高羊茅CBF转录激活因子基因片段的克隆 被引量：7

1

作者 吴关庭 胡张华 +3 位作者 郎春秀 陈笑芸 陈锦清 夏英武 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期353-356,共4页

根据拟南芥CBF基因序列的保守区设计 1对特异引物 ,采用PCR方法从高羊茅基因组中扩增出 1个DNA片段并克隆到pUCm T载体中。经序列测定和分析 ,该片段长 60 8bp ,与 3个拟南芥CBF基因的核苷酸及其推导氨基酸序列分别具有 81～ 84%和 75～... 根据拟南芥CBF基因序列的保守区设计 1对特异引物 ,采用PCR方法从高羊茅基因组中扩增出 1个DNA片段并克隆到pUCm T载体中。经序列测定和分析 ,该片段长 60 8bp ,与 3个拟南芥CBF基因的核苷酸及其推导氨基酸序列分别具有 81～ 84%和 75～ 79%的同源性 ,而且推导氨基酸序列中包含有同源性更高的AP2DNA结合域以及CBF蛋白的两段特征序列PKK RPAGRxKFxETRHP和DSAWR。这些结果表明 。 展开更多

关键词 转录激活因子 基因片段 克隆 UC 扩增 蛋白 AP 高羊茅 特异引物 同源性

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目的Ribozyme两侧长片段附加序列（LAS）的去除及其转录载体构建 被引量：6

2

作者 陈桦 陆长德 祁国荣 《生物化学杂志》 CSCD 1995年第1期44-49,共6页

选择小鼠腺苷脱氨酶ｍＲＮＡ特异Ｒｉｂｏｚｙｍｅ做为目的Ｒｉｂｏｚｙｍｅ（Ｒｚ），在目的Ｒｉｂｏｚｙｍｅ两侧分别设计５＇－顺式Ｒｚ和３＇－顺式Ｒｚ，在目的Ｒｉｂｏｚｙｍｅ上设计ＢａｍＨＩ酶切位点，并构建了上述Ｒｉｂｏｚ... 选择小鼠腺苷脱氨酶ｍＲＮＡ特异Ｒｉｂｏｚｙｍｅ做为目的Ｒｉｂｏｚｙｍｅ（Ｒｚ），在目的Ｒｉｂｏｚｙｍｅ两侧分别设计５＇－顺式Ｒｚ和３＇－顺式Ｒｚ，在目的Ｒｉｂｏｚｙｍｅ上设计ＢａｍＨＩ酶切位点，并构建了上述Ｒｉｂｏｚｙｍｅ转录载体ｐＳＣＲｚ２６２，采用该质粒进行体外转录，并对转录靶ＲＮＡ分子进行了切割反应。结果显示ｐＳＣＲｚ２６２在转录过程中发生了自身切割，并释放出目的Ｒｉｂｏｚｙｍｅ－Ｒｚ２６２，该目的Ｒｉｂｏｚｙｍｅ不但去除了两侧长片段附加序列，而且保持了正确的生物学活性，通过ＢａｍＨＩ切点的设计简化了该质粒的筛选。 展开更多

关键词 目的Ribozyme 长片段附加序列 转录 RNA 载体

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人β-防御素-2基因5′-端转录调控区DNA片段的克隆及序列初步分析 被引量：1

3

作者 汪宇辉 黄宁 +1 位作者 吴琦 王伯瑶 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第11期1565-1566,共2页

关键词 人β-防御素-2基因 5′-端转录调控区 DNA片段 克隆 序列分析 基因转录

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体外转录法制备SARS冠状病毒RNA片段

4

作者 张克斌 戢福云 +2 位作者 光丽霞 周世文 钱桂生 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第24期2472-2474,共3页

