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茶籽象ATP合成酶基因在不同海拔选择压力下的遗传分化及结构变异 被引量:4
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作者 张守科 方林鑫 +6 位作者 刘亚宁 王毅 张威 舒金平 张亚波 汪阳东 王浩杰 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第6期65-73,共9页
【目的】基于不同地区茶籽象线粒体ATP合成酶基因遗传分化及结构变异,研究环境压力尤其是海拔对茶籽象不同地理种群遗传多样性及系统发育关系的影响,探讨ATP合成酶基因在适应环境压力中碱基及氨基酸序列结构变化规律,为茶籽象防控提供... 【目的】基于不同地区茶籽象线粒体ATP合成酶基因遗传分化及结构变异,研究环境压力尤其是海拔对茶籽象不同地理种群遗传多样性及系统发育关系的影响,探讨ATP合成酶基因在适应环境压力中碱基及氨基酸序列结构变化规律,为茶籽象防控提供理论依据。【方法】采集不同地理海拔油茶产区的茶籽象种群,设计ATP合成酶基因特异性引物,PCR扩增获取ATP基因,基于ATP基因应用相关分析软件分析碱基序列遗传多样性及系统发育关系,分析氨基酸序列结构差异及氨基酸使用频率。【结果】获得32个单倍型(NCBI: MH560360—MH560391),其中存在5个共享单倍型,包含个体数2~36不等;茶籽象各地理种群遗传多样性分化无明显规律(核酸多样性π为0.000 86 ~ 0.048 03),茶籽象种群扩张不明显(Tajima’s D < 0,P > 0.05;Fu’s Fs > 0);依据地理海拔,茶籽象种群可显著聚为低海拔和高海拔2个分支,2个分支间受到显著的环境正选择(选择系数:高海拔ω=1.65,低海拔ω=2.26,LRTP<0.001),分化明显( F st =0.374,P < 0.001);低海拔分支 ATP[STBX]8[STBZ]编码解氨基酸序列(36个保守位点)较高海拔分支(27个保守位点)更为保守,且高海拔分支酸性氨基酸使用率较高,这可能与昆虫为适应高海拔而增加蛋白稳定性、提高氧结合效率以及氧化呼吸效率有关。【结论】茶籽象种群ATP合成酶基因分化程度不高,但存在对海拔明显的适应性进化。 展开更多
关键词 茶籽象 ATP合成酶基因 遗传分化 系统发育 海拔 选择压力
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高选择压力下蛤仔奶牛蛤品系两个世代连续选择的选择反应和现实遗传力
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作者 李冬春 闫喜武 +3 位作者 霍忠明 姚托 孙欣 张国范 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期5-10,共6页
以1%为选择压力,以壳长为选择指标,对菲律宾蛤仔Ruditapes philippinarum奶牛蛤品系进行了两个世代的连续混合选择,并跟踪测量了各试验组在不同生长阶段的壳长,计算了选择反应、现实遗传力和遗传获得等遗传参数。结果表明:在奶牛蛤两个... 以1%为选择压力,以壳长为选择指标,对菲律宾蛤仔Ruditapes philippinarum奶牛蛤品系进行了两个世代的连续混合选择,并跟踪测量了各试验组在不同生长阶段的壳长,计算了选择反应、现实遗传力和遗传获得等遗传参数。结果表明:在奶牛蛤两个世代的各个生长阶段,选择组的平均壳长均大于对照组;F2和F3世代的选择反应在幼虫培育期、稚贝培育期和幼贝养成期的平均值分别为1.98、0.72、0.64和1.10、0.68、0.74,总平均值分别为1.19和0.90;F2和F3世代的现实遗传力在幼虫期、稚贝期和幼贝期的平均值分别为0.43、0.16、0.14和0.41、0.26、0.28,总平均值分别为0.26和0.34;F2和F3世代的遗传获得在幼虫期、稚贝期和幼贝期的平均值分别为4.79%、17.81%、13.27%和5.60%、4.28%、16.30%,总平均值分别为10.78%和7.94%;F2和F3世代的总遗传获得在幼虫期、稚贝期和幼贝期的平均值分别为10.73%、15.56%、29.34%,总平均值为16.59%。研究表明,在高选择压力下进行两个世代蛤仔连续混合选择的方法获得的选育效果较为理想,且该群体仍具有一定的改良潜力。 展开更多
