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杜仲赖氨酸巴豆酰化的全蛋白质组学分析
1
作者
姚新转
陶乃邦
+1 位作者
田兴玉
吕立堂
《种子》
北大核心
2025年第2期18-28,共11页
赖氨酸巴豆酰化(Kcr)是一种新型的翻译后修饰(PTM),关于Kcr及其在杜仲生物学和代谢中的参与信息有限。杜仲不仅是重要的药用植物,也是天然的优质橡胶资源。采用LC-MS/MS结合基于免疫的纯化方法进行巴豆酰化组分析,推测巴豆酰化对杜仲生...
赖氨酸巴豆酰化(Kcr)是一种新型的翻译后修饰(PTM),关于Kcr及其在杜仲生物学和代谢中的参与信息有限。杜仲不仅是重要的药用植物,也是天然的优质橡胶资源。采用LC-MS/MS结合基于免疫的纯化方法进行巴豆酰化组分析,推测巴豆酰化对杜仲生长发育和生理的潜在调控作用。结果检测到1721个巴豆酰化蛋白的3645个巴豆酰化位点。生物信息学分析表明,巴豆酰化蛋白主要分布在叶绿体(671种蛋白质,占39%)、细胞质(544种蛋白质,占32%)和细胞核(209种蛋白质,占12%)中,主要参与能量代谢,包括光合作用、柠檬酸循环(三羧酸循环)、氧化磷酸化、光合生物中的碳固定等。研究表明,巴豆酰化在杜仲的生理生物学过程中起着至关重要的作用,研究结果可为其他植物的巴豆酰化研究提供参考。
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关键词
杜仲
赖氨酸巴豆酰化
(Kcr)
翻译后修饰
蛋白质组学
光合作用
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职称材料
缺氧预处理调节间充质干细胞中的赖氨酸巴豆酰化改善其缺氧存活和增殖
2
作者
叶嘉豪
王鹏珍
+4 位作者
刘朝云
彭钊
熊磊
蔡文倩
张少衡
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期1180-1190,共11页
缺氧预处理能提高间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)在缺血缺氧环境中存活,但其具体机制仍未深入探讨。本研究旨在确定赖氨酸巴豆酰化调节外周血间充质干细胞(peripheral blood mesenchymal stem cells,PBMSCs)在缺氧培养中存...
缺氧预处理能提高间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)在缺血缺氧环境中存活,但其具体机制仍未深入探讨。本研究旨在确定赖氨酸巴豆酰化调节外周血间充质干细胞(peripheral blood mesenchymal stem cells,PBMSCs)在缺氧培养中存活和增殖中的作用。从大鼠外周血单个核细胞中分离、培养得到PBMSCs,流式细胞仪鉴定其表面标志。首先将PBMSCs进行缺氧/常氧预处理:缺氧(1%O_(2))或常氧(21%O_(2))培养24 h。然后将预处理的PBMSCs移至缺氧培养箱(37℃、94%N2、5%CO_(2)、1%O_(2))内持续缺氧培养72 h。观察不同时间点(预处理前、后,持续缺氧培养后24 h、48 h、72 h)PBMSCs凋亡和增殖情况。为确定赖氨酸巴豆酰化(lysine crotonylation,Kcr)对PBMSCs增殖和存活的影响,将预处理的细胞随机加入巴豆酸钠(NaCr)或其溶剂(DMSO),并行缺氧培养72 h,使用免疫印迹方法检测赖氨酸巴豆酰化修饰,应用qRT-PCR和Western印迹检测凋亡相关因子Bcl2、Bax和胱天蛋白酶3 mRNA和蛋白质表达情况。与常氧预处理组比较,缺氧预处理明显增加PBMSCs数量(3.53×10^(5)vs 0.03×10^(5),P<0.001),使其活力增加1.3倍(P<0.001);明显降低细胞凋亡率(缺氧培养48 h,缺氧预处理组9.9±2.1%vs常氧预处理组29.6±3.1%,P<0.001;缺氧培养72 h,缺氧预处理组12.1±2.2%vs常氧预处理组43.3±6.0%,P<0.001)。进一步研究发现,缺氧预适应会促进NaCr诱导的巴豆酰化水平;在缺氧预处理的PBMSCs中Bcl2表达水平明显高于常氧预处理组(P<0.001),而Bax和胱天蛋白酶3表达水平明显低于常氧预处理组(P<0.001)。我们的研究结果表明,凋亡相关蛋白质Kcr可能是缺氧预处理提高PBMSCs抗缺氧凋亡的关键机制,这为提高MSCs抗缺氧生存提供了新的干预策略。
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关键词
缺氧预处理
赖氨酸巴豆酰化
外周血间充质干细胞
增殖
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职称材料
蛋白质巴豆酰化修饰研究进展
被引量：
2
3
作者
曹喜兵
赵振利
+1 位作者
曹亚兵
翟晓巧
《河南林业科技》
2020年第3期25-28,共4页
赖氨酸巴豆酰化修饰作为蛋白翻译后修饰的一种,在染色质重塑、细胞代谢、细胞周期以及细胞重组中发挥着重要的作用。近年来,关于赖氨酸巴豆酰化修饰的研究越来越受科研工作者青睐。为进一步了解巴豆酰化修饰的生物学意义,就蛋白质巴豆...
