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超敏结核分枝杆菌和利福平耐药基因检测技术在结核病诊断中的应用进展
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作者 张永恒 岳菀潞 秦刚 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期469-475,共7页
1结核病现状结核病是严重危害人类健康的传染性疾病之一,是仅次于新型冠状病毒感染的第二大传染病杀手,是全球第13大死因[1]。2022年10月27日,世界卫生组织(World Health Organization,WHO)发布《2022全球结核病报告》[2](以下简称报告... 1结核病现状结核病是严重危害人类健康的传染性疾病之一,是仅次于新型冠状病毒感染的第二大传染病杀手,是全球第13大死因[1]。2022年10月27日,世界卫生组织(World Health Organization,WHO)发布《2022全球结核病报告》[2](以下简称报告)指出,2021年全球新发结核病患者约1060万人,其中儿童约120万人。受新型冠状病毒的影响,全球结核病发病率与2020年相比上升了3.6%,打破了过去20年间每年约2%的下降趋势。2019年至2021年,全球因结核病死亡人数有所增加,2021年全球共有160万人死于结核病,相当于倒退到2017年的水平。2020年至2021年全球耐药结核病负担增加了3%,2021年报告了45万例利福平耐药结核病例,需要治疗的耐药结核患者中仅有36%的人接受了治疗,并且全球耐药结核的成功治疗率只有60%。2021年全球结核病基本医疗服务支出也从2019年的60亿美元下降至54亿美元,而2022年所需的费用为130亿美元[2],资金缺口巨大。 展开更多
关键词 结核 分子生物学 超敏结核分枝杆菌和利福平耐药基因 快速诊断
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结核分枝杆菌利福平耐药的分子机制及检测技术 被引量:1
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作者 杨国元 黄福岚 杨彩虹 《畜牧兽医科技信息》 2024年第3期24-26,共3页
结核病是一种由结核分枝杆菌引起的人畜共患病,长期以来不仅给人类健康产生巨大威胁,也给养殖场(户)造成巨大的经济损失。利福平作为一个关键性药物,在结核病漫长的治疗历程中发挥了里程牌作用,但随着药物的使用,结核分支杆菌对利福平... 结核病是一种由结核分枝杆菌引起的人畜共患病,长期以来不仅给人类健康产生巨大威胁,也给养殖场(户)造成巨大的经济损失。利福平作为一个关键性药物,在结核病漫长的治疗历程中发挥了里程牌作用,但随着药物的使用,结核分支杆菌对利福平的耐药性愈发普遍,给结核病治疗带来了挑战。本文对结核分枝杆菌利福平耐药的机制及检测技术做一简单概述,以期为临床上治疗结核病制定合理用药方案提供参考。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 利福平 分子机制 检测
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结核分枝杆菌rpoB基因突变特征与利福平耐药水平关系的研究 被引量:22
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作者 胡族琼 刘燕文 +6 位作者 周文 高璐璐 陈俊宇 谢伟胜 周德旺 曾少芳 钟炳棠 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期39-44,50,共7页
目的了解结核分枝杆菌rpoB基因突变特征与利福平耐药水平的关系。方法测定266株(109株利福平耐药株,157株利福平敏感株)结核分枝杆菌利福平MIC值及其rpoB基因序列,分析不同突变特征的菌株其利福平MIC值的差异。结果 109株利福平耐药株r... 目的了解结核分枝杆菌rpoB基因突变特征与利福平耐药水平的关系。方法测定266株(109株利福平耐药株,157株利福平敏感株)结核分枝杆菌利福平MIC值及其rpoB基因序列,分析不同突变特征的菌株其利福平MIC值的差异。结果 109株利福平耐药株rpoB基因皆发生错义突变,常见突变密码子531与526的突变频率分别为69.7%与17.4%。利福平耐药株中单密码子突变株占82.6%,多重密码子突变株占17.4%。