目的通过体外转录获得SARS冠状病毒RNA片段,为建立RTPCR和荧光定量PCR诊断方法提供阳性对照。方法根据GenBank登录SARS冠状病毒Tor2株基因组序列,选择基因组中18138-18327nt作为目的扩增序列,并将其分解为首尾重叠的3个片段,人工合成对... 目的通过体外转录获得SARS冠状病毒RNA片段,为建立RTPCR和荧光定量PCR诊断方法提供阳性对照。方法根据GenBank登录SARS冠状病毒Tor2株基因组序列,选择基因组中18138-18327nt作为目的扩增序列,并将其分解为首尾重叠的3个片段,人工合成对应的单链DNA序列,通过退火延伸获得全长dsDNA片段,PCR扩增该片段后,连接至载体pMD18T上,筛选含目的插入片段的阳性重组质粒pMD18TSARS,用BamHⅠ和HindⅢ切出目的片段,连接至线性化表达性质粒pGEM上;筛选阳性重组质粒pGEMSARS,测序鉴定后,经HindⅢ酶切线性化,用T7RNA聚合酶进行体外转录,得到含SARS冠状病毒目的序列的RNA片段,转录产物经电泳观察后,用RTPCR验证。结果获得含SARS冠状病毒目的基因序列的RNA片段。结论该RNA片段可用于SARS冠状病毒RTPCR和荧光定量RTPCR诊断方法的阳性对照。 展开更多

关键词 SARS冠状病毒 RNA片段 体外转录 RT-PCR

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鼠牙乳头细胞核心结合因子cDNA片段的克隆与序列测定 被引量：3

5

作者 郭红延 吴补领 +2 位作者 郭希民 陆怀秀 余擎 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第11期1309-1311,共3页

目的　从培养的大鼠牙乳头细胞中克隆核心结合因子 (cbfa1)的cDNA片段。方法　原代培养大鼠牙乳头细胞 ,提取培养细胞的总RNA ,逆转录合成cDNA ,用PCR的方法扩增cbfa1基因片段。将获得的预期大小的PCR产物插入pUC18克隆载体中 ,转化TOP1... 目的　从培养的大鼠牙乳头细胞中克隆核心结合因子 (cbfa1)的cDNA片段。方法　原代培养大鼠牙乳头细胞 ,提取培养细胞的总RNA ,逆转录合成cDNA ,用PCR的方法扩增cbfa1基因片段。将获得的预期大小的PCR产物插入pUC18克隆载体中 ,转化TOP10感受态细胞 ,蓝白筛选白色克隆 ,进行体外扩增 ,提取质粒进行酶切鉴定 ,含目的插段的克隆在PE317 A自动测序仪上进行序列测定。结果　从培养的鼠牙乳头细胞提取的总RNA中成功克隆出 6 91bpcbfa1基因片段 ,测序结果和GenBank报道序列完全一致。结论　从鼠牙乳头细胞中成功克隆到cbfa1基因片段 ,确切的证实了核心结合因子 (cbfa1)基因在鼠牙乳头细胞中的表达。 展开更多

关键词 鼠牙乳头细胞 核心结合因子 CDNA片段 基因表达 成骨细胞转录因子

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D10-86cDNA片段在人食管癌中的表达 被引量：1

6

作者 郭长青 王明荣 +6 位作者 陈宝生 李继昌 徐昕 蔡岩 韩亚玲 刘国永 吴旻 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期12-14,共3页

目的:D10-86cDNA片段是通过mRNA差异显示技术分离的在食管癌中低表达的cDNA片段。由于mRNA差异显示技术具有较高的假阳性,故需进一步鉴定其在食管癌中的表达情况。方法:采用RT-PCR方法检测了41对食管癌组织及配对食管癌旁粘膜和食管癌... 目的:D10-86cDNA片段是通过mRNA差异显示技术分离的在食管癌中低表达的cDNA片段。由于mRNA差异显示技术具有较高的假阳性,故需进一步鉴定其在食管癌中的表达情况。方法:采用RT-PCR方法检测了41对食管癌组织及配对食管癌旁粘膜和食管癌细胞系EC9706和肺癌细胞系GLC82中D10-86cDNA片段的表达。结果:D10-86cDNA片段在41.5%(17/41)食管癌组织中的表达明显低于相应的癌旁粘膜,未检测到表达和微弱表达的分别为9.8%(4/41)和31.7%(13/41),食管癌组织中的表达高于相应的癌旁粘膜7.3%(3/41),表达无差别的51.2%(21/41);在食管癌细胞系EC9706和肺腺癌细胞系GLC82未检测到表达;D10-86cDNA片段表达下调与食管癌临床病理因素无显著相关性(P>0.05)。结论:D10-86cDNA片段在人食管癌中表达下调。 展开更多

关键词 食管肿瘤 基因表达 D10-86 CDNA片段 逆转录聚合酶链反应 食管癌

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食管癌组织中cystatin B基因、D10-86 cDNA片段的表达 被引量：1