赖氨酸巴豆酰化修饰作为蛋白翻译后修饰的一种,在染色质重塑、细胞代谢、细胞周期以及细胞重组中发挥着重要的作用。近年来,关于赖氨酸巴豆酰化修饰的研究越来越受科研工作者青睐。为进一步了解巴豆酰化修饰的生物学意义,就蛋白质巴豆酰化修饰在微生物、动物、人类和植物方面的研究现状进行综述,以期为植物病害的表观遗传学研究提供新的思路。
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关键词
赖氨酸巴豆酰化
蛋白质
研究进展
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职称材料
题名
杜仲赖氨酸巴豆酰化的全蛋白质组学分析
1
作者
姚新转
陶乃邦
田兴玉
吕立堂
机构
贵州大学茶学院
贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院
出处
《种子》
北大核心
2025年第2期18-28,共11页
基金
贵州省高层次创新型人才(黔科合平台人才-GCC[2023]014)。
文摘
赖氨酸巴豆酰化(Kcr)是一种新型的翻译后修饰(PTM),关于Kcr及其在杜仲生物学和代谢中的参与信息有限。杜仲不仅是重要的药用植物,也是天然的优质橡胶资源。采用LC-MS/MS结合基于免疫的纯化方法进行巴豆酰化组分析,推测巴豆酰化对杜仲生长发育和生理的潜在调控作用。结果检测到1721个巴豆酰化蛋白的3645个巴豆酰化位点。生物信息学分析表明,巴豆酰化蛋白主要分布在叶绿体(671种蛋白质,占39%)、细胞质(544种蛋白质,占32%)和细胞核(209种蛋白质,占12%)中,主要参与能量代谢,包括光合作用、柠檬酸循环(三羧酸循环)、氧化磷酸化、光合生物中的碳固定等。研究表明,巴豆酰化在杜仲的生理生物学过程中起着至关重要的作用,研究结果可为其他植物的巴豆酰化研究提供参考。
关键词
杜仲
赖氨酸巴豆酰化
(Kcr)
翻译后修饰
蛋白质组学
光合作用
Keywords
Eucommia ulmoides
Lysine crotonylation(Kcr)
post-translational modification
proteomics
photosynthesis
分类号
S567.19 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
缺氧预处理调节间充质干细胞中的赖氨酸巴豆酰化改善其缺氧存活和增殖
2
作者
叶嘉豪
王鹏珍
刘朝云
彭钊
熊磊
蔡文倩
张少衡
机构
贵州医科大学临床医学系
暨南大学附属广州红十字会医院心内科
暨南大学附属广州红十字会医院广州市创伤外科研究所
广州市妇女儿童医疗中心儿科研究所
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期1180-1190,共11页
基金
广州市科技计划项目(No.202002030081)资助。
文摘
缺氧预处理能提高间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)在缺血缺氧环境中存活,但其具体机制仍未深入探讨。本研究旨在确定赖氨酸巴豆酰化调节外周血间充质干细胞(peripheral blood mesenchymal stem cells,PBMSCs)在缺氧培养中存活和增殖中的作用。从大鼠外周血单个核细胞中分离、培养得到PBMSCs,流式细胞仪鉴定其表面标志。首先将PBMSCs进行缺氧/常氧预处理:缺氧(1%O_(2))或常氧(21%O_(2))培养24 h。然后将预处理的PBMSCs移至缺氧培养箱(37℃、94%N2、5%CO_(2)、1%O_(2))内持续缺氧培养72 h。观察不同时间点(预处理前、后,持续缺氧培养后24 h、48 h、72 h)PBMSCs凋亡和增殖情况。