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禽坦布苏病毒连接酶依赖RT-PCR检测方法的建立及应用
被引量:
4
1
作者
傅光华
黄瑜
+6 位作者
程龙飞
陈翠腾
万春和
陈红梅
彭春香
施少华
林建生
《福建农业学报》
CAS
2013年第7期639-643,共5页
根据连接酶依赖PCR工作原理设计并建立一种禽坦布苏病毒RT—PCR快速检测方法。结果显示,该方法能特异性检测不同禽源的坦布苏病毒分离株,且与常规RT—PCR检测敏感性相当。运用该方法对动物攻毒试验采集的6份样品及2011~2012年间采集...
根据连接酶依赖PCR工作原理设计并建立一种禽坦布苏病毒RT—PCR快速检测方法。结果显示,该方法能特异性检测不同禽源的坦布苏病毒分离株,且与常规RT—PCR检测敏感性相当。运用该方法对动物攻毒试验采集的6份样品及2011~2012年间采集自福建、江西、浙江及广东省发病鸭场的140份样品进行检测。动物试验样品均为阳性,临床样品检出率为14.3%(20/140)。试验结果表明,本试验所建立的连接酶依赖RT—PCR方法具有快速、敏感、特异等优点,可用于禽坦布苏病毒的流行病学调查及病毒检测。
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关键词
禽坦布苏病毒
连接酶依赖rt—pcr
病源检测
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职称材料
海刺参(Stichopus japonicus)电压依赖性钙离子通道β亚基基因及其编码产物的结构特点
被引量:
3
2
作者
杨冠科
丛丽娜
+2 位作者
谢三群
张宗申
朱蓓薇
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期137-145,共9页
电压依赖性钙离子通道(voltage-dependent calcium channels,VDCC)是细胞膜上控制Ca2+进入胞内的特殊蛋白质,VDCCβ亚基具有调节其通道活性的作用.使用RT-PCR和RACE PCR技术,从海刺参(Stichopus japonicus)肠中克隆得到电压依赖性钙离...
电压依赖性钙离子通道(voltage-dependent calcium channels,VDCC)是细胞膜上控制Ca2+进入胞内的特殊蛋白质,VDCCβ亚基具有调节其通道活性的作用.使用RT-PCR和RACE PCR技术,从海刺参(Stichopus japonicus)肠中克隆得到电压依赖性钙离子通道β亚基(SjCaβ)基因,所得序列提交GenBank,登录号EU853658.该基因全长1 867 bp,包含1个1 614 bp的开放阅读框(ORF),编码537个氨基酸.将SjCaβ与多种无脊椎动物钙离子通道β亚基进行分析比较,发现它们有较高的同源性,并具有钙离子通道β亚基基因内保守的2个功能区域,即SH3功能区(src-homology 3 domain)和GK功能区(guanylate kinase domain).在功能区域附近还具有电压依赖性钙离子通道β亚基特有的BID区(βinteraction domain),氨基酸保守序列为PYDVVP-RP---VGPSLKGYEVTDMMQKALFDF,进一步确定了得到的cDNA序列为海刺参电压依赖性钙离子通道β亚基.对SjCaβ的二级结构进行了预测,构建了系统进化发育树,并运用同源建模法构建了SjCaβ的三维结构模型.研究结果对深入研究海刺参离子通道的结构以及在信号传导过程中的作用有着重要意义,并为研究海刺参自溶等问题提供一定的理论基础.
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关键词
海刺参
电压
依赖
性钙离子通道
Β亚基
rt
—pcr
结构分析
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职称材料
题名
禽坦布苏病毒连接酶依赖RT-PCR检测方法的建立及应用
被引量:
4
1
作者
傅光华
黄瑜
程龙飞
陈翠腾
万春和
陈红梅
彭春香
施少华
林建生
机构
福建省农业科学院畜牧兽医研究所
出处
《福建农业学报》
CAS
2013年第7期639-643,共5页
基金
福建省科技计划项目--省属公益类科研院所基本科研专项(2011R1025-2
2011R1025-8)
+1 种基金
国家自然科学基金项目(31201936)
现代农业产业技术体系建设专项(CARS-43)
文摘
根据连接酶依赖PCR工作原理设计并建立一种禽坦布苏病毒RT—PCR快速检测方法。结果显示,该方法能特异性检测不同禽源的坦布苏病毒分离株,且与常规RT—PCR检测敏感性相当。运用该方法对动物攻毒试验采集的6份样品及2011~2012年间采集自福建、江西、浙江及广东省发病鸭场的140份样品进行检测。动物试验样品均为阳性,临床样品检出率为14.3%(20/140)。试验结果表明,本试验所建立的连接酶依赖RT—PCR方法具有快速、敏感、特异等优点,可用于禽坦布苏病毒的流行病学调查及病毒检测。
关键词
禽坦布苏病毒
连接酶依赖rt—pcr
病源检测
Keywords
avian tembusu virus
Iigase-dependent
rt
-
pcr
assay
pathogen detection
分类号
S852 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
海刺参(Stichopus japonicus)电压依赖性钙离子通道β亚基基因及其编码产物的结构特点
被引量:
3
2
作者
杨冠科
丛丽娜
谢三群
张宗申
朱蓓薇
机构
大连工业大学生物与食品工程学院
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期137-145,共9页
基金
国家自然科学基金(No.30571449)
国家重点基础研究发展规划(973计划前期研究
+1 种基金
No.2006CB708210)
大连工业大学研究生科技创新基金(No.2007012)资助项目~~
文摘
电压依赖性钙离子通道(voltage-dependent calcium channels,VDCC)是细胞膜上控制Ca2+进入胞内的特殊蛋白质,VDCCβ亚基具有调节其通道活性的作用.使用RT-PCR和RACE PCR技术,从海刺参(Stichopus japonicus)肠中克隆得到电压依赖性钙离子通道β亚基(SjCaβ)基因,所得序列提交GenBank,登录号EU853658.该基因全长1 867 bp,包含1个1 614 bp的开放阅读框(ORF),编码537个氨基酸.将SjCaβ与多种无脊椎动物钙离子通道β亚基进行分析比较,发现它们有较高的同源性,并具有钙离子通道β亚基基因内保守的2个功能区域,即SH3功能区(src-homology 3 domain)和GK功能区(guanylate kinase domain).在功能区域附近还具有电压依赖性钙离子通道β亚基特有的BID区(βinteraction domain),氨基酸保守序列为PYDVVP-RP---VGPSLKGYEVTDMMQKALFDF,进一步确定了得到的cDNA序列为海刺参电压依赖性钙离子通道β亚基.对SjCaβ的二级结构进行了预测,构建了系统进化发育树,并运用同源建模法构建了SjCaβ的三维结构模型.研究结果对深入研究海刺参离子通道的结构以及在信号传导过程中的作用有着重要意义,并为研究海刺参自溶等问题提供一定的理论基础.
关键词
海刺参
电压
依赖
性钙离子通道
Β亚基
rt
—pcr
结构分析
Keywords
Stichopus japonicus
voltage-dependent calcium channel
β subunit
rt
-
pcr
structure modeling
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
Q959.269 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
禽坦布苏病毒连接酶依赖RT-PCR检测方法的建立及应用
傅光华
黄瑜
程龙飞
陈翠腾
万春和
陈红梅
彭春香
施少华
林建生
《福建农业学报》
CAS
2013
4
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
海刺参(Stichopus japonicus)电压依赖性钙离子通道β亚基基因及其编码产物的结构特点
杨冠科
丛丽娜
谢三群
张宗申
朱蓓薇
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
3
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