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丹参赤霉素刺激转录基因SmGAST的克隆及生物信息学分析
1
作者
强毅
王喆之
《陕西师范大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期64-70,共7页
通过对丹参EST数据库进行BLAST比对,发现一条与GAST基因家族同源性较高的基因序列(CV163373),采用RT-PCR方法从丹参中克隆得到该基因,命名为SmGAST.该基因cDNA序列长406 bp,包含一个303 bp的ORF,编码100个氨基酸残基,推测为GAST基因家...
通过对丹参EST数据库进行BLAST比对,发现一条与GAST基因家族同源性较高的基因序列(CV163373),采用RT-PCR方法从丹参中克隆得到该基因,命名为SmGAST.该基因cDNA序列长406 bp,包含一个303 bp的ORF,编码100个氨基酸残基,推测为GAST基因家族的一个新基因.生物信息学分析表明,SmGAST所编码蛋白的分子量为10.5473 kD,理论等电点为9.01,具有信号肽,为定位于胞外的不稳定类蛋白,具有GAST基因家族所特有的功能结构域.实时定量PCR检测的结果显示,SmGAST在丹参根、茎和叶中均有表达,但主要在叶中表达,茎部的表达量最低.
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关键词
丹参
赤霉素刺激转录基因
生物信息学
表达分析
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题名
丹参赤霉素刺激转录基因SmGAST的克隆及生物信息学分析
1
作者
强毅
王喆之
机构
陕西师范大学药用资源与天然药物化学教育部重点实验室西北濒危药材资源开发国家工程实验室
出处
《陕西师范大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期64-70,共7页
基金
国家"十一五"科技支撑计划项目(2006BAI06A12-04)
文摘
通过对丹参EST数据库进行BLAST比对,发现一条与GAST基因家族同源性较高的基因序列(CV163373),采用RT-PCR方法从丹参中克隆得到该基因,命名为SmGAST.该基因cDNA序列长406 bp,包含一个303 bp的ORF,编码100个氨基酸残基,推测为GAST基因家族的一个新基因.生物信息学分析表明,SmGAST所编码蛋白的分子量为10.5473 kD,理论等电点为9.01,具有信号肽,为定位于胞外的不稳定类蛋白,具有GAST基因家族所特有的功能结构域.实时定量PCR检测的结果显示,SmGAST在丹参根、茎和叶中均有表达,但主要在叶中表达,茎部的表达量最低.
关键词
丹参
赤霉素刺激转录基因
生物信息学
表达分析
Keywords
Salvia miltiorrhiz Bunge
GA stimulated transcript gene
Bioinformatics
expression analysis
分类号
Q945 [生物学—植物学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
丹参赤霉素刺激转录基因SmGAST的克隆及生物信息学分析
强毅
王喆之
《陕西师范大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2011
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