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应用3种遗传分析方法分析养殖鲤与天然群体的遗传差异
被引量:
3
1
作者
许丽花
李巍
+2 位作者
吴春琳
董在杰
王成辉
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期393-399,共7页
应用基于分子标记的主成分分析法、贝叶斯遗传聚类法和遗传重排技术对鲤4个人工选育群体(兴国红鲤、荷包红鲤、玻璃红鲤和建鲤)和2个长江干流天然群体(湖北监利和江苏扬州)的10个微卫星标记结果进行分析,以有效检测人工选育群体间以及...
应用基于分子标记的主成分分析法、贝叶斯遗传聚类法和遗传重排技术对鲤4个人工选育群体(兴国红鲤、荷包红鲤、玻璃红鲤和建鲤)和2个长江干流天然群体(湖北监利和江苏扬州)的10个微卫星标记结果进行分析,以有效检测人工选育群体间以及选育群体与天然群体间的遗传差异。主成分分析显示,人工选育群体与天然群体存在一定程度的遗传分化,荷包红鲤与天然群体的遗传差异最大,其主成分1(PC1)和主成分2(PC2)解释了总遗传变异的48.23%;在贝叶斯遗传聚类分析中,6个群体的最佳聚类数值为4,即兴国红鲤与2个天然群体聚为一类,玻璃红鲤、荷包红鲤和建鲤3个群体分别单独聚为一类;贝叶斯遗传重排分析显示,6个群体的遗传自排率较高,为81%~100%,玻璃红鲤和荷包红鲤的遗传自排率最高,均为100%。研究结果综合表明:4个人工选育群体与天然群体间存在较明显的遗传差异,而且天然群体已受到人工选育群体的遗传影响;这3种方法能很好地检测鲤人工选育群体间、以及选育群体与天然群体间的遗传差异。
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关键词
鲤
微卫星标记
主成分
分析
贝叶斯遗传聚类分析
贝叶斯
遗传
重排技术
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职称材料
题名
应用3种遗传分析方法分析养殖鲤与天然群体的遗传差异
被引量:
3
1
作者
许丽花
李巍
吴春琳
董在杰
王成辉
机构
上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室
全国水产技术推广站
中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室
出处
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期393-399,共7页
基金
公益性行业(农业)科研专项资助项目(200903045)
教育部新世纪优秀人才支持计划资助项目(NCET-08-0896)
文摘
应用基于分子标记的主成分分析法、贝叶斯遗传聚类法和遗传重排技术对鲤4个人工选育群体(兴国红鲤、荷包红鲤、玻璃红鲤和建鲤)和2个长江干流天然群体(湖北监利和江苏扬州)的10个微卫星标记结果进行分析,以有效检测人工选育群体间以及选育群体与天然群体间的遗传差异。主成分分析显示,人工选育群体与天然群体存在一定程度的遗传分化,荷包红鲤与天然群体的遗传差异最大,其主成分1(PC1)和主成分2(PC2)解释了总遗传变异的48.23%;在贝叶斯遗传聚类分析中,6个群体的最佳聚类数值为4,即兴国红鲤与2个天然群体聚为一类,玻璃红鲤、荷包红鲤和建鲤3个群体分别单独聚为一类;贝叶斯遗传重排分析显示,6个群体的遗传自排率较高,为81%~100%,玻璃红鲤和荷包红鲤的遗传自排率最高,均为100%。研究结果综合表明:4个人工选育群体与天然群体间存在较明显的遗传差异,而且天然群体已受到人工选育群体的遗传影响;这3种方法能很好地检测鲤人工选育群体间、以及选育群体与天然群体间的遗传差异。
关键词
鲤
微卫星标记
主成分
分析
贝叶斯遗传聚类分析
贝叶斯
遗传
重排技术
Keywords
Cyprinus carpio L.
microsatellite marker
principal coordinate analysis
Bayesian cluster analysis
Bayesian genetic assignment technique
分类号
Q346.5 [生物学—遗传学]
S917 [农业科学—水产科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用3种遗传分析方法分析养殖鲤与天然群体的遗传差异
许丽花
李巍
吴春琳
董在杰
王成辉
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2012
3
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