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新型通用探针LDR分型技术的开发及细胞色素P450基因多位点分型
被引量：
6
1
作者
王刚
李凯
+1 位作者
周宇荀
肖君华
《华东理工大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第4期503-508,共6页
构建了一种可同时对多个位点进行基因分型的新型通用探针连接酶检测方案．与普通的连接酶检测方案相似．具有灵敏度高和特异性强的特点．但降低了50％～90％的探针设计与合成成本。利用该方案对115例正常中国人的细胞色素P450系统的6个...
构建了一种可同时对多个位点进行基因分型的新型通用探针连接酶检测方案．与普通的连接酶检测方案相似．具有灵敏度高和特异性强的特点．但降低了50％～90％的探针设计与合成成本。利用该方案对115例正常中国人的细胞色素P450系统的6个位点进行基因分型．样本测序与基因频率的统计学分析验证了该方案准确可靠。
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关键词
通用探针连接酶检测反应
基因分型
基因多态性
细胞色素P450基因
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职称材料
基于PLP-LDR-HRCA策略进行微量DNA分析——rs17750303位点分型
2
作者
陈宝生
张振
王保捷
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第8期776-782,共7页
增强PCR和全基因组扩增是当前微量DNA分析的主要策略,但是,由于DNA模板量过少,受随机效应影响显著,往往不能得到可靠的DNA分型结果.本文提出一种新的检验策略:PLP-LDR-HRCA,尝试微量DNA检材的SNPs分型研究.选择rs17750303位点,并设计等...
增强PCR和全基因组扩增是当前微量DNA分析的主要策略,但是,由于DNA模板量过少,受随机效应影响显著,往往不能得到可靠的DNA分型结果.本文提出一种新的检验策略:PLP-LDR-HRCA,尝试微量DNA检材的SNPs分型研究.选择rs17750303位点,并设计等位基因特异性锁式探针,采用连接酶检测反应来识别等位基因,而后采用超分支滚环扩增反应来放大检测信号.结果表明,PLP-LDR-HRCA反应特异性好,灵敏度高,能够直接鉴别微量基因组DNA模板中待测SNP位点,rs17750303纯合型样品(AA型或CC型)和杂合型样品(AC型)准确分型所需最少模板量分别为20pg和30pg.对于增强PCR和全基因组扩增技术不能有效检验的微量检材,PLP-LDR-PCR策略独具优势,可能具有较大的开发价值.
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关键词
微量DNA
锁式
探针
连接酶
检测
反应
超分支滚环扩增
单核苷酸多态性
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职称材料
题名
新型通用探针LDR分型技术的开发及细胞色素P450基因多位点分型
被引量：
6
1
作者
王刚
李凯
周宇荀
肖君华
机构
华东理工大学生物工程学院
东华大学生物科学与技术研究所
出处
《华东理工大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第4期503-508,共6页
基金
国家自然科学基金资助(30700529)
文摘
构建了一种可同时对多个位点进行基因分型的新型通用探针连接酶检测方案．与普通的连接酶检测方案相似．具有灵敏度高和特异性强的特点．但降低了50％～90％的探针设计与合成成本。利用该方案对115例正常中国人的细胞色素P450系统的6个位点进行基因分型．样本测序与基因频率的统计学分析验证了该方案准确可靠。
关键词
通用探针连接酶检测反应
基因分型
基因多态性
细胞色素P450基因
Keywords
universal probe ligase detection reaction
genotyping
genetic polymorphism
cytochrome P450
分类号
Q341 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
基于PLP-LDR-HRCA策略进行微量DNA分析——rs17750303位点分型
2
作者
陈宝生
张振
王保捷
机构
河南科技大学法医学院
中国医科大学法医学院
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第8期776-782,共7页
基金
国家自然科学基金项目(No30772460)
高校博士科研启动基金项目(No09001369)资助~~
文摘
增强PCR和全基因组扩增是当前微量DNA分析的主要策略,但是,由于DNA模板量过少,受随机效应影响显著,往往不能得到可靠的DNA分型结果.本文提出一种新的检验策略:PLP-LDR-HRCA,尝试微量DNA检材的SNPs分型研究.选择rs17750303位点,并设计等位基因特异性锁式探针,采用连接酶检测反应来识别等位基因,而后采用超分支滚环扩增反应来放大检测信号.结果表明,PLP-LDR-HRCA反应特异性好,灵敏度高,能够直接鉴别微量基因组DNA模板中待测SNP位点,rs17750303纯合型样品(AA型或CC型)和杂合型样品(AC型)准确分型所需最少模板量分别为20pg和30pg.对于增强PCR和全基因组扩增技术不能有效检验的微量检材,PLP-LDR-PCR策略独具优势,可能具有较大的开发价值.
关键词
微量DNA
锁式
探针
连接酶
检测
反应
超分支滚环扩增
单核苷酸多态性
Keywords
trace DNA
padlock probe
ligase detection reaction
hyper-branched rolling circle amplification
single nucleotide polymorphism
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
新型通用探针LDR分型技术的开发及细胞色素P450基因多位点分型
王刚
李凯
周宇荀
肖君华
《华东理工大学学报（自然科学版）》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于PLP-LDR-HRCA策略进行微量DNA分析——rs17750303位点分型
陈宝生
张振
王保捷
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
0
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职称材料
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