531单密码子突变株与526单密码子突变株之间平均利福平MIC值差异无统计学意义(P=0.87),但两独立样本T检验分析显示,多重密码子突变株平均利福平MIC值(115.8μg/mL)显著高于单密码子突变株平均利福平MIC值(48.4μg/mL)(t=2.659,P=0.016)。利福平敏感株未发生错义突变。5.5%(6/109)的利福平耐药株仅在rpoB基因起始端发生突变,突变密码子分别是247,251和253。结论 531与526是最常见突变密码子,且以单密码子突变为主;531与526单密码子突变株之间利福平耐药水平差异无统计学意义,但多重密码子突变株利福平耐药水平显著高于单密码子突变株利福平耐药水平;rpoB基因起始端突变可能是除利福平耐药决定区域之外导致利福平耐药的第2个耐药决定区;rpoB基因DNA序列分析有助于结核分枝杆菌利福平耐药表型和耐药水平的预测。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 rpoB突变 利福平 水平 最低抑菌浓度
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结核分枝杆菌rpoB基因突变与多重耐药及利福平耐药程度的相关性 被引量:9
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作者 庞茂银 张文宏 +2 位作者 陈澍 胡忠义 翁心华 《复旦学报(医学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第3期228-230,238,共4页
目的 研究结核分枝杆菌rpoB基因突变与多重耐药及利福平耐药程度强弱之间的关系。 方法 应用绝对浓度法测定 5 8株结核分枝杆菌对 4种一线抗结核药物的药敏特性 ,对耐利福平结核分枝杆菌的耐药谱进行分析。同时对含有核心突变区的结... 目的 研究结核分枝杆菌rpoB基因突变与多重耐药及利福平耐药程度强弱之间的关系。 方法 应用绝对浓度法测定 5 8株结核分枝杆菌对 4种一线抗结核药物的药敏特性 ,对耐利福平结核分枝杆菌的耐药谱进行分析。同时对含有核心突变区的结核分枝杆菌rpoB基因片段进行PCR扩增和DNA测序 ,分析rpoB基因突变与多重耐药的关系 ,以及突变位点和突变性质与利福平耐药强弱的相关性。结果  5 8株结核分枝杆菌中 ,利福平耐药株 36株 ,敏感株 2 2株。 36株耐药株均存在rpoB基因突变 ,其中 88.9% (32 / 36 )至少对利福平和异烟肼同时耐药。 90 .0 %的利福平高度耐药株 (18/ 2 0 )与rpoB基因 5 31位和 5 2 6位密码子突变相关。密码子 5 31位和 5 2 6位各有 1株双碱基突变 ,且均为多重耐药株。结论 结核分枝杆菌rpoB基因突变所致的利福平耐药株大部分对异烟肼耐药 ,因此单独检测rpoB基因突变即可初步筛选多重耐药的结核分枝杆菌 ; 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 RPOB基因 突变 多重 利福平 程度 相关性
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河南省耐多药结核分枝杆菌利福平耐药基因rpoB的突变特征 被引量:10
5
作者 赵玉玲 杨洪毅 +3 位作者 马晓光 石洁 李辉 赵东阳 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2012年第2期166-169,共4页
目的:分析河南省耐多药(MDR)结核分枝杆菌利福平耐药相关基因rpoB的突变特征。方法:收集150株MDR结核分枝杆菌,应用PCR扩增利福平耐药相关基因rpoB编码区全长并测序,以结核分枝杆菌H37Rv标准株DNA序列为参比序列,分析菌株的突变特征。结... 目的:分析河南省耐多药(MDR)结核分枝杆菌利福平耐药相关基因rpoB的突变特征。方法:收集150株MDR结核分枝杆菌,应用PCR扩增利福平耐药相关基因rpoB编码区全长并测序,以结核分枝杆菌H37Rv标准株DNA序列为参比序列,分析菌株的突变特征。结果:MDR菌株rpoB基因编码区存在突变者占97.2%(140/144),突变在利福平耐药决定区(RRDR)内者占96.5%(139/144),RRDR内和RRDR外同时存在突变者占99.3%(139/140);突变热点依次为rpoB531、rpoB526和rpoB516。发现未被记录的15个突变位点和4个突变类型,其中rpoB1284位点突变可能是多态性位点,与利福平耐药无关。结论:检测河南地区结核分枝杆菌rpoB基因RRDR内位点的突变可预测MDR结核分枝杆菌的耐药性。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 利福平 RPOB 突变
