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酉州乌羊MC1R基因的克隆鉴定、生物信息学及多态性分析
被引量:
5
1
作者
付琳
任航行
+5 位作者
王高富
周鹏
张丽
李杰
董贤文
蒋婧
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期31-40,共10页
MC1R是影响皮肤色素沉着中黑皮素系统的重要基因,通过信号分子的相互作用影响黑色素的生成。为探究酉州乌羊MC1R的生物学特性,本研究对酉州乌羊MC1R进行了分离鉴定、生物信息学分析。结果表明,酉州乌羊皮肤组织MC1R基因的CDS序列为954 ...
MC1R是影响皮肤色素沉着中黑皮素系统的重要基因,通过信号分子的相互作用影响黑色素的生成。为探究酉州乌羊MC1R的生物学特性,本研究对酉州乌羊MC1R进行了分离鉴定、生物信息学分析。结果表明,酉州乌羊皮肤组织MC1R基因的CDS序列为954 bp,共编码317个氨基酸,酉州乌羊与各物种MC1R具有较高同源性。酉州乌羊MC1R编码蛋白的分子式是C_(1603)H_(2565)N_(411)O_(410)S_(22),其为疏水蛋白,有7个α-螺旋组成的跨膜结构域和3个保守功能结构域,MC1R氨基酸序列大部分都用于构成α-螺旋。此外,酉州乌羊MC1R基因c.676A>G突变,其编码的氨基酸由赖氨酸转变为谷氨酸,位于受光刺激和G蛋白配体结合的保守结构域上,氨基酸的异义替换还造成了酉州乌羊MC1R空间构象的差异。而对重庆市山羊群体多态性检测发现,山羊MC1R基因c.676A>G变异位点在重庆合川白山羊、巫溪白山羊、本地白山羊、酉州乌羊中共享,且c.676A>G位点的各基因型在皮肤白色和乌色山羊群体中的分布差异不显著(P>0.05)。本研究初步揭示酉州乌羊MC1R的序列特征和蛋白结构,为酉州乌羊MC1R影响皮肤色素沉积的分子机制研究提供了理论数据。
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关键词
MC1R基因
克隆
酉州乌羊
遗传多态性分析
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题名
酉州乌羊MC1R基因的克隆鉴定、生物信息学及多态性分析
被引量:
5
1
作者
付琳
任航行
王高富
周鹏
张丽
李杰
董贤文
蒋婧
机构
重庆市畜牧科学院/重庆市山羊工程技术研究中心
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期31-40,共10页
基金
重庆市基础研究与前沿探索项目(cstc2018jcyjAX0042)
2019年财政专项资金项目(19504)。
文摘
MC1R是影响皮肤色素沉着中黑皮素系统的重要基因,通过信号分子的相互作用影响黑色素的生成。为探究酉州乌羊MC1R的生物学特性,本研究对酉州乌羊MC1R进行了分离鉴定、生物信息学分析。结果表明,酉州乌羊皮肤组织MC1R基因的CDS序列为954 bp,共编码317个氨基酸,酉州乌羊与各物种MC1R具有较高同源性。酉州乌羊MC1R编码蛋白的分子式是C_(1603)H_(2565)N_(411)O_(410)S_(22),其为疏水蛋白,有7个α-螺旋组成的跨膜结构域和3个保守功能结构域,MC1R氨基酸序列大部分都用于构成α-螺旋。此外,酉州乌羊MC1R基因c.676A>G突变,其编码的氨基酸由赖氨酸转变为谷氨酸,位于受光刺激和G蛋白配体结合的保守结构域上,氨基酸的异义替换还造成了酉州乌羊MC1R空间构象的差异。而对重庆市山羊群体多态性检测发现,山羊MC1R基因c.676A>G变异位点在重庆合川白山羊、巫溪白山羊、本地白山羊、酉州乌羊中共享,且c.676A>G位点的各基因型在皮肤白色和乌色山羊群体中的分布差异不显著(P>0.05)。本研究初步揭示酉州乌羊MC1R的序列特征和蛋白结构,为酉州乌羊MC1R影响皮肤色素沉积的分子机制研究提供了理论数据。
关键词
MC1R基因
克隆
酉州乌羊
遗传多态性分析
Keywords
MC1R gene
amplification
Youzhou dark goat
genetic diversity analysis
分类号
S826 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
酉州乌羊MC1R基因的克隆鉴定、生物信息学及多态性分析
付琳
任航行
王高富
周鹏
张丽
李杰
董贤文
蒋婧
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
5
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