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辣椒轻斑驳病毒RT-RAA-CRISPR/Cas12a可视化检测方法的建立 被引量:2
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作者 赵振兴 范奇璇 +3 位作者 王思元 董铮 胡中泽 张永江 《河南农业科学》 北大核心 2024年第9期80-87,共8页
辣椒是重要的园艺作物,辣椒轻斑驳病毒(Pepper mild mottle virus,PMMoV)严重威胁辣椒等茄科园艺作物的生产安全。为提高PMMoV的防控效率,根据其编码外壳蛋白(Coat protein,CP)的基因保守序列,基于重组酶介导等温核酸扩增技术(Recombina... 辣椒是重要的园艺作物,辣椒轻斑驳病毒(Pepper mild mottle virus,PMMoV)严重威胁辣椒等茄科园艺作物的生产安全。为提高PMMoV的防控效率,根据其编码外壳蛋白(Coat protein,CP)的基因保守序列,基于重组酶介导等温核酸扩增技术(Recombinase?aided amplification,RAA),设计了特异性RAA引物,实现对PMMoV的快速等温扩增,并基于CRISPR/Cas12a的设计原则,设计了crRNA靶向RT-RAA扩增产物。优化结果显示,总反应体系在报告基因FQ终浓度为400 nmol/L,Cas12a/crRNA比例为1∶5、终浓度为200 nmol/L和1000 nmol/L条件下检测信号最强,最终的RT-RAA反应和CRISPR显色体系分别仅需15 min,即可在便携式蓝光照射设备下直接观察到阳性信号。该方法可特异性检测PMMoV,对携带PMMoV的辣椒样品RNA的检测极限可达到1.34 pg/μL,分别是普通RT-PCR和实时荧光RT-PCR检测灵敏度的1000倍和10倍。对实际样品中的检测结果显示,建立的RT-RAA-CRISPR/Cas12a检测技术可以在PMMoV侵染的辣椒和番茄叶片、果实及土壤中检测到PMMoV,可用于辣椒轻斑驳病毒的快速、灵敏、可视化检测。 展开更多
关键词 辣椒斑驳病毒 RT-RAA CRISPR/Cas12a 可视化检测
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贵州辣椒轻斑驳病毒分离物的分子鉴定 被引量:16
2
作者 郑兴华 洪鲲 +2 位作者 杨立昌 乙引 万晴姣 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2013年第5期30-32,共3页
为了对贵州辣椒轻斑驳病毒分离物进行分子鉴定,采用生物学方法对ELISA检测为阳性的辣椒轻斑驳病毒贵州分离物(PMMoV-GZ)进行纯化,以RT-PCR技术克隆其外壳蛋白(CP)基因并测序,使用DNAstar和MEGA5.0软件对PMMoV-GZ的CP基因进行同源性分析... 为了对贵州辣椒轻斑驳病毒分离物进行分子鉴定,采用生物学方法对ELISA检测为阳性的辣椒轻斑驳病毒贵州分离物(PMMoV-GZ)进行纯化,以RT-PCR技术克隆其外壳蛋白(CP)基因并测序,使用DNAstar和MEGA5.0软件对PMMoV-GZ的CP基因进行同源性分析。结果表明:成功克隆了该病毒分离物的CP基因(474bp),该基因编码157个氨基酸残基;同源性分析显示,该分离物的CP基因及相应的氨基酸序列与11种已报道的PMMoV各地分离物的同源性均在95%以上,而其基因序列与6种同属的其它病毒同源性低于60%。证明该病毒分离物为辣椒轻斑驳病毒(PMMoV)。 展开更多
关键词 辣椒 斑驳病毒 分离物 外壳蛋白 分子鉴定 贵州
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青海海东设施辣椒轻斑驳病毒的分子检测 被引量:14
3
