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基于实时荧光定量PCR筛选巨菌草内参基因
被引量：
3
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作者
李苏涛
李妍
+6 位作者
张磊
陈思齐
韩雪林
张娟
苏德伟
罗海凌
周晶
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期907-921,共15页
以巨菌草(Pennisetum giganteum)的叶片、茎、根为试验材料,通过分析8个基因18s rRNA、Actin、GAPDH、ACTB、EF-1α、UBQ、CYP、TUB在正常生长、干旱以及盐碱胁迫下荧光定量PCR中稳定性表达情况,筛选巨菌草的稳定内参基因。利用geNorm、...
以巨菌草(Pennisetum giganteum)的叶片、茎、根为试验材料,通过分析8个基因18s rRNA、Actin、GAPDH、ACTB、EF-1α、UBQ、CYP、TUB在正常生长、干旱以及盐碱胁迫下荧光定量PCR中稳定性表达情况,筛选巨菌草的稳定内参基因。利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件计算内参基因的表达稳定值并进行排序,最终通过赋值法综合排序确定稳定内参基因。结果表明,内参基因的稳定性在不同处理下存在差异。其中,ACTB稳定性好,为本研究筛选出巨菌草的内参基因。本研究筛选出的内参基因,为后续巨菌草功能基因表达分析奠定了基础。
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关键词
巨菌草
实时荧光定量PCR
内参基因
稳定性评价
干旱胁迫
盐碱胁迫
赋值法综合排序
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职称材料
题名
基于实时荧光定量PCR筛选巨菌草内参基因
被引量：
3
1
作者
李苏涛
李妍
张磊
陈思齐
韩雪林
张娟
苏德伟
罗海凌
周晶
机构
福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)
福建农林大学国家菌草工程技术研究中心
出处
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期907-921,共15页
基金
国家自然科学基金项目(32101418、42075116)
福建省重大专项(2021NZ0101)。
文摘
以巨菌草(Pennisetum giganteum)的叶片、茎、根为试验材料,通过分析8个基因18s rRNA、Actin、GAPDH、ACTB、EF-1α、UBQ、CYP、TUB在正常生长、干旱以及盐碱胁迫下荧光定量PCR中稳定性表达情况,筛选巨菌草的稳定内参基因。利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件计算内参基因的表达稳定值并进行排序,最终通过赋值法综合排序确定稳定内参基因。结果表明,内参基因的稳定性在不同处理下存在差异。其中,ACTB稳定性好,为本研究筛选出巨菌草的内参基因。本研究筛选出的内参基因,为后续巨菌草功能基因表达分析奠定了基础。
关键词
巨菌草
实时荧光定量PCR
内参基因
稳定性评价
干旱胁迫
盐碱胁迫
赋值法综合排序
Keywords
giant juncao
real-time fluorescent quantitative PCR
references genes
expression stability evaluation
drought stress
salt-alkali stress
comprehensive ranking of assignment method
分类号
S543.9 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于实时荧光定量PCR筛选巨菌草内参基因
李苏涛
李妍
张磊
陈思齐
韩雪林
张娟
苏德伟
罗海凌
周晶
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
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