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欧洲型PRRSVGD2023株的全长基因序列测定与分析
1
作者
王紫荷
吕丁丁
+5 位作者
闫才杰
韩峰
李铎
李玉博
孙刘妹
张振东
《动物医学进展》
北大核心
2025年第11期17-24,共8页
为了解我国猪繁殖与呼吸综合征病毒1(PRRSV 1)的遗传变异与演化情况,试验使用分段引物对广东省一规模化猪场PRRSV 1的强阳性样品进行全长基因组的扩增、测序与拼接,并与国内外常见参考毒株进行了同源性比对及遗传演化分析。结果表明,GD2...
为了解我国猪繁殖与呼吸综合征病毒1(PRRSV 1)的遗传变异与演化情况,试验使用分段引物对广东省一规模化猪场PRRSV 1的强阳性样品进行全长基因组的扩增、测序与拼接,并与国内外常见参考毒株进行了同源性比对及遗传演化分析。结果表明,GD2023全长基因组为14979 bp(不含poly A),与PRRSV 1及PRRSV 2经典毒株LV、VR2332核苷酸同源性分别为86.7%、60.6%,全长核苷酸遗传进化树分析显示与国内外PRRSV 1毒株处于大的分支,表明GD2023属于PRRSV 1。ORF5遗传进化树分析显示GD2023与PRRSV 1变异株Lena处于同一分支,与SL-01亲缘关系最近。对nsp2与GP5进行氨基酸序列比对分析,结果发现nsp2存在43个氨基酸的缺失(aa289、aa320-360和aa420),缺失模式为1+41+1;GP5蛋白的信号肽、潜在糖基化位点及中和表位均存在不同程度的变异。重组分析显示GD2023未发生任何重组。说明国内PRRSV 1正在发生不同程度的变异与演化,临床上需加强对该类型毒株的关注与监测。
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关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
欧洲型
全基因组测序与分析
遗传与演化
阅读框5
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职称材料
丁型流感病毒在中国的流行状况及研究进展
被引量：
2
2
作者
余界石
魏文康
《广东农业科学》
CAS
2022年第11期1-8,共8页
丁型流感病毒是继甲型、乙型和丙型流感病毒之后的一种新型正粘病毒,2011年首次由美国从表现出流感样症状的猪只中分离出来,并于2016年被国际病毒分类委员会正式命名为丁型流感病毒。目前丁型流感病毒已广泛分布于美洲、亚洲、欧洲和非...
丁型流感病毒是继甲型、乙型和丙型流感病毒之后的一种新型正粘病毒,2011年首次由美国从表现出流感样症状的猪只中分离出来,并于2016年被国际病毒分类委员会正式命名为丁型流感病毒。目前丁型流感病毒已广泛分布于美洲、亚洲、欧洲和非洲的数十个国家。丁型流感病毒利用牛作为其自然宿主和扩增宿主,并定期扩散到其他哺乳动物物种,包括猪、马、羊和骆驼等。因此,丁型流感病毒具有广泛的地域分布和宽泛的宿主范围。丁型流感病毒感染可导致牛患轻度至中度呼吸道疾病,被认为是牛呼吸系统疾病综合征的重要关联因子。血清学证据表明,丁型流感病毒具有感染人的潜在风险。我国研究人员于2014年首次在山东省的牛群中检测到丁型流感病毒,随后,来自不同团队的研究人员分别于2017、2021和2022年报道了丁型流感病毒核酸阳性病例。为更好地了解丁型流感病毒对我国畜牧养殖业的影响,系统综述了丁型流感病毒在我国的分布情况和研究进展,并分析了丁型流感病毒在我国的流行趋势及对我国畜牧养殖业的潜在威胁。
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关键词
丁型流感病毒
流行趋势
遗传与演化
致病与传播
致病性
人畜共患风险
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职称材料
题名
欧洲型PRRSVGD2023株的全长基因序列测定与分析
1
作者
王紫荷
吕丁丁
闫才杰
韩峰
李铎
李玉博
孙刘妹
张振东
机构
江苏科技大学生物技术学院
镇江高等专科学校
扬州大学兽医学院
出处
《动物医学进展》
北大核心
2025年第11期17-24,共8页
基金