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应用基因芯片快速检测结核分枝杆菌利福平耐药基因的研究 被引量:13
6
作者 李锋 李凫坚 +1 位作者 陈园园 王静 《中国防痨杂志》 CAS 2011年第3期188-189,共2页
在全球范围内,结核分枝杆菌耐药率不断上升,高耐药和耐多药菌株不断出现和传播,对化疗疗效及结核病流行产生很大影响。利福平(RFP)作为1种主要的抗结核药物,对其耐药常常导致化疗失败。快速检测RFP耐药菌株对了解细菌耐药性有较大意... 在全球范围内,结核分枝杆菌耐药率不断上升,高耐药和耐多药菌株不断出现和传播,对化疗疗效及结核病流行产生很大影响。利福平(RFP)作为1种主要的抗结核药物,对其耐药常常导致化疗失败。快速检测RFP耐药菌株对了解细菌耐药性有较大意义。我们收集了76株临床分离RFP耐药菌株,扩增rpoB基因的核心位点,并进行自主设计DNA芯片检测,并进行DNA直接测序,了解本地区耐利福平结核分枝杆菌rpoB基因的突变特征。 展开更多
关键词 利福平结核分枝杆菌 基因 快速检测 基因芯片 DNA直接测序 RPOB基因 应用 菌株
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某院结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药基因特征 被引量:11
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作者 刘厚明 陈珊 +1 位作者 黄莎莎 单万水 《中国感染控制杂志》 CAS 北大核心 2018年第6期490-495,共6页
目的了解某院结核分枝杆菌(MTB)利福平耐药相关基因rpo B及异烟肼耐药相关基因kat G、inh A的突变特征,为耐药结核病的预防和治疗提供科学依据。方法收集83例结核病患者痰标本,分离培养MTB,采用BD960液体法检测利福平、异烟肼耐药性,提... 目的了解某院结核分枝杆菌(MTB)利福平耐药相关基因rpo B及异烟肼耐药相关基因kat G、inh A的突变特征,为耐药结核病的预防和治疗提供科学依据。方法收集83例结核病患者痰标本,分离培养MTB,采用BD960液体法检测利福平、异烟肼耐药性,提取菌株DNA,采用聚合酶链反应扩增rpo B、kat G、inh A全基因,对扩增产物进行测序分析。结果 83株样本中,39株对利福平耐药,51株对异烟肼耐药。耐利福平菌株rpo B基因突变率为97.44%(38/39),531位点突变率60.53%(23/38),526位点突变率23.68%(9/38),32株出现多位点联合突变。耐异烟肼菌株kat G基因突变率为98.04%(50/51),共发现16种突变类型,其中以kat G 315位点突变为主,占70.00%(35/50),1株为kat G与inh A联合突变。结论该院耐多药MTB产生耐药性与rpo B和kat G基因突变相关,检测MTB耐多药相关基因突变可为早期快速诊断耐药结核病提供参考依据。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 利福平 异烟肼 基因突变
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广西百色地区结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药基因特征 被引量:4
8
作者 韦红玉 隆昕颖 +6 位作者 凌俊 谢振锋 唐华英 黄小凤 韦连登 覃艳春 曾怡 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2015年第5期731-734,共4页
目的:分析百色地区结核分枝杆菌利福平耐药相关基因rpoB及异烟肼耐药相关基因KatG、inhA的突变特征。方法:收集128例结核病患者痰液标本,分离培养结核分枝杆菌并检测利福平及异烟肼耐药性,提取耐药菌株DNA,分析耐药相关基因突变特征。结... 目的:分析百色地区结核分枝杆菌利福平耐药相关基因rpoB及异烟肼耐药相关基因KatG、inhA的突变特征。方法:收集128例结核病患者痰液标本,分离培养结核分枝杆菌并检测利福平及异烟肼耐药性,提取耐药菌株DNA,分析耐药相关基因突变特征。结果:耐利福平菌株rpo B基因突变率为75%(27/36),531位点突变率为59.3%(16/27)。耐异烟肼菌株KatG、inhA基因突变率为44.1%(15/34),其中315位点突变率为66.7%(10/15),出现2个新的突变位点279(4/15)和427(1/15)。inhA 5位点突变率为13.3%(2/15),inhA 16位点突变率为6.7%(2/15),3株为KatG和inhA联合突变。结论:百色地区耐多药结核分枝杆菌耐药性产生与rpoB、katG和inhA基因突变相关,检测本地区结核分枝杆菌耐多药相关基因突变为进一步研究耐药机制及耐药结核病的快速检测提供依据。 展开更多
