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利用DNA序列构建系统树的方法 被引量:25
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作者 李涛 赖旭龙 钟扬 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期205-210,共6页
利用DNA序列进行系统发生分析是分子进化研究的必要手段。构建系统树的方法有距离法、简约法、最大似然法以及贝叶斯推断法等。要解决特定的系统发生问题,首先要挑选合理的分类群及序列,尽量减少数据的偏倚,然后选择构树方法,最后还要... 利用DNA序列进行系统发生分析是分子进化研究的必要手段。构建系统树的方法有距离法、简约法、最大似然法以及贝叶斯推断法等。要解决特定的系统发生问题,首先要挑选合理的分类群及序列,尽量减少数据的偏倚,然后选择构树方法,最后还要对结果进行评价并给出进化学上的解释。通过讨论挑选数据的原则及存在的问题,介绍了几种构树方法的基本原理及步骤,并列举了它们的优缺点。 展开更多
关键词 DNA序列 系统树 分子进化 距离 简约 贝叶斯推断法
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基于紫贻贝Mytilus galloprovincialis表达序列的核受体家族分析
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作者 李娟 李崇德 《海洋通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期174-179,共6页
通过对紫贻贝(Mytilus galloprovincialis)公共数据库表达序列的整合分析,共获得29条核受体序列。通过DNA结合结构域(DBD)和配体结合结构域(LBD)的多序列比对,并采用贝叶斯推断法进行系统进化分析,推测其中19个核受体属于NR1亚家族,5个... 通过对紫贻贝(Mytilus galloprovincialis)公共数据库表达序列的整合分析,共获得29条核受体序列。通过DNA结合结构域(DBD)和配体结合结构域(LBD)的多序列比对,并采用贝叶斯推断法进行系统进化分析,推测其中19个核受体属于NR1亚家族,5个属于NR2亚家族,2个属于NR3亚家族,1个属于NR5亚家族。结果表明紫贻贝中存在HR96、E75、ROR、HNF4、RXR、TLL、SVP、ESR、ERR同源的核受体,并且具有新型的2DBD核受体。 展开更多
关键词 紫贻贝 核受体(核激素受体) 多序列比对 贝叶斯推断法
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