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人SDCT2基因的两种不同转录产物选择性转录机理分析
被引量：
1
1
作者
白雪源
陈香美
+2 位作者
侯剀
朱晗玉
邱强
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第5期615-622,共8页
为了克隆人高亲和力钠离子依赖性二羧酸转运蛋白 (highaffinitysodium dependentdicarboxylatetransporter,SDCT2 ,或NaDC3)基因并研究其生理功能 ,用大鼠SDCT2基因序列作为电子杂交探针对人EST数据库进行电子筛选 ,得到了一系列与大鼠S...
为了克隆人高亲和力钠离子依赖性二羧酸转运蛋白 (highaffinitysodium dependentdicarboxylatetransporter,SDCT2 ,或NaDC3)基因并研究其生理功能 ,用大鼠SDCT2基因序列作为电子杂交探针对人EST数据库进行电子筛选 ,得到了一系列与大鼠SDCT2序列具有高度同源性的人EST序列 ,将它们拼接成 2个基因重叠群 ,设计特异性PCR引物通过RT PCR扩增得到 2条杂交探针用于筛选人肾cDNA文库 .从肾组织中同时克隆出了人SDCT2基因 2种mRNA变异体的全长cDNA(SDCT2α和SDCT2 β) ,两者 5′端前 3435bp序列完全一致 ,但 3′端长度不同 ,SDCT2 β在第 3435bp以后比SDCT2α多出了 5 85bp的序列 .Northern杂交和RT PCR显示 ,SDCT2α在人肾中的表达丰度最高 ,在肝、脾、胎盘、脑及结肠中也有低水平的表达 .而SDCT2 β主要在肾脏中表达 ,在脾也有低水平的表达 .基因组结构分析表明 ,虽然两种mRNAs均由 13个外显子组成 ,但是SDCT2α的第 13外显子含有 1个poly(A)加尾信号AATAAA ,而SDCT2 β的第 13外显子含有 2个poly(A)加尾信号 .这表明在肾脏和脾脏组织中 ,人SDCT2基因可能通过选择性使用位于第 13外显子不同位置的 2个poly(A)信号而转录出 2种不同长度的mRNA变异体 .
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关键词
SDCT2基因
选择性转录终止
选择性
剪接
转录
产物
变异体
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职称材料
红麻Ms5基因的克隆及多转录本分析
被引量：
3
2
作者
唐向民
金刚
+3 位作者
李刚
周琼
陈鹏
周瑞阳
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期536-540,共5页
为研究Ms5基因在红麻(Hibiscus canabius L.)花药中的转录特征,以L23A不育系为试材,基于已知的红麻Ms5基因5′端cDNA序列,采用3′RACE和RT-PCR技术对该基因全长cDNA序列进行克隆。序列比对分析结果表明,红麻花药组织中同时存在Ms5基因2...
为研究Ms5基因在红麻(Hibiscus canabius L.)花药中的转录特征,以L23A不育系为试材,基于已知的红麻Ms5基因5′端cDNA序列,采用3′RACE和RT-PCR技术对该基因全长cDNA序列进行克隆。序列比对分析结果表明,红麻花药组织中同时存在Ms5基因2种不同的转录本,其长度分别为972和1 105bp,依次命名为HcMs5-α和HcMs5-β。这2种转录本均包含了完整且一致的编码序列,其编码序列(CDS)全长为858bp,预测编码的蛋白质含有285个氨基酸残基,分子质量为32.4ku,理论等电点为7.62;两者5′端前972bp序列完全一致,但3′端的非编码区(UTR)长度有所不同,HcMs5-β在第972bp以后比HcMs5-α多出133bp的序列,具有选择性转录终止的特征。这种转录终止信号的可选择性可能与该基因转录后水平的调控有关。
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关键词
红麻
Ms5基因
3′RACE
多
转录
本
选择性转录终止
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职称材料
题名
人SDCT2基因的两种不同转录产物选择性转录机理分析
被引量：
1
1
作者
白雪源
陈香美
侯剀
朱晗玉
邱强
机构
中国人民解放军总医院军医进修学院
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第5期615-622,共8页
基金
国家重点基础研究发展规划项目 ( 973 ) (No.G2 0 0 0 0 5 70 0 3 )
