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贵州本地山羊POLRMT基因启动子区SNP的生物信息学分析
被引量：
3
1
作者
孙岩岩
罗卫星
+3 位作者
谢海强
宋桃伟
刘彬
蔡惠芬
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第12期110-113,I0001,共5页
为给贵州本地山羊肉质品质选育工作提供更好的科学依据,以贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊为试验对象,探究肉质相关基因POLRMT启动子区SNP位点对肉质品质的影响。通过构建DNA池筛选出SNP位点,并采用多种生物信息学软件预测核心启动子...
为给贵州本地山羊肉质品质选育工作提供更好的科学依据,以贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊为试验对象,探究肉质相关基因POLRMT启动子区SNP位点对肉质品质的影响。通过构建DNA池筛选出SNP位点,并采用多种生物信息学软件预测核心启动子范围、CpG岛及转录因子。结果表明,POLRMT基因启动子区存在2个SNP位点,分别为T-81A、T-289C。POLRMT基因核心启动子范围发生改变,SNP位点导致部分转录因子结合位点消失,MethPrimer预测到CpG岛增加1个。
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关键词
POLRMT基因
启动子
SNP
贵州本地山羊
大理石纹性状
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职称材料
贵州本地山羊STAT5A基因第10外显子SNP研究
被引量：
1
2
作者
谢海强
孙岩岩
+6 位作者
盘道兴
钱成
康建兵
胡玲玲
龚俞
焦仁刚
刘若余
《江苏农业科学》
北大核心
2015年第7期30-33,共4页
利用黔北麻羊、贵州黑山羊和贵州白山羊构建DNA池,设计1对引物扩增其STAT5A基因第10外显子及部分内含子序列。PCR产物纯化后进行双向测序。DNAStar和BLAST分析确定多态性位点。利用生物信息学软件分析SNPs位点对STAT5A基因RNA二级结构、...
利用黔北麻羊、贵州黑山羊和贵州白山羊构建DNA池,设计1对引物扩增其STAT5A基因第10外显子及部分内含子序列。PCR产物纯化后进行双向测序。DNAStar和BLAST分析确定多态性位点。利用生物信息学软件分析SNPs位点对STAT5A基因RNA二级结构、STAT5A蛋白二级及三级结构的影响。结果表明:在扩增的STAT5A基因中筛选到3个SNPs:C-32A、G+71A和G+158A,其中G+71A为错义突变,导致编码的丙氨酸(Ala)变为苏氨酸(Thr);C-32A和G+158A均在内含子区,不参与氨基酸编码。SNPs位点对STAT5A基因RNA二级结构和STAT5A蛋白结构均有一定影响。
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关键词
STAT5A基因
SNPS
外显子
贵州本地山羊
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职称材料
题名
贵州本地山羊POLRMT基因启动子区SNP的生物信息学分析
被引量：
3
1
作者
孙岩岩
罗卫星
谢海强
宋桃伟
刘彬
蔡惠芬
机构
贵州大学动物科学学院
贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点试验室
出处
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第12期110-113,I0001,共5页
基金
教育部促进与美大地区科研合作与高层次人才培养项目(教外司美[2013]1741号)
贵州省农业科技攻关项目(黔科合NY字[2012]3006号)
文摘
为给贵州本地山羊肉质品质选育工作提供更好的科学依据,以贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊为试验对象,探究肉质相关基因POLRMT启动子区SNP位点对肉质品质的影响。通过构建DNA池筛选出SNP位点,并采用多种生物信息学软件预测核心启动子范围、CpG岛及转录因子。结果表明,POLRMT基因启动子区存在2个SNP位点,分别为T-81A、T-289C。POLRMT基因核心启动子范围发生改变,SNP位点导致部分转录因子结合位点消失,MethPrimer预测到CpG岛增加1个。
关键词
POLRMT基因
启动子
SNP
贵州本地山羊
大理石纹性状
Keywords
POLRMT gene
promoter
SNP
Guizhou local goats marbling performance
分类号
S826 [农业科学—畜牧学]
Q346.5 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
贵州本地山羊STAT5A基因第10外显子SNP研究
被引量：
1
2
作者
谢海强
孙岩岩
盘道兴
钱成
康建兵
胡玲玲
龚俞
焦仁刚
刘若余
机构
贵州大学动物科学学院
贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室
贵州省畜牧技术推广站
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2015年第7期30-33,共4页
基金
贵州省重大科技专项计划(编号:黔科合重大专项字[2011]6009号)
黔西南州种草养羊产业发展省州科技合作专项(编号:黔西南科合字[2011]5-3号)
贵州大学研究生创新基金(编号:研农2014012)
文摘
利用黔北麻羊、贵州黑山羊和贵州白山羊构建DNA池,设计1对引物扩增其STAT5A基因第10外显子及部分内含子序列。PCR产物纯化后进行双向测序。DNAStar和BLAST分析确定多态性位点。利用生物信息学软件分析SNPs位点对STAT5A基因RNA二级结构、STAT5A蛋白二级及三级结构的影响。结果表明:在扩增的STAT5A基因中筛选到3个SNPs:C-32A、G+71A和G+158A,其中G+71A为错义突变,导致编码的丙氨酸(Ala)变为苏氨酸(Thr);C-32A和G+158A均在内含子区,不参与氨基酸编码。SNPs位点对STAT5A基因RNA二级结构和STAT5A蛋白结构均有一定影响。
关键词
STAT5A基因
SNPS
外显子
贵州本地山羊
分类号
S827.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
贵州本地山羊POLRMT基因启动子区SNP的生物信息学分析
孙岩岩
罗卫星
谢海强
宋桃伟
刘彬
蔡惠芬
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
在线阅读
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职称材料
2
贵州本地山羊STAT5A基因第10外显子SNP研究
谢海强
孙岩岩
盘道兴
钱成
康建兵
胡玲玲
龚俞
焦仁刚
刘若余
《江苏农业科学》
北大核心
2015
1
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职称材料
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