作者 李廷芳 吴淑华 +3 位作者 赵文浩 季英华 周益军 郭青云 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第4期958-960,共3页
辣(甜)椒分布在全世界60多个国家和地区,是重要的经济作物[1]。由于辣椒栽培面积大且品种多,所以辣椒上病毒的种类多。有报道指出,至少有45种病毒侵染辣椒,其中中国有15种[2],常见的有烟草花叶病毒(TMV)、黄瓜花叶病毒(CMV)、辣椒轻斑... 辣(甜)椒分布在全世界60多个国家和地区,是重要的经济作物[1]。由于辣椒栽培面积大且品种多,所以辣椒上病毒的种类多。有报道指出,至少有45种病毒侵染辣椒,其中中国有15种[2],常见的有烟草花叶病毒(TMV)、黄瓜花叶病毒(CMV)、辣椒轻斑驳病毒(PMMo V)等。PMMo V是烟草花叶病毒属(Tobamovirus)的重要成员,受其侵染的辣椒叶片皱缩、斑驳,果实变小、畸形,辣椒的光合作用。 展开更多
关键词 辣椒 斑驳病毒 RT-PCR
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种传辣椒轻斑驳病毒病DAS-ELISA的检测 被引量:20
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作者 李兴红 严红 +1 位作者 郭京泽 夏雪娟 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期66-68,共3页
2003~2004年在北京、宁夏等地分批次从田间采集标样,利用辣椒轻斑驳病毒(PMMoV)抗体,采用双抗体夹心酶联免疫吸附反应(DAS-ELISA)对采集的标样进行检测,结果表明北京地区被检测的24个标样中,有19个样品为阳性,占79.17%,宁夏的23个样品... 2003~2004年在北京、宁夏等地分批次从田间采集标样,利用辣椒轻斑驳病毒(PMMoV)抗体,采用双抗体夹心酶联免疫吸附反应(DAS-ELISA)对采集的标样进行检测,结果表明北京地区被检测的24个标样中,有19个样品为阳性,占79.17%,宁夏的23个样品中检出2个样品为阳性,占8.5%. 展开更多
关键词 辣椒 斑驳病毒 酶联免疫吸附反应 检测 种传病害
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新疆喀什辣椒轻斑驳病毒和黄瓜花叶病毒复合侵染的分子鉴定 被引量:5
5
作者 柴阿丽 陈利达 +6 位作者 许帅 帕提古丽·艾斯木托拉 王利丽 石延霞 谢学文 李磊 李宝聚 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2020年第S01期332-337,共6页
2018-2019年,在新疆喀什地区调查时发现部分种植的辣椒植株上心叶发黄皱缩、卷曲,个别植株叶片呈现斑驳花叶状。为了明确引起新疆喀什辣椒病毒病的病毒种类,提取典型症状样品的总RNA,反转录得到cDNA,分别用辣椒轻斑驳病毒和黄瓜花叶病... 2018-2019年,在新疆喀什地区调查时发现部分种植的辣椒植株上心叶发黄皱缩、卷曲,个别植株叶片呈现斑驳花叶状。为了明确引起新疆喀什辣椒病毒病的病毒种类,提取典型症状样品的总RNA,反转录得到cDNA,分别用辣椒轻斑驳病毒和黄瓜花叶病毒特异性引物进行RT-PCR检测,CMV和PMMoV特异引物分别扩增得到约735,472 bp的特异条带,阴性对照未扩增目的条带,核苷酸序列比对发现,分别与韩国西葫芦CMV分离物(GU327368.1)和日本辣椒PMMoV分离物(AB276030.1)序列同源性最高为95%,99%,结果表明,喀什地区辣椒疑似病毒病样本被CMV与PMMoV复合侵染。 展开更多
关键词 辣椒 黄瓜花叶病毒 辣椒斑驳病毒 复合侵染 RT-PCR
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基于高光谱和叶绿素荧光成像技术的辣椒及玉米幼苗病毒病快速检测
