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江西铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗的转录组分析 被引量:3
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作者 尹明华 张艺欣 +4 位作者 邓雨晴 吴洪婷 陈婷 郭淑贞 杨于萱 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1050-1062,共13页
【目的】探究江西铅山红芽芋对超低温疗法脱毒的转录组响应机制,为江西铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗的规模化应用奠定理论依据。【方法】以江西铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗(VF组)和江西铅山红芽芋超低温疗法带毒苗(V组)试验材料进行转录... 【目的】探究江西铅山红芽芋对超低温疗法脱毒的转录组响应机制,为江西铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗的规模化应用奠定理论依据。【方法】以江西铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗(VF组)和江西铅山红芽芋超低温疗法带毒苗(V组)试验材料进行转录组比较分析。【结果】VF组Clean reads为42 406 188,GC含量为54.09%;V组Clean reads为46 818 060,GC含量为50.36%。VF组和V组表达量FPKM的对数值在0~2,表达量密度在0~0.8。VF组和V组表达的共有基因数为23 820,V组单独表达的基因数为10 298,VF组单独表达的基因数为4 477。VF组和V组表达量的相关系数为0.287,样本间相关性较差。VF组和V组共产生差异表达基因5 282个,与V组比较,VF组上调基因3 011,下调基因2 271。GO富集分析显示,差异基因主要注释到过氧化氢分解过程、过氧化氢代谢过程、一元羧酸生物合成过程、多糖分解代谢过程、金属离子输运、细胞外区、细胞壁、外部封装结构、膜的固有成分、质膜固有成分、核酸结合转录因子活性、序列特异性DNA结合转录因子活性、单加氧酶活性、铁离子结合、血红素结合等功能。KEGG富集分析显示,差异基因主要注释到苯丙酸生物合成、类黄酮生物合成、二苯乙烯类和二芳基庚烷类以及姜辣素的生物合成、MAPK信号通路-植物、淀粉和蔗糖代谢、酪氨酸代谢、植物激素信号转导、戊糖和葡萄糖醛酸的相互转化、过氧化物酶体、α-亚麻酸代谢、苯丙氨酸代谢、氰胺酸代谢、类胡萝卜素生物合成、异喹啉生物碱的生物合成、泛醌和其他萜类醌的生物合成、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、植物昼夜节律、果糖和甘露糖代谢、半乳糖代谢、氨基糖和核苷酸糖代谢等途径。【结论】F-box家族蛋白、脱落酸受体PYR1、乙烯受体2、生长素响应因子1、BZIP转录因子家族蛋白、过氧化物酶、过氧化氢酶1、超氧化物歧化酶[Cu-Zn]、植物抗病反应蛋白、抗病蛋白、抗病蛋白RPS2、抗病蛋白RPS5、抗病蛋白RGA2、抗病反应蛋白、转座子TNT的逆转录病毒相关Pol多蛋白、逆转录病毒相关Pol多聚蛋白系1、类烟草病毒增殖蛋白3、烟草病毒增殖蛋白1、转座子RE1的逆转录病毒相关Pol多蛋白、蔗糖合成酶等基因是江西铅山红芽芋的超低温疗法脱毒的主要响应基因。 展开更多
关键词 江西铅山红芽芋 超低温疗法脱毒苗 超低温疗法带毒苗 转录组分析
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超低温疗法脱除马铃薯种薯病毒病的研究进展 被引量:6
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作者 黄修梅 惠霖 +1 位作者 袁春爱 杨进 《种子》 北大核心 2015年第3期50-54,共5页
超低温疗法是近几年兴起的一种新的脱除植物病毒的方法。该方法不受茎尖大小的限制,具有操作简便、脱毒效率高、实验周期短等优点。本文就超低温疗法脱毒原理、技术优势、方法种类和操作程序应用在马铃薯种薯上的最新研究进展进行综述,... 超低温疗法是近几年兴起的一种新的脱除植物病毒的方法。该方法不受茎尖大小的限制,具有操作简便、脱毒效率高、实验周期短等优点。本文就超低温疗法脱毒原理、技术优势、方法种类和操作程序应用在马铃薯种薯上的最新研究进展进行综述,并对其今后的发展进行了展望,以期为建立广谱性马铃薯超低温脱毒体系奠定基础,为确保使用合格种薯提供技术支持。 展开更多
