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基于连接酶链式反应的EML4-ALK融合基因分型检测
1
作者
钱丽君
胡珊珊
+2 位作者
肖君华
李凯
周宇荀
《东华大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2024年第5期69-77,共9页
针对棘皮动物微管相关蛋白样4-间变性淋巴瘤激酶(EML4-ALK)融合基因变异体V1、V2、V3a、V3b设计引物、探针,优化连接探针长度及其浓度,建立基于连接酶链式反应的qPCR法检测方案,并对该方案的特异性、检出限、抗干扰性进行验证。结果表明...
针对棘皮动物微管相关蛋白样4-间变性淋巴瘤激酶(EML4-ALK)融合基因变异体V1、V2、V3a、V3b设计引物、探针,优化连接探针长度及其浓度,建立基于连接酶链式反应的qPCR法检测方案,并对该方案的特异性、检出限、抗干扰性进行验证。结果表明:基于连接酶链式反应的qPCR法能对EML4-ALK融合基因进行有效分型;连接探针长度在30 nt(nucleotide)时检测灵敏度、特异性最高;连接探针终浓度在0.1~1.0 nmol/L较为合适;设计的引物、探针特异性好,只扩增靶RNA,对其他RNA无扩增;对EML4-ALK融合基因变异体V1、V2的检出限为10 copies/μL,变异体V3a、V3b的检出限为100 copies/μL;在EML4-ALK融合基因RNA标准品检测过程中加入100 ng的肺癌样本RNA作为干扰,检测结果未受到明显干扰。
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关键词
非小细胞肺癌
EML4-ALK融合基因
连接酶链式反应
基因分型检测
荧光定量PCR
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题名
基于连接酶链式反应的EML4-ALK融合基因分型检测
1
作者
钱丽君
胡珊珊
肖君华
李凯
周宇荀
机构
东华大学生物与医学工程学院
出处
《东华大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2024年第5期69-77,共9页
基金
科技部重大研发计划(2018YFA0801101)
中央高校基本科研业务费专项资金资助(2232023A-04)。
文摘
针对棘皮动物微管相关蛋白样4-间变性淋巴瘤激酶(EML4-ALK)融合基因变异体V1、V2、V3a、V3b设计引物、探针,优化连接探针长度及其浓度,建立基于连接酶链式反应的qPCR法检测方案,并对该方案的特异性、检出限、抗干扰性进行验证。结果表明:基于连接酶链式反应的qPCR法能对EML4-ALK融合基因进行有效分型;连接探针长度在30 nt(nucleotide)时检测灵敏度、特异性最高;连接探针终浓度在0.1~1.0 nmol/L较为合适;设计的引物、探针特异性好,只扩增靶RNA,对其他RNA无扩增;对EML4-ALK融合基因变异体V1、V2的检出限为10 copies/μL,变异体V3a、V3b的检出限为100 copies/μL;在EML4-ALK融合基因RNA标准品检测过程中加入100 ng的肺癌样本RNA作为干扰,检测结果未受到明显干扰。
关键词
非小细胞肺癌
EML4-ALK融合基因
连接酶链式反应
基因分型检测
荧光定量PCR
Keywords
non-small cell lung cancer
EML4-ALK fusion gene
ligase chain reaction
genotyping detection
fluorescence quantitative PCR
分类号
Q33 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于连接酶链式反应的EML4-ALK融合基因分型检测
钱丽君
胡珊珊
肖君华
李凯
周宇荀
《东华大学学报（自然科学版）》
CAS
北大核心
2024
0
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