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基于种子贮藏蛋白电泳的豌豆遗传多态性分析
1
作者 马天天 郭瑞 +3 位作者 陈高 兰红 陈禅友 潘磊 《种子》 北大核心 2025年第7期140-148,共9页
以100份豌豆种质为材料,采用SDS-PAGE电泳技术获取种子盐溶蛋白和水溶蛋白图谱,建立数据矩阵并进行遗传多态性、品种聚类分析。结果表明,两类蛋白均分离出36条条带,其中多态性条带30条。盐溶蛋白多态性条带平均显带次数为60.70、变异系... 以100份豌豆种质为材料,采用SDS-PAGE电泳技术获取种子盐溶蛋白和水溶蛋白图谱,建立数据矩阵并进行遗传多态性、品种聚类分析。结果表明,两类蛋白均分离出36条条带,其中多态性条带30条。盐溶蛋白多态性条带平均显带次数为60.70、变异系数为48.14%,供试品种平均显带数为18.21、变异系数为15.14%;水溶蛋白多态性条带平均显带次数为63.43、变异系数为39.22%,供试品种平均显带数为19.03、变异系数为15.65%。电泳条带数目及分布差异使品种间带型变异显著,表明豌豆种子贮藏蛋白具有丰富遗传多态性,可作为有效的遗传标记。基于60条多态性条带信息进行UPGMA聚类分析,在遗传相似系数0.57处将100份豌豆划分为7个类群,81个品种聚于品种群Ⅰ,19个遗传差异大的品种分散于其他群,主成分分析二维散点图进一步印证了品种分布特征。 展开更多
关键词 豌豆 遗传多态性 盐溶蛋白 水溶蛋白 SDS-PAGE
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深圳汉族人群42个常染色体短串联重复序列基因座的遗传多态性
2
作者 钟艳平 伍立桃 +5 位作者 李桢 周丹 全湛柔 梁爽 邓志辉 张胤鸣 《中山大学学报（医学科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期739-744,共6页
【目的】调查深圳汉族人群42个常染色体短串联重复序列(STR)基因座(含41个非CODIS系统STR基因座)等位基因的遗传多态性,研究其在法医鉴定中的应用价值。【方法】采用AGCU21+1和阅微MR23荧光扩增试剂盒对深圳汉族人群435个无关个体STR基... 【目的】调查深圳汉族人群42个常染色体短串联重复序列(STR)基因座(含41个非CODIS系统STR基因座)等位基因的遗传多态性,研究其在法医鉴定中的应用价值。【方法】采用AGCU21+1和阅微MR23荧光扩增试剂盒对深圳汉族人群435个无关个体STR基因座进行序列多态性分析。通过Modified-Powerstates和arlequin v3.5软件统计等位基因频率、法医遗传学参数并进行Hardy-Weinberg平衡检验。【结果】深圳汉族人群435个无关个体共检出418个等位基因,均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05/42),频率分布在0.0011~0.5529之间。D1S1656和D21S1270基因座多态性最高,均检出16个等位基因;D4S2408基因座检出的等位基因最少;个体识别能力(DP)为0.7988(D1S1627)~0.9686(D7S3048),多态性信息含量(PIC)为0.5680(D1S1627)~0.8598(D7S3048),杂合度(H)为0.6276(D1S1627)~0.8782(D20S470)。【结论】42个常染色体STR基因座的等位基因在深圳地区汉族群体遗传多态性较好,具有较高的个体识别能力,在个体识别和亲权鉴定尤其是单亲或出现基因突变的情况下具有较高的应用价值;所得的数据亦为STR群体遗传学提供基础数据。 展开更多
关键词 法医遗传学 遗传多态性 常染色体 短串联重复序列 深圳 汉族
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A-FABP基因在三个品种鸡中的群体遗传多态性分析 被引量：1
3
作者 陈芝媛 苏咏梅 +3 位作者 朱文进 宋雪柔 张铷铄 代晓琳 《饲料研究》 北大核心 2024年第23期113-118,共6页