江苏省自然科学青年基金项目(BK20201005,BK20220647)。
文摘
为了解我国猪繁殖与呼吸综合征病毒1(PRRSV 1)的遗传变异与演化情况,试验使用分段引物对广东省一规模化猪场PRRSV 1的强阳性样品进行全长基因组的扩增、测序与拼接,并与国内外常见参考毒株进行了同源性比对及遗传演化分析。结果表明,GD2023全长基因组为14979 bp(不含poly A),与PRRSV 1及PRRSV 2经典毒株LV、VR2332核苷酸同源性分别为86.7%、60.6%,全长核苷酸遗传进化树分析显示与国内外PRRSV 1毒株处于大的分支,表明GD2023属于PRRSV 1。ORF5遗传进化树分析显示GD2023与PRRSV 1变异株Lena处于同一分支,与SL-01亲缘关系最近。对nsp2与GP5进行氨基酸序列比对分析,结果发现nsp2存在43个氨基酸的缺失(aa289、aa320-360和aa420),缺失模式为1+41+1;GP5蛋白的信号肽、潜在糖基化位点及中和表位均存在不同程度的变异。重组分析显示GD2023未发生任何重组。说明国内PRRSV 1正在发生不同程度的变异与演化,临床上需加强对该类型毒株的关注与监测。
关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒
欧洲型
全基因组测序与分析
遗传与演化
阅读框5
Keywords
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus
European type
Whole genome sequencing and analysis
Genetics and evolution
ORF5
分类号
S852.651 [农业科学—基础兽医学]
S858.28 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
丁型流感病毒在中国的流行状况及研究进展
被引量：
2
2
作者
余界石
魏文康
机构
广东省农业科学院农业生物基因研究中心/广东省农作物种质资源保存与利用重点实验室
出处
《广东农业科学》
CAS
2022年第11期1-8,共8页
基金
广东省农业科学院科技人才引进专项(R2021YJ-QG008)
广东省农业科学院农业生物基因研究中心创新基金重点项目。
文摘
丁型流感病毒是继甲型、乙型和丙型流感病毒之后的一种新型正粘病毒,2011年首次由美国从表现出流感样症状的猪只中分离出来,并于2016年被国际病毒分类委员会正式命名为丁型流感病毒。目前丁型流感病毒已广泛分布于美洲、亚洲、欧洲和非洲的数十个国家。丁型流感病毒利用牛作为其自然宿主和扩增宿主,并定期扩散到其他哺乳动物物种,包括猪、马、羊和骆驼等。因此,丁型流感病毒具有广泛的地域分布和宽泛的宿主范围。丁型流感病毒感染可导致牛患轻度至中度呼吸道疾病,被认为是牛呼吸系统疾病综合征的重要关联因子。血清学证据表明,丁型流感病毒具有感染人的潜在风险。我国研究人员于2014年首次在山东省的牛群中检测到丁型流感病毒,随后,来自不同团队的研究人员分别于2017、2021和2022年报道了丁型流感病毒核酸阳性病例。为更好地了解丁型流感病毒对我国畜牧养殖业的影响,系统综述了丁型流感病毒在我国的分布情况和研究进展,并分析了丁型流感病毒在我国的流行趋势及对我国畜牧养殖业的潜在威胁。
关键词
丁型流感病毒
流行趋势
遗传与演化
致病与传播
致病性
人畜共患风险
Keywords
influenza D virus
epidemiology
genetics and evolution
pathogenesis and transmission
pathogenicity
zoonotic risk
分类号
S855.3 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
欧洲型PRRSVGD2023株的全长基因序列测定与分析
王紫荷
吕丁丁
闫才杰
韩峰
李铎
李玉博
孙刘妹
张振东
《动物医学进展》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
丁型流感病毒在中国的流行状况及研究进展
余界石
魏文康
《广东农业科学》
CAS
2022
2
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