7

作者 郭长青 王明荣 +6 位作者 李继昌 徐峰 陈宝生 徐昕 蔡岩 韩亚玲 吴旻 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2004年第2期235-238,共4页

目的:研究食管癌组织中cystatin B基因、D10-86 cDNA片段的表达及相关性。方法:采用RT-PCR方法检测了41对食管癌组织及配对食管癌旁正常黏膜cystatin B基因、D10-86 cDNA片段的表达。结果:cystatin B基因、D10-86 cDNA片段各在82.9％(34... 目的:研究食管癌组织中cystatin B基因、D10-86 cDNA片段的表达及相关性。方法:采用RT-PCR方法检测了41对食管癌组织及配对食管癌旁正常黏膜cystatin B基因、D10-86 cDNA片段的表达。结果:cystatin B基因、D10-86 cDNA片段各在82.9％(34/41)、41.5％(17/41)食管癌组织中的表达水平低于配对的食管癌旁正常黏膜,cystatin B基因的表达下调情况显著高于D10-86 cDNA片段(P<0.05),但2者的表达无相关性(JD>0.05)。结论:cystatin B基因、D10-86 cDNA片段在食管癌中表达下调,可能源于不同的机制。2者可能分别是由不同的机制而导致在食管癌组织中表达下调。 展开更多

关键词 CYSTATIN B基因 D10—86 CDNA片段 食管肿瘤 基因表达 逆转录聚合酶链反应

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香蕉枯萎病菌4个生理小种核糖体DNA内转录间隔区的RFLP分析 被引量：1

8

作者 舒灿伟 曾蕊 +1 位作者 杨媚 周而勋 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期52-56,共5页

【目的】明确香蕉枯萎病菌Fusarium oxysporum f.sp.cubense 4个生理小种的系统发育关系。【方法】利用PCR扩增该病菌4个生理小种的核糖体DNA内转录间隔区(Internal transcribed spacer,ITS),利用AIu I、Hpa II和Taq I 3种限制性内切酶... 【目的】明确香蕉枯萎病菌Fusarium oxysporum f.sp.cubense 4个生理小种的系统发育关系。【方法】利用PCR扩增该病菌4个生理小种的核糖体DNA内转录间隔区(Internal transcribed spacer,ITS),利用AIu I、Hpa II和Taq I 3种限制性内切酶对这些小种的ITS产物进行RFLP分析。【结果】PCR扩增结果表明:来自4个生理小种的8个菌株均可扩增得到568 bp的ITS单一片段,但这些生理小种间的片段没有明显的多态性;对这些生理小种ITS产物进行RFLP分析发现,不同生理小种之间的差异很小。【结论】PCR-RFLP技术不适用香蕉枯萎病菌生理小种的分析鉴定。 展开更多

关键词 香蕉枯萎病菌 生理小种 内部转录间隔区 聚合酶链式反应 限制性片段长度多态性

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酵母菌3-磷酸甘油脱氢酶基因(gpd1)的克隆及其在高渗胁迫下mRNA转录水平的差异 被引量：2

9

作者 张凡 马向东 +5 位作者 余华顺 姚娟 郭永豪 邢学森 阎淳泰 梁运祥 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期15-19,共5页

YY、FHS和WFB是生产中常用的酵母菌株。在高渗胁迫下的生长速度依次为FHS、YY、WFB。克隆gpd1基因片段并测序,再与NCBI公布的gpd1序列(X76859)比较,WFB、YY、FHS的同源性分别为99·32%、99·83%、99·83%,YY、FHS菌株的gpd... YY、FHS和WFB是生产中常用的酵母菌株。在高渗胁迫下的生长速度依次为FHS、YY、WFB。克隆gpd1基因片段并测序,再与NCBI公布的gpd1序列(X76859)比较,WFB、YY、FHS的同源性分别为99·32%、99·83%、99·83%,YY、FHS菌株的gpd1序列与NCBI上的gpd1序列(X76859)对应的氨基酸序列完全一致,WFB与它们的同源性只有98·5%。用不同浓度的NaCl培养酵母细胞进行渗透胁迫处理,RNA点杂交显示YY、FHS菌株gpd1基因的mRNA表达量在NaCl浓度上升时候有上升的趋势;WFB菌株gpd1基因的mRNA表达量随NaCl浓度的上升逐渐降低。实验结果显示,gpd1基因mRNA转录水平与抗高渗能力相关。 展开更多