关键词 蛤仔 选择压力 选择反应 现实遗传力 遗传获得
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哺乳动物乙酰胆碱酯酶的结构预测与选择压力检测
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作者 朱红霞 胡利宗 +1 位作者 任敏 邓小莉 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期133-136,共4页
乙酰胆碱酯酶(AChE)是一种丝氨酸水解酶,是哺乳动物神经传导中的关键性酶。为研究不同哺乳动物AChE基因在进化过程中是否发生了适应性进化,基于位点模型与分支位点模型对哺乳动物11条AChE蛋白序列所受到的选择压力进行了检测,并模建了... 乙酰胆碱酯酶(AChE)是一种丝氨酸水解酶,是哺乳动物神经传导中的关键性酶。为研究不同哺乳动物AChE基因在进化过程中是否发生了适应性进化,基于位点模型与分支位点模型对哺乳动物11条AChE蛋白序列所受到的选择压力进行了检测,并模建了绒猴的蛋白结构。结果表明:11个哺乳动物AChE蛋白中,几乎所有的分支和位点均处于强烈的负选择压力下;在所有分枝中,位点模型鉴定了1个共同的正选择位点Ala389;此外,分支位点模型鉴定了绒猴分支中的Tyr285和Glu392处于正选择压力,发生了适应性进化。最后,将3个正选择位点定位在绒猴AChE蛋白的立体结构中,为直观观察与分析蛋白适应性进化位点提供了便捷,为进一步功能分析AChE活性位点提供了线索。 展开更多
关键词 哺乳动物 乙酰胆碱酯酶 选择压力 结构预测
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高粱·玉米核及细胞器基因核苷酸替代率与选择压力关系分析
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作者 唐萍 彭程 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第17期8854-8858,共5页
[目的]探讨选择压力与核苷酸替代率的关系。[方法]采用统计学方法分析高粱、玉米中部分核基因、细胞器基因的同义替代率、非同义替代率以及二者之间的比值,并对一些相关功能基因进行对比分析。[结果]相关功能基因在核与叶绿体中所受的... [目的]探讨选择压力与核苷酸替代率的关系。[方法]采用统计学方法分析高粱、玉米中部分核基因、细胞器基因的同义替代率、非同义替代率以及二者之间的比值,并对一些相关功能基因进行对比分析。[结果]相关功能基因在核与叶绿体中所受的纯化选择压力相近,在线粒体中则较低。高粱、玉米核同源基因间及核中不同功能基因间核苷酸替代的差异主要由非同义替代的差异造成。[结论]选择压力影响不同功能基因、不同物种的分子进化速率,而核与细胞器基因间进化速率的差异与选择压力间并无直接联系。 展开更多
关键词 核基因 细胞器基因 核苷酸替代 选择压力
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韭菜迟眼蕈蚊对2种常用杀虫剂的选择压力及抗性回复 被引量:4
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作者 李照诺 徐维红 +3 位作者 许静杨 陈俊荣 胡霞 谷希树 《山东农业科学》 2015年第7期98-100,共3页
采用药液滴定法检测韭菜迟眼蕈蚊3龄幼虫对辛硫磷和吡虫啉的抗药性水平。结果表明:韭菜迟眼蕈蚊田间种群对辛硫磷、吡虫啉均产生不同程度的抗药性,对辛硫磷的抗性水平明显高于吡虫啉;经脱毒饲养,韭菜迟眼蕈蚊对辛硫磷和吡虫啉的抗性水... 采用药液滴定法检测韭菜迟眼蕈蚊3龄幼虫对辛硫磷和吡虫啉的抗药性水平。结果表明:韭菜迟眼蕈蚊田间种群对辛硫磷、吡虫啉均产生不同程度的抗药性,对辛硫磷的抗性水平明显高于吡虫啉;经脱毒饲养,韭菜迟眼蕈蚊对辛硫磷和吡虫啉的抗性水平均有不同程度的下降,辛硫磷相对更为敏感。 展开更多
关键词 韭菜迟眼蕈蚊 杀虫剂 选择压力 抗药性 抗性回复