为确定赖氨酸巴豆酰化(lysine crotonylation,Kcr)对PBMSCs增殖和存活的影响,将预处理的细胞随机加入巴豆酸钠(NaCr)或其溶剂(DMSO),并行缺氧培养72 h,使用免疫印迹方法检测赖氨酸巴豆酰化修饰,应用qRT-PCR和Western印迹检测凋亡相关因子Bcl2、Bax和胱天蛋白酶3 mRNA和蛋白质表达情况。与常氧预处理组比较,缺氧预处理明显增加PBMSCs数量(3.53×10^(5)vs 0.03×10^(5),P<0.001),使其活力增加1.3倍(P<0.001);明显降低细胞凋亡率(缺氧培养48 h,缺氧预处理组9.9±2.1%vs常氧预处理组29.6±3.1%,P<0.001;缺氧培养72 h,缺氧预处理组12.1±2.2%vs常氧预处理组43.3±6.0%,P<0.001)。进一步研究发现,缺氧预适应会促进NaCr诱导的巴豆酰化水平;在缺氧预处理的PBMSCs中Bcl2表达水平明显高于常氧预处理组(P<0.001),而Bax和胱天蛋白酶3表达水平明显低于常氧预处理组(P<0.001)。我们的研究结果表明,凋亡相关蛋白质Kcr可能是缺氧预处理提高PBMSCs抗缺氧凋亡的关键机制,这为提高MSCs抗缺氧生存提供了新的干预策略。
关键词
缺氧预处理
赖氨酸巴豆酰化
外周血间充质干细胞
增殖
Keywords
hypoxic preconditioning
lysine crotonylation(Kcr)
peripheral blood mesenchymal stem cells(PBMSCs)
proliferation
分类号
Q291 [生物学—细胞生物学]
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职称材料
题名
蛋白质巴豆酰化修饰研究进展
被引量：
2
3
作者
曹喜兵
赵振利
曹亚兵
翟晓巧
机构
河南农业大学泡桐研究所
河南省林业科学研究院
出处
《河南林业科技》
2020年第3期25-28,共4页
基金
河南省林木种质资源保护与良种选育重点实验室开放课题“泡桐丛枝病发生与蛋白质巴豆酰化关系研究”,项目编号:2020JB02008。
文摘
赖氨酸巴豆酰化修饰作为蛋白翻译后修饰的一种,在染色质重塑、细胞代谢、细胞周期以及细胞重组中发挥着重要的作用。近年来,关于赖氨酸巴豆酰化修饰的研究越来越受科研工作者青睐。为进一步了解巴豆酰化修饰的生物学意义,就蛋白质巴豆酰化修饰在微生物、动物、人类和植物方面的研究现状进行综述,以期为植物病害的表观遗传学研究提供新的思路。
关键词
赖氨酸巴豆酰化
蛋白质
研究进展
Keywords
Lysine crotonylation
Protein
Research progress
分类号
S722.3 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杜仲赖氨酸巴豆酰化的全蛋白质组学分析
姚新转
陶乃邦
田兴玉
吕立堂
《种子》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
缺氧预处理调节间充质干细胞中的赖氨酸巴豆酰化改善其缺氧存活和增殖
叶嘉豪
王鹏珍
刘朝云
彭钊
熊磊
蔡文倩
张少衡
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
蛋白质巴豆酰化修饰研究进展
曹喜兵
赵振利
曹亚兵
翟晓巧
《河南林业科技》
2020
2
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职称材料
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