关键词 结核 结核分枝杆菌 异烟肼 利福平 RPOB KATG INHA
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210株结核分枝杆菌利福平耐药基因rpoB突变特征研究 被引量:15
9
作者 黄振宇 范学工 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期548-551,共4页
目的了解结核分枝杆菌利福平耐药株rpoB基因突变特点。方法对结核分枝杆菌临床分离株包括rpoB基因利福平耐药决定区(RRDR)81个碱基在内的286bp的片段进行PCR-SSCP分析,并对经检测显示有突变的结核分枝杆菌的rpoB基因此扩增区域进行序列... 目的了解结核分枝杆菌利福平耐药株rpoB基因突变特点。方法对结核分枝杆菌临床分离株包括rpoB基因利福平耐药决定区(RRDR)81个碱基在内的286bp的片段进行PCR-SSCP分析,并对经检测显示有突变的结核分枝杆菌的rpoB基因此扩增区域进行序列测定。结果共对210株结核分枝杆菌临床分离菌株进行了研究,其中利福平耐药株110株,非利福平耐药株40株,敏感株60株。PCR-SSCP检测显示110株利福平耐药株中有75株有突变存在,经测序分析,77.3%(58/75)的菌株发生rpoB基因的单位点突变,主要集中在456位60.3%(35/58)和451位25.9%(15/58);22.7%(25/110)的菌株发生了联合突变。此外,经PCR-SSCP检测,40株非利福平耐药株中有3株发生突变,60株敏感株中有2株发生突变。经直接测序分析突变涉及位点为436位、451位和460位。结论结核分枝杆菌利福平耐药的主要原因是rpoB基因耐药决定区发生突变,其中456位丝氨酸和451位组氨酸是最常见的突变位点。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 利福平 RPOB 基因突变
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对利福平敏感的多耐药结核分枝杆菌rpoB基因突变一例 被引量:1
10
作者 闫丽萍 唐神结 +2 位作者 秦莲花 韩敏 肖和平 《中国防痨杂志》 CAS 2013年第2期146-148,共3页
2011年10月11日,世界卫生组织《2011年全球结核病(TB)控制报告》显示,2010年全球结核病新发患者880万例,死亡145万例。虽较前有所下降,但下降过于缓慢,提醒我们结核病防治的工作仍任重道远。利福平是目前广泛使用的杀菌作用最强的抗... 2011年10月11日,世界卫生组织《2011年全球结核病(TB)控制报告》显示,2010年全球结核病新发患者880万例,死亡145万例。虽较前有所下降,但下降过于缓慢,提醒我们结核病防治的工作仍任重道远。利福平是目前广泛使用的杀菌作用最强的抗结核药物之一,其通过结合依赖DNA的RNA多聚酶β亚单位抑制细菌RNA转录。 展开更多
关键词 RPOB基因突变 结核分枝杆菌 利福平 世界卫生组织 RNA多聚酶 结核 RNA转录 结核
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山东省耐利福平结核分枝杆菌rpoB基因突变的研究 被引量:6
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作者 王海英 徐勇 +4 位作者 邓云峰 潘晞 Edward Graviss 马欣 刘志敏 《中国防痨杂志》 CAS 2005年第5期289-292,共4页
目的分析山东省利福平耐药结核菌株rpoB基因突变特点。方法本研究为回顾性调查,135株样本分别取自1997、2000及2003年的流行病学调查和医院的临床样本。采用PCR直接基因测序法分析rpoB基因突变。结果135株结核菌中,60株为利福平耐药菌株... 目的分析山东省利福平耐药结核菌株rpoB基因突变特点。方法本研究为回顾性调查,135株样本分别取自1997、2000及2003年的流行病学调查和医院的临床样本。采用PCR直接基因测序法分析rpoB基因突变。结果135株结核菌中,60株为利福平耐药菌株,其中55株(91.7%)rpoB基因的利福平耐药决定区(RRDR)有突变。突变频率依次为密码子531(60.0%),526(29.1%)和516(7.3%)。1株耐药菌同时发生了少见的3个密码子(511,515,518)的多核苷酸突变。75株敏感菌株中,仅3株(4.0%)有突变,均发生在密码子533,包括一个新发现的突变基因型CTG(Leu)→ATG(Met)。结论来自山东省结核菌中,利福平耐药表型与rpoB基因突变的符合率为94.1%,并提示密码子533突变与利福平耐药表型相关性较低。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 RPOB基因 基因测序 利福平结核分枝杆菌 RPOB基因突变 山东省 结核菌株 流行病学调查 临床样本 菌株 表型 回顾性调查