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微波压力浸提离子选择性电极法快速测定饲料中微量氟的研究 被引量:1
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作者 高向阳 王翠 +1 位作者 李淑芬 张洪 《中国饲料》 北大核心 2002年第1期33-34,共2页
离子选择性电极法测定饲料中的氟具有干扰少、选择性好、线件范围宽等特点,但目前所用的分析方法样品浸提时间长、速度慢且样品易粘附于瓶壁。
关键词 饲料检验 微量元素 氟元素 微波压力浸提离子选择性电极法
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中小城镇天然气配气管网的压力级别选择
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作者 孔川 《天然气工业》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第1期152-156,共5页
中小城镇是我国当前天然气利用快速发展的区域,工程设计中其天然气管网多采用中压A级配气管网,而忽略了中压B级管网具有的特性。为此,比较了中压B级和中压A级管道的爆破能量比和泄漏质量流量比,分析了压能转移利用的贡献,对中压A级管道... 中小城镇是我国当前天然气利用快速发展的区域,工程设计中其天然气管网多采用中压A级配气管网,而忽略了中压B级管网具有的特性。为此,比较了中压B级和中压A级管道的爆破能量比和泄漏质量流量比,分析了压能转移利用的贡献,对中压A级管道所需的最小街道宽度进行了定量分析,论证了中压B级管道的适用性。进而用虚拟环网覆盖中小城镇供气区域,推导出等流速工况下中压天然气配气管网管径表达式,计算了相同管网构成时不同供气规模、不同最大管路长度时,中压B级管网与中压A级管网的管材耗量比。结果表明:中小城镇天然气配气管网采用中压B级比采用中压A级投资增加20%以上,经济性相对较差;但中压B级在压力安全和敷设条件方面却具有明显的优势。因此对于老城古镇等区域较窄的街道,要考虑各种方案并综合决策。结论认为:中压B级配气管网在中小城镇的应用具有广阔的前景。 展开更多
关键词 中小城镇 天然气 配气管网 中压B级管道 压力安全 中压A级管道 压力级别选择
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发电引水隧洞压力状态选择探讨
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作者 邵莉芳 黄保冲 《中国高新技术企业》 2016年第20期125-127,共3页
引水建筑物在引水式电站中所占投资比例较大,发电引水隧洞是引水式电站较为简单和常用的引水建筑物,因而发电引水隧洞型式选择对引水建筑物乃至工程布置、工程投资及效益影响较大。文章分析了发电引水隧洞压力状态对引水建筑物和工程布... 引水建筑物在引水式电站中所占投资比例较大,发电引水隧洞是引水式电站较为简单和常用的引水建筑物,因而发电引水隧洞型式选择对引水建筑物乃至工程布置、工程投资及效益影响较大。文章分析了发电引水隧洞压力状态对引水建筑物和工程布置的影响。 展开更多
关键词 发电引水隧洞 压力状态选择 引水建筑物 引水式电站 工程布置 工程投资
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脊椎动物TYR基因的序列特征与正选择位点鉴定 被引量:5
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作者 李青芝 陈宇旭 +1 位作者 周琳 胡利宗 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第23期131-137,共7页
