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铁皮石斛根发育的转录模式及转录因子相关基因的差异表达
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作者 陈宏宇 于莹 +3 位作者 任得强 阮志珍 李二妹 冉琳琳 《湖北农业科学》 2025年第2期207-213,共7页
采用Illumina HiSeqTM4000测序平台对铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)根2个不同部位(根尖区和根成熟区)样品进行测序,对差异表达基因进行GO聚类和KEGG分析。结果表明,铁皮石斛根的高质量读长被组装成136 541个单基因,... 采用Illumina HiSeqTM4000测序平台对铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)根2个不同部位(根尖区和根成熟区)样品进行测序,对差异表达基因进行GO聚类和KEGG分析。结果表明,铁皮石斛根的高质量读长被组装成136 541个单基因,平均长度为982 bp。对具有编码转录因子能力的基因进行鉴定和分类统计,20 105个单基因被映射到55类转录因子中,共识别了148个MADS-box、737个NAC、449个WRKY、369个MYB和105个ARF等。差异表达基因的调控通路涉及很多途径,包括苯丙烷生物合成等次生代谢途径、植物病原体相互作用等环境应答途径以及植物MAPK信号通路等信号转导通路途径。 展开更多
关键词 铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo) 发育 基因 转录模式 转录因子 差异表达
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多年生黑麦草LpPIL15-like基因转录模式及耐逆功能分析 被引量:1
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作者 关昊 姚佳明 +5 位作者 张欣栎 王硕 宋欣瑶 刘信宝 张敬 徐彬 《中国草地学报》 CSCD 北大核心 2024年第2期24-34,共11页
光敏色素互作因子(Phytochrome-interacting factors,PIFs)属于bHLH家族成员,在植物光信号传导、光形态建成和抗逆性等方面发挥重要作用。本研究基于已发表的多年生黑麦草转录组数据,克隆了逆境响应差异表达PIF基因LpPIL15-like,并初步... 光敏色素互作因子(Phytochrome-interacting factors,PIFs)属于bHLH家族成员,在植物光信号传导、光形态建成和抗逆性等方面发挥重要作用。本研究基于已发表的多年生黑麦草转录组数据,克隆了逆境响应差异表达PIF基因LpPIL15-like,并初步分析其基因特征、转录模式及耐逆功能。LpPIL15-like基因具有5个外显子,编码区全长为1671 bp,编码556个氨基酸,与硬直黑麦草LrPIL15-like基因亲缘关系最近。LpPIL15-like蛋白具有典型的bHLH结构域及APB和APA功能域,定位于细胞核。LpPIL15-like启动子中含有ABRE、CGTCA-motif和G-box等激素、逆境和光响应顺式作用元件。定量分析表明,LpPIL15-like在伸展叶中表达量最高,在茎、根和叶鞘中表达量较低。此外,LpPIL15-like基因的表达受昼夜节律调控,在光照条件下的表达量显著高于黑暗条件。PEG、NaCl、CdCl2、高温胁迫以及6-BA、ABA等激素处理0.5、2、6、12、24 h显著增强了叶片中LpPIL15-like基因表达,而逆境胁迫和激素处理0.5、2、6、12 h均显著抑制了LpPIL15-like基因在根中的表达。异源过量表达LpPIL15-like基因显著提高了酵母的耐盐、高温和干旱的能力。综上,LpPIL15-like的转录受昼夜节律、非生物逆境和植物激素调控,可作为黑麦草耐逆遗传改良的候选基因。 展开更多
关键词 多年生黑麦草 光敏色素互作因子 转录模式 非生物胁迫 耐逆功能
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猪圆环病毒复制与转录模式研究进展 被引量:3
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作者 琚春梅 《动物医学进展》 CSCD 2007年第4期68-72,共5页