6
作者 崇晓月 张树根 +3 位作者 王培 张秦 张军民 周涛 《植物保护》 北大核心 2025年第4期109-118,共10页
作物病毒病发生的早期检测能够为病害预警和综合防控提供关键信息。为探究病毒病早期无损检测的可行方法,本文分别使用高光谱成像技术和叶绿素荧光成像技术,以辣椒轻斑驳病毒侵染的辣椒幼苗、甘蔗花叶病毒侵染的玉米幼苗以及相应的健康... 作物病毒病发生的早期检测能够为病害预警和综合防控提供关键信息。为探究病毒病早期无损检测的可行方法,本文分别使用高光谱成像技术和叶绿素荧光成像技术,以辣椒轻斑驳病毒侵染的辣椒幼苗、甘蔗花叶病毒侵染的玉米幼苗以及相应的健康幼苗为测试样品,对病毒侵染早期的辣椒和玉米幼苗开展了快速、无损检测。对高光谱数据及叶绿素荧光数据进行不同预处理后,使用随机森林(RF)、正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)及支持向量机(SVM)算法构建了分类模型。结果表明,叶绿素荧光RF模型最适于辣椒显症前或显症后叶片带毒的判断,其训练集和测试集的准确率分别均为78.3%和80.0%;玉米显症前叶片高光谱数据经多元散射校正(MSC)预处理后的OPLS-DA模型最适于其带毒情况的判断,其训练集和测试集的准确率分别为90.0%和100.0%;叶绿素荧光OPLS-DA模型最适于玉米显症后叶片带毒的判断,其训练集和测试集的准确率分别为95.0%和100.0%。本研究为生产上使用高光谱或叶绿素荧光成像技术在早期检测作物幼苗病毒病提供了参考。 展开更多
关键词 高光谱成像 叶绿素荧光成像 检测 辣椒斑驳病毒 甘蔗花叶病毒
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实时荧光RT-PCR检测辣椒轻斑驳病毒的初步研究 被引量:8
7
作者 郭京泽 李兴红 +3 位作者 廖芳 张文明 刘鹏 刘跃庭 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期117-120,共4页
本研究选取辣椒轻斑驳病毒PMMoV、烟草花叶病毒TMV、黄瓜花叶病毒CMV和马铃薯Y病毒PVY作为试验材料,根据PMMoV衣壳蛋白(CP)RNA的序列特异性位点,设计出Taqman荧光探针及其引物,采用实时荧光RT-PCR技术对PMMoV进行快速检测,同时与ELISA... 本研究选取辣椒轻斑驳病毒PMMoV、烟草花叶病毒TMV、黄瓜花叶病毒CMV和马铃薯Y病毒PVY作为试验材料,根据PMMoV衣壳蛋白(CP)RNA的序列特异性位点,设计出Taqman荧光探针及其引物,采用实时荧光RT-PCR技术对PMMoV进行快速检测,同时与ELISA方法进行了灵敏度比较,结果表明:该方法具有较高的灵敏度及较强的特异性,PMMoV检测结果为阳性,TMV、CMV和PVY均无荧光信号,为阴性,灵敏度是传统的ELISA方法的100倍,而且大大缩短了检测时间。该方法快速、准确、灵敏、简便、安全,具有实际应用价值,适用于植物病毒病害的快速检测。 展开更多
关键词 辣椒斑驳病毒 实时荧光RT-PCR 双抗夹心酶联免疫吸附法
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辣椒轻斑驳病毒湖南分离物的全基因序列测定及结构分析 被引量:4
8
作者 刘湘宁 戴良英 +2 位作者 李魏 董铮 唐前君 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期88-94,共7页