酪氨酸酶是一种含铜金属酶,它广泛存在于各种生物中,是黑色素生物合成的关键酶。利用生物信息学手段详细剖析了脊椎动物TYR基因的序列和进化特性,并模拟了其蛋白的三位结构。系统发生研究显示,脊椎动物TYR基因与物种进化关系之间具有较... 酪氨酸酶是一种含铜金属酶,它广泛存在于各种生物中,是黑色素生物合成的关键酶。利用生物信息学手段详细剖析了脊椎动物TYR基因的序列和进化特性,并模拟了其蛋白的三位结构。系统发生研究显示,脊椎动物TYR基因与物种进化关系之间具有较高的一致性。基因结构分析表明,绝大多数脊椎动物TYR基因有5个外显子,但Dr TYR和Ol TYR有6个外显子,而Ss TYR有9个外显子。蛋白序列特征分析显示,脊椎动物TYR蛋白均具有典型的TYROSINASE结构域,但不同物种具有特异的保守基序组织模式,其中保守基序13是哺乳类动物TYR蛋白所特有的。位点模型没有检测出正选择位点,但分支位点模型已经检测出马与猪的祖先支(26个正选择位点)、猪进化分支(27个正选择位点)以及斑胸草雀与鸡的祖先支(1个正选择位点)均经历了适应性进化。这些正选择位点虽然被定位于不同二级结构内,但在三维结构中它们分布在相对集中的区域内,很可能与特定功能密切相关。 展开更多
关键词 脊椎动物 酪氨酸酶 序列 选择压力 结构建模
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近年湖南省猪圆环病毒2型感染状况的调查及遗传演化分析
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作者 范杰 邰易润 +7 位作者 朱艳丽 陈志雄 胡巧云 陈智 刘甜甜 李欣 范仲鑫 葛猛 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第3期1376-1385,共10页
本研究旨在掌握近期湖南省各地区猪圆环病毒2型(PCV2)最新的感染和遗传演化情况。本研究运用qPCR方法对2021-2023年采集自湖南省长沙市、岳阳市、怀化市、常德市、株洲市等14个地级市的1244份肥猪的淋巴结、拭子、脑组织及血样通过qPCR... 本研究旨在掌握近期湖南省各地区猪圆环病毒2型(PCV2)最新的感染和遗传演化情况。本研究运用qPCR方法对2021-2023年采集自湖南省长沙市、岳阳市、怀化市、常德市、株洲市等14个地级市的1244份肥猪的淋巴结、拭子、脑组织及血样通过qPCR进行了病毒核酸检测,筛选出PCV2阳性样品,再通过PCR扩增及测序对PCV2的ORF2基因序列进行分析。结果显示,1244份样品中有778份为PCV2阳性,总阳性率达62.54%,其中邵阳市的PCV2阳性率最高,达92.55%(87/94),郴州市最低,为18.28%(17/93);57株PCV2 ORF2基因测序结果表明,PCV2a、PCV2b和PCV2d占比分别为12.28%、7.02%和80.70%;测序毒株间的ORF2基因核苷酸、氨基酸序列相似性分别为88.5%~100.0%和86.3%~100.0%,存在45个氨基酸差异位点,PCV2d间存在15个差异氨基酸位点,选择压力分析表明,PCV2存在3个阳性选择位点。研究表明:目前,PCV2的突变速率较快,各毒株之间存在较多的氨基酸位点差异,与既往报道相同,本研究中PCV2d已成为绝对优势的流行毒株,PCV2的这些变异可能使现有疫苗保护效果减弱,应予以重视。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 分子流行病学调查 遗传变异 ORF2基因 选择压力
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疫苗免疫压力下新城疫病毒的动态演化 被引量:11
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作者 秦卓明 徐怀英 +3 位作者 刘玉山 黄兵 李玉峰 黄迪海 《中国兽药杂志》 2013年第2期1-6,共6页
国内大量新城疫病毒(NDV)血凝素基因F和HN的测序表明,NDV主要免疫原HN和F基因与生产中广泛应用的经典疫苗La Sota株的核苷酸同源性不足80%,而NDV流行株之间则高达94.4%~100%,从分子遗传学角度证实了VIId型NDV是导致新城疫免疫失败的重... 国内大量新城疫病毒(NDV)血凝素基因F和HN的测序表明,NDV主要免疫原HN和F基因与生产中广泛应用的经典疫苗La Sota株的核苷酸同源性不足80%,而NDV流行株之间则高达94.4%~100%,从分子遗传学角度证实了VIId型NDV是导致新城疫免疫失败的重要原因。HI交叉抑制和鸡胚中和试验等则从抗原性的角度证实了NDV在免疫压力下抗原性的变化,尽管NDV不同毒株间抗原性变异的程度已出现明显差异,但仍局限在同一个血清型中。 展开更多