猪圆环病毒(PCV)是一种单股、环状DNA病毒,有两种血清型,其中PCV-2是引起断奶仔猪多系统衰竭综合征的重要病原,给世界养猪业造成了巨大的经济损失。文章主要从PCV-1和PCV-2的基因组结构、复制起始区的结构与功能、复制相关蛋白的结构与... 猪圆环病毒(PCV)是一种单股、环状DNA病毒,有两种血清型,其中PCV-2是引起断奶仔猪多系统衰竭综合征的重要病原,给世界养猪业造成了巨大的经济损失。文章主要从PCV-1和PCV-2的基因组结构、复制起始区的结构与功能、复制相关蛋白的结构与功能、转录图谱、各转录物的剪接方式及主要转录物的转录效率等方面进行了综述,同时也对二者的复制与转录模式的异同点进行了比较。这些结果对PCV-1和PCV-2毒力差异的分子机制研究具有一定的借鉴意义,同时可为抗PCV药物的研发提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 猪圆环病毒 基因组结构 复制模式 转录模式
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猪圆环病毒2型复制与转录模式研究进展
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作者 王伟丞 梁海英 +3 位作者 曾智勇 汤德元 刘钊 代振江 《猪业科学》 2015年第1期106-107,共2页
猪圆环病毒是一种单股负链环状DNA病毒,有PCV1和PCV2两种血清型,PCV1一般认为无致病性,而PCV2是导致断奶仔猪多系统衰竭综合症的重要病原,给养猪业造成了巨大的经济损失。PCV复制模式为坩埚滚环复制,须依赖于Rep和Rep,蛋白的共表达、病... 猪圆环病毒是一种单股负链环状DNA病毒,有PCV1和PCV2两种血清型,PCV1一般认为无致病性,而PCV2是导致断奶仔猪多系统衰竭综合症的重要病原,给养猪业造成了巨大的经济损失。PCV复制模式为坩埚滚环复制,须依赖于Rep和Rep,蛋白的共表达、病毒复制起始区和双链DNA片段的形成,三者缺一不可;其转录模式也较为复杂,可双向进行且通过选择性剪切从而产生不同的RNA。主要对PCV2复制模式和转录模式等方面进行综述,以期为PCV的相关研究提供借鉴和参考。 展开更多
关键词 猪圆环病毒 基因组结构 复制模式 转录模式
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小地老虎AiHSP19.3基因鉴定及其对高温和杀虫剂胁迫的响应 被引量:1
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作者 邵云飞 张今 +5 位作者 王莹莹 江连强 刘苏 仇腾腾 范子明 李茂业 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期80-87,共8页
小地老虎Agrotis ipsilon是一种重要的农业害虫。小分子热激蛋白(sHSP)是细胞抵御外界胁迫的关键蛋白,本文旨在探索sHSP基因在小地老虎不同发育阶段以及在高温和杀虫剂胁迫下的响应模式。使用同源检索方法从小地老虎转录组中鉴定到了一... 小地老虎Agrotis ipsilon是一种重要的农业害虫。小分子热激蛋白(sHSP)是细胞抵御外界胁迫的关键蛋白,本文旨在探索sHSP基因在小地老虎不同发育阶段以及在高温和杀虫剂胁迫下的响应模式。使用同源检索方法从小地老虎转录组中鉴定到了一个sHSP基因的cDNA序列,命名为AiHSP 19.3。通过RT-PCR技术克隆该序列,利用实时荧光定量PCR技术分析AiHSP 19.3基因在小地老虎不同发育阶段和不同组织中的转录模式,并分析了该基因在高温和杀虫剂胁迫下的转录水平。结果表明,小地老虎AiHSP 19.3基因的开放阅读框为516 bp,编码含171个氨基酸,分子量为19.3 kD的蛋白,具有sHSP典型的α-晶状体结构域(ACD)。在供试小地老虎的不同发育阶段和3龄幼虫组织中均能检测到AiHSP 19.3的转录,其中在6龄幼虫和3龄幼虫脂肪体内转录水平最高。小地老虎幼虫经高温和3种杀虫剂(高效氯氟氰菊酯、氯虫苯甲酰胺及辛硫磷)处理后AiHSP 19.3的转录水平显著提高,表明该基因可能在响应高温及杀虫剂胁迫中起到重要作用。 展开更多
关键词 小地老虎 小分子热激蛋白 高温 杀虫剂 转录模式
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