关键词 mRNA 转录水平 脱氢酶基因 克隆 NaCl浓度 甘油 磷酸 RNA点杂交 NCBI 氨基酸序列 酵母菌株 生长速度 基因片段 胁迫处理 酵母细胞 同源性 表达量 上升 显示 测序

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长片段非编码RNA及其功能 被引量：2

10

作者 陈龙 《生物学教学》 北大核心 2010年第3期2-4,共3页

本文主要介绍了长片段非编码RNA的特性、功能以及与一些疾病的关系。

关键词 长片段非编码RNA 转录调控 疾病发生

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EB病毒基因在鼻咽癌组织转录表达的研究

11

作者 陈小君 易青 刘克拉 《中山大学学报（医学科学版）》 CAS CSCD 1993年第3期197-199,共3页

本研究在转录水平上,利用转录载体PGEM-2与两种EB病毒基因片段(LMP和FBER-1)分别构建重组质粒,以SP^6和T^7RNA聚合酶合成含有~35标记的单链反义RNA(Anti-sense RNA或cRNA)和正义RNA(sense RNA),并分别与经病理确诊的鼻咽癌组织40例进行... 本研究在转录水平上,利用转录载体PGEM-2与两种EB病毒基因片段(LMP和FBER-1)分别构建重组质粒,以SP^6和T^7RNA聚合酶合成含有~35标记的单链反义RNA(Anti-sense RNA或cRNA)和正义RNA(sense RNA),并分别与经病理确诊的鼻咽癌组织40例进行组织原位杂交,结果显示与40例鼻咽癌组织原位杂交后,LMP单链反义RNA有36例呈阳性,其阳性率为90％;EBER-1反义RNA40例均呈阳性,阳性率为100％;两种基因片段的单链正义RNA均为阴性。 展开更多

关键词 鼻咽癌组织 EB病毒 反义RNA 阳性率 单链 转录表达 基因片段 酶合成 转录水平 ^35S标记

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马立克病疱疹病毒致瘤株基因组IRL区Bam H I I2和L片段内一特异性cDNA的分离与鉴定

12

作者 卢春 吴建平 +2 位作者 张训海 朱鸿飞 蔡宝祥 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CSCD 1999年第6期447-449,共3页

目的　了解马立克病疱疹病毒（ＭＤＶ）强毒ＧＡ株Ｂａｍ ＨＩＬ片段在ＭＤＶ致瘤毒株京－１株（中国特有的地方株）所诱导的淋巴肿瘤组织中转录状况。方法　从人工感染ＭＤＶ致瘤株京－１株发病鸡内脏淋巴肿瘤组织中分离ｍ ＲＮＡ，根... 目的　了解马立克病疱疹病毒（ＭＤＶ）强毒ＧＡ株Ｂａｍ ＨＩＬ片段在ＭＤＶ致瘤毒株京－１株（中国特有的地方株）所诱导的淋巴肿瘤组织中转录状况。方法　从人工感染ＭＤＶ致瘤株京－１株发病鸡内脏淋巴肿瘤组织中分离ｍ ＲＮＡ，根据已发表的ＭＤＶ肿瘤候选基因ｍ ｅｑ 基因序列和我们已测定的强毒ＧＡ株Ｂａｍ ＨＩＬ片段序列，设计两段寡核苷酸引物，以此ｍ ＲＮＡ为模板经逆转录合成ｃＤＮＡ，应用ＰＣＲ法进行目的基因扩增。用非放射性Ｄｉｇｏｘｉｇｅｎｉｎ 分别标记ＧＡ株基因组Ｂａｍ ＨＩＩ２和ＬＤＮＡ片段，制成核酸探针，分别与ＰＣＲ产物作Ｓｏｕｔｈｅｒｎ ｂｌｏｔ分子杂交鉴定。结果　逆转录聚合酶链反应（ＲＴ－ＰＣＲ）扩增的ｃＤＮＡ大小约７３０ ｂｐ，该ｃＤＮＡ能同时与上述两探针发生免疫呈色反应。结论　①ＭＤＶ ｍ ｅｑ基因的转录可以延伸到其右侧的Ｂａｍ ＨＩＬ片段区；②Ｂａｍ ＨＩＬ区在ＭＤＶ致瘤株京－１株所诱导的淋巴肿瘤组织中可发生转录。 展开更多