试验旨在探究脂肪细胞型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因在坝上长尾鸡、东乡黑鸡和白羽来航鸡3个品种中的遗传多态性。试验采用单链构象多态性分析(PCR-SSCP)方法对3个品种鸡的A-FABP基因进行SNP检测。结果显示,共发现4个突变位点:g.09A>... 试验旨在探究脂肪细胞型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因在坝上长尾鸡、东乡黑鸡和白羽来航鸡3个品种中的遗传多态性。试验采用单链构象多态性分析(PCR-SSCP)方法对3个品种鸡的A-FABP基因进行SNP检测。结果显示,共发现4个突变位点:g.09A>G、g.110T>C、g.1607A>G和g.1727A>C,均为在鸡中首次发现的突变位点,且g.1607A>G和g.1727A>C两个位点的突变只发生在坝上长尾鸡。坝上长尾鸡多态信息含量(PIC平均值为0.3280)和观测杂合度(Ho平均值为0.5945)在3个品种中均为最高。Hardy-Weinberg平衡性检验发现坝上长尾鸡有3个突变位点(g.09A>G、g.1607A>G和g.1727A>C)处于平衡状态(P>0.05),白羽来航鸡的2个突变位点(g.09A>G和g.110T>C)处于平衡状态(P>0.05),其余各位点处于不平衡状态(P<0.05)。研究表明,A-FABP基因在坝上长尾鸡的遗传多态性高于东乡黑鸡和白羽来航鸡。 展开更多
关键词 地方品种鸡 A-FABP PCR-SSCP 群体遗传多态性
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中国东乡族9个STR基因座遗传多态性研究 被引量：26
4
作者 陈腾 张琳琳 +5 位作者 赖江华 郑海波 王占海 汪健 胡松年 李生斌 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期247-250,共4页
选择 9个STR基因座 ,采用四色荧光标记STR基因扫描技术 ,对中国甘肃省特有民族———东乡族的群体遗传多态性进行研究。同时检测 94个无关个体血液样本 ,共检出 72种等位基因 ,基因频率的分布在 0 .0 0 5 3～0 .5 82 5之间 ;检出 182种... 选择 9个STR基因座 ,采用四色荧光标记STR基因扫描技术 ,对中国甘肃省特有民族———东乡族的群体遗传多态性进行研究。同时检测 94个无关个体血液样本 ,共检出 72种等位基因 ,基因频率的分布在 0 .0 0 5 3～0 .5 82 5之间 ;检出 182种基因型 ,基因型频率分布在 0 .0 10 6～ 0 .2 6 6 0之间 ;9个STR位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律 (P >0 .0 5 )。 9个STR位点多态信息量 (polymorphisminformationcontent,PIC)均大于0 .6 378,杂合度 (heterozygosity ,H)均大于 0 .6 5 0 0 ,个体识别力 (discriminationpower ,DP)均大于 0 .82 16 ,非父排除率 (probabilitiesofpaternityexclusion ,PPE)均大于 0 .490 3。种族比较结果显示 ,甘肃东乡族与白种人及黑种人在绝大多数位点存在显著差异 (P <0 .0 5 ) ,而 9个STR位点与汉族群体的遗传差异均不显著 (P >0 .0 5 )。研究结果丰富了中华民族基因数据库 ,在人类群体遗传学及法医学研究领域有重要应用价值。 展开更多
关键词 中国 东乡族 STR基因座 遗传多态性
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云南怒族STR基因座遗传多态性研究 被引量：14
5
作者 高树辉 王新淮 +2 位作者 赖江华 郑海波 李生斌 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期125-130,共6页
本文选择 9个STR基因座和Amelogenin基因座 ,利用基因测序 ,采用基因扫描技术 ,对云南怒族聚集地区84名无关个体血样进行研究 ,建立了云南怒族 9个STR基因座的基因频率数据库。用 χ2 检验 ,9个STR基因座基因型分布符合Hardy -Weinberg... 本文选择 9个STR基因座和Amelogenin基因座 ,利用基因测序 ,采用基因扫描技术 ,对云南怒族聚集地区84名无关个体血样进行研究 ,建立了云南怒族 9个STR基因座的基因频率数据库。用 χ2 检验 ,9个STR基因座基因型分布符合Hardy -Weinberg平衡定律。与其他民族资料一样 ,本课题所获得的云南怒族 9个STR基因座数据是一组有价值的DNA多态性遗传标记资料。 展开更多
关键词 怒族 STR 基因扫描 基因频率 遗传多态性 云南 基因座
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云南白族STR遗传多态性研究 被引量：20
6
作者 赖江华 张保华 +4 位作者 朱波峰 陈腾 郑海波 寻兮 李生斌 《西安医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期242-245,共4页
