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益肾骨康方对肺癌A549细胞形态及转录组基因表达的影响
被引量：
1
1
作者
何理玉
杨梦霞
+1 位作者
芦殿荣
冯利
《世界中医药》
CAS
2022年第15期2162-2166,共5页
目的:通过益肾骨康方作用后肺癌A549细胞基因的差异表达情况及进行功能分析,探讨益肾骨康方作用于肺癌的分子作用机制奠定实验基础。方法:实验分为对照组和益肾骨康方组,中药作用于A549细胞24 h后,利用扫描电镜观察A549细胞表面形态的变...
目的:通过益肾骨康方作用后肺癌A549细胞基因的差异表达情况及进行功能分析,探讨益肾骨康方作用于肺癌的分子作用机制奠定实验基础。方法:实验分为对照组和益肾骨康方组,中药作用于A549细胞24 h后,利用扫描电镜观察A549细胞表面形态的变化;利用转录组基因测序,筛选差异表达基因,并通过基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析对差异表达基因进行功能富集分析。利用Cytoscape 3.6.0软件构建差异表达基因蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。结果:扫描电镜结果显示对照组细胞形态正常,饱满,表面有膜皱,丝状伪足。益肾骨康方组可见细胞表面膜皱显著减少,丝状伪足断裂,凋亡小体形成。差异基因筛选|log2FoldChange|>1的差异表达基因有440个,其中下调基因有136个,上调基因有304个。其中与癌症密切相关的基因为SOX2,在给药组中表达下调。在GO功能富集过程中共得到307条结果,主要涉及生物过程(237项)、细胞组分(56项)和分子功能(14项)。KEGG通路分析,结果显示与益肾骨康方抑制肺癌A549细胞的作用相关机制主要涉及到细胞凋亡方面。通过构建PPI网络,找到与中药干预肺癌增殖和转移相关的2个节点度较高的基因:MMP9和CCL2。与对照组比较益肾骨康方下调了MMP9和CCL2基因的表达。结论:益肾骨康方的抗肿瘤作用机制可能是通过下调SOX2、MMP9和CCL2基因的表达,从而抑制了肺癌A549细胞的增殖和转移能力。
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关键词
中药
肺癌
A549细胞
益肾骨康方
扫描电镜
转录组基因测序
生物信息学
核心
基因
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职称材料
盾叶冠心宁片抗动脉粥样硬化相关lncRNA-miRNA-mRNA共表达及关键基因网络构建预测
被引量：
1
2
作者
李艳霞
李益萍
王肖龙
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期3812-3818,共7页
目的研究盾叶冠心宁片抗ApoE^(-/-)小鼠动脉粥样硬化的作用及机制。方法40只ApoE^(-/-)小鼠随机分为空白组、模型组、可定组、盾叶组,每组10只。空白组给予基础饲料,其余各组均给予高脂饲料。造模的同时可定组、盾叶组分别灌胃给予瑞舒...
目的研究盾叶冠心宁片抗ApoE^(-/-)小鼠动脉粥样硬化的作用及机制。方法40只ApoE^(-/-)小鼠随机分为空白组、模型组、可定组、盾叶组,每组10只。空白组给予基础饲料,其余各组均给予高脂饲料。造模的同时可定组、盾叶组分别灌胃给予瑞舒伐他汀钙片0.76 mg/kg、盾叶冠心宁片146 mg/kg。12周后,对主动脉窦进行HE染色、油红O染色、Masson染色。全基因转录组测序技术对空白组、模型组、盾叶组筛选差异基因进行聚类分析、WGCNA及STEM分析重叠基因、GO和KEGG功能通路分析,同时构建相关网络。结果病理染色结果显示,与模型组比较,可定组、盾叶组主动脉窦处的斑块面积及油红面积占比减少(P<0.05),同时胶原纤维增加(P<0.05);与可定组比较,盾叶组主动脉窦斑块面积增加(P<0.05),而油红面积占比和斑块内胶原纤维占比无明显差异(P>0.05)。测序共得到了1623个差异基因;聚类分析可以有效区分不同的组别;WGCNA及STEM分析得到156个重叠基因;经GO和KEGG分析显示盾叶冠心宁片抗动脉粥样硬化作用主要与脂质代谢有关。结论盾叶冠心宁片对ApoE^(-/-)小鼠动脉粥样硬化具有一定干预作用,其机制可能与脂质代谢有关,如脂肪酸代谢、脂质代谢过程、脂类生物合成、PPAR信号通路。
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关键词
盾叶冠心宁片
动脉粥样硬化
全
基因
转录
组
测
序
脂质代谢
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职称材料
题名
益肾骨康方对肺癌A549细胞形态及转录组基因表达的影响
被引量：
1
1
作者
何理玉
杨梦霞
芦殿荣
冯利
机构
中国中医科学院望京医院
国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院
出处
《世界中医药》
CAS
2022年第15期2162-2166,共5页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(81603598)——基于OPG/RANKL/RANK轴及其关键分子探讨扶正解毒化瘀中药益肾骨康方防治骨转移癌的作用机制。