关键词 新城疫病毒 免疫选择压力 演化
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巨猿、化石人和智人牙齿的波动不对称:人类进化中压力源变化的意义(英文)
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作者 Michael J. Frederick Gordon G. Gallup Jr 《心理学报》 CSSCI CSCD 北大核心 2007年第3期489-494,共6页
波动不对称(FA)是压力的随机性引发双侧完美对称偏离的现象,这是个体无力免受发展中不利因素(如早期营养不良)侵害的一个标志。比较个体口腔两侧牙齿的大小是一种测量 FA 的方法。本研究汇集了 10 个物种共 296 名个体的牙齿测量结果,... 波动不对称(FA)是压力的随机性引发双侧完美对称偏离的现象,这是个体无力免受发展中不利因素(如早期营养不良)侵害的一个标志。比较个体口腔两侧牙齿的大小是一种测量 FA 的方法。本研究汇集了 10 个物种共 296 名个体的牙齿测量结果,测量对象包括黑猩猩(学名 Pan troglodytes)、猩猩(学名Pongo pygmaeus)、大猩猩(学名 Gorilla gorilla)、智人(学名 Homo sapiens),以及许多化石人。分析发现,猩猩样本牙齿的 FA 水平要显著低于大猩猩、黑猩猩、直立人、尼安德特人和智人样本的 FA 水平。而与之相反的是,智人与尼安德特人样本的牙齿 FA 水平要显著高于其它任何一种巨猿样本的 FA 水平。该文提出了有关缓和的选择压力的解释。 展开更多
关键词 波动对称 选择压力 化石人
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野生稻CBF/DREB1转录因子的鉴定与生物信息学分析 被引量:1
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作者 霍晨敏 袁敏 +1 位作者 张宝文 王瑞菊 《草业学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期126-144,共19页
低温冷害是限制栽培稻地域分布和产量的重要因素之一,严重影响我国的粮食安全。以CBF/DREB1为核心的C-重复结合因子-冷调节基因(CBF-COR)途径是水稻适应低温的重要信号传导途径。基于稻属9种植物的全基因测序结果和隐马尔可夫模型(HMM)... 低温冷害是限制栽培稻地域分布和产量的重要因素之一,严重影响我国的粮食安全。以CBF/DREB1为核心的C-重复结合因子-冷调节基因(CBF-COR)途径是水稻适应低温的重要信号传导途径。基于稻属9种植物的全基因测序结果和隐马尔可夫模型(HMM)搜索,共鉴定出71个CBF/DREB1基因序列。所有基因均无内含子,由单个外显子组成。大部分DREB1s呈弱酸性,所有DREB1s亲水性平均值<0。进化树分析进一步将其分为3个组:DREB1A/1B/1H、DREB1C/1E/1F/1G和DREB1D/1I/1J,各组成员除AP2保守结构域和侧翼序列外,其他保守基序组成差别较大。适应性进化分析粳亚种和其他水稻的直系同源基因对,发现OsDREB1A/ObDREB1A、OsDREB1D/OnDREB1D、OsDREB1I/OsIDREB1I和OsDREB1J/OsIDREB1J四对基因非同义替换/同义替换(Ka/Ks)值均>1,受到正选择压力。旁系同源基因之间启动子顺式元件种类和数量差异较大,直系同源基因的启动子顺式元件种类和数量很相似。对日本晴、93-11和东乡野生稻7 d幼苗4℃冷处理2 h的实时荧光定量PCR分析发现早期冷响应基因可分为激活型(DREB1A/1B/1C/1E/1F/1G/1H)和抑制型(DREB1D/1I/1J)。在日本晴、93-11和东乡野生稻冷激活型基因中,DREB1B/1G/1H均是冷处理后响应最快的一级冷响应因子,且启动子均含有至少一个拷贝的CAMTA转录因子结合元件CM2(CCGCGT)。OrDREB1B/1C/1E/1F/1G/1H在东乡野生稻4℃冷处理4 h后的表达量均高于栽培稻同源基因的表达量。9种稻属植物的CBF/DREB1基因亚家族的分子进化分析结果为低温抗性基因的挖掘和利用提供了前期基础。 展开更多
