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适合转录组测序的葡萄叶片总RNA试剂盒提取法的改进
被引量：
13
1
作者
杨晓燕
张波
+3 位作者
黄方爱
颜欢
李月荣
郑秋生
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期215-220,共6页
RNA试剂盒法是获取植物高质量RNA样品的常用技术,针对3种常见RNA提取试剂盒在红地球葡萄叶样品RNA提取效果进行评估和优化,以期找到适合红地球葡萄叶片RNA表达谱测序需求的高质量RNA提取策略。试验依据3种试剂盒推荐时间和条件进行RNA提...
RNA试剂盒法是获取植物高质量RNA样品的常用技术,针对3种常见RNA提取试剂盒在红地球葡萄叶样品RNA提取效果进行评估和优化,以期找到适合红地球葡萄叶片RNA表达谱测序需求的高质量RNA提取策略。试验依据3种试剂盒推荐时间和条件进行RNA提取,并对时间等条件进行优化,比对了优化前后RNA质量。结果显示,试剂盒经优化后的方法提取的RNA收率高,完整性好,OD260/OD280在1.8-2.2之间,OD260/OD230大于2,28S与18S条带清晰完整,RNA-Seq测序质量及基因覆盖度符合要求。在红地球葡萄叶片上的RNA提取结果表明,延长提取试剂与样品的接触时间操作可以显著提高RNA提取质量(纯度/完整性)。
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关键词
红地球葡萄
RNA提取
试剂盒
法
转录组短枪测序法
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职称材料
题名
适合转录组测序的葡萄叶片总RNA试剂盒提取法的改进
被引量：
13
1
作者
杨晓燕
张波
黄方爱
颜欢
李月荣
郑秋生
机构
石河子大学药学院
省部共建新疆特种资源植物药重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期215-220,共6页
基金
国家自然科学基金项目(30860032
31160058)
兵团博士资金项目(2011BB018)
文摘
RNA试剂盒法是获取植物高质量RNA样品的常用技术,针对3种常见RNA提取试剂盒在红地球葡萄叶样品RNA提取效果进行评估和优化,以期找到适合红地球葡萄叶片RNA表达谱测序需求的高质量RNA提取策略。试验依据3种试剂盒推荐时间和条件进行RNA提取,并对时间等条件进行优化,比对了优化前后RNA质量。结果显示,试剂盒经优化后的方法提取的RNA收率高,完整性好,OD260/OD280在1.8-2.2之间,OD260/OD230大于2,28S与18S条带清晰完整,RNA-Seq测序质量及基因覆盖度符合要求。在红地球葡萄叶片上的RNA提取结果表明,延长提取试剂与样品的接触时间操作可以显著提高RNA提取质量(纯度/完整性)。
关键词
红地球葡萄
RNA提取
试剂盒
法
转录组短枪测序法
Keywords
Vitis viniferacv.Red Globe RNA extaction Kit assay RNA-Seq
分类号
S663.1 [农业科学—果树学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
适合转录组测序的葡萄叶片总RNA试剂盒提取法的改进
杨晓燕
张波
黄方爱
颜欢
李月荣
郑秋生
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
13
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