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大麦CIPK基因家族鉴定及表达分析
1
作者
高姗姗
冯浩
+3 位作者
黄鑫
张鑫月
张泽阳
刘贵河
《现代农业科技》
2024年第4期156-163,共8页
钙调神经磷酸酶B样相互作用蛋白激酶(CIPK)蛋白家族是由Ca^(2+)介导的植物信号通路中的关键蛋白家族,在植物抗逆和生长发育中发挥着关键作用。本文利用生物信息学方法和转录组数据分析法,进行了大麦CIPK基因家族鉴定及表达分析。结果表...
钙调神经磷酸酶B样相互作用蛋白激酶(CIPK)蛋白家族是由Ca^(2+)介导的植物信号通路中的关键蛋白家族,在植物抗逆和生长发育中发挥着关键作用。本文利用生物信息学方法和转录组数据分析法,进行了大麦CIPK基因家族鉴定及表达分析。结果表明,从大麦基因组数据库中鉴定出31个大麦CIPK基因家族成员,命名为HvCIPK1~HvCIPK31,这些成员分为5个亚族。HvCIPKs基因家族成员具有CIPKs典型的N端激酶结构域和C端NAF调节结构域;蛋白质分子量为40302.27~89926.43 kD,为亲水性蛋白;启动子总共包含11种与非生物胁迫、激素调控以及生长发育相关的顺式作用元件;HvCIPKs与Na^(+)和K^(+)转运体、ABA信号通路关键蛋白(SOS1、AKT1和ABL2)存在相互作用关系;HvCIPK1、HvCIPK2、HvCIPK6、HvCIPK9、HvCIPK11与响应盐碱胁迫相关。该研究可为进一步探索大麦HvCIPKs基因家族功能及调控机制提供理论依据。
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关键词
大麦
CIPK基因家族
生物信息学
转录组表达量
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职称材料
题名
大麦CIPK基因家族鉴定及表达分析
1
作者
高姗姗
冯浩
黄鑫
张鑫月
张泽阳
刘贵河
机构
河北北方学院
北京市农林科学院农业生物技术研究所
河北工程大学
河北师范大学
出处
《现代农业科技》
2024年第4期156-163,共8页
基金
国家财政部和农业农村部现代农业产业技术体系(CARS-34)
河北省林业和草原科学研究项目(2113055)
+1 种基金
北京市农林科学院创新能力建设项目“大麦属种质资源保存、评价与创新”(KJCX20230117)
野大麦HbNRT2提高盐碱胁迫下氮吸收的机制研究及其在大麦育种的应用(KJCX20230404)。
文摘
钙调神经磷酸酶B样相互作用蛋白激酶(CIPK)蛋白家族是由Ca^(2+)介导的植物信号通路中的关键蛋白家族,在植物抗逆和生长发育中发挥着关键作用。本文利用生物信息学方法和转录组数据分析法,进行了大麦CIPK基因家族鉴定及表达分析。结果表明,从大麦基因组数据库中鉴定出31个大麦CIPK基因家族成员,命名为HvCIPK1~HvCIPK31,这些成员分为5个亚族。HvCIPKs基因家族成员具有CIPKs典型的N端激酶结构域和C端NAF调节结构域;蛋白质分子量为40302.27~89926.43 kD,为亲水性蛋白;启动子总共包含11种与非生物胁迫、激素调控以及生长发育相关的顺式作用元件;HvCIPKs与Na^(+)和K^(+)转运体、ABA信号通路关键蛋白(SOS1、AKT1和ABL2)存在相互作用关系;HvCIPK1、HvCIPK2、HvCIPK6、HvCIPK9、HvCIPK11与响应盐碱胁迫相关。该研究可为进一步探索大麦HvCIPKs基因家族功能及调控机制提供理论依据。
关键词
大麦
CIPK基因家族
生物信息学
转录组表达量
Keywords
barley
CIPK gene family
bioinformatics
transcriptome expression level
分类号
S512.3 [农业科学—作物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大麦CIPK基因家族鉴定及表达分析
高姗姗
冯浩
黄鑫
张鑫月
张泽阳
刘贵河
《现代农业科技》
2024
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