目的　研究我国白族STR遗传多态性。方法　通过STR复合扩增、基因扫描、基因分型调查了 98名中国白族无关个体 1 5个STR基因座等位基因分布情况。结果　共检出 1 3 4个STR等位基因 ,其频率分布在 0 .0 0 5 8～ 0 .5 799之间 ,杂合度 (H)... 目的　研究我国白族STR遗传多态性。方法　通过STR复合扩增、基因扫描、基因分型调查了 98名中国白族无关个体 1 5个STR基因座等位基因分布情况。结果　共检出 1 3 4个STR等位基因 ,其频率分布在 0 .0 0 5 8～ 0 .5 799之间 ,杂合度 (H)为 0 .5 83 4～ 0 .882 8,个体识别力 (DP)为 0 .773 9～ 0 .9666,非父排除率 (EPP)为 0 .5 692～ 0 .8694,多态信息量 (PIC)为 0 .5 3 1 7～ 0 .8694。结论　为进一步研究中华民族STR遗传结构奠定了基础 ,在人类学。 展开更多
关键词 云南 STR 遗传多态性 基因扫描 白族 短串联重复序列 基因分型
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湖北汉族人群15个STR基因座的遗传多态性 被引量：15
7
作者 易少华 杨荣芝 +2 位作者 梅焜 杨庆恩 余纯应 《华中科技大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期91-93,共3页
目的调查湖北汉族人群15个STR基因座(D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、vWA,TPOX,D18S51,D5S818,FGA)的遗传多态性分布。方法采用Identifiler试剂盒复合扩增305例湖北汉族个体的15... 目的调查湖北汉族人群15个STR基因座(D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、vWA,TPOX,D18S51,D5S818,FGA)的遗传多态性分布。方法采用Identifiler试剂盒复合扩增305例湖北汉族个体的15个STR基因座,产物经3130遗传分析仪电泳分离和分型检测,分析检验基因座的遗传学参数:基因频率、杂合度、多态信息含量(PIC)、个体识别能力(DP)、非父排除概率(PE)和遗传平衡状态。结果305名无关个体共检测到15个STR基因座的146个等位基因,各基因座基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。13个STR基因座的PIC>0.5,14个STR基因座的DP>0.8,12个STR基因座的PE>0.5;累积个体识别力>0.999 999 999,累积非父排除率>0.999 998 8。结论湖北汉族人群15个STR基因座的绝大多数基因座具有较高的遗传多态性,其群体遗传学数据可用于本地人类遗传学、法医亲子鉴定和个体识别等研究领域。 展开更多
关键词 STR基因座 遗传多态性 基因频率 汉族 湖北
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西安汉族X染色体上6个STR位点的遗传多态性 被引量：20
8
作者 余兵 秦群霞 +2 位作者 闫金成 张洪波 李生斌 《法医学杂志》 CAS CSCD 2005年第3期188-191,共4页
目的调查西安汉族人群6个位于X染色体上的短串联重复序列:DXS8378、DXS7132、DXS6789、DXS101、HPRTB和DXS7423的基因及基因型频率分布。方法应用PCR和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染技术检测结果。结果在120例女性无关个体中,DXS8378、D... 目的调查西安汉族人群6个位于X染色体上的短串联重复序列:DXS8378、DXS7132、DXS6789、DXS101、HPRTB和DXS7423的基因及基因型频率分布。方法应用PCR和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染技术检测结果。结果在120例女性无关个体中,DXS8378、DXS7132、DXS6789、DXS101、HPRTB和DXS7423分别检出5、6、11、10、8和4个等位基因;分别检出10、17、29、32、22和7种基因型;此6个位点女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡。结论此6个X染色体STR位点均有较高的个体识别率,在个体识别和女孩的亲权鉴定中有应用价值,对疾病相关研究有实际意义。 展开更多
关键词 X染色体 短串联重复序列 遗传多态性 汉族