文摘
目的:通过益肾骨康方作用后肺癌A549细胞基因的差异表达情况及进行功能分析,探讨益肾骨康方作用于肺癌的分子作用机制奠定实验基础。方法:实验分为对照组和益肾骨康方组,中药作用于A549细胞24 h后,利用扫描电镜观察A549细胞表面形态的变化;利用转录组基因测序,筛选差异表达基因,并通过基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析对差异表达基因进行功能富集分析。利用Cytoscape 3.6.0软件构建差异表达基因蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。结果:扫描电镜结果显示对照组细胞形态正常,饱满,表面有膜皱,丝状伪足。益肾骨康方组可见细胞表面膜皱显著减少,丝状伪足断裂,凋亡小体形成。差异基因筛选|log2FoldChange|>1的差异表达基因有440个,其中下调基因有136个,上调基因有304个。其中与癌症密切相关的基因为SOX2,在给药组中表达下调。在GO功能富集过程中共得到307条结果,主要涉及生物过程(237项)、细胞组分(56项)和分子功能(14项)。KEGG通路分析,结果显示与益肾骨康方抑制肺癌A549细胞的作用相关机制主要涉及到细胞凋亡方面。通过构建PPI网络,找到与中药干预肺癌增殖和转移相关的2个节点度较高的基因:MMP9和CCL2。与对照组比较益肾骨康方下调了MMP9和CCL2基因的表达。结论:益肾骨康方的抗肿瘤作用机制可能是通过下调SOX2、MMP9和CCL2基因的表达,从而抑制了肺癌A549细胞的增殖和转移能力。
关键词
中药
肺癌
A549细胞
益肾骨康方
扫描电镜
转录组基因测序
生物信息学
核心
基因
Keywords
Chinese medicine
Lung cancer
A549 cells
Yishen Gukang Prescription
Scanning electron microscope
Transcriptome gene sequencing
Bioinformatics
Core genes
分类号
R289.5 [医药卫生—方剂学]
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
盾叶冠心宁片抗动脉粥样硬化相关lncRNA-miRNA-mRNA共表达及关键基因网络构建预测
被引量：
1
2
作者
李艳霞
李益萍
王肖龙
机构
上海中医药大学附属曙光医院
出处
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期3812-3818,共7页
基金
国家自然科学基金面上项目(81573647,82074222)
国家自然科学基金青年科学基金项目(81803887)
+3 种基金
上海市科学技术委员会重点实验室建设(医疗类)项目(14DZ2273200)
上海市科学技术委员会引导类项目(19401934300)
上海市卫生和计划生育委员会中医药事业发展三年行动计划项目[ZY(2018-2020)-CCCX-2003-07]
上海市临床重点专科(中医心病科)(shslczdzk05301)。
文摘
目的研究盾叶冠心宁片抗ApoE^(-/-)小鼠动脉粥样硬化的作用及机制。方法40只ApoE^(-/-)小鼠随机分为空白组、模型组、可定组、盾叶组,每组10只。空白组给予基础饲料,其余各组均给予高脂饲料。造模的同时可定组、盾叶组分别灌胃给予瑞舒伐他汀钙片0.76 mg/kg、盾叶冠心宁片146 mg/kg。12周后,对主动脉窦进行HE染色、油红O染色、Masson染色。全基因转录组测序技术对空白组、模型组、盾叶组筛选差异基因进行聚类分析、WGCNA及STEM分析重叠基因、GO和KEGG功能通路分析,同时构建相关网络。结果病理染色结果显示,与模型组比较,可定组、盾叶组主动脉窦处的斑块面积及油红面积占比减少(P<0.05),同时胶原纤维增加(P<0.05);与可定组比较,盾叶组主动脉窦斑块面积增加(P<0.05),而油红面积占比和斑块内胶原纤维占比无明显差异(P>0.05)。测序共得到了1623个差异基因;聚类分析可以有效区分不同的组别;WGCNA及STEM分析得到156个重叠基因;经GO和KEGG分析显示盾叶冠心宁片抗动脉粥样硬化作用主要与脂质代谢有关。结论盾叶冠心宁片对ApoE^(-/-)小鼠动脉粥样硬化具有一定干预作用,其机制可能与脂质代谢有关,如脂肪酸代谢、脂质代谢过程、脂类生物合成、PPAR信号通路。
关键词
盾叶冠心宁片
动脉粥样硬化
全
基因
转录
组
测
序
脂质代谢
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
益肾骨康方对肺癌A549细胞形态及转录组基因表达的影响
何理玉
杨梦霞
芦殿荣
冯利
《世界中医药》
CAS
2022
1
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下载PDF
职称材料
2
盾叶冠心宁片抗动脉粥样硬化相关lncRNA-miRNA-mRNA共表达及关键基因网络构建预测
李艳霞
李益萍
王肖龙
《中成药》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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