国家自然科学基金 (No.3 0 0 70 2 88
+1 种基金
No .3 0 12 10 0 5
No .3 0 2 70 5 0 5 )资助
文摘
为了克隆人高亲和力钠离子依赖性二羧酸转运蛋白 (highaffinitysodium dependentdicarboxylatetransporter,SDCT2 ,或NaDC3)基因并研究其生理功能 ,用大鼠SDCT2基因序列作为电子杂交探针对人EST数据库进行电子筛选 ,得到了一系列与大鼠SDCT2序列具有高度同源性的人EST序列 ,将它们拼接成 2个基因重叠群 ,设计特异性PCR引物通过RT PCR扩增得到 2条杂交探针用于筛选人肾cDNA文库 .从肾组织中同时克隆出了人SDCT2基因 2种mRNA变异体的全长cDNA(SDCT2α和SDCT2 β) ,两者 5′端前 3435bp序列完全一致 ,但 3′端长度不同 ,SDCT2 β在第 3435bp以后比SDCT2α多出了 5 85bp的序列 .Northern杂交和RT PCR显示 ,SDCT2α在人肾中的表达丰度最高 ,在肝、脾、胎盘、脑及结肠中也有低水平的表达 .而SDCT2 β主要在肾脏中表达 ,在脾也有低水平的表达 .基因组结构分析表明 ,虽然两种mRNAs均由 13个外显子组成 ,但是SDCT2α的第 13外显子含有 1个poly(A)加尾信号AATAAA ,而SDCT2 β的第 13外显子含有 2个poly(A)加尾信号 .这表明在肾脏和脾脏组织中 ,人SDCT2基因可能通过选择性使用位于第 13外显子不同位置的 2个poly(A)信号而转录出 2种不同长度的mRNA变异体 .
关键词
SDCT2基因
选择性转录终止
选择性
剪接
转录
产物
变异体
Keywords
SDCT2 gene,alternative transcription termination,alternative splicing, transcript, variant
分类号
Q493.8 [生物学—生理学]
Q735 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
红麻Ms5基因的克隆及多转录本分析
被引量：
3
2
作者
唐向民
金刚
李刚
周琼
陈鹏
周瑞阳
机构
广西大学农学院
广西亚热带作物研究所
广西药用植物园
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期536-540,共5页
基金
现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-19-E16)
文摘
为研究Ms5基因在红麻(Hibiscus canabius L.)花药中的转录特征,以L23A不育系为试材,基于已知的红麻Ms5基因5′端cDNA序列,采用3′RACE和RT-PCR技术对该基因全长cDNA序列进行克隆。序列比对分析结果表明,红麻花药组织中同时存在Ms5基因2种不同的转录本,其长度分别为972和1 105bp,依次命名为HcMs5-α和HcMs5-β。这2种转录本均包含了完整且一致的编码序列,其编码序列(CDS)全长为858bp,预测编码的蛋白质含有285个氨基酸残基,分子质量为32.4ku,理论等电点为7.62;两者5′端前972bp序列完全一致,但3′端的非编码区(UTR)长度有所不同,HcMs5-β在第972bp以后比HcMs5-α多出133bp的序列,具有选择性转录终止的特征。这种转录终止信号的可选择性可能与该基因转录后水平的调控有关。
关键词
红麻
Ms5基因
3′RACE
多
转录
本
选择性转录终止
Keywords
kenaf（Hibiscus canabius L. ）
Ms5 gene
3＇RACE
multiple transcript
alternative ter-mination
分类号
S563.5 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人SDCT2基因的两种不同转录产物选择性转录机理分析
白雪源
陈香美
侯剀
朱晗玉
邱强
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
红麻Ms5基因的克隆及多转录本分析
唐向民
金刚
李刚
周琼
陈鹏
周瑞阳
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
3
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职称材料
已选择
0
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引证文献
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