采自湖南地区的辣椒轻斑驳病毒Pepper mild mottle virus(PMMoV)样品经单斑分离后,根据已经报道的PMMoV序列基因保守区设计6对简并引物,采用片段重叠法和RACE方法扩增、克隆获得一个全长为6 356bp的湖南分离物(PMMoV-HN1,登录号:KP3458... 采自湖南地区的辣椒轻斑驳病毒Pepper mild mottle virus(PMMoV)样品经单斑分离后,根据已经报道的PMMoV序列基因保守区设计6对简并引物,采用片段重叠法和RACE方法扩增、克隆获得一个全长为6 356bp的湖南分离物(PMMoV-HN1,登录号:KP345899)全基因组序列,编码4个蛋白,分别为126kD蛋白(70~3 423nt)、183kD蛋白(70~4 908nt)、28kD蛋白(4 909~5 682nt)和17.5kD蛋白(5 685~6 158nt),5′-非编码区(5′-UTR)和3′-非编码区(3′-UTR)分别含有69和198个碱基,其中5′-UTR存在一个序列为m7G5′pppG的甲基化核苷酸帽子结构。一致性分析发现PMMoV-HN1与PMMoV其他分离物的核酸一致性为94%~99%,编码的氨基酸一致性为94%~99%。全基因组序列系统进化分析表明PMMoV-HN1分离物与中国首次报道的PMMoV-CN分离物亲缘关系最近。本研究是国内报道的第二例PMMoV全基因组序列。 展开更多
关键词 辣椒 辣椒斑驳病毒 全基因序列 序列分析
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台湾甜椒种子中辣椒轻斑驳病毒检测及其致病型鉴定 被引量:6
9
作者 廖富荣 沈建国 +5 位作者 吴媛 郭木金 黄蓬英 陈青 陈红运 林石明 《热带作物学报》 CSCD 2011年第6期1128-1135,共8页
利用双抗体夹心酶联免疫吸附法(DAS-ELISA)、反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和基因序列分析法对一批台湾进境的辣椒种子进行病毒检测及致病型鉴定,同时使用特征序列扩增区域(SCAR)标记引物利用PCR方法对该辣椒品种进行L抗性基因检测。DAS... 利用双抗体夹心酶联免疫吸附法(DAS-ELISA)、反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和基因序列分析法对一批台湾进境的辣椒种子进行病毒检测及致病型鉴定,同时使用特征序列扩增区域(SCAR)标记引物利用PCR方法对该辣椒品种进行L抗性基因检测。DAS-ELISA及RT-PCR结果表明,从该批种子中检测到辣椒轻斑驳病毒(Peppe rmild mottle virus,PM MoV)。PCR产物测序分析表明,该序列为PM MoV的外壳蛋白(CP)基因,与已报道的PM MoV序列同源性为92.4%~99.8%。CP蛋白氨基酸序列分析表明,该分离物(命名为TW分离物)属于PM MoV的P1,2,3致病型。抗性基因检测表明,该辣椒品种携带有L3抗性基因。TW分离物能够系统侵染该辣椒品种,意味着该分离物已经克服L3基因介导的抗性。本研究报道的PM MoV的P1,2,3致病型在中国大陆尚属首次,这对于抗病辣椒品种的选育具有重要的指导意义。 展开更多
关键词 甜椒 辣椒斑驳病毒 种子传播 外壳蛋白基因 P1 2 3致病型 L3抗性基因
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辣椒轻斑驳病毒的分子杂交检测 被引量:5
10
作者 刘崇 高颖 杨洪一 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期360-363,共4页
为探索辣椒轻斑驳病毒(pepper mild mottle virus,PMMo V)的分子杂交技术检测方法,以感病辣椒叶片为试材,用改良CTAB法从辣椒叶片中提取总核酸,运用RT–PCR技术扩增出PMMo V特异片段。以带有PMMo V特异片段的质粒DNA为模板,以用PCR技术... 为探索辣椒轻斑驳病毒(pepper mild mottle virus,PMMo V)的分子杂交技术检测方法,以感病辣椒叶片为试材,用改良CTAB法从辣椒叶片中提取总核酸,运用RT–PCR技术扩增出PMMo V特异片段。以带有PMMo V特异片段的质粒DNA为模板,以用PCR技术制备的地高辛标记PMMo V c DNA探针检测PMMo V。结果表明:1)干燥叶片、新鲜叶片中提取的总核酸稀释80、640倍(相当于12.5、1.60μg叶片)后仍可检测到其中的PMMo V;干燥叶片利于保存及长距离转运,利于对大批量样品进行集中检测;2)采用快速提取法提取叶片总核酸,可从稀释80倍(约12.5μg叶片)的总核酸样品中检测到PMMo V。该技术体系可基本满足常规检测试验的需要。 展开更多