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广东地区结核分枝杆菌利福布丁耐药株rpoB全基因序列突变特征 被引量:2
12
作者 胡族琼 谭耀驹 +2 位作者 罗春明 蔡杏珊 赵雁林 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期980-982,共3页
目的分析广东地区结核分枝杆菌利福布丁耐药株rpoB全基因序列突变特征。方法常规比例法检出100株结核分枝杆菌利福布丁(rifabutin,RBU)耐药株,30株敏感株,扩增rpoB全基因序列并进行序列测定,Clustal×软件比对所测序列突变情况。结... 目的分析广东地区结核分枝杆菌利福布丁耐药株rpoB全基因序列突变特征。方法常规比例法检出100株结核分枝杆菌利福布丁(rifabutin,RBU)耐药株,30株敏感株,扩增rpoB全基因序列并进行序列测定,Clustal×软件比对所测序列突变情况。结果利福布丁敏感株rpoB基因无突变;利福布丁耐药株有24种突变类型,121个突变位点,其中106个在利福平耐药决定区(rifampin resistance determining region,RRDR)之内,15个在RRDR之外,包括3个是单点突变(V176F,P206R,H323Y)和12个联合突变;常见突变位点分别是531(70%)和526(20%);两位点联合突变率21%,单点突变率79%。结论广东结核分枝杆菌敏感株rpoB基因不发生突变,利福布丁耐药株rpoB基因突变率100%,最常见突变位点分别是531和526。516、526和531之间不发生联合突变。RRDR之内鉴定出9种突变位点,RRDR之外鉴定出15个新突变位点,包括3个单点突变V176F,P206R和H323Y,位于rpoB基因起始端。 展开更多
关键词 利福布丁 点突变 结核分枝杆菌 RPOB基因 序列分析
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RPA-LFD技术快速检测结核分枝杆菌利福平耐药性的应用 被引量:4
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作者 鲁瑶 赵丽丽 +5 位作者 李马超 刘海灿 赵秀芹 刘志广 万康林 楼永良 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期387-391,共5页
目的基于重组酶聚合酶扩增(RPA)技术结合侧向流动试纸条(LFD),建立可快速检测结核分枝杆菌(MTB)利福平耐药的方法,并初步评价其临床应用价值。方法采用比例法对182株结核分枝杆菌临床分离株进行利福平耐药性检测。建立RPA-LFD技术,检测... 目的基于重组酶聚合酶扩增(RPA)技术结合侧向流动试纸条(LFD),建立可快速检测结核分枝杆菌(MTB)利福平耐药的方法,并初步评价其临床应用价值。方法采用比例法对182株结核分枝杆菌临床分离株进行利福平耐药性检测。建立RPA-LFD技术,检测182株菌株中利福平耐药决定区(RRDR)常见突变位点rpoB 531、526和516的突变情况,同时使用PCR测序进行验证。用SPSS 24.0分析,以比例法为金标准,评价RPA-LFD对利福平耐药的检测效率。结果以比例法药敏结果为金标准,RPA-LFD检测利福平耐药的灵敏度为84.2%,特异度为100.0%,Kappa检验显示Kappa值为0.880,两种方法检测结果具有高度一致性。同样以比例法为金标准,以DNA测序结果判断利福平耐药性的灵敏度为91.2%,特异度为100.0%,Kappa值为0.935。结论RPA-LFD技术用于结核分枝杆菌利福平耐药性的检测具有好的灵敏度、很高的特异度,且检测时间短,具有一定的临床应用价值。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 利福平 RPA-LFD RRDR 突变
