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3个贵州地方鸡种NKX2-5基因多态性及生物信息学分析 被引量:3
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作者 杨红 孙鹃 +5 位作者 裘贵华 宋汝谋 杨开明 朱明贵 李俊 张勇 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第12期209-214,共6页
以高脚鸡、威宁鸡、乌蒙乌骨鸡(含白壳蛋鸡和绿壳蛋鸡)3个贵州地方鸡种为研究对象,构建品种DNA池,扩增NKX2-5基因第1外显子全部序列及第2内含子部分序列,采用直接测序法对3个品种(4个群体)的NKX2-5基因进行单核苷酸多态性检测,利用生物... 以高脚鸡、威宁鸡、乌蒙乌骨鸡(含白壳蛋鸡和绿壳蛋鸡)3个贵州地方鸡种为研究对象,构建品种DNA池,扩增NKX2-5基因第1外显子全部序列及第2内含子部分序列,采用直接测序法对3个品种(4个群体)的NKX2-5基因进行单核苷酸多态性检测,利用生物信息学软件预测不同多态性位点对NKX2-5基因mRNA二级结构、蛋白质二级结构的影响。结果表明,在3个品种(4个群体)中共检测到G108A、T288C、C400T、T420G和G429A5个SNPs位点,其中,G108A位于非编码区;T288C、C400T位于第1外显子区;T420G和G429A位于内含子区。T288C和C400T均为错义突变,T288C突变导致丝氨酸(Ser)变为脯氨酸(Pro)、C400T突变导致丙氨酸(Ala)变为缬氨酸(Val),SNPs位点对于NKX2-5基因mRNA二级结构、蛋白质二级结构有一定影响。 展开更多
关键词 贵州地方鸡种 NKX2-5基因 SNPS 生物信息学
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贵州地方鸡种与隐性白洛克鸡遗传多样性对比研究 被引量:2
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作者 张勇 肖礼华 +3 位作者 陈祥 何爱飞 王安娜 简承松 《畜牧兽医科技信息》 2007年第6期32-34,共3页
本研究运用微卫星DNA标记技术对贵州12个地方鸡种(类群)和引进鸡种-隐性白洛克的等位基因、平均杂合度和多态信息含量等指标进行了对比分析研究,结果表明,贵州地方鸡种的遗传多样性较隐性白洛克高,遗传基础更为丰富,更适宜培育不同的新... 本研究运用微卫星DNA标记技术对贵州12个地方鸡种(类群)和引进鸡种-隐性白洛克的等位基因、平均杂合度和多态信息含量等指标进行了对比分析研究,结果表明,贵州地方鸡种的遗传多样性较隐性白洛克高,遗传基础更为丰富,更适宜培育不同的新品种(类型),满足多样化的市场需求。 展开更多
关键词 贵州地方鸡种 隐性白洛克 遗传多样性 微卫星
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贵州地方鸡种的遗传变异研究 被引量:1
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作者 王文涛 林家栋 +1 位作者 陈眷华 张福平 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第4期185-188,共4页
为了研究贵州地方鸡种的遗传多样性与系统进化,试验通过PCR直接测序的方法,测定了6个贵州地方鸡种的90个个体线粒体DNA控制区部分序列,并进行了序列分析。结果表明,DNA控制区序列长度为780bp,A、G、C、T4种核苷酸的平均比例分别为2... 为了研究贵州地方鸡种的遗传多样性与系统进化,试验通过PCR直接测序的方法,测定了6个贵州地方鸡种的90个个体线粒体DNA控制区部分序列,并进行了序列分析。结果表明,DNA控制区序列长度为780bp,A、G、C、T4种核苷酸的平均比例分别为26.14%、13.38%、25.98%、34.50%;共发现40个变异位点(不包含种内变异位点),占分析位点总数的5.13%;共确定30个单倍型,6个群体内单倍型变异度总体为0.914,变化范围为0.506~0.976。6个群体间表现出显著的遗传分化和较高水平的群体遗传多态性。 展开更多
关键词 贵州地方鸡种 线粒体DNA控制区 遗传多样性
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FABP4基因在3个贵州地方鸡种中多态性研究
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作者 何琦 郭勇 杨红 《现代畜牧科技》 2023年第11期49-52,共4页
为系统筛查贵州地方鸡FABP4基因多态性。该试验以3个贵州地方鸡种(高脚鸡、百宜黑鸡和乌蒙凤鸡)为研究对象,构建品种DNA池,PCR扩增FABP4基因所有外显子及部分内显子区域,采用直接测序结合生物信息技术检测FABP4基因多态性。结果显示,在... 为系统筛查贵州地方鸡FABP4基因多态性。该试验以3个贵州地方鸡种(高脚鸡、百宜黑鸡和乌蒙凤鸡)为研究对象,构建品种DNA池,PCR扩增FABP4基因所有外显子及部分内显子区域,采用直接测序结合生物信息技术检测FABP4基因多态性。结果显示,在3个贵州地方鸡资源群体中共发现C51T和T1751C 2个SNPs位点,其中C51T位于第一外显子区,属于同义突变位点;等位基因频率估算发现,C51T位点在3个地方鸡种中多态丰度较高,T1751C位点在群体中多态丰度低;生物信息学得出,C51T位点突变后,鸡FABP4基因mRNA二级结构发生变化,自由能提升,稳定性降低。该试验成功挖掘出贵州地方鸡FABP4基因外显子及部分内含子区域变异位点,以期为贵州地方鸡分子标记开发利用提供参考。 展开更多