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鸡胰岛素样生长因子-1基因的遗传多态性与其体重的关系 被引量：25
9
作者 欧阳建华 孙汉 +5 位作者 李海华 邱峰芳 柳小春 施启顺 王文君 林树茂 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期525-529,共5页
对宁都三黄鸡、万载康乐黄鸡两个鸡种共295个样本,采用PCR RFLP技术对胰岛素样生长因子—1(cIGF 1)基因的5'端调控区进行遗传变异研究,发现该调控区的扩增产物经PstⅠ酶切后出现3种基因型(AA、AB、BB)。结果表明:性别对宁都三黄鸡这... 对宁都三黄鸡、万载康乐黄鸡两个鸡种共295个样本,采用PCR RFLP技术对胰岛素样生长因子—1(cIGF 1)基因的5'端调控区进行遗传变异研究,发现该调控区的扩增产物经PstⅠ酶切后出现3种基因型(AA、AB、BB)。结果表明:性别对宁都三黄鸡这3种基因型的分布呈现显著差异(P<0 05)。分析这3种基因型与其体重的关系发现,这3种基因型对初生重、30日龄体重、60日龄体重、90日龄体重及120日龄体重影响差异均不显著(P>0 05),但体现出AA型有较高体重的趋势,公母表现出一致的规律。在万载康乐黄鸡中,均呈现出杂合优势,在8周龄及18周龄时差异不显著(P>0 05),而在12周龄表现为差异显著(P<0 05)。宁都三黄鸡公母基因型分布均符合哈代 温格伯定律,而万载康乐黄鸡基因型分布不符合哈代 温格伯定律。 展开更多
关键词 鸡 胰岛素样生长因子-1 IGF-1 基因 遗传多态性 体重 宁都三黄鸡 万载康乐黄鸡 PCR—RFLP 调控区 遗传 变异 基因型 哈代-温格伯定律 AA型
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DXS6804/DXS9896/GATA144D04基因座在中国汉族群体中的遗传多态性及其法医学应用 被引量：15
10
作者 应斌武 石美森 +5 位作者 邓建强 李英碧 吴谨 颜静 张霁 侯一平 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期603-606,共4页
为了调查X染色体上DXS6804、DXS9896和GATA144D04等3个STR基因座在中国汉族群体的遗传多态性及其法医学应用价值,来用PCR和聚丙烯酰胺凝胶电泳对X染色体3个STR基因座进行分型,并检验女性基因型频率分布是否符合Hardy Weinberg平衡,计算... 为了调查X染色体上DXS6804、DXS9896和GATA144D04等3个STR基因座在中国汉族群体的遗传多态性及其法医学应用价值,来用PCR和聚丙烯酰胺凝胶电泳对X染色体3个STR基因座进行分型,并检验女性基因型频率分布是否符合Hardy Weinberg平衡,计算法医学常用各种概率。DXS6804、DXS9896和GATA144D04的非父排除率分别为0 5990、0 6220、0 4280,表明3个STR基因座在中国汉族群体均具有遗传多态性,χ2检验表明女性的基因型频率分布符合Hardy Weinberg平衡。X染色体上的基因座DXS6804、DXS9896和GATA144D04在中国汉族群体中具有较高的遗传多态性,可应用于法医学检验和群体遗传学分析。 展开更多
关键词 X染色体 短串联重复序列 遗传多态性 中国汉族
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华南地区汉族群体15个STR基因座的遗传多态性调查 被引量：21
11
作者 薛天羽 成建定 +2 位作者 张晋湘 李海霞 孙宏钰 《中山大学学报（医学科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第A03期45-50,共6页
【目的】调查获得华南地区汉族群体遗传多态性参数,并与以往相关文献报道的群体资料进行统计比较。同时评估PowerPlex誖16体系应用于华南汉族人群进行法医学个体识别及亲子鉴定的价值。【方法】应用PowerPlex誖16荧光标记复合扩增系统检... 【目的】调查获得华南地区汉族群体遗传多态性参数,并与以往相关文献报道的群体资料进行统计比较。同时评估PowerPlex誖16体系应用于华南汉族人群进行法医学个体识别及亲子鉴定的价值。【方法】应用PowerPlex誖16荧光标记复合扩增系统检测4786名华南地区汉族无关个体15个STR基因座的多态性,统计计算群体遗传学参数,并将获得的等位基因频率与文献报道的群体资料进行统计比较。【结果】15个STR基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P﹥0.05),共检出241个等位基因,频率在0.0001～0.5458;共1043种基因型。