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DNA条形码在入侵植物鉴定中的应用进展
被引量：
1
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作者
田旭飞
曲波
《生物安全学报》
2016年第2期99-105,共7页
生物入侵对世界经济、环境造成了巨大的影响,已经成为世界关注的焦点。传统的海关检验方法存在鉴定缓慢、准确率低、鉴定专家稀缺等问题,因此急需一种鉴定率高、操作简单和快速的方法对入侵植物的繁殖体进行精确的鉴别。DNA条形码是一...
生物入侵对世界经济、环境造成了巨大的影响,已经成为世界关注的焦点。传统的海关检验方法存在鉴定缓慢、准确率低、鉴定专家稀缺等问题,因此急需一种鉴定率高、操作简单和快速的方法对入侵植物的繁殖体进行精确的鉴别。DNA条形码是一种基于DNA序列差异进行物种鉴定的技术,鉴定结果只受样品组织内DNA保存状况影响,不受形态学性状保存状态影响,只需掌握简单分子生物学技术的工作人员即可实现对未知样品的鉴定,在入侵植物检疫鉴定中有很大的应用潜力。根据入侵植物进化快、变异多的特点,可优先考虑种间、种内差异度高的ITS基因作为核心条形码,再以mat K和rbc L基因为辅助条形码。本文分析了植物DNA条形码技术及其衍生出的超级DNA条形码和metabarcoding技术在入侵植物鉴定中的应用潜力,提出构建入侵植物DNA条形码参考数据库与智能植物志(i Flora)相结合,为利用DNA条形码技术对入侵植物进行快速鉴定和相关研究提供参考。
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关键词
DNA
条形码
入侵植物
超级
DNA
条形码
metabarcoding
智能植物志
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职称材料
维管植物质体基因组多样性及其获取与应用研究进展
2
作者
陈丽琼
黎若竹
+4 位作者
李鑫
姚昕
杨俊波
李德铢
郁文彬
《广西植物》
北大核心
2025年第3期466-482,共17页
维管植物是地球生物多样性的重要组成部分,维管植物的系统分类、多样性起源和演化等问题一直备受关注。随着测序技术的发展,越来越多的维管植物质体基因组序列被解析和发表,为深入认识维管植物多样性的起源和演化提供了新的证据。该文...
维管植物是地球生物多样性的重要组成部分,维管植物的系统分类、多样性起源和演化等问题一直备受关注。随着测序技术的发展,越来越多的维管植物质体基因组序列被解析和发表,为深入认识维管植物多样性的起源和演化提供了新的证据。该文介绍了维管植物质体基因组的基本特征和结构多样性,并以寄生植物为例简述了质体基因组退化;回顾了当前主流的质体基因组的测序技术及组装策略,并探讨了获取标本DNA和特殊类群的质体基因组时需要注意的问题。此外,该文还探讨了质体基因组在系统发育和超级DNA条形码研究中面临的问题与挑战,并提出了相应的建议。
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关键词
质体基因组演化
基因组结构变异
质体基因组获取
系统发育
超级条形码
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职称材料
题名
DNA条形码在入侵植物鉴定中的应用进展
被引量：
1
1
作者
田旭飞
曲波
机构
沈阳农业大学生物科学技术学院
出处
《生物安全学报》
2016年第2期99-105,共7页
基金
沈阳市大型仪器共享项目(F13-306-4-00)
国家水体污染控制与治理科技重大专项(2012ZX07202-004-01)
文摘
生物入侵对世界经济、环境造成了巨大的影响,已经成为世界关注的焦点。传统的海关检验方法存在鉴定缓慢、准确率低、鉴定专家稀缺等问题,因此急需一种鉴定率高、操作简单和快速的方法对入侵植物的繁殖体进行精确的鉴别。DNA条形码是一种基于DNA序列差异进行物种鉴定的技术,鉴定结果只受样品组织内DNA保存状况影响,不受形态学性状保存状态影响,只需掌握简单分子生物学技术的工作人员即可实现对未知样品的鉴定,在入侵植物检疫鉴定中有很大的应用潜力。根据入侵植物进化快、变异多的特点,可优先考虑种间、种内差异度高的ITS基因作为核心条形码,再以mat K和rbc L基因为辅助条形码。本文分析了植物DNA条形码技术及其衍生出的超级DNA条形码和metabarcoding技术在入侵植物鉴定中的应用潜力,提出构建入侵植物DNA条形码参考数据库与智能植物志(i Flora)相结合,为利用DNA条形码技术对入侵植物进行快速鉴定和相关研究提供参考。
关键词
DNA
条形码
入侵植物
超级
DNA
条形码
metabarcoding
智能植物志
Keywords
DNA barcoding
invasive plant
ultra-barcoding
meta-barcoding
iFlora
分类号
S45 [农业科学—植物保护]
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职称材料
题名
维管植物质体基因组多样性及其获取与应用研究进展
2
作者
陈丽琼
黎若竹
李鑫
姚昕
杨俊波
李德铢
郁文彬
机构
中国科学院西双版纳热带植物园综合保护中心和云南省热带雨林与亚洲象保护重点实验室
钦州市农业技术推广中心
奈良先端科学技术大学院大学科学技术研究生院
中国科学院昆明植物研究所中国西南野生生物种质资源库
中国科学院东南亚生物多样性研究中心
出处
《广西植物》
北大核心
2025年第3期466-482,共17页
基金
国家自然科学基金(31870196,32371700)
云南省兴滇人才专项(202405AS350019)
+2 种基金
中国科学院西部青年人才项目
云南省基础研究专项重大项目(202101BC070003)
海南省重点研发计划项目(ZDYF2023RDY201)。
文摘
维管植物是地球生物多样性的重要组成部分,维管植物的系统分类、多样性起源和演化等问题一直备受关注。随着测序技术的发展,越来越多的维管植物质体基因组序列被解析和发表,为深入认识维管植物多样性的起源和演化提供了新的证据。该文介绍了维管植物质体基因组的基本特征和结构多样性,并以寄生植物为例简述了质体基因组退化;回顾了当前主流的质体基因组的测序技术及组装策略,并探讨了获取标本DNA和特殊类群的质体基因组时需要注意的问题。此外,该文还探讨了质体基因组在系统发育和超级DNA条形码研究中面临的问题与挑战,并提出了相应的建议。
关键词
质体基因组演化
基因组结构变异
质体基因组获取
系统发育
超级条形码
Keywords
plastome evolution
genome structure variation
acquiring plastomes
phylogeny
super-barcodes
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
DNA条形码在入侵植物鉴定中的应用进展
田旭飞
曲波
《生物安全学报》
2016
1
在线阅读
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职称材料
2
维管植物质体基因组多样性及其获取与应用研究进展
陈丽琼
黎若竹
李鑫
姚昕
杨俊波
李德铢
郁文彬
《广西植物》
北大核心
2025
0
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