关键词 辣椒斑驳病毒 核酸 辣椒叶片 地高辛标记
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辣椒种子中辣椒轻斑驳病毒的检测 被引量:3
11
作者 张永江 李桂芬 +1 位作者 马洁 郭京泽 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第14期4228-4229,共2页
采用三抗体夹心酶联(TAS-ELISA)法和反转录PCR(RT-RCR)扩增法分别对3份进口的包被种衣剂的辣椒种子进行了辣椒轻斑驳病毒(Pepper mild mottle virus,PMMoV)的检测。结果表明,两种方法均表明被检样品携带PMMoV,检测结果比较理想。在此基... 采用三抗体夹心酶联(TAS-ELISA)法和反转录PCR(RT-RCR)扩增法分别对3份进口的包被种衣剂的辣椒种子进行了辣椒轻斑驳病毒(Pepper mild mottle virus,PMMoV)的检测。结果表明,两种方法均表明被检样品携带PMMoV,检测结果比较理想。在此基础上建立了一种快速、灵敏的从辣椒种子中直接检测PMMoV的检测体系,缩短了检测时间,提高了检测效率。 展开更多
关键词 辣椒斑驳病毒 检测 种子 辣椒
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辣椒轻斑驳病毒研究现状 被引量:9
12
作者 王亚南 赵绪生 +1 位作者 袁文龙 刘淑香 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第14期7401-7402,7404,共3页
阐述了国内外对辣椒轻斑驳病毒(PMMoV)的研究现状,包括病毒的发生情况、基因组结构、致病相关基因研究进展及病毒检测方法的应用现状。
关键词 辣椒斑驳病毒 发生 致病基因 检测方法
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辣椒轻斑驳病毒辽宁分离物的鉴定及序列分析 被引量:11
13
作者 李晓冬 安梦楠 +2 位作者 王冠中 赵秀香 吴元华 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期29-34,共6页
采用鉴别寄主、血清学及RT-PCR检测的方法对采自辽宁省葫芦岛地区的辣椒病毒进行了分离与鉴定,并将克隆得到的病毒CP基因进行测序及同源性比较.结果表明:该病毒分离物可侵染辣椒(Capsicum frutescens)产生局部枯斑、系统斑驳或花叶;... 采用鉴别寄主、血清学及RT-PCR检测的方法对采自辽宁省葫芦岛地区的辣椒病毒进行了分离与鉴定,并将克隆得到的病毒CP基因进行测序及同源性比较.结果表明:该病毒分离物可侵染辣椒(Capsicum frutescens)产生局部枯斑、系统斑驳或花叶;局部侵染普通烟(Nicotiana tabacum)、心叶烟(Nicotiana glutinosa)、三生烟(Nicotiana tabacum. var. samsun)、矮牵牛(Petuniahybrida)产生坏死枯斑,在曼陀罗(Datura stramonium)、洋酸浆(Physalis pubescens)和苋色藜(Chenopodium amaranticolor)上引起褪绿斑;不能侵染番茄(Lycopersicon esculentum)、葫芦(Lagenaria siceraria)、甜瓜(Cucumis melo)、黄瓜(Cucumis sativus)、千日红(Gomphrena globosa)、白菜(Brassica pekinensis)、百日草(Zinnia elegans)、蚕豆(Vicia faba)和玉米(Zea mays).