期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
2
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
透明带结合蛋白ZPBP2在公猪睾丸中的表达调控及生物信息学分析
1
作者
张霞
冯彩平
+2 位作者
王瑞
贺莹
王海贞
《四川农业大学学报》
北大核心
2025年第2期435-443,共9页
【目的】研究ZPBP2在滇南小耳猪(Diannan small-eared pig,DSE)中的基因结构和蛋白网络调控特征,探寻其在猪受精过程中的生理功能。【方法】采用RNA测序技术对成年DSE的睾丸进行全转录组测序分析,获得ZPBP2在睾丸中的表达量,分析ZPBP2...
【目的】研究ZPBP2在滇南小耳猪(Diannan small-eared pig,DSE)中的基因结构和蛋白网络调控特征,探寻其在猪受精过程中的生理功能。【方法】采用RNA测序技术对成年DSE的睾丸进行全转录组测序分析,获得ZPBP2在睾丸中的表达量,分析ZPBP2基因结构和蛋白特征;分析氨基酸序列同源性和邻近基因并构建系统进化树;进而挖掘ZPBP2的互作蛋白,并构建蛋白互作网络,进行GO功能注释和KEGG功能富集分析;预测潜在调控的ceRNA并构建调控网络图。【结果】ZPBP2编码区全长981 bp,含有8个外显子以及7个内含子,编码326个氨基酸;二级结构中无规则卷曲的占比最高,含有丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点并且含有信号肽;进化分析表明,ZPBP2在各物种中均具有高度的保守性以及同源性;蛋白互作分析发现ZPBP2与ZP3R、CCT6A、CCT8、ZPBP、CCT3等多种蛋白均存在互作关系;GO与KEGG功能富集分析发现这些蛋白主要富集在受精、精子与透明带的结合、糖解与糖代谢合成以及碳代谢等信号通路上;功能注释发现ZPBP2在免疫球蛋白产生的负向调节、基因表达的昼夜节律调节以及精子与透明带的结合等方面具有重要功能;ceRNA网络图分析表明ZPBP2受ssc-miR-122-5p靶向调控。【结论】ZPBP2基因在DSE受精过程中参与了表达调控,获得的结构特征为进一步研究该基因在猪精子发生过程的功能奠定了基础。
展开更多
关键词
猪
透明带结合蛋白2
精子发生
蛋白
互作
功能注释
在线阅读
下载PDF
职称材料
版纳微型猪近交系 ZPBP2 基因的克隆及生物信息学分析
2
作者
查星琴
成文敏
+3 位作者
李海昌
潘伟荣
霍金龙
黄英
《家畜生态学报》
北大核心
2021年第10期22-26,共5页
为了对版纳微型猪近交系(Banna Minipig Inbred Line,BMI)ZPBP2基因进行克隆及相关生物信息学分析,该研究以BMI睾丸组织为试验材料提取RNA,通过RT-PCR方法扩增获得ZPBP2基因编码区序列,采用在线分析软件进行生物信息学分析。结果表明,ZP...