在13个基因座上检出共60个等位基因阶梯以外的等位基因。15个基因座的杂合度观察值(Ho)在0.6030～0.9076之间,多态信息含量(PIC)在0.5428～0.9044之间,累计个人识别率(TDP)达0.9999999999999999971,三联体累计非父排除概率(CPE)达到0.99999981,单亲鉴定累计亲权排除概率(CPE*)为0.9543。本文调查结果与以往文献报道的人群等位基因频率资料有不同程度的差异。【结论】15个STR基因座在华南汉族人群中有较高的多态性,PowerPlex誖16荧光标记复合扩增系统对华南汉族人群的个体识别及亲子鉴定具有很高的应用价值。本文调查获得的群体遗传学数据可为法医学个人识别和亲子鉴定提供结果评估的依据。 展开更多
关键词 STR基因座 遗传多态性 等位基因频率 华南地区
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陕西小麦品种(系)脂肪氧化酶活性基因的遗传多态性分析 被引量：15
12
作者 张钰玉 王晓龙 +5 位作者 张晓科 付晓洁 冯毅 王轩 杨松杰 王宏礼 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期616-621,共6页
为给小麦品质改良提供理论依据,利用1A染色体上QLpx.caas1-AL位点的标记Xwmc312及基于4B染色体上TaLOX-B1位点开发的显性互补功能标记LOX16和LOX18,对173份陕西小麦品种(系)进行检测,分析LOX活性基因的遗传多态性。在QLpx.caas1-AL位点... 为给小麦品质改良提供理论依据,利用1A染色体上QLpx.caas1-AL位点的标记Xwmc312及基于4B染色体上TaLOX-B1位点开发的显性互补功能标记LOX16和LOX18,对173份陕西小麦品种(系)进行检测,分析LOX活性基因的遗传多态性。在QLpx.caas1-AL位点,所检测的陕西小麦品种(系)存在Xwmc312-227、Xwmc312-235和Xwmc312-247三种等位变异类型。其中,Xwmc312-227类型有54个,占31.21%;Xwmc312-235类型有31个,占17.92%;Xwmc312-247类型有88个,占50.87%。在TaLOX-B1位点,所检测的品种(系)存在TaLOX-B1a和TaLOX-B1b两种等位变异。其中,TaLOX-B1a类型有39个,占22.54%;TaLOX-B1b类型有134个,占77.46%。两个位点在陕西小麦中存在6种等位变异的组合类型,其总体分布比例不同,以Xwmc312-247/TaLOX-B1b组合类型品种(系)的分布比例最高(41.0%),其次为Xwmc312-227/TaLOX-B1b(19.6%)、Xwmc312-235/TaLOX-B1b(16.8%)、Xwmc312-227/TaLOX-B1a(11.6%)和Xwmc312-247/TaLOX-B1a(9.8%),而以Xwmc312-235/TaLOX-B1a组合类型品种(系)的分布比例最低(1.2%)。6种等位变异组合类型的分布比例在陕西不同麦区也存在差异。在陕西小麦中,低LOX活性等位变异品种(系)的比例明显高于高LOX活性等位变异品种。 展开更多
关键词 小麦 面粉白度 脂肪氧化酶活性基因 遗传多态性
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基于线粒体COⅠ基因序列的中国二点委夜蛾遗传多态性分析 被引量：14
13
作者 朱彦彬 马继芳 +6 位作者 董立 李立涛 姜京宇 李智慧 董志平 董金皋 王勤英 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期457-465,共9页
二点委夜蛾Athetis lepigone是2005年首次在河北省发现危害夏玉米苗的新害虫,2011年7月在河北、河南、山东、山西、安徽和江苏6省47市夏玉米苗期大面积暴发成灾,严重威胁玉米生产。为了从种群水平探讨该虫暴发成灾的机制,我们通过分析... 二点委夜蛾Athetis lepigone是2005年首次在河北省发现危害夏玉米苗的新害虫,2011年7月在河北、河南、山东、山西、安徽和江苏6省47市夏玉米苗期大面积暴发成灾,严重威胁玉米生产。为了从种群水平探讨该虫暴发成灾的机制,我们通过分析线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(mtCOⅠ)基因序列来研究不同地区二点委夜蛾种群的进化关系。本研究采集了河北、河南、山东和山西等地的19个不同地理种群样本,用同源序列比对的方法分析样本mtCOⅠ基因片段,利用DnaSP5.0软件和Arlequin3.5软件对不同地理种群间的mtCOⅠ单倍型多样性分析和Tajima’sD中性检测,建立了单倍型邻接(N-J)系统发育进化树和单倍型网络图。结果表明,在203头个体的658bpmtCOⅠ基因片段中,得到17种单倍型和18个变异位点,河北省的二点委夜蛾的单倍型多态性最丰富,而河南、山东和山西3省采集的二点委夜蛾样品其单倍型均有与河北种群单倍型一致的类型。二点委夜蛾不同地理种群间基因流水平较高,种群间没有明显的遗传分化,并且在较近的历史时期未经历明显的种群扩张。 展开更多