关键词 疱疹病毒 MEQ基因 BamHIL片段 基因转录 MDV

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5种多房棘球绦虫续绦期幼虫的制备RNA方法比较及长片段DNART-PCR扩增方法研究

13

作者 王昌源 张洪花 +1 位作者 陈雅棠 刘杞 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2004年第10期863-867,共5页

目的探讨从多房棘球绦虫续绦期幼虫制备RNA的最佳方法,研究逆转录PCR扩增DNA长片段目的基因的方法。方法应用改良的琼脂糖核酸电泳方法和RT-PCR技术比较观察了5种商品化RNA/mRNA提取试剂/试剂盒用于提取多房棘球绦虫续绦期幼虫RNA的效果... 目的探讨从多房棘球绦虫续绦期幼虫制备RNA的最佳方法,研究逆转录PCR扩增DNA长片段目的基因的方法。方法应用改良的琼脂糖核酸电泳方法和RT-PCR技术比较观察了5种商品化RNA/mRNA提取试剂/试剂盒用于提取多房棘球绦虫续绦期幼虫RNA的效果;用琼脂糖凝胶电泳方法观察比较了不同的DNA聚合酶用于RT-PCR扩增长片段EMⅡ/3(1.72kb)和EM10(1.76kb)的效果。结果总RNA提取试剂盒(RNeasyTotalRNAKit)提取的多房棘球绦虫续绦期幼虫RNA电泳显示出清晰的28S、18SrRNA条带和弥散于0.8kb至20kb之间未降解的mRNA,是唯一能逆转录扩增出单一目的条带的核酸提取物。TaqDNA聚合酶与高保真DNA聚合酶Pfu的混合制剂TaqPlus应用于RT-PCR可扩增出大量1720bp和1760bp单一目的基因。结论总RNA提取试剂盒(RNeasyTotalRNAKit)对多房棘球绦虫续绦期幼虫RNA的提取效果最好;TaqPlus适合用于RT-PCR扩增长片段目的基因。 展开更多

关键词 长片段DNA 逆转录 聚合酶链式反应 多房棘球绦虫 DNA聚合酶 RNA制备方法

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mRNA差异显示法分离早期胚胎发育相关基因片段

14

作者 赵振华 钱红娟 +1 位作者 周敏敏 王杏龙 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2008年第12期27-29,共3页

关键词 早期胚胎发育 MRNA差异显示法 基因片段 分离 个体发育 遗传因子 卵母细胞 基因转录

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藻类rDNA特异性片段长度多态性在溺死鉴定中的应用 被引量：4

15

作者 袁文勇 汤晓蕙 +1 位作者 周顺平 俞卫东 《法医学杂志》 CAS CSCD 2018年第5期516-519,共4页

目的通过检验水体和人体器官中硅藻核糖体DNA(rDNA) 5.8S部分序列、第二内转录间隔区(second internal transcribed spacer,ITS2)序列(5.8S+ITS2)的长度多态性差异,判断溺水死亡案件中受害人的落水地点以及受害人系生前落水还是死后被... 目的通过检验水体和人体器官中硅藻核糖体DNA(rDNA) 5.8S部分序列、第二内转录间隔区(second internal transcribed spacer,ITS2)序列(5.8S+ITS2)的长度多态性差异,判断溺水死亡案件中受害人的落水地点以及受害人系生前落水还是死后被抛尸入水。方法以南京市公安局法医中心受理的2例硅藻检验鉴定案例为对象,利用5.8S+ITS2分子标记的长度多态性,分析藻类生物在水体、人体组织中种群结构的差异。结果案例1中,在受害人肺、肝组织和水体样本中均检出种类相近的硅藻,利用5.8S+ITS2分子标记在死者肺组织和水体样本中均检出330 bp和376 bp两种DNA片段,确定受害人系生前溺水。案例2中,在死者肺、肝组织中均未检出硅藻,利用5.8S+ITS2分子标记在死者肺组织中仅获得1条DNA片段,长度为331 bp,相对荧光单位值非常低,确定受害人系死后抛尸入水。结论本方法检验两案例的实验结果符合实际案情和硅藻镜检的结论,利用5.8S+ITS2分子标记研究水体和人体组织中特定微生物的种群结构差异,从而判断溺水死亡的落水地点以及受害人系生前落水还是死后被抛尸入水等问题具有可行性。 展开更多