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西安市耐利福平结核分枝杆菌rpoB基因的突变型分析 被引量:2
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作者 杜蓬 李峰 +1 位作者 董兆麟 陈超 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期19-23,共5页
目的西安市结核分枝杆菌临床分离株rpoB基因RRDR的基因型分析。方法采用PCR-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析32株结核分枝杆菌耐RFP株和10株RFP敏感株的rpoB基因PCR产物,并对8株具有代表性的菌株rpoB基因片段通过DNA测序进行验证。结果 r... 目的西安市结核分枝杆菌临床分离株rpoB基因RRDR的基因型分析。方法采用PCR-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析32株结核分枝杆菌耐RFP株和10株RFP敏感株的rpoB基因PCR产物,并对8株具有代表性的菌株rpoB基因片段通过DNA测序进行验证。结果 rpoB基因PCR-SSCP分析灵敏度为56.3%(18/32),特异性为80%(8/10)。8株结核分枝杆菌rpoB基因经测序,6株耐RFP菌株中有5株的rpoB基因突变均发生在531或526密码子上。其中有两株在526密码子均发生了双碱基突变;1株PCR-SSCP呈现阴性的耐RFP结核分枝杆菌存在513密码子突变;两株RFP敏感株出现PCR-SSCP假阳性,其rpoB基因均涉及2~3个密码子的突变,其中518密码子突变型AAC→GAC为首次报道。结论 531和526密码子除了单点突变之外,亦出现同密码子双碱基突变型;RFP敏感株多密码子突变型值得关注。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 利福平 RPOB基因 突变
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结核分枝杆菌北京基因型菌株与耐药表型的关系 被引量:19
15
作者 王胜芬 赵雁林 +4 位作者 黄海荣 李强 周杨 欧喜超 付育红 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期427-431,共5页
目的研究我国结核分枝杆菌北京基因型菌株的分布以及与耐药表型的关系。方法2008年4~12月从我国6个区域收集痰涂片阳性的结核病患者的临床分离株,每一患者的一份分离株经生化方法鉴定为结核分枝杆菌复合群。收集患者的性别、年龄、病... 目的研究我国结核分枝杆菌北京基因型菌株的分布以及与耐药表型的关系。方法2008年4~12月从我国6个区域收集痰涂片阳性的结核病患者的临床分离株,每一患者的一份分离株经生化方法鉴定为结核分枝杆菌复合群。收集患者的性别、年龄、病史、菌株耐药谱和菌株来源资料。药物敏感性实验采用比例法。运用间隔区寡核苷酸分型方法或基因dnaA~dnaN之间插入序列IS6110鉴定北京基因型菌株。结果在410份结核分枝杆菌分离株中,67.1%(275/410)的分离株属于北京基因型菌株,东北部区域感染北京基因型菌株患者的比例高于中西部区域(χ2=20.50,P=0.000)。患者的年龄、性别和治疗史与感染北京基因型菌株无关。在耐多药菌株和耐利福平菌株中,北京基因型菌株的比例显著高于非北京基因型(P=0.002,P=0.005)。结论患者的年龄、性别和治疗史与感染北京基因型菌株无关,东北部区域北京基因型菌株分布比例显著高于中西部区域。北京基因型菌株与利福平耐药和耐多药有关。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 北京基因 表型
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我国利福平敏感结核杆菌rpoB基因利福平耐药决定区序列循证分析 被引量:11
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作者 孟繁荣 刘志辉 +2 位作者 谢贝 张言斌 谭守勇 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2013年第21期3601-3604,共4页
