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克隆超基因家族中新基因的一种PCR同源引物
1
作者
郭葆玉
久野耕嗣
+1 位作者
张淑英
松岛纲治
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
1998年第2期101-105,共5页
目的：用同源引物克隆ＲＮＡ低丰度表达的小鼠β－趋化因子受体。方法：将β－趋化因子受体小鼠ＭＩＰ－１αＲ，人ＭＣＰ－１Ｒ和大鼠ＩＬ－８Ｒ跨膜区中高度保守的氨基酸序列中的核苷酸进行相似序列对比后，设计出同源引物，再用ＲＴ...
目的：用同源引物克隆ＲＮＡ低丰度表达的小鼠β－趋化因子受体。方法：将β－趋化因子受体小鼠ＭＩＰ－１αＲ，人ＭＣＰ－１Ｒ和大鼠ＩＬ－８Ｒ跨膜区中高度保守的氨基酸序列中的核苷酸进行相似序列对比后，设计出同源引物，再用ＲＴ－ＰＣＲ扩增出ＤＮＡ片段，经基因库检索为该超基因家族中的新基因序列后设计特异引物，用ＭａｒａｔｈｏｎＰＣＲ扩增出该新基因。结果：成功克隆出小鼠β－趋化因子受体５（ＣＣＲ５）ｃＤＮＡ全基因序列，序列全长２８８８ｂｐ，开放阅读框１０６５个核苷酸，编码３５５个氨基酸。该序列经序列分析、配体结合试验及国际基因库检索证实为该超基因家族中的一个新基因成员。结论：该克隆策略的引物设计思路较为新颖，能有效捕获超基因家族中的新基因。该克隆方法敏感、高效。
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关键词
克隆
超基因家族
同源引物
β趋化因子受体
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职称材料
桃CYP450超基因家族的基因鉴定及Prupe.6G046800的功能分析
被引量：
1
2
作者
别航灵
李勇
+5 位作者
王力荣
方伟超
陈昌文
王新卫
吴金龙
曹珂
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期845-855,共11页
【目的】鉴定分析桃(Prunus persica)细胞色素P450(Cytochrome P450,CYP450)超基因家族成员,并对Prupe.6G046800基因进行功能分析。【方法】系统分析了桃的CYP450超基因家族功能。采用比对和检索2种方法鉴定桃基因组中的CYP450超家族成...
【目的】鉴定分析桃(Prunus persica)细胞色素P450(Cytochrome P450,CYP450)超基因家族成员,并对Prupe.6G046800基因进行功能分析。【方法】系统分析了桃的CYP450超基因家族功能。采用比对和检索2种方法鉴定桃基因组中的CYP450超家族成员,构建上述基因和拟南芥同源基因的系统进化树并分析其基因结构;运用转录组学数据分析该家族基因组织特异性表达和果实发育时期表达量变化;最后,构建了其中1个重要基因Prupe.6G046800的过表达载体并转化番茄,采用瞬时转化的方法分析该基因的启动子活性。【结果】桃基因组CYP450超家族成员共295个,可分为9个家族簇,其中包含4个多基因家族簇和5个单基因家族簇。未发现CYP727和CYP746家族簇成员,其中CYP71家族簇成员数量最多。组织特异性表达分析显示,CYP450超家族在桃不同组织中均有表达,有145个基因至少在1个组织中表达,以根中特异表达基因数目最多。选择上述表达基因进行基因结构分析,发现桃的CYP450s基因长度跨度大、外显子数量差异明显。分析了CYP450超基因家族在果实发育过程中的表达,发现有45个基因表达量持续下降,36个基因持续上升。将Prupe.6G046800在番茄中进行异源稳定转化,此基因在过量表达的番茄植株不同组织中表达有着显著差异,且明显高于野生型番茄。启动子顺式作用元件分析显示,该基因可能受到光、干旱及激素等信号的调控。【结论】从桃基因组中鉴定出295个CYP450超家族成员,可分为9个家族簇。转录组数据显示,CYP450s基因参与了桃的整个生长发育过程。Prupe.6G046800过表达导致番茄单果质量降低,表明Prupe.6G046800参与果实发育调控。
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关键词
桃
CYP450
超基因家族
生长素
单果质量
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职称材料
人类白细胞抗原的研究进展
被引量：
5
3
作者
田丁
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第12期1145-1150,共6页
关键词
人类白细胞抗原
RECEPTOR
细胞表面分子
HLA-Ⅰ类
超基因家族
细胞识别
免疫球蛋白
T细胞受体
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职称材料
题名
克隆超基因家族中新基因的一种PCR同源引物
1
作者
郭葆玉
久野耕嗣
张淑英
松岛纲治
机构
第二军医大学基础医学部分子遗传学教研室
日本金泽大学癌症研究所
第二军医大学科研处新药评价中心
出处
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