关键词 法医病理学 法医遗传学 硅藻类 DNA 核糖体 第二内转录间隔区 扩增片段长度多态性分析 溺死

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盐胁迫下棉属野生种旱地棉(Gossypium aridum)差异表达基因的cDNA-AFLP分析(英文) 被引量：6

16

作者 刘章伟 冯娟 +3 位作者 范昕琦 徐鹏 张香桂 沈新莲 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2012年第5期435-443,共9页

以一个耐盐的二倍体野生种旱地棉和对盐敏感的陆地棉栽培种苏棉12号为材料，运用cDNA—AFLP技术，比较两个材料分别在盐胁迫前后的表达情况，获得了25个仅在旱地棉盐胁迫下特异表达的转录片段（TDF）。将这些片段进行电子克隆，延伸后... 以一个耐盐的二倍体野生种旱地棉和对盐敏感的陆地棉栽培种苏棉12号为材料，运用cDNA—AFLP技术，比较两个材料分别在盐胁迫前后的表达情况，获得了25个仅在旱地棉盐胁迫下特异表达的转录片段（TDF）。将这些片段进行电子克隆，延伸后的序列进行BLAST分析，结果显示23个转录片段推断的氨基酸序列与已知的蛋白同源，这些盐诱导表达的基因主要涉及离子转运、活性氧清除、细胞信号传导、细胞分裂、转录调节、膜保护、渗透调节等功能蛋白。从23个差异表达的转录片段中选择9个进行实时定量PCR（qRT—PCR）分析，结果表明这些基因在盐胁迫后表达显著增强，而且多数在12～24h达到高峰。这些cDNA克隆是开展棉花耐盐性分子基础研究的重要资源。 展开更多

关键词 棉属 盐胁迫 cDNA—AFLP 转录片段(tdfs) 实时定量PCR(qRT—PCR)

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干旱胁迫下割手密基因cDNA-SCoT差异表达分析（英文） 被引量：1

17

作者 吴凯朝 韦莉萍 +8 位作者 徐林 唐仕云 魏源文 黄诚梅 曹辉庆 罗海斌 蒋胜理 邓智年 李杨瑞 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期201-207,共7页

【目的】通过分析割手密叶片在干旱胁迫下的基因表达谱,筛选获得抗旱相关基因,为开展甘蔗抗旱性遗传改良研究提供候选基因。【方法】以割手密GX83-10为材料,构建正常浇灌(对照)及两个干旱处理叶片总RNA混合池,使用cDNA-SCoT构建割手密GX... 【目的】通过分析割手密叶片在干旱胁迫下的基因表达谱,筛选获得抗旱相关基因,为开展甘蔗抗旱性遗传改良研究提供候选基因。【方法】以割手密GX83-10为材料,构建正常浇灌(对照)及两个干旱处理叶片总RNA混合池,使用cDNA-SCoT构建割手密GX83-10伸长期应答干旱胁迫的基因表达谱,筛选、分离转录衍生片段(TDFs)并进行测序,根据NCBI数据库BLAST同源性检索结果推测基因功能,并使用qRT-PCR对抗旱相关TDFs进行表达验证分析。【结果】成功获得120个上调表达TDFs序列,其中53个TDFs序列与NCBI数据库中已录入的基因具有较高相似性,根据同源基因功能可分为10个类群:结合功能蛋白相关基因(20.75%)、新陈代谢相关基因(13.21%)、通信及信号转导相关基因(13.21%)、转录调控因子相关基因(13.21%)、运输途径相关基因(11.32%)、环境互作相关基因(9.43%)、能量代谢相关基因(7.55%)、蛋白质合成相关基因(3.77%)、防御相关基因(3.77%)及细胞成分生物合成相关基因(3.77%)。通过对运输因子家族蛋白、RING/U-box超家族蛋白、22 kD干旱诱导蛋白、微管蛋白alpha-3链和质膜H+-ATPase进行qRT-PCR分析,结果表明,这些基因在干旱胁迫下均呈不同程度的上调表达。【结论】干旱胁迫下,应用cDNA-SCoT构建割手密叶片基因表达谱筛选抗旱相关基因具有可行性。从割手密叶片中挖掘获得的抗旱及水分有效利用相关基因,可为利用野生种质资源开展甘蔗育种研究提供候选基因,改良甘蔗抗旱性,拓宽甘蔗育种基因库。 展开更多

