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赖氨酰氧化酶LOXL2稳定性的理论计算研究
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作者 林李锐 林凯 +3 位作者 邹海鹰 许丽艳 李恩民 东庚 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期685-695,共11页
赖氨酰氧化酶LOXL2是一种依赖于铜离子的胺氧化酶,催化胶原蛋白和弹性蛋白的赖氨酸残基侧链发生氧化脱氨,发挥着稳固细胞外基质的作用。而稳定性是蛋白质的一个重要特性,直接影响蛋白质的分子动态及其正常功能发挥,这与人类的健康和疾... 赖氨酰氧化酶LOXL2是一种依赖于铜离子的胺氧化酶,催化胶原蛋白和弹性蛋白的赖氨酸残基侧链发生氧化脱氨,发挥着稳固细胞外基质的作用。而稳定性是蛋白质的一个重要特性,直接影响蛋白质的分子动态及其正常功能发挥,这与人类的健康和疾病密切相关。然而,关于LOXL2的稳定性目前鲜有报道,哪些位点对其稳定性有显著影响尚不清楚。本研究采用冷冻电镜和Alphafold2的数据,建立LOXL2的全长结构,通过分子动力学模拟得到其优化构象。再通过4种方法(mCSM,PremPS,DeepDDG和FoldX),计算所有位点的稳定性属性,筛选出对稳定性有显性影响的位点(定义为关键位点)。结果表明,95个关键位点对LOXL2的稳定性具有显著影响,在5个结构域上的分布数量依次为14、13、8、11和26,而结构域间的连接肽段上也有23个关键位点。在这些关键位点中,类型及数量分别为Leu(24个)、Val(20个)、Ile(12个)、Trp(11个)、Phe(11个)、Tyr(6个)、Cys(6个)、Met(4个)和Arg(1个)。其中大部分关键位点(88个)为疏水性质,这与蛋白质折叠的主要力量为疏水作用的情况是一致的,而Cys两两成对,构成二硫键,对LOXL2的结构及功能发挥重要作用。讨论中,我们将预测结果与实验值进行比较,并用自由能微扰方法,对部分关键位点进行比较,从多方面论证此项工作的可信度。此项研究,可为靶向LOXL2的疾病治疗研究,提供重要指导。 展开更多
关键词 赖氨酰氧化酶样2 稳定性 分子动力学模拟 计算预测 吉布斯自由能
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肺癌中赖氨酰氧化酶样蛋白2的研究进展 被引量:2
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作者 普元倩 李彬 +1 位作者 余敏 熊伟 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期323-327,共5页
赖氨酰氧化酶样蛋白2(lysyl oxidase-like protein-2,LOXL2)是一种铜依赖性胺氧化酶,其过表达可导致肿瘤细胞的增殖、侵袭和转移。大量研究表明LOXL2在肺癌中的高表达与上皮-间质转化、转移、肿瘤进展和预后不良有关。该文主要对LOXL2... 赖氨酰氧化酶样蛋白2(lysyl oxidase-like protein-2,LOXL2)是一种铜依赖性胺氧化酶,其过表达可导致肿瘤细胞的增殖、侵袭和转移。大量研究表明LOXL2在肺癌中的高表达与上皮-间质转化、转移、肿瘤进展和预后不良有关。该文主要对LOXL2蛋白的结构、生物学作用、在肺癌中的表达与预后价值进行综述,并进一步探讨LOXL2单克隆抗体和小分子抑制剂在肺癌中的应用前景,以期为肺癌患者筛选预后标志物及相关临床治疗靶点提供理论基础和参考依据。 展开更多
关键词 肺肿瘤 上皮-间质转化 氧化酶蛋白-2 文献综述
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托芬那酸通过下调LOXL2表达抑制人胃癌SGC-7901细胞侵袭 被引量:4
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作者 程琦 徐松涛 +1 位作者 饶淑梅 马永超 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第21期2624-2627,2634,共5页
目的:观察托芬那酸(TA)对人胃癌SGC-7901细胞侵袭能力的影响,并探讨其作用机制。方法:用不同剂量的TA(0、3、6、12、24、48、96μmol/L)处理SGC-7901细胞24 h或48 h,CCK-8法检测细胞活力,脂质体介导shRNA转染靶向沉默LOXL2基因,Transwel... 目的:观察托芬那酸(TA)对人胃癌SGC-7901细胞侵袭能力的影响,并探讨其作用机制。方法:用不同剂量的TA(0、3、6、12、24、48、96μmol/L)处理SGC-7901细胞24 h或48 h,CCK-8法检测细胞活力,脂质体介导shRNA转染靶向沉默LOXL2基因,Transwell检测侵袭细胞数,RT-PCR检测LOXL2的mRNA水平,Western blot检测SP1、LOXL2、Snail、E-cad、MMP9蛋白水平。结果:TA可剂量依赖性地抑制SGC-7901细胞活力(P<0.05),24 h和48 h的IC50分别为78.06μmol/L和50.72μmol/L;与对照组相比,0、3、6和12μmol/L TA作用24 h后,SGC-7901细胞侵袭数显著减少(P<0.05),Snail、MMP9、SP1和LOXL2蛋白水平均显著降低(P<0.05),E-cad蛋白水平显著升高(P<0.05),LOXL2的mRNA水平显著降低(P<0.05),且呈现剂量依赖性;敲除LOXL2基因可抑制SGC-7901细胞侵袭(P<0.05),下调Snail和MMP9(P<0.05)、上调E-cad蛋白水平(P<0.05)。结论:TA可能通过下调SP1和LOXL2蛋白表达,进而下调Snail和MMP9、上调E-cad蛋白水平,最终抑制人胃癌SGC-7901细胞侵袭。 展开更多
