瑞
张丽芳
程云连
兰进好
杨庆文
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期603-610,共8页
采用25对SSR分子标记,对广西境内采集的1610份药用野生稻材料进行遗传多样性和聚类分析,其中检测到等位变异181个,有效等位基因数Ae范围为1.0094(RM240)~2.2674(RM488),平均值为1.3568;期望杂合度He范围为0.0093(RM240)~0.5591(RM448),...
采用25对SSR分子标记,对广西境内采集的1610份药用野生稻材料进行遗传多样性和聚类分析,其中检测到等位变异181个,有效等位基因数Ae范围为1.0094(RM240)~2.2674(RM488),平均值为1.3568;期望杂合度He范围为0.0093(RM240)~0.5591(RM448),平均值为0.2112;Shannon多样性指数I在0.0393~0.9296之间变动,平均值为0.3624。数据表明,广西药用野生稻遗传多样性较为丰富,12个药用野生稻地理居群按遗传多样性指数大小排序为:梧州-3>南宁-1>梧州-2>梧州-1>南宁-2>玉林-2>贵港-2>梧州-4>玉林-3>玉林-1>贺州>贵港-1,其中指数高的居群均分布于梧州市和南宁市两地,因此确定了这两地为广西药用野生稻的遗传多样性中心。通过不同数量的SSR引物对药用野生稻材料间相似系数矩阵进行相关性测验,结果显示当引物按照PIC值降序排列时,10对引物即达到较好聚类效果,升序排列时,21对引物即达到较好聚类效果。研究表明,在进行药用野生稻大居群聚类分析时,SSR引物适宜数量应多于21对,最低不得少于10对。
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关键词
药用野生稻
遗传多样性中心
聚类分析
SSR引物数量
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职称材料
题名
广西药用野生稻遗传多样性分析及SSR引物数量对遗传多样性结果的影响研究
被引量：
15
1
作者
苏龙
徐志健
乔卫华
郑晓明
梁云涛
丁膺宾
刘莎
齐兰
公婷婷
梁新霞
王君瑞
张丽芳
程云连
兰进好
杨庆文
机构
青岛农业大学农学院
中国农业科学院作物科学研究所
广西农业科学院水稻研究所
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期603-610,共8页
基金
国家自然科学基金(31471471)
国家重点研发计划(2016YFD0100101-01-02)
+2 种基金
农业部财政专项(2016NWB036-01-12)
广西壮族自治区主席科技资金项目(1517-03)
广西农业科学院基本科研业务专项(2015YT14)
文摘
采用25对SSR分子标记,对广西境内采集的1610份药用野生稻材料进行遗传多样性和聚类分析,其中检测到等位变异181个,有效等位基因数Ae范围为1.0094(RM240)~2.2674(RM488),平均值为1.3568;期望杂合度He范围为0.0093(RM240)~0.5591(RM448),平均值为0.2112;Shannon多样性指数I在0.0393~0.9296之间变动,平均值为0.3624。数据表明,广西药用野生稻遗传多样性较为丰富,12个药用野生稻地理居群按遗传多样性指数大小排序为:梧州-3>南宁-1>梧州-2>梧州-1>南宁-2>玉林-2>贵港-2>梧州-4>玉林-3>玉林-1>贺州>贵港-1,其中指数高的居群均分布于梧州市和南宁市两地,因此确定了这两地为广西药用野生稻的遗传多样性中心。通过不同数量的SSR引物对药用野生稻材料间相似系数矩阵进行相关性测验,结果显示当引物按照PIC值降序排列时,10对引物即达到较好聚类效果,升序排列时,21对引物即达到较好聚类效果。研究表明,在进行药用野生稻大居群聚类分析时,SSR引物适宜数量应多于21对,最低不得少于10对。
关键词
药用野生稻
遗传多样性中心
聚类分析
SSR引物数量
Keywords
Oryza officinalis Wall.ex G.Watt
genetic diversity center
cluster analysis
SSR
分类号
S511.9 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
广西药用野生稻遗传多样性分析及SSR引物数量对遗传多样性结果的影响研究
苏龙
徐志健
乔卫华
郑晓明
梁云涛
丁膺宾
刘莎
齐兰
公婷婷
梁新霞
王君瑞
张丽芳
程云连
兰进好
杨庆文
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
15
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