关键词 超低温疗法 马铃薯种薯 茎尖 脱毒
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红芽芋超低温疗法脱毒苗基因组DNA甲基化的MSAP分析 被引量:1
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作者 尹明华 廖玉 万志庭 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期132-138,共7页
对红芽芋超低温疗法脱毒苗的基因组DNA甲基化进行MSAP分析。结果表明,红芽芋超低温疗法脱毒苗总甲基化率提高10.27%,全甲基化率提高12.98%,但半甲基化率下降2.71%。红芽芋超低温疗法脱毒苗去甲基化模式和甲基化模式并存,但去甲基化模式... 对红芽芋超低温疗法脱毒苗的基因组DNA甲基化进行MSAP分析。结果表明,红芽芋超低温疗法脱毒苗总甲基化率提高10.27%,全甲基化率提高12.98%,但半甲基化率下降2.71%。红芽芋超低温疗法脱毒苗去甲基化模式和甲基化模式并存,但去甲基化模式高于甲基化模式,说明较多基因被激活。 展开更多
关键词 红芽芋 超低温疗法脱毒苗 DNA甲基化 MSAP分析
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超低温疗法在薯芋类蔬菜脱毒中的应用进展 被引量:1
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作者 周洁 温亮 +3 位作者 周黎 王方 矫振彪 吴金平 《湖北农业科学》 2017年第24期4697-4699,共3页
超低温疗法相对传统脱毒方法具有操作相对容易、时间周期短、脱毒率高等优势。从超低温疗法原理、种类及优势等方面进行了阐述,并展望了通过处理材料不同生理状态研究、优化预培养因子等技术,可有效提高超低温疗法在薯芋类蔬菜脱毒上应用。
关键词 超低温疗法 脱毒 薯芋类蔬菜
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江西铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗的离体保存 被引量:1
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作者 张艺欣 邓雨晴 +9 位作者 张清招 曾会英 聂学文 龚寅 陈丽丽 侯莹 陈小波 陆春西 韦宏默 尹明华 《江苏农业科学》 北大核心 2021年第21期58-66,共9页
以江西铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗为试验材料,从温度、培养基养分水平、培养基物理状态、渗透压调节剂、生长抑制剂、活性炭等方面对铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗进行离体保存,从DNA分子标记、气孔参数、光合参数和叶绿素荧光参数等方... 以江西铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗为试验材料,从温度、培养基养分水平、培养基物理状态、渗透压调节剂、生长抑制剂、活性炭等方面对铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗进行离体保存,从DNA分子标记、气孔参数、光合参数和叶绿素荧光参数等方面衡量江西铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗离体保存后的遗传稳定性,并对江西铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗离体保存后相关基因表达水平进行qRT-PCR检测。结果表明,5℃低温、1 mg/L多效唑(PP333)、18 g/L蔗糖、0.6 g/L琼脂、1/8 MS、2 g/L活性炭、20 g/L甘露醇、0.5 mg/L脱落酸均有利于江西铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗的离体保存,并且可以显著提高其离体保存过程中蔗糖合成酶、超氧化物歧化酶[Cu-Zn]、过氧化物酶、多胺氧化酶、衰老相关半胱氨酸蛋白酶、L-抗坏血酸氧化酶等基因的表达水平。