关键词 野生稻 CBF/DREB1 保守基序 选择压力 启动子分析
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20种千屈菜科植物rbcL基因密码子使用偏好性分析 被引量:6
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作者 郑钢 顾翠花 +1 位作者 林琳 王杰 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期476-484,共9页
【目的】分析千屈菜科Lythraceae植物rbcL基因密码子使用特性,明确密码子偏好性的影响因素,筛选rbcL基因异源表达和遗传转化的合适受体。【方法】从美国国家生物技术信息中心(NCBI)获取20种千屈菜科植物的rbcL基因全长编码区序列(CDS)数... 【目的】分析千屈菜科Lythraceae植物rbcL基因密码子使用特性,明确密码子偏好性的影响因素,筛选rbcL基因异源表达和遗传转化的合适受体。【方法】从美国国家生物技术信息中心(NCBI)获取20种千屈菜科植物的rbcL基因全长编码区序列(CDS)数据,运用CodonW、EMBOSS和DAMBE软件获取基因碱基组成和密码子使用偏好性的相关参数,分析该类植物叶绿体rbcL基因使用密码子的偏倚性及其影响因素。【结果】千屈菜科植物rbcL基因GC含量(GC)为0.425~0.437,密码子第3位碱基GC含量(GC3s)为0.275~0.300。GC3s、GC与有效密码子数(ENC)显著相关(P<0.01);ENC-GC3s散点图分析、中性绘图分析、奇偶偏差分析均表明:相较于突变压力,自然选择压力对千屈菜科植物rbcL基因密码子使用偏好性的影响更大。基于同义密码子相对使用度的系统聚类与CDS邻接树结果部分一致。与千屈菜科rbcL基因密码子平均使用频率相比,大肠埃希菌Escherichia coli、酵母Saccharomyces cerevisiae、拟南芥Arabidopsis thaliana、烟草Nicotiana tabacum和番茄Solanum lycopersicum分别存在28、26、20、19和17个使用频率相差较大的密码子。【结论】千屈菜科植物rbcL基因碱基组成上更倾向于选择A/T碱基,且偏好使用末端A/T碱基的密码子;rbcL基因密码子使用偏好性受多种因素共同作用,但自然选择压力是最主要因素;密码子偏好性的系统聚类可为系统发育研究提供补充;酵母更适合作为千屈菜科植物rbcL基因异源表达受体,番茄更适合作为rbcL基因遗传转化和功能研究的受体材料。 展开更多
关键词 碱基组成 选择压力 突变压力 聚类分析 受体
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玉米不同基因型对氮营养胁迫的反应 被引量:27
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作者 向春阳 常强 +3 位作者 马兴林 关义新 凌碧莹 张宝石 《黑龙江八一农垦大学学报》 2002年第4期5-7,共3页
在低氮土壤上,对7个玉米基因型的氮胁迫反应进行了研究。结果表明,不同玉米基因型对氮胁迫反应存在明显的差异。在缺氮条件下,地上部干重、籽粒产量和吸氮量都呈下降趋势,但敏感基因型下降幅度比迟钝基因型大。耐低氮能力差的品种对氮... 在低氮土壤上,对7个玉米基因型的氮胁迫反应进行了研究。结果表明,不同玉米基因型对氮胁迫反应存在明显的差异。在缺氮条件下,地上部干重、籽粒产量和吸氮量都呈下降趋势,但敏感基因型下降幅度比迟钝基因型大。耐低氮能力差的品种对氮肥反应敏感。试验鉴定出京科132和农大108不仅耐低氮能力强,而且在缺氮和正常供氮条件下,地上部干重和籽粒产量都较高,是进行玉米耐氮胁迫遗传育种研究的良好材料。 展开更多
关键词 玉米 基因型 氮营养胁迫 选择压力 抗逆遗传育种
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杜兰落花生球蛋白基因家族的生物信息学分析 被引量:5
16