关键词 割手密 cDNA-SCoT 转录衍生片段(tdfs) 基因 干旱胁迫

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天津地区保护地蔬菜根结线虫种类的分子鉴定 被引量：12

18

作者 霍建飞 任文来 +5 位作者 刘春艳 王勇 田涛 郝永娟 王万立 万久兴 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2012年第5期179-183,共5页

旨为明确天津地区蔬菜根结线虫的主要种类,为该区域线虫病害的防治提供理论依据。从天津市7个区、县温室中采集蔬菜根结线虫样本14份,应用线粒体DNA-限制性片段长度多态性(mtDNA-RFLP)技术,结合核糖体DNA内转录间隔区(rDNA-ITS区)的序... 旨为明确天津地区蔬菜根结线虫的主要种类,为该区域线虫病害的防治提供理论依据。从天津市7个区、县温室中采集蔬菜根结线虫样本14份,应用线粒体DNA-限制性片段长度多态性(mtDNA-RFLP)技术,结合核糖体DNA内转录间隔区(rDNA-ITS区)的序列分析对其进行种类鉴定。结果表明,在天津地区采集的蔬菜根结线虫均为南方根结线虫。 展开更多

关键词 蔬菜 根结线虫 线粒体DNA 限制性片段长度多态性 内转录间隔区

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甜瓜根分泌物介导自毒作用差异基因表达分析 被引量：1

19

作者 谢新蕊 高强 +1 位作者 奚玉培 张志忠 《山西农业大学学报（自然科学版）》 CAS 2013年第4期332-335,共4页

以甜瓜品种"新银辉"为试验材料,利用甜瓜根系分泌物胁迫处理甜瓜幼苗,通过cDNA-AFLP技术分析甜瓜自毒作用相关基因及其表达情况。结果表明,利用63对引物组合获得约1200条TDFs(Transcription-derived fragments),平均每对引物... 以甜瓜品种"新银辉"为试验材料,利用甜瓜根系分泌物胁迫处理甜瓜幼苗,通过cDNA-AFLP技术分析甜瓜自毒作用相关基因及其表达情况。结果表明,利用63对引物组合获得约1200条TDFs(Transcription-derived fragments),平均每对引物组合扩增出15-30条TDF,长度在50-700bp之间。相关基因的表达模式可分为上调、下调、瞬时和持续表达4类。选取表达差异明显片段进行回收、测序、比对,获得42条同源性高的TDFs序列。甜瓜根系分泌物介导的自毒作用相关差异表达基因涉及能量代谢、物质合成与运输、逆境诱导和基因调控及信号传导等过程,分子调控机制较为复杂。 展开更多

关键词 甜瓜 根系分泌物 自毒作用 差异表达转录衍生片段(tdfs) cDNA—AFLP

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RT-PCR检测健康猪扁桃体和流产死胎猪瘟病毒的应用及RFLP分析 被引量：14

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作者 罗廷荣 孙敬锋 +6 位作者 莫扬 刘芳 黄伟坚 陆芹章 温荣辉 秦爱珍 余克伦 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期192-195,共4页

本研究用反转录＿聚合酶链反应(RT＿PCR)技术对广西部分猪场的健康猪扁桃体材料以及流产胎儿和死胎中的猪瘟病毒(HCV)进行检测。70份健康猪扁桃体材料中阳性11份,阳性率达15 7%;52份流产胎儿及死胎材料中检出阳性9份,阳性率达17 3%。表... 本研究用反转录＿聚合酶链反应(RT＿PCR)技术对广西部分猪场的健康猪扁桃体材料以及流产胎儿和死胎中的猪瘟病毒(HCV)进行检测。70份健康猪扁桃体材料中阳性11份,阳性率达15 7%;52份流产胎儿及死胎材料中检出阳性9份,阳性率达17 3%。表明广西猪场中有比较严重的健康带毒情况。用限制性片段长度多态性分析法(RFLP)对25份阳性材料、HCLV和石门毒的引物A1/A2的PCR产物进行分析,发现HCLV、石门强毒和广西流行野毒的RT＿PCR扩增产物中均有RsaⅠ的一个识别序列,但HCLV上的识别序列所在位置不同。本研究表明,用引物A1/A2作RT＿PCR检测,并结合RFLP分析技术可把兔化弱毒和流行野毒区分开来,这将对预防猪瘟起到十分重要的作用。 展开更多

关键词 猪瘟病毒 反转录-聚合酶链式反应 限制性片段长度多态性分析法

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