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盐芥STZ转录因子基因的克隆及序列分析
1
作者
王荣
李晓峰
+2 位作者
高飞
黄继昌
周宜君
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2012年第9期215-220,共6页
【目的】克隆盐芥STZ转录因子基因,对其进行序列分析,为进一步研究ThSTZ转录因子在逆境应答中的作用奠定基础。【方法】利用GenBank数据库中盐芥STZ转录因子的EST序列设计特异引物,通过3′RACE技术克隆ThSTZ基因的全长序列,应用生物信...
【目的】克隆盐芥STZ转录因子基因,对其进行序列分析,为进一步研究ThSTZ转录因子在逆境应答中的作用奠定基础。【方法】利用GenBank数据库中盐芥STZ转录因子的EST序列设计特异引物,通过3′RACE技术克隆ThSTZ基因的全长序列,应用生物信息学手段对该基因编码蛋白的结构与功能、亚细胞定位等进行预测,并对其编码氨基酸序列的同源性和系统进化进行分析。【结果】盐芥STZ转录因子基因全长717bp,编码238个氨基酸。其编码蛋白含有2个C2H2型锌指结构域,位于细胞核内,属于C2H2家族转录因子;多重序列比对和系统进化分析表明,盐芥STZ转录因子与拟南芥属植物同源蛋白的相似性最高。【结论】获得了ThSTZ转录因子基因的全长序列,为进一步探讨ThSTZ转录因子在逆境应答中的功能奠定了基础。
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关键词
盐芥
C2H2型锌指蛋白
转录因子stz
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职称材料
题名
盐芥STZ转录因子基因的克隆及序列分析
1
作者
王荣
李晓峰
高飞
黄继昌
周宜君
机构
阜阳师范学院生命科学学院
北京市科学技术委员会
中央民族大学生命与环境科学学院
出处
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2012年第9期215-220,共6页
基金
安徽省教育厅自然科学研究项目(KJ2012A215)
国家自然科学基金项目(31070361)
+5 种基金
教育部科学技术研究重点项目(210266)
中央高校基本科研业务费专项(1112KYQN31
0910KYZY43)
国家985工程项目(MUC98507-08)
高等学校学科创新引智计划项目(B08044)
国家民委科研项目(10ZY01)
文摘
【目的】克隆盐芥STZ转录因子基因,对其进行序列分析,为进一步研究ThSTZ转录因子在逆境应答中的作用奠定基础。【方法】利用GenBank数据库中盐芥STZ转录因子的EST序列设计特异引物,通过3′RACE技术克隆ThSTZ基因的全长序列,应用生物信息学手段对该基因编码蛋白的结构与功能、亚细胞定位等进行预测,并对其编码氨基酸序列的同源性和系统进化进行分析。【结果】盐芥STZ转录因子基因全长717bp,编码238个氨基酸。其编码蛋白含有2个C2H2型锌指结构域,位于细胞核内,属于C2H2家族转录因子;多重序列比对和系统进化分析表明,盐芥STZ转录因子与拟南芥属植物同源蛋白的相似性最高。【结论】获得了ThSTZ转录因子基因的全长序列,为进一步探讨ThSTZ转录因子在逆境应答中的功能奠定了基础。
关键词
盐芥
C2H2型锌指蛋白
转录因子stz
Keywords
Thellungiella halophila
C2H2 zinc-finger protein
transcription factor
stz
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
盐芥STZ转录因子基因的克隆及序列分析
王荣
李晓峰
高飞
黄继昌
周宜君
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》
CSCD
北大核心
2012
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