作者 陈湘瑜 徐日荣 +1 位作者 陈昊 唐兆秀 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期391-398,共8页
为了解球蛋白基因家族在杜兰落花生(Arachis duranensis)种子中的特征,利用生物信息学方法对杜兰落花生球蛋白基因进行全基因组鉴定及表达模式分析。结果表明,杜兰落花生含有9个球蛋白基因,家族成员间理化特性总体差异不大,亲缘关系相... 为了解球蛋白基因家族在杜兰落花生(Arachis duranensis)种子中的特征,利用生物信息学方法对杜兰落花生球蛋白基因进行全基因组鉴定及表达模式分析。结果表明,杜兰落花生含有9个球蛋白基因,家族成员间理化特性总体差异不大,亲缘关系相近的蛋白具有相似的保守基序组成。根据物种间的球蛋白系统进化树,球蛋白进化关系符合物种之间的亲缘关系。杜兰落花生球蛋白在进化过程中较为保守,受纯化选择主导,但在部分进化枝上存在正选择位点。栽培种花生转录组数据分析表明,15个花生球蛋白基因在花生种子中检测到表达,其中4个表达量远超其它成员,在花生荚果成熟后期表达量仍较高。 展开更多
关键词 杜兰落花生 球蛋白基因家族 生物信息 系统发育 选择压力 表达模式
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野生花生全基因组抗病相关LOX基因的生物信息学分析 被引量:4
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作者 宋辉 赵术珍 +4 位作者 侯蕾 乔善良 赵传志 李爱芹 王兴军 《山东农业科学》 2015年第10期1-7,共7页
脂肪氧合酶(lipoxygenases,LOX)是生物体内一种重要的双加氧酶,其在植物发育以及响应生物和非生物胁迫时发挥重要作用。本研究从 Arachis duranensis 和 Arachis ipaёnsis 两个野生花生基因组中各鉴定出18个 LOX 基因,分别命名为 ... 脂肪氧合酶(lipoxygenases,LOX)是生物体内一种重要的双加氧酶,其在植物发育以及响应生物和非生物胁迫时发挥重要作用。本研究从 Arachis duranensis 和 Arachis ipaёnsis 两个野生花生基因组中各鉴定出18个 LOX 基因,分别命名为 AdLOX1~18和 AiLOX1~18。在 AdLOX5、AdLOX7、AiLOX8和 AiLOX18基因的CDS 序列中发现提前终止翻译的终止密码子,而 AiLOX9基因的 CDS 序列过短,推测这些基因可能是假基因。染色体定位结果显示,AdLOX 和 AiLOX 基因主要分布在2、3、6、8、9和10号染色体上,且其直系同源基因分布在两套染色体相同或相近的位置。通过分析 AdLOX 和 AiLOX 基因与已知功能 LOX 基因的亲缘关系发现,Ad-LOX6、AdLOX9、AdLOX11、AdLOX12、AdLOX17、AiLOX1、AiLOX4、AiLOX6、AiLOX16和 AiLOX17基因可能参与花生的抗病过程,启动子分析结果也支持这一结论。基因选择压力研究表明,AdLOX 和 AiLOX 基因在进化历程中受到纯化选择。 展开更多
关键词 野生花生 LOX 基因家族 抗病 系统发育 选择压力
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卡那霉素对紫花苜蓿愈伤组织诱导和分化的影响 被引量:2
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作者 张丽 买合木提 玉永雄 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第28期8835-8836,共2页
[目的]研究紫花苜蓿叶片在诱导愈伤组织阶段、愈伤组织分化阶段对卡那霉素的敏感程度。[方法]确定卡那霉素对紫花苜蓿叶片愈伤组织形成的影响,并在形成愈伤组织的基础上,进一步确定卡那霉素对愈伤组织分化的影响。[结果]不同浓度的卡那... [目的]研究紫花苜蓿叶片在诱导愈伤组织阶段、愈伤组织分化阶段对卡那霉素的敏感程度。[方法]确定卡那霉素对紫花苜蓿叶片愈伤组织形成的影响,并在形成愈伤组织的基础上,进一步确定卡那霉素对愈伤组织分化的影响。[结果]不同浓度的卡那霉素对紫花苜蓿叶片诱导愈伤与分化均有一定的抑制作用,而且随浓度升高,抑制作用增强;卡那霉素对愈伤组织分化阶段的敏感程度比诱导愈伤阶段高;分化阶段选择压力要控制在25 mg/L以下;延迟加入卡那霉素或在分化阶段降低卡那霉素浓度是对筛选转化苗的可取办法。[结论]该研究为利用农杆菌介导法转化紫花苜蓿奠定了基础。 展开更多