关键词 贵州地方鸡种 FABP4基因 多态性
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8个地方鸡品种的体尺、屠宰性能及肉品质的比较及综合评价 被引量:6
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作者 徐丹 唐继高 +5 位作者 苗小猛 冯宇隆 伍革民 代国滔 韩雪 赵小玲 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期1-10,共10页
【目的】通过比较分析贵州省8个地方鸡品种的体尺、屠宰性能及肉品质性状差异,为贵州地方鸡种的保护开发和利用提供基础数据。【方法】采用常规方法对乌蒙乌骨鸡、威宁鸡、普定高脚鸡、兴义矮脚鸡、黔东南小香鸡、赤水乌骨鸡、长顺绿壳... 【目的】通过比较分析贵州省8个地方鸡品种的体尺、屠宰性能及肉品质性状差异,为贵州地方鸡种的保护开发和利用提供基础数据。【方法】采用常规方法对乌蒙乌骨鸡、威宁鸡、普定高脚鸡、兴义矮脚鸡、黔东南小香鸡、赤水乌骨鸡、长顺绿壳蛋鸡和瑶山鸡的体尺指标、屠宰性能和肉品质性状指标进行测定,利用主成分分析法构建肉用性状综合评价模型。【结果】贵州8个地方鸡品种体尺性状、屠宰性能及肉品质指标存在明显差异,但屠宰率均大于86%,全净膛率均大于67%,8个品种均表现出了较佳的产肉性能;成功构建了肉用鸡综合评价模型,评分结果为:威宁鸡>乌蒙乌骨鸡>普定高脚鸡>赤水乌骨鸡>瑶山鸡>兴义矮脚鸡>黔东南小香鸡>长顺绿壳蛋鸡。【结论】8个地方鸡品种均表现出了良好的产肉性,是优质的肉鸡种质资源;综合评价结果显示,威宁鸡和乌蒙乌骨鸡肉用性能比较出色。 展开更多
关键词 贵州地方鸡种 体尺性状 屠宰性能 肉品质 综合评价 主成分分析法
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贵州地方白羽鸡种MSTN基因SNP位点快速筛查及其蛋白功能预测 被引量:3
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作者 龙广丽 牟腾慧 +6 位作者 刘洋 饶永超 杨德凤 谭光辉 林家栋 傅筑荫 张福平 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期1840-1848,共9页
【目的】明确贵州地方白羽鸡种肌肉生长抑制素(MSTN)基因的多态性,筛选出改良白羽鸡肉质品质的分子遗传标记,为选择培育优良肉质鸡种提供参考依据。【方法】以兴义矮脚鸡白羽品系、罗曼蛋鸡及兴义矮脚鸡白羽品系与罗曼蛋鸡杂交的自交后... 【目的】明确贵州地方白羽鸡种肌肉生长抑制素(MSTN)基因的多态性,筛选出改良白羽鸡肉质品质的分子遗传标记,为选择培育优良肉质鸡种提供参考依据。【方法】以兴义矮脚鸡白羽品系、罗曼蛋鸡及兴义矮脚鸡白羽品系与罗曼蛋鸡杂交的自交后代(F2)为研究对象,提取3个鸡种的血液基因组DNA构建DNA混合池,PCR扩增MSTN基因全部外显子序列,直接测序筛选SNP位点并进行生物信息学分析,探究SNP位点突变对MSTN基因mRNA二级结构及编码蛋白结构和功能的影响。【结果】在鸡MSTN基因第1外显子(Exon-1)筛查到6个SNPs位点,分别为G51A、A60G、G195C、A234G、C297T和C324T,且6个SNPs位点均为同义突变。在A234G位点处检测到兴义矮脚鸡白羽系和F2代存在多态性,但罗曼蛋鸡未发生变异;在C297T位点处检测到罗曼蛋鸡存在多态性,以C为优势等位基因,而兴义矮脚鸡白羽品系和F2代均未发生变异;G51A、G60A、G159C和C324T等4个SNPs位点在3个鸡种中均存在多态性。A234G位点突变对鸡MSTN基因m RNA二级结构稳定性无影响,G51A位点突变致使MSTN基因mRNA二级结构最小自由能降低但未改变其构象,A60G、G195C、C297T和C324T等4个SNPs位点突变均引起MSTN基因mRNA二级结构和最小自由能的改变。鸡MSTN基因编码蛋白为不稳定的脂溶性蛋白,存在信号肽,但不存在跨膜区域,其二级结构由无规则卷曲、β-折叠和α-螺旋组成,且以无规则卷曲占比最高。【结论】MSTN基因在贵州地方白羽鸡种中的多态性较丰富,其中A60G、G195C、C297T和C324T等4个SNPs位点突变会导致基因mRNA二级结构的构象发生改变,可作为改良白羽鸡肉质品质的分子遗传标记进一步研究。 展开更多
关键词 贵州地方白羽 MSTN基因 肉质性状 SNP位点 多态性 生物信息学
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百宜黑鸡部分种质特性研究
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作者 刘付祥 《中国畜牧业》 2023年第10期55-56,共2页
百宜黑鸡是优良的贵州地方鸡种。近年来,受生存环境遭到破坏,引进外地品种杂交改良等人为因素以及某些自然因素的影响,其开发利用受到限制,种群数量呈下降趋势。笔者通过研究百宜黑鸡部分种质特性,分析品种生产性能,以保存百宜黑鸡的优... 百宜黑鸡是优良的贵州地方鸡种。近年来,受生存环境遭到破坏,引进外地品种杂交改良等人为因素以及某些自然因素的影响,其开发利用受到限制,种群数量呈下降趋势。笔者通过研究百宜黑鸡部分种质特性,分析品种生产性能,以保存百宜黑鸡的优良基因,防止优良遗传性状的流失。 展开更多
关键词 质特性 百宜黑 优良基因 杂交改良 遗传性状 群数量 贵州地方鸡种 人为因素
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