关键词 托芬那酸 胃癌 SGC-7901细胞 侵袭 氧化酶蛋白2
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系统性硬化症和混合性结缔组织病活动期血清中LOXL-2的比较 被引量:4
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作者 程瑶 王晓非 +2 位作者 张晓莉 张娜 张新刚 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期414-416,421,共4页
目的比较赖氨酰氧化酶样蛋白2(LOXL-2)在系统性硬化症(SSc)和混合性结缔组织病(MCTD)活动期患者血清中的表达情况。方法用酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测20例SSc和20例MCTD患者中LOXL-2的浓度,进行统计分析。结果在活动期MCTD和SSc患者... 目的比较赖氨酰氧化酶样蛋白2(LOXL-2)在系统性硬化症(SSc)和混合性结缔组织病(MCTD)活动期患者血清中的表达情况。方法用酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测20例SSc和20例MCTD患者中LOXL-2的浓度,进行统计分析。结果在活动期MCTD和SSc患者血清中LOXL-2的蛋白表达量高于对照组(均P<0.05),且在SSc患者中LOXL-2浓度与患者皮肤病变评分(mRSS)呈正相关(r=0.982 P=0.001)。结论 LOXL-2在SSc和MCTD活动期患者的血清中高表达,可能与LOXL-2促进组织纤维化及血管炎的发生相关。 展开更多
关键词 系统性硬化症 混合性结缔组织病 氧化酶蛋白2 纤维化
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LOXL1和LOXL2基因在恶性胸膜间皮瘤中的表达及临床意义 被引量:5
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作者 李彬 杨娜 +5 位作者 李素芬 普元倩 张态 自加吉 李正亮 熊伟 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2022年第2期154-160,共7页
目的 赖氨酰氧化酶样蛋白1(LOXL1)和赖氨酰氧化酶样蛋白2(LOXL2)在恶性胸膜间皮瘤(MPM)的表达差异及其预后价值尚不明确。文中旨在探讨LOXL1和LOXL2基因mRNA在MPM组织中的表达及其临床意义。方法 回顾性收集2017年6月至2019年12月大理... 目的 赖氨酰氧化酶样蛋白1(LOXL1)和赖氨酰氧化酶样蛋白2(LOXL2)在恶性胸膜间皮瘤(MPM)的表达差异及其预后价值尚不明确。文中旨在探讨LOXL1和LOXL2基因mRNA在MPM组织中的表达及其临床意义。方法 回顾性收集2017年6月至2019年12月大理大学第一附属医院胸外科12例MPM患者的癌组织和配对相邻正常胸膜组织。采用RT-qPCR检测MPM组织及配对正常胸膜组织中LOXL1和LOXL2基因mRNA表达量。通过Oncomine数据库对非瘤组织与MPM组织中LOXL1和LOXL2基因的表达差异进行分析。通过R4.0.2软件对TCGA数据库中LOXL1和LOXL2基因mRNA表达量与MPM临床病理特征的相关性进行分析。构建Kaplan-Meier模型分别探讨LOXL1和LOXL2基因mRNA表达量对MPM患者预后的影响。采用基因表达谱动态分析(GEPIA)分别对LOXL1和LOXL2与MPM肿瘤标志物基因和LOX家族其他成员基因表达的相关性进行分析。结果 RT-qPCR检测显示,与正常胸膜组织比较,MPM组织中LOXL1和LOXL2基因mRNA的表达量显著增加(P<0.01)。LOXL1基因和LOXL2基因的高表达是导致MPM患者预后不良的影响因素,上皮样型MPM预示着MPM患者预后良好(P<0.05)。LOXL1基因表达与EFEMP1(r=-0.25,P=0.021)、MSLN(r=-0.35,P<0.001)、CALB2(r=-0.36,P<0.001)、THBS2(r=0.32,P=0.003)和CDH11基因(r=0.25,P=0.018)表达具有显著相关性。LOXL1基因表达与LOXL2(r=0.22,P=0.041)、LOXL4(r=0.3,P=0.004)基因具有显著正相关;LOXL2基因表达与LOX(r=0.65,P<0.001)、LOXL1(r=0.22,P=0.041)和LOXL4(r=0.37,P<0.001)基因表达具有显著正相关。结论 LOXL1和LOXL2基因在MPM组织中均呈现显著高表达,其基因表达量是评估MPM患者预后的有效指标。 展开更多
关键词 氧化酶蛋白1 氧化酶蛋白2 RT-QPCR 恶性胸膜间皮瘤 数据挖掘 临床意义
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