关键词 二点委夜蛾 线粒体COⅠ 单倍型 遗传多态性 地理种群
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奶牛乳铁蛋白基因5′侧翼区遗传多态性及其与乳腺炎关联性分析 被引量：15
14
作者 王洪梅 孔振兴 +5 位作者 王长法 黄金明 李秋玲 侯明海 李建斌 仲跻峰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期393-399,共7页
牛乳铁蛋白(Lactoferrin,LF)是保护乳腺组织的防御因子之一,是具有多种功能的糖蛋白。关于牛LF基因的多态性研究的报道较多,但其多态性与奶牛乳腺炎相关性的研究较少。文章采用PCR-RFLP、CRS-PCR对268头中国荷斯坦牛LF基因启动子区的-92... 牛乳铁蛋白(Lactoferrin,LF)是保护乳腺组织的防御因子之一,是具有多种功能的糖蛋白。关于牛LF基因的多态性研究的报道较多,但其多态性与奶牛乳腺炎相关性的研究较少。文章采用PCR-RFLP、CRS-PCR对268头中国荷斯坦牛LF基因启动子区的-926(G/A)、-915(T/G)、-478(/G)、+72(T/C)突变进行基因型分型,应用最小二乘线性模型分析LF基因多态性与体细胞评分(Somaticcellscore,SCS)的相关性。结果表明,新发现+72(T/C)和-478(/G)对SCS有显著影响,而其他两个位点对SCS影响不显著(P>0.05)。+72(T/C)的AB基因型是优良基因型,其个体的SCS值均显著低于AA型(P<0.01)、BB型个体(P<0.05)。-478(/G)位点的C等位基因是优良的等位基因,CC基因型个体的SCS值极显著低于CD、DD基因型个体(P<0.01)。因此,LF基因+72(T/C)的AB基因型和-478(/G)位点的CC基因型均是奶牛乳腺炎抗性的优良基因型,可作为分子标记应用于奶牛乳腺炎抗性筛选。 展开更多
关键词 乳铁蛋白基因5’侧翼区 遗传多态性 乳腺炎 体细胞评分 中国荷斯坦牛
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中国南方汉族群体27个Y-STR基因座的遗传多态性及突变研究 被引量：15
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作者 王瑛 张楚楚 +4 位作者 李燃 彭珊 欧雪玲 童大跃 孙宏钰 《中山大学学报（医学科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期650-656,共7页
【目的】调查27个Y-STR基因座在中国南方汉族群体的遗传多态性及突变情况。【方法】采集885名中国南方汉族无关男性个体血样和911对父子血样,采用YfilerPlus扩增体系对样本进行扩增,并进行毛细管电泳检测与分型,统计相关遗传多态性参... 【目的】调查27个Y-STR基因座在中国南方汉族群体的遗传多态性及突变情况。【方法】采集885名中国南方汉族无关男性个体血样和911对父子血样,采用YfilerPlus扩增体系对样本进行扩增,并进行毛细管电泳检测与分型,统计相关遗传多态性参数,观察Y-STR基因座突变情况。【结果】885名无关男性个体中共观察到880种单倍型,其中875种单倍型为唯一单倍型,5种单倍型分别出现两次。单倍型多样性（HD）为0.999 987 2,系统识别能力（DC）为0.994 350 3。27个Y-STR基因座基因多态性（GD）在0.434 4（DYS438）-0.960 5（DYS385a/b）之间。在911个父子对共246 23次等位基因传递中共观察到113次突变事件,其中108次突变事件为一步突变,5次突变事件为二步突变。11个父子对观察到2个基因座同时突变,1个父子对发生3个基因座同时突变。平均突变率为4.6×10-3（95%CI：3.8×10-3-5.5×10-3）。【结论】YfilerPlus体系包含的27个Y-STR基因座在中国南方汉族群体中具有高度遗传多态性,对于法医学实践中个体识别、父系亲缘关系鉴定等具有重要意义。 展开更多
关键词 短串联重复序列(STR) YfilerPlus PCR扩增体系 遗传多态性 突变