目的:了解我国利福平敏感结核杆菌rpoB基因利福平耐药决定区(rifampicin resistancedetermining region,RRDR)序列的多态性特征。方法:采用"rpoB AND Mycobacterium tuberculosis AND(China OR Hong Kong OR Macon OR Taiwan)"... 目的:了解我国利福平敏感结核杆菌rpoB基因利福平耐药决定区(rifampicin resistancedetermining region,RRDR)序列的多态性特征。方法:采用"rpoB AND Mycobacterium tuberculosis AND(China OR Hong Kong OR Macon OR Taiwan)"检索策略在Pubmed数据库中检索文献,循证分析Pubmed数据库中截止至2013年4月30日有关我国结核杆菌rpoB基因突变分子特征的研究文献。结果:36篇文献纳入研究,5 136株利福平敏感结核杆菌rpoB基因RRDR序列信息得以分析,38株(0.74%)rpoB基因RRDR序列呈现基因突变,涉及8个位点,分别为511(11株)、533(7株)、531(6株)、526(5株)、516(4株)、518(2株)、519(2株)、521(2株)等,其中1株涉及511/526双位点。结论:我国结核杆菌rpoB基因RRDR序列存在沉默突变现象,并非所有RRDR序列改变均与结核杆菌利福平药物敏感性有关。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 利福平 RPOB基因 利福平决定区(RRDR) 沉默突变
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应用基因芯片分析结核分枝杆菌常见耐药基因型的研究 被引量:29
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作者 吴雪琼 张琼 +9 位作者 张俊仙 梁建琴 鲁红丽 李洪敏 张洪恩 陆阳 荣利 吕翠环 张广宇 邢婉丽 《中国防痨杂志》 CAS 2006年第1期4-10,共7页
目的应用基因芯片快速检测结核分枝杆菌耐药基因型,建立一种新的分子药敏试验方法。方法以传统药敏试验和PCR-直接测序方法为对照,应用基因芯片快速检测157株结核分枝杆菌临床分离株异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)和乙胺丁醇(EMB... 目的应用基因芯片快速检测结核分枝杆菌耐药基因型,建立一种新的分子药敏试验方法。方法以传统药敏试验和PCR-直接测序方法为对照,应用基因芯片快速检测157株结核分枝杆菌临床分离株异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)和乙胺丁醇(EMB)耐药基因(katGr、poB、rp-sLr、rs和embB)的带荧光素标记的PCR产物。结果PCR-直接测序和基因芯片检测36株结核分枝杆菌药物敏感株的5种耐药基因均为野生型。121株结核分枝杆菌耐药分离株中,56株耐INH分离株,katG基因突变率为62.5%,其中katG缺失率为7.5%,315位密码子突变率为55.4%,279位密码子突变率为1.8%;104株耐RFP株,rpoB基因突变率为94.2%,最常见的突变位点为531位和526位密码子(突变率分别为60.6%、15.4%),双位点突变率为5.8%,还发现511、513、515、516、517、518和533位密码子突变;62株耐SM分离株,rpsL和rrs总突变率为88.7%(两者分别为82.3%、6.5%),rpsL突变位于43位和88位密码子(突变率分别为77.4%、4.8%),rrs突变位于513位和516位碱基(突变分别为4.8%、1.6%);57株为耐EMB株,embB基因突变率为61.4%,均为306位密码子突变,最常见的突变为ATG→GTG或ATA(突变率分别为35.1%、15.8%),还发现306位密码子ATG→ATC、ATT和CTG突变。通过基因芯片检出的突变与基因测序结果一致。结论应用基因芯片可分析大多数结核分枝杆菌耐药基因型,弥补传统药敏试验方法的不足,指导临床治疗。 展开更多
关键词 基因芯片 基因 聚合酶链反应 分枝杆菌 结核
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河南省耐多药结核分枝杆菌链霉素耐药相关基因rpsL和rrs突变分析 被引量:17
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作者 贾琼 石大伟 +4 位作者 赵玉玲 李辉 陈彦丞 李亮 朱国峰 《中国防痨杂志》 CAS 2010年第11期760-762,共3页
关键词 结核分枝杆菌 相关基因 链霉素 突变分析 RPSL rrS 河南省 结核