为了对版纳微型猪近交系(Banna Minipig Inbred Line,BMI)ZPBP2基因进行克隆及相关生物信息学分析,该研究以BMI睾丸组织为试验材料提取RNA,通过RT-PCR方法扩增获得ZPBP2基因编码区序列,采用在线分析软件进行生物信息学分析。结果表明,ZPBP2基因编码蛋白分子量为17.4798 kD,理论等电点为5.63;在氨基酸组成上,碱性氨基酸(Lys+Arg)有14个,酸性氨基酸(Asp+Glu)有19个。在核苷酸相似度上与普通猪相似度最高,与人相似度较低;构建ZPBP2基因系统进化树的结果表明,与BMI遗传距离最近的是非近交系猪,最远是绵羊。该研究结果可为进一步全面分析和研究BMI ZPBP2基因功能及其应用奠定基础。
展开更多
关键词
BMI(版纳微型猪近交系)
透明带结合蛋白2
基因
系统进化分析
生物信息学
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
透明带结合蛋白ZPBP2在公猪睾丸中的表达调控及生物信息学分析
1
作者
张霞
冯彩平
王瑞
贺莹
王海贞
机构
吕梁学院生物与食品工程系
出处
《四川农业大学学报》
北大核心
2025年第2期435-443,共9页
基金
吕梁市引进高层次科技人才计划项目(2023RC26)
山西省高等学校科技创新项目(2021L571)。
文摘
【目的】研究ZPBP2在滇南小耳猪(Diannan small-eared pig,DSE)中的基因结构和蛋白网络调控特征,探寻其在猪受精过程中的生理功能。【方法】采用RNA测序技术对成年DSE的睾丸进行全转录组测序分析,获得ZPBP2在睾丸中的表达量,分析ZPBP2基因结构和蛋白特征;分析氨基酸序列同源性和邻近基因并构建系统进化树;进而挖掘ZPBP2的互作蛋白,并构建蛋白互作网络,进行GO功能注释和KEGG功能富集分析;预测潜在调控的ceRNA并构建调控网络图。【结果】ZPBP2编码区全长981 bp,含有8个外显子以及7个内含子,编码326个氨基酸;二级结构中无规则卷曲的占比最高,含有丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点并且含有信号肽;进化分析表明,ZPBP2在各物种中均具有高度的保守性以及同源性;蛋白互作分析发现ZPBP2与ZP3R、CCT6A、CCT8、ZPBP、CCT3等多种蛋白均存在互作关系;GO与KEGG功能富集分析发现这些蛋白主要富集在受精、精子与透明带的结合、糖解与糖代谢合成以及碳代谢等信号通路上;功能注释发现ZPBP2在免疫球蛋白产生的负向调节、基因表达的昼夜节律调节以及精子与透明带的结合等方面具有重要功能;ceRNA网络图分析表明ZPBP2受ssc-miR-122-5p靶向调控。【结论】ZPBP2基因在DSE受精过程中参与了表达调控,获得的结构特征为进一步研究该基因在猪精子发生过程的功能奠定了基础。
关键词
猪
透明带结合蛋白2
精子发生
蛋白
互作
功能注释
Keywords
pig
ZPBP
2
spermatogenesis
protein interaction
functional annotation
分类号
S828.3 [农业科学—畜牧学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
版纳微型猪近交系 ZPBP2 基因的克隆及生物信息学分析
2
作者
查星琴
成文敏
李海昌
潘伟荣
霍金龙
黄英
机构
云南农业大学动物医学院
云南农业大学动物科学技术学院
云南农业大学云南省动物营养与饲料重点实验室
出处
《家畜生态学报》
北大核心
2021年第10期22-26,共5页
基金
云南省应用基础研究面上项目(2017FB068)。
文摘
为了对版纳微型猪近交系(Banna Minipig Inbred Line,BMI)ZPBP2基因进行克隆及相关生物信息学分析,该研究以BMI睾丸组织为试验材料提取RNA,通过RT-PCR方法扩增获得ZPBP2基因编码区序列,采用在线分析软件进行生物信息学分析。结果表明,ZPBP2基因编码蛋白分子量为17.4798 kD,理论等电点为5.63;在氨基酸组成上,碱性氨基酸(Lys+Arg)有14个,酸性氨基酸(Asp+Glu)有19个。在核苷酸相似度上与普通猪相似度最高,与人相似度较低;构建ZPBP2基因系统进化树的结果表明,与BMI遗传距离最近的是非近交系猪,最远是绵羊。该研究结果可为进一步全面分析和研究BMI ZPBP2基因功能及其应用奠定基础。
关键词
BMI(版纳微型猪近交系)
透明带结合蛋白2
基因
系统进化分析
生物信息学
Keywords
BMI
ZPBP
2
gene
phylogenetic analysis
bioinformatics
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
透明带结合蛋白ZPBP2在公猪睾丸中的表达调控及生物信息学分析
张霞
冯彩平
王瑞
贺莹
王海贞
《四川农业大学学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
版纳微型猪近交系 ZPBP2 基因的克隆及生物信息学分析
查星琴
成文敏
李海昌
潘伟荣
霍金龙
黄英
《家畜生态学报》
北大核心
2021
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