1998年第2期101-105,共5页
文摘
目的：用同源引物克隆ＲＮＡ低丰度表达的小鼠β－趋化因子受体。方法：将β－趋化因子受体小鼠ＭＩＰ－１αＲ，人ＭＣＰ－１Ｒ和大鼠ＩＬ－８Ｒ跨膜区中高度保守的氨基酸序列中的核苷酸进行相似序列对比后，设计出同源引物，再用ＲＴ－ＰＣＲ扩增出ＤＮＡ片段，经基因库检索为该超基因家族中的新基因序列后设计特异引物，用ＭａｒａｔｈｏｎＰＣＲ扩增出该新基因。结果：成功克隆出小鼠β－趋化因子受体５（ＣＣＲ５）ｃＤＮＡ全基因序列，序列全长２８８８ｂｐ，开放阅读框１０６５个核苷酸，编码３５５个氨基酸。该序列经序列分析、配体结合试验及国际基因库检索证实为该超基因家族中的一个新基因成员。结论：该克隆策略的引物设计思路较为新颖，能有效捕获超基因家族中的新基因。该克隆方法敏感、高效。
关键词
克隆
超基因家族
同源引物
β趋化因子受体
Keywords
molecular cloning
supergene family
homology primer
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
桃CYP450超基因家族的基因鉴定及Prupe.6G046800的功能分析
被引量：
1
2
作者
别航灵
李勇
王力荣
方伟超
陈昌文
王新卫
吴金龙
曹珂
机构
中国农业科学院郑州果树研究所
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期845-855,共11页
基金
国家自然科学基金(31872061)
中国农业科学院科技创新工程专项(CAAS-ASTIP-2020-ZFRI)。
文摘
【目的】鉴定分析桃(Prunus persica)细胞色素P450(Cytochrome P450,CYP450)超基因家族成员,并对Prupe.6G046800基因进行功能分析。【方法】系统分析了桃的CYP450超基因家族功能。采用比对和检索2种方法鉴定桃基因组中的CYP450超家族成员,构建上述基因和拟南芥同源基因的系统进化树并分析其基因结构;运用转录组学数据分析该家族基因组织特异性表达和果实发育时期表达量变化;最后,构建了其中1个重要基因Prupe.6G046800的过表达载体并转化番茄,采用瞬时转化的方法分析该基因的启动子活性。【结果】桃基因组CYP450超家族成员共295个,可分为9个家族簇,其中包含4个多基因家族簇和5个单基因家族簇。未发现CYP727和CYP746家族簇成员,其中CYP71家族簇成员数量最多。组织特异性表达分析显示,CYP450超家族在桃不同组织中均有表达,有145个基因至少在1个组织中表达,以根中特异表达基因数目最多。选择上述表达基因进行基因结构分析,发现桃的CYP450s基因长度跨度大、外显子数量差异明显。分析了CYP450超基因家族在果实发育过程中的表达,发现有45个基因表达量持续下降,36个基因持续上升。将Prupe.6G046800在番茄中进行异源稳定转化,此基因在过量表达的番茄植株不同组织中表达有着显著差异,且明显高于野生型番茄。启动子顺式作用元件分析显示,该基因可能受到光、干旱及激素等信号的调控。【结论】从桃基因组中鉴定出295个CYP450超家族成员,可分为9个家族簇。转录组数据显示,CYP450s基因参与了桃的整个生长发育过程。Prupe.6G046800过表达导致番茄单果质量降低,表明Prupe.6G046800参与果实发育调控。
关键词
桃
CYP450
超基因家族
生长素
单果质量
Keywords
Peach
CYP450 gene superfamily
Auxin
Fruit weight
分类号
S662.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
人类白细胞抗原的研究进展
被引量：
5
3
作者
田丁
机构
首都医科大学宣武医院
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第12期1145-1150,共6页
关键词
人类白细胞抗原
RECEPTOR
细胞表面分子
HLA-Ⅰ类
超基因家族
细胞识别
免疫球蛋白
T细胞受体
分类号
R699.2 [医药卫生—泌尿科学]
R392 [医药卫生—免疫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
克隆超基因家族中新基因的一种PCR同源引物
郭葆玉
久野耕嗣
张淑英
松岛纲治
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
1998
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
桃CYP450超基因家族的基因鉴定及Prupe.6G046800的功能分析
别航灵
李勇
王力荣
方伟超
陈昌文
王新卫
吴金龙
曹珂
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
人类白细胞抗原的研究进展
田丁
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
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