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武汉地区结核分枝杆菌氨基糖苷类抗生素耐药分离株rpsL和rrs基因特征分析 被引量:7
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作者 温子禄 沈建国 +5 位作者 张朝宝 余晓丽 陈平 唐神结 郭晓奎 张舒林 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期1583-1587,共5页
目的阐明武汉地区结核分枝杆菌分离株氨基糖苷类药物耐药相关基因rpsL和rrs的分子突变特征。方法从武汉医疗救治中心共收集69株结核分枝杆菌的临床菌株,包括耐链霉素(SM)菌株35株(其中4株同时对卡那霉素耐药)和SM敏感菌株34株(其中全敏... 目的阐明武汉地区结核分枝杆菌分离株氨基糖苷类药物耐药相关基因rpsL和rrs的分子突变特征。方法从武汉医疗救治中心共收集69株结核分枝杆菌的临床菌株,包括耐链霉素(SM)菌株35株(其中4株同时对卡那霉素耐药)和SM敏感菌株34株(其中全敏感20株)。采用PCR直接测序法分析rpsL和rrs基因的分子突变特征。结果 35株SM耐药株中有26株(74.3%)检测到rpsL突变,突变位点集中在第43位和第88位密码子,并发现了1个新的突变类型Lys88Glu;13株耐药株(37.1%)检测到四种不同类型的rrs基因突变,分别为A1401G(17.1%,6/35)、A514C(14.3%,5/35)、G1487A(2.9%,1/35)和C517T(2.9%,1/35),1株全敏感菌株的rrs基因发生了C1029T突变。卡那霉素耐药株中只有3株检测到了rrs突变,并发现了一种rrs基因尚未见报道的G1487A突变类型。结论结核分枝杆菌对氨基糖苷类药物的耐药与rpsL和rrs突变相关,耐药基因突变类型存在地域差异。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 氨基糖苷类 RPSL基因 rrs基因
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福建省耐多药结核分枝杆菌对氟喹诺酮类药物表型耐药与gyrA基因突变特征分析 被引量:8
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作者 魏淑贞 赵永 +2 位作者 梁庆福 林建 林淑芳 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期876-879,884,共5页
目的了解福建省耐多药(Multi-drug resistant,MDR)结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)氟喹诺酮类药物(Fluoroquinolones,FQs)的gyrA基因突变特征,为FQs耐药菌株的快速分子药敏检测提供基础科学数据。方法收集来自福建省2010-... 目的了解福建省耐多药(Multi-drug resistant,MDR)结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)氟喹诺酮类药物(Fluoroquinolones,FQs)的gyrA基因突变特征,为FQs耐药菌株的快速分子药敏检测提供基础科学数据。方法收集来自福建省2010-2011年和2008-2009年耐药监测点的所有MDR Mtb临床菌株,采用常规比例法进行FQs敏感性试验。PCR扩增包含gyrA耐药决定区的基因片段,测序后比对分析。结果共收集到MDR结核分枝杆菌临床菌株119株,经常规药敏试验,氧氟沙星(Ofloxacin,Ofx)的耐药率为26.89%,左氧氟沙星(Levofloxacin,Lfx)耐药率为25.21%,莫西沙星(Moxifloxacin,Mfx)耐药率为11.76%。FQs敏感株gyrA基因未检测到突变。gyrA基因在Ofx耐药菌株的突变率为84.38%(27/32),Lfx耐药菌株的突变率为83.33%(25/30),Mfx耐药菌株的突变率为92.86%(13/14)。gyrA基因突变为点突变,共发现有5种突变类型,以Asp94Gly,Asp94Asn和Ala90Val为主。结论福建省MDR-Mtb对FQs耐药的主要原因是gyrA基因突变,最常见的突变位于第94位,第90位和第91位密码子。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 氟喹诺酮类 基因突变
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