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甘薯抗、感茎线虫病品种遗传多态性的RAPD分析 被引量：13
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作者 周忠 王欣 +3 位作者 马代夫 李洪民 谢逸萍 李秀英 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2005年第1期35-39,共5页
利用田间自然诱发方法对100余份甘薯品种连续进行3年茎线虫病的抗性鉴定,选取其中21份抗、感性稳定的品种作为供试材料,含高抗品种10个、抗病品种2个、感病品种2个、高感品种7个.以徐781和栗子香的总DNA为模板,从70个随机引物中选出16... 利用田间自然诱发方法对100余份甘薯品种连续进行3年茎线虫病的抗性鉴定,选取其中21份抗、感性稳定的品种作为供试材料,含高抗品种10个、抗病品种2个、感病品种2个、高感品种7个.以徐781和栗子香的总DNA为模板,从70个随机引物中选出16个引物对其进行随机扩增,均得到了稳定的RAPD图谱.扩增出的片段分子量为0.3～2.0 kb,条带数在1至9之间,共扩增出119个条带,其中,84.03%的谱带为多态性带.利用NTSYS-PC软件中的Simqual程序估算DNA的相似系数,UPGMA程序构建遗传相关树状图.遗传多态性的RAPD分析可为甘薯抗茎线虫病品种选育的亲本组配提供依据. 展开更多
关键词 茎线虫病 感病品种 甘薯 RAPD分析 遗传相关 品种选育 亲本 扩增 遗传多态性 诱发
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西安荷斯坦奶牛群5个基因座位遗传多态性的PCR-RFLP分析 被引量：12
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作者 张润锋 陈宏 +4 位作者 蓝贤勇 田燚 潘传英 胡沈荣 苏利红 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期545-549,共5页
应用PCR RFLP方法对西安荷斯坦牛的κcn、βlg、βlg 5′侧翼区、CSN1S2、IGFBP 3 共5 个基因座位进行了多态性分析。结果表明,在西安荷斯坦牛群中,没有发现携带CSN1S2F 等位基因的个体,其多态信息含量为0。κcn基因座位呈现低度多态(PI... 应用PCR RFLP方法对西安荷斯坦牛的κcn、βlg、βlg 5′侧翼区、CSN1S2、IGFBP 3 共5 个基因座位进行了多态性分析。结果表明,在西安荷斯坦牛群中,没有发现携带CSN1S2F 等位基因的个体,其多态信息含量为0。κcn基因座位呈现低度多态(PIC=0 236 6),βlg、βlg 5′侧翼区、IGFBP 3 基因座位的多态信息含量分别为0 316 8、0 368 9、0 443 9,均呈现中度多态。κcn、βlg、βlg 5′侧翼区、IGFBP 3、CSN1S2 基因座位的杂合度和DNA多态度分别为0 274 2、0 394 7、0 487 9、0 489 1、0和0 025 5、0 011 6、0 033 3、0 011 2、0。而且,在西安荷斯坦牛群中,κcn、βlg、βlg 5′侧翼区、IGFBP 3 共4 个基因座位均处于Hardy Weinberg平衡状态,CSN1S2 基因座位处于纯合状态。 展开更多
关键词 PCR-RFLP分析 基因座位 遗传多态性 西安 奶牛群 多态信息含量 多态性分析 DNA多态 荷斯坦牛 等位基因 平衡状态 杂合度 纯合
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中国荷斯坦牛IL8基因遗传多态性与泌乳性状以及体细胞评分的关联 被引量：9
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作者 陈仁金 杨章平 +6 位作者 毛永江 陈莹 常玲玲 冀德君 吴海涛 李云龙 李锐 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1256-1262,共7页