辣椒病叶、病果和种子及表现症状的鉴别寄主叶片经DAS-ELISA检测均证实存在辣椒轻斑驳病毒(Pepper mild mottle virus, PMMoV).通过RTPCR技术成功克隆获得该病毒CP基因,测序并分析其同源性表明,该分离物与GenBank 上已报道的13 个国内外PMMoV分离物同源性很高,核苷酸和氨基酸同源性均为94%-100%.将该分离物与其他13 个PMMoV分离物的CP基因序列一起构建系统发育进化树分析表明,该分离物与各亚洲分离物亲缘关系密切,并与国内各分离物可能具有相同的进化祖先.综上所述,辽宁辣椒上发现的病毒可鉴定为辣椒轻斑驳病毒辽宁分离物(PMMoV-LN),此为辽宁辣椒生产区首次报道.由于PMMoV 具有典型的种传特性,而我国目前尚未将其列为检疫对象,这将促进病毒的快速扩展蔓延,因此应重视该病毒的危害性及对我国辣椒生产的潜在威胁,并加强其抗病育种和检验检疫工作以达到对PMMoV防控的目的. 展开更多
关键词 辣椒 辣椒斑驳病毒 鉴别寄主反应 DAS-ELISA RT-PCR 序列分析
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辣椒轻斑驳病毒凤城分离物的鉴定、全基因测序及系统进化分析 被引量:7
14
作者 竹怀婷 李晓冬 +2 位作者 侯慧慧 徐千惠 安梦楠 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期55-58,81,共5页
辣椒轻斑驳病毒Pepper mild mottle virus(PMMoV)属于烟草花叶病毒属,是辣椒上重要的病原病毒之一,近年来PMMoV对辽宁部分辣椒产区造成严重危害。本文采用DAS-ELISA检测以及RT-PCR的方法首次从辽宁省凤城市蔬菜产区辣椒病叶中检测出PMM... 辣椒轻斑驳病毒Pepper mild mottle virus(PMMoV)属于烟草花叶病毒属,是辣椒上重要的病原病毒之一,近年来PMMoV对辽宁部分辣椒产区造成严重危害。本文采用DAS-ELISA检测以及RT-PCR的方法首次从辽宁省凤城市蔬菜产区辣椒病叶中检测出PMMoV,暂命名为PMMoV-FC。设计3对特异性引物对其进行扩增并测序后得到该病毒分离物全基因序列。将PMMoV-FC的全基因序列与已报道的国内外9个PMMoV分离物进行同源性分析,结果表明,其同源性介于94.3%~99.7%之间。基于全基因序列的系统发育进化分析表明,PMMoV-FC与国内分离物、日本分离物以及美洲分离物亲缘关系密切,而与韩国和西班牙分离物亲缘关系稍远。鉴于该病毒在辣椒上造成的严重危害,对于PMMoV-FC在辽宁地区的发生以及防治仍需进行更为详细的研究。 展开更多
关键词 辣椒斑驳病毒 RT-PCR 全基因组测序 系统进化分析
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我国部分地区鲜食辣椒及其加工品中辣椒轻斑驳病毒的调查 被引量:4
15
作者 张蔚 张志想 李世访 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期158-160,164,共4页
本研究利用RT-PCR技术对我国部分地区鲜食辣椒和辣椒加工品中的辣椒轻斑驳病毒Pepper mild mottle virus(PMMoV)进行了调查。其中,鲜食辣椒样品(249份)中PMMoV检出率为75.5%;147份辣椒加工品中有97份检测到PMMoV,且所采集的每一类别的... 本研究利用RT-PCR技术对我国部分地区鲜食辣椒和辣椒加工品中的辣椒轻斑驳病毒Pepper mild mottle virus(PMMoV)进行了调查。其中,鲜食辣椒样品(249份)中PMMoV检出率为75.5%;147份辣椒加工品中有97份检测到PMMoV,且所采集的每一类别的辣椒制品中都有阳性样品。调查结果表明:PMMoV不仅广泛分布于我国辣椒种植区,而且在多种辣椒加工品中的检出率也较高。该研究进一步明确了PMMoV的来源及可能的传播途径,为该病毒的防控提供了理论依据。 展开更多