关键词 紫花苜蓿 卡那霉素 选择压力 遗传转化
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分歧多于保守:人、小鼠、大鼠和猪中klf家族进化分析 被引量:2
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作者 杨红文 陈知龙 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期508-514,共7页
为研究人、猪、大鼠、小鼠中klf家族的进化特征,笔者用Clustal X和MEGA,在线软件GSGD,K es-timator和PAML,在线软件MEME\MAST和InterProScan,PSORT II分别构建进化亲缘关系树、分析基因结构、鉴定选择压力、注释蛋白质模体和确定核定位... 为研究人、猪、大鼠、小鼠中klf家族的进化特征,笔者用Clustal X和MEGA,在线软件GSGD,K es-timator和PAML,在线软件MEME\MAST和InterProScan,PSORT II分别构建进化亲缘关系树、分析基因结构、鉴定选择压力、注释蛋白质模体和确定核定位信号。结果显示:进化亲缘树及基因结构分析都将KLF家族分为α,β,γ,δ和ε5个亚类,亚类内各基因结构相似,家族各成员基因随机分布于不同染色体,klf1和klf2紧密簇集,猪klf17定位于6号染色体而非15号染色体,猪的两对旁系同源基因:klf9和klf9a,klf10和klf10a,及相似家族成员klf1和klf2,分别起源于近期和远期的基因串联复制事件;适应性进化选择压力分析表明,klf13和klf17经历了正选择,其他基因都受到严格的负选择作用;KLF蛋白羧基端都有3个高度保守的串联锌指结构,核定位信号(NLS)位于3串联锌指内或其紧邻上游,氨基端模体则相对多样化,KLF3,KLF4,KLF8和KLF12以其共有的PVDLS/T模体(单字母氨基酸缩写)结合转录辅因子CtBP(C-terminus-binding protein)进而调控靶基因转录,KLF9,KLF10,KLF11,KLF13,KLF14和KLF16共享转录辅因子Sin3结合结构域SID(Sin3-interacting domain),KLF7中发现的亮氨酸拉链模体表明其以二聚体的形式参与转录调控。klf家族基因结构和氨基端模体的多样化、羧基端保守锌指结构及进化中经历的负选择压力表明家族进化中经历了转录调控方式和调控功能的多样化,同时保留了结合富含GC启动子的基本模式。 展开更多
关键词 klf家族 进化特征 亲缘关系 基因结构 选择压力 结构域和模体
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害虫抗药性的治理 被引量:4
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作者 高希武 《世界农业》 1987年第7期41-44,共4页
杀虫剂是现代农业生产中不可缺少的重要资源。但由于长期连续使用后,害虫抗药性日趋严重。据报道,目前世界上至少有14个目500种以上的昆虫和螨类产生了抗药性,涉及到几乎所有的杀虫剂,害虫抗药性已成为杀虫剂应用中最严重的问题之一。 ... 杀虫剂是现代农业生产中不可缺少的重要资源。但由于长期连续使用后,害虫抗药性日趋严重。据报道,目前世界上至少有14个目500种以上的昆虫和螨类产生了抗药性,涉及到几乎所有的杀虫剂,害虫抗药性已成为杀虫剂应用中最严重的问题之一。 抗药性是因杀虫剂连续大量应用而产生的,是一种“瞬间进化”现象(Oppenoorth,1985),要终止其发展是非常困难的。但是,只要合理地施用杀虫剂,降低抗性发展速率及防治抗性害虫还是可能的。 展开更多
关键词 有机磷杀虫剂 害虫抗药性 抗性基因 抗性机制 适度治理 抗性害虫 抗性治理 双硫磷 选择压力 增效醚
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