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幽门螺杆菌与食管癌的因果关联:基于孟德尔随机化研究
1
作者 杜凯豪 侯立朝 +5 位作者 东小鸽 罗兰明慧 蒋威 汪占金 薛伟伟 王展 《南京医科大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第10期1404-1416,共13页
目的:本研究旨在探索幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,HP)与食管癌(esophageal cancer,EC)之间的潜在因果关系。方法:本研究分析了全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)数据,以HP感染作为暴露因素,EC作为结局变量。采... 目的:本研究旨在探索幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,HP)与食管癌(esophageal cancer,EC)之间的潜在因果关系。方法:本研究分析了全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)数据,以HP感染作为暴露因素,EC作为结局变量。采用了多种孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法,包括逆方差加权分析法、加权中位数法、MR Egger法、Simple mode法以及Weighted mode法来探索HP与EC之间的关联性。此外,还引入了贝叶斯加权MR方法,并通过假阳性发现率(false discovery rate,FDR)进行结果矫正,以提高分析的精确性。研究还包括离群值检测、异质性检测、敏感性分析、多效性分析,并且移除了可能因混杂因素影响结果的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)。对于争议较大的结果,进行了Meta分析以提供更广泛的视角。同时,通过Steiger测试和反向MR方法排除了潜在的反向因果关系。此外,本研究还利用连锁不平衡分数回归(linkage disequilibrium score regression,LDSC)评估了HP与EC之间的遗传相关性。结果:经过综合分析,无论是传统的两样本MR还是贝叶斯加权MR在FDR矫正后,结果均表明HP与EC之间没有统计学上的因果联系(P>0.05)。所有分析结果均未显示存在多效性(P>0.05),且“留一法”检验也证实了所得结果的稳健性。然而,对抗HP IgG血清阳性和HP GroEL抗体水平的遗传相关性分析提示,这些标志物与食管腺癌之间可能存在潜在的遗传相关性(P<0.05)。结论:尽管采用了遗传相关的统计方法,本研究发现当前的证据不足以支持HP与EC之间存在明确的因果关系。这一发现强调了需要更大规模的GWAS数据和更细致的亚型特异性分析来进一步探究二者之间关系的必要性。未来研究应包括更广泛的人群和地理区域,以增强发现的一般性和适用性,同时应探讨HP不同菌株的具体影响以及可能机制,为EC的预防和治疗提供更有力的科学依据。 展开更多
关键词 食管癌 幽门螺杆菌 全基因组关联研究 孟德尔随机化 贝叶斯加权孟德尔随机化
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基于耳鸣与阿尔茨海默病发病风险因果关系的孟德尔随机化分析
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作者 孙行云 李傅尧 +1 位作者 李可心 时晶 《吉林大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第4期1052-1060,共9页
目的:采用两样本孟德尔随机化(MR)方法评估耳鸣与阿尔茨海默病(AD)发病风险之间的潜在因果关系,并阐明其作用机制,为AD早期预警提供新思路。方法:利用全基因组关联研究(GWAS)数据库,搜索关键词“tinnitus”和“Alzheimer”,获取暴露因... 目的:采用两样本孟德尔随机化(MR)方法评估耳鸣与阿尔茨海默病(AD)发病风险之间的潜在因果关系,并阐明其作用机制,为AD早期预警提供新思路。方法:利用全基因组关联研究(GWAS)数据库,搜索关键词“tinnitus”和“Alzheimer”,获取暴露因素耳鸣和结局AD的相关数据集,其中耳鸣数据集包括ukb-d-4803_11、ukb-d-4803_12、ukb-d-4803_13、ukb-b-14254和ukb-a-384,AD数据集包括ieu-b-5067、ieu-b-2、ieu-a-297、ebi-a-GCST90027158和ebi-a-GCST002245。筛选与耳鸣密切相关且独立的单核苷酸多态性(SNPs)作为工具变量(IVs),与AD相关的SNPs作为结局。采用逆方差加权法(IVW)进行MR分析,评估其比值比(OR)值、95%置信区间(CI)及P值,当P<0.05时提示存在显著因果关系。敏感性检测使用Cochran’s Q检验IVs的异质性,评估其Q值、df值和P值,当IVW分析法的P>0.05时,提示无显著异质性;采用MR-Egger截距检测水平多效性,当截距为0或接近0,且P>0.05时,提示无显著水平多效性;采用留一法进行敏感性分析,通过森林图、散点图、漏斗图和留一图进行结果可视化。结果:共筛选出286个SNPs作为IVs。所有的IVs满足F>10,提示不存在弱IVs,经过PhenoScanner网页工具筛选,所有SNPs与混杂因素无关。当耳鸣和AD数据集分别为ukb-d-4803和ebi-a-GCST90027158时,耳鸣与AD发病风险之间呈显著正相关关系(OR=1.842,95%CI=1.065~3.188,P=0.029);Cochran’s Q检验提示IVs不存在显著异质性(Q=9.788,df=10.000,P=0.459);MR-Egger截距表明无水平多效性(Egger intercept=-0.006,P=0.147);留一法显示结果稳定,未检测出对结果影响大的SNPs。结论:耳鸣与AD的发病风险之间存在正向因果关系。神经炎症伴随不同程度的小胶质细胞持续激活,可能是耳鸣与AD的共同发病机制。抑郁症也可能作为上游因素,过度激活了下丘脑-垂体-肾上腺(HPA)轴,从而导致耳鸣与AD关系的进阶。 展开更多
关键词 耳鸣 阿尔茨海默病 孟德尔随机化 全基因组关联研究 逆方差加权法
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6种代谢产物与特应性皮炎的因果关联:双向双样本孟德尔随机化研究
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作者 魏艳 孙妍 +2 位作者 王丽娟 邵帅 郑焱 《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期801-808,共8页
目的采用双向双样本孟德尔随机化(MR)分析来研究代谢产物与特应性皮炎(AD)之间的因果关系。方法从全基因组关联研究(GWAS)的汇总数据中提取与代谢产物相关的单核苷酸多态性(SNP)位点作为工具变量(IV)。使用R软件中的TwoSampleMR包对6种... 目的采用双向双样本孟德尔随机化(MR)分析来研究代谢产物与特应性皮炎(AD)之间的因果关系。方法从全基因组关联研究(GWAS)的汇总数据中提取与代谢产物相关的单核苷酸多态性(SNP)位点作为工具变量(IV)。使用R软件中的TwoSampleMR包对6种代谢物与AD之间的因果关联进行分析。所采用的主要方法包括逆方差加权法(IVW)、MR Egger和加权中位数法。使用Cochran’Q统计量进行异质性检验,MR Egger截距检验水平多效性,使用“留一法”进行敏感性分析。结果IVW分析结果显示,抗坏血酸(OR=0.861,95%CI:0.751~0.987)、花生四烯酸(OR=0.363,95%CI:0.193~0.683)、可的松(OR=0.447,95%CI:0.221~0.906)与AD的发生呈负相关;尿苷(OR=3.473,95%CI:1.043~11.562)、5-羟色胺(OR=1.896,95%CI:1.007~3.571)及2-羟基戊二酸(OR=2.158,95%CI:1.186~3.924)与AD的发生呈正相关,差异均具有统计学意义。结论遗传学预测的代谢产物与AD风险增加具有因果关联,但尚无显著证据支持AD与上述6种代谢产物之间的因果关系。 展开更多
关键词 特应性皮炎(AD) 孟德尔随机化(MR) 因果关联 代谢产物 逆方差加权法(IVW)
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