关键词 辣椒斑驳病毒 RT-PCR 鲜食辣椒 辣椒加工品
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滇重楼辣椒轻斑驳病毒分离物的鉴定及全基因组序列分析 被引量:3
16
作者 杨林毅 陈潞 +5 位作者 陈泽历 飞进强 王喆 徐绍忠 赵明富 文国松 《湖北农业科学》 2020年第13期154-157,162,共5页
滇重楼(Paris polyphylla var.yunnanensis)是多年生草本植物,其药用部位为地下根茎,是一种重要的中药材。为明确侵染滇重楼的病毒病原,对采自云南省曲靖市的滇重楼进行透射电镜观察、DASELISA和RT-PCR技术检测。在透射电镜下观察到杆... 滇重楼(Paris polyphylla var.yunnanensis)是多年生草本植物,其药用部位为地下根茎,是一种重要的中药材。为明确侵染滇重楼的病毒病原,对采自云南省曲靖市的滇重楼进行透射电镜观察、DASELISA和RT-PCR技术检测。在透射电镜下观察到杆状病毒粒子,大小为(200~300)nm×(20~36)nm。对采集到的7份病样进行DAS-ELISA检测,结果表明,其中5份病样呈阳性。通过RT-PCR技术扩增、克隆获得1个全长为6357 bp的曲靖分离物PMMoV-QJ的全基因组序列。将PMMoV-QJ的全基因组序列与国内外已经报道的10个PMMoV分离物进行同源性分析比对,其同源性为99.42%~99.81%。基于全基因序列的系统发育分析表明,PMMoV-QJ与韩国分离物亲缘关系密切。本研究明确了该分离物的亲缘关系,从分子水平鉴定该分离物,为后续滇重楼病毒病的预防提供理论依据。 展开更多
关键词 滇重楼(Paris polyphylla var.yunnanensis) 辣椒斑驳病毒(pmmov) 鉴定 序列分析
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安徽和县地区辣椒病株辣椒轻斑驳病毒的鉴定 被引量:9
17
作者 严丹侃 郑红英 +5 位作者 张海珊 沈艳 顾江涛 刘勇 章东方 燕飞 《安徽农业科学》 CAS 2018年第32期82-84,共3页
[目的]鉴定安徽和县地区辣椒病株辣椒轻斑驳病毒(pepper mild mottle virus,PMMoV)(PMMoV-AH)。[方法]采用胶体金免疫层析试纸条和RT-PCR检测和县辣椒病样辣椒轻斑驳病毒,并将其外壳蛋白基因序列与已报道的国内外12个PMMoV分离物进行同... [目的]鉴定安徽和县地区辣椒病株辣椒轻斑驳病毒(pepper mild mottle virus,PMMoV)(PMMoV-AH)。[方法]采用胶体金免疫层析试纸条和RT-PCR检测和县辣椒病样辣椒轻斑驳病毒,并将其外壳蛋白基因序列与已报道的国内外12个PMMoV分离物进行同源性分析。[结果]PMMoV-AH与已报道的12个分离物核苷酸同源性介于94.5%~100.0%,氨基酸同源性介于96.8%~100.0%。基于外壳蛋白基因序列进行系统发育分析发现,PMMoV-AH与亚洲分离物亲缘关系密切,与其他区域分离物亲缘关系较远。[结论]PMMoV危害性强,对于其在安徽地区的发生和防治还需进一步研究。 展开更多
关键词 辣椒斑驳病毒 外壳基因 和县
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一个辣椒轻斑驳病毒中国分离物的基因组测序及分析 被引量:5
18