以上海某奶牛场30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛为试验材料,采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术对Interleukin-8(IL8)基因的遗传多态性进行了分析,采用混合动物模型分析了IL8基因突变位点与测定日产奶量、测定日乳脂率... 以上海某奶牛场30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛为试验材料,采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术对Interleukin-8(IL8)基因的遗传多态性进行了分析,采用混合动物模型分析了IL8基因突变位点与测定日产奶量、测定日乳脂率、测定日乳蛋白率、305d校正产奶量、305d乳脂量、305d乳蛋白量及测定日体细胞评分7个性状的相关性,寻找可用于生产实际的分子标记。共检测到KK、KA和AA3种基因型,频率分别为0.187、0.451和0.362,等位基因K和A的频率分别为0.412和0.588。该位点突变对测定日产奶量、305d乳蛋白量、305d校正产奶量和305d乳脂量以及体细胞评分影响达到极显著水平(P<0.01),对测定日乳蛋白率的影响达到显著水平(P<0.05),对测定日乳脂率影响不显著(P>0.05)。多重比较表明:KK基因型对测定日产奶量、305d校正产奶量、305d乳蛋白量和305d乳脂量极显著高于AA和KA基因型(P<0.01)。KK基因型的体细胞评分(SCS)最小二乘均值极显著低于KA、AA基因型(P<0.01)。对于测定日的乳蛋白率AA基因型显著低于KA、KK型(P<0.05)。IL8基因遗传突变对中国荷斯坦牛泌乳性状和乳房炎抗性有较大的遗传效应,可用于中国荷斯坦牛的分子标记辅助选择。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 IL8基因 泌乳性状 遗传多态性 PCR-SSCP SCS
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安徽汉族人群15个STR基因座遗传多态性 被引量：13
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作者 杨玉玲 王冬花 +5 位作者 陈玲 侯庆唐 刘忠 方勤 吕蓉 郭晓婕 《法医学杂志》 CAS CSCD 2007年第1期36-38,共3页
关键词 汉族人群 STR基因座 遗传多态性 荧光标记 复合扩增
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绵羊GDF9基因mRNA、DNA和调控区序列克隆及其在11个品种中遗传多态性检测 被引量：8
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作者 潘章源 贺小云 +6 位作者 刘秋月 胡文萍 王翔宇 郭晓飞 曹晓涵 狄冉 储明星 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期1555-1564,共10页
本研究旨在克隆绵羊生长分化因子9（Growth differentiation factor 9,GDF9）基因mRNA、DNA和调控区全序列,并检测其在11个绵羊品种中的遗传多态性,探究GDF9基因与绵羊多羔性状的关系。首先应用RACE和PCR技术克隆GDF9基因全长序列,其次... 本研究旨在克隆绵羊生长分化因子9（Growth differentiation factor 9,GDF9）基因mRNA、DNA和调控区全序列,并检测其在11个绵羊品种中的遗传多态性,探究GDF9基因与绵羊多羔性状的关系。首先应用RACE和PCR技术克隆GDF9基因全长序列,其次利用SNaPshot分型技术检测11个绵羊品种GDF9基因遗传多态性。结果显示,克隆获得GDF9基因mRNA全长1 852bp（GenBank序列号：KR063137）,编码区两侧翼分别具有5′-UTR58bp（1~58nt）和3′-UTR 432bp（1 421~1 852nt）。进一步克隆获得长为2 898bp的DNA序列和2 304bp的调控区序列,分析发现调控区序列比数据库序列（NC_019462.1）多两个长片段。序列比对发现了已知突变G260A（G1）和调控区新突变-2078C〉G。分型结果显示,11个绵羊品种均不含FecGE、FecGH、FecGT、FecGF、FecGV突变,而G260A和-2078C〉G广泛存在于除草原型藏羊外的各绵羊品种中,G260A表现3种基因型（AA、BB和AB）,首次在小尾寒羊和山谷型藏羊中检测到BB型突变纯合子。-2078C〉G也存在3种基因型,基因型结果表明该位点与G260A完全连锁。关联分析结果显示,小尾寒羊AB型产羔数显著高于AA型（P〈0.05）。本研究完善了绵羊GDF9mRNA、DNA和调控区全长序列,为进一步研究GDF9基因功能奠定了基础。同时在不同绵羊品种中发现了G260A和-2078C〉G突变,其中G260A作为潜在的有效遗传标记可用于提高绵羊的产羔数。 展开更多
关键词 绵羊 GDF9基因 mRNA 调控区 遗传多态性
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