与常温继代苗对照组相比,江西铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗离体保存后复苏苗经SSR检测,电泳峰型一致,遗传距离为0,遗传相似系数为1,可以聚为一类;铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗离体保存后复苏苗和常温继代苗对照组的气孔长径、短径、周长、气孔数量、气孔密度、净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、细胞间CO2浓度(Ci)、蒸腾速率(Tr)、实际光化学效率ΦPSⅡ、捕获激发能效率Fv′/Fm′、光化学猝灭系数(qP)、非光化学猝灭系数NPQ均无显著差异。由此可见,铅山红芽芋超低温疗法脱毒苗离体保存可以保证其种质遗传稳定性。 展开更多
关键词 江西铅山红芽芋 脱毒苗 超低温疗法 离体保存
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上饶早梨主栽品种病毒种类分析及其茎尖脱毒技术效率比较 被引量:4
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作者 尹明华 周宇瑶 +6 位作者 杨星鹏 徐玉琴 刘郑英 舒荣建 魏志敏 夏华炎 洪森荣 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第1期89-100,共12页
对上饶早梨3个主栽品种的病毒种类进行分析,并对其不同茎尖脱毒技术的效率进行比较。结果表明,花厅六月雪和田墩六月雪没有检测到苹果茎痘病毒(ASPV),花厅黄皮消检测到ASPV,田墩六月雪、花厅六月雪和花厅黄皮消均检测到苹果茎沟病毒(AS... 对上饶早梨3个主栽品种的病毒种类进行分析,并对其不同茎尖脱毒技术的效率进行比较。结果表明,花厅六月雪和田墩六月雪没有检测到苹果茎痘病毒(ASPV),花厅黄皮消检测到ASPV,田墩六月雪、花厅六月雪和花厅黄皮消均检测到苹果茎沟病毒(ASGV)和苹果锈果类病毒(ASSVd),但均未检测到苹果褪绿叶斑病毒(ACLSV)和苹果花叶病毒(Ap MV)。对于上饶早梨3个主栽品种来说,超低温疗法的脱毒效率显著高于常规茎尖培养,在3种超低温疗法脱毒技术中,包埋玻璃化法超低温疗法的脱毒效率最高。SSR荧光标记毛细管电泳检测表明,常规茎尖培养和3种超低温疗法脱毒技术均能保证上饶早梨3个主栽品种的遗传稳定性。该研究有助于上饶早梨种苗病毒病害的检测鉴定和实时监控检疫,同时也可为建立上饶早梨种质资源超低温库和生产无毒苗提供一定的技术支撑。 展开更多
关键词 上饶早梨 主栽品种 病毒种类 茎尖 超低温疗法 脱毒
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高山马铃薯脱毒苗DNA甲基化的MSAP分析 被引量:4
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作者 尹明华 叶思雨 +2 位作者 宁本松 张铭心 石光禹 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1079-1087,共9页
为了解脱毒对高山马铃薯试管苗DNA甲基化水平的影响,探究DNA甲基化在高山马铃薯脱毒后的作用,结合毛细管电泳检测技术对怀玉山高山马铃薯脱毒苗的基因组DNA甲基化进行MSAP分析。结果表明,怀玉山高山马铃薯常温继代带毒苗甲基化水平较高... 为了解脱毒对高山马铃薯试管苗DNA甲基化水平的影响,探究DNA甲基化在高山马铃薯脱毒后的作用,结合毛细管电泳检测技术对怀玉山高山马铃薯脱毒苗的基因组DNA甲基化进行MSAP分析。结果表明,怀玉山高山马铃薯常温继代带毒苗甲基化水平较高,经过玻璃化法超低温保存处理但未能脱毒时其甲基化水平有所下降,但甲基化仍处于较高水平,而常规茎尖培养脱毒和玻璃化法超低温疗法脱毒可明显降低试管苗的甲基化水平,且玻璃化法超低温疗法脱毒苗的甲基化水平更低。在怀玉山高山马铃薯超低温保存(未能脱毒)、茎尖常规培养脱毒和超低温疗法脱毒3个处理方式中,去甲基化模式和甲基化模式并存,但均以去甲基化模式为主要趋势,且在去甲基化模式的强弱依次为超低温疗法脱毒>茎尖常规培养脱毒>超低温保存(未脱毒)。本研究结果为怀玉山高山马铃薯脱毒苗的种质保存和规模化生产提供了一定的理论依据。 展开更多
关键词 高山马铃薯 茎尖培养 超低温疗法脱毒 DNA甲基化 MSAP分析
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