作者 李丽丽 郑敏 杨洪一 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2020年第6期12-16,共5页
利用CTAB法分离辣椒叶片总RNA,利用RT-PCR技术扩增出了辣椒轻斑驳病毒中国分离物Hrb基因组不同区域片段。并经克隆、测序,证明其为辣椒轻斑驳病毒特异序列。经序列拼接,获得了6 290 nt的辣椒轻斑驳病毒中国分离物Hrb基因组全序列;该序列... 利用CTAB法分离辣椒叶片总RNA,利用RT-PCR技术扩增出了辣椒轻斑驳病毒中国分离物Hrb基因组不同区域片段。并经克隆、测序,证明其为辣椒轻斑驳病毒特异序列。经序列拼接,获得了6 290 nt的辣椒轻斑驳病毒中国分离物Hrb基因组全序列;该序列与GenBank中已报道的其他辣椒轻斑驳病毒基因组的序列同源性为94.0%~99.6%。系统进化分析显示辣椒轻斑驳病毒中国分离物Hrb与日本分离物(PMMoV-J、C-1421、Pa18、TPO-2-19)亲缘关系较近,与西班牙分离物Ia亲缘关系较远。 展开更多
关键词 辣椒 辣椒斑驳病毒 基因组
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辣椒轻斑驳病毒RT-LAMP快速检测方法的建立 被引量:1
19
作者 邵煜尊 张万红 +6 位作者 王惠 王玉洁 苗圃 申莉莉 李莹 焦裕冰 杨金广 《中国蔬菜》 北大核心 2023年第12期42-48,共7页
辣椒轻斑驳病毒(pepper mild mottle virus,PMMo V)是发生在辣椒上的一种重要病毒病。通过逆转录环介导等温扩增技术(RT-LAMP),以PMMo V外壳蛋白CP序列为靶标基因,设计F3/B3、FIP/BIP 4条引物,构建了基于RT-LAMP技术的PMMo V快速检测方... 辣椒轻斑驳病毒(pepper mild mottle virus,PMMo V)是发生在辣椒上的一种重要病毒病。通过逆转录环介导等温扩增技术(RT-LAMP),以PMMo V外壳蛋白CP序列为靶标基因,设计F3/B3、FIP/BIP 4条引物,构建了基于RT-LAMP技术的PMMo V快速检测方法。结果表明,该方法在60 min内便可完成对PMMo V的特异性检测,灵敏度比传统RT-PCR技术高10倍,检测过程中与其他相关病毒无交叉反应。本试验建立的PMMo V RT-LAMP检测方法操作简便、特异性强、灵敏度高,可用于田间生产中对PMMo V的快速检测。 展开更多
关键词 辣椒斑驳病毒 RT-LAMP检测 快速检测
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辣椒轻斑驳病毒研究的回顾与展望 被引量:7
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作者 杨中周 邓竹根 +1 位作者 李曼 戴祖云 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2021年第9期1-6,共6页
近年来,辣椒生产中辣椒轻斑驳病毒(Pepper mild mottle virus,PMMoV)危害日趋严重,并影响到辣椒的品质和产量。综述了辣椒轻斑驳病毒的危害性与分布、寄主范围、在寄主组织中的分布与传播途径、基因组结构、致病型及亲缘关系、检测方法... 近年来,辣椒生产中辣椒轻斑驳病毒(Pepper mild mottle virus,PMMoV)危害日趋严重,并影响到辣椒的品质和产量。综述了辣椒轻斑驳病毒的危害性与分布、寄主范围、在寄主组织中的分布与传播途径、基因组结构、致病型及亲缘关系、检测方法、防治方法等方面的研究进展,并对存在的相关问题进行分析与展望,以期为今后的PMMoV防治与抗性品种选育提供借鉴和参考。 展开更多
关键词 辣椒 辣椒斑驳病毒 寄主范围 抗病育种 防治方法
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