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题名利用谱图校正提高色谱-质谱联用的分析效率
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作者
陆文渊
张扬
沈诚频
殷薛飞
刘晓慧
杨芃原
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机构
复旦大学化学系
复旦大学上海医学院生物医学研究院
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出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期349-354,共6页
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基金
国家重大科学计划项目(2010CB912700
2013CB911201
+3 种基金
2011CB910600)
国家高技术研究发展计划项目(2012AA020203
2014AAQ00361)
国家自然科学基金重点项目(21227805)
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文摘
在使用对二甲基亚砜(DMSO)和NEDD8激活酶抑制剂(MLN4924,MLN)刺激的人脐静脉内皮细胞(HUVEC)内的蛋白质进行分析的过程中,利用Progenesis LC-M S软件对色谱图进行了保留时间的校正,并比较了同组分多次重复实验中的谱图相似率及两种刺激下细胞内蛋白质色谱图的相似度。样品经双酶切处理后,加入QconC AT标准蛋白质混合物作为参照,经高效液相色谱-串级质谱分离,后续又对谱图进行了校正与分析。经过谱图校正,将蛋白质鉴定结果从7 000个左右提高到8 000个以上,提高了蛋白质的鉴定效率。在利用谱图计数进行相对定量时,还分析了DMSO和MLN分别刺激HUVEC后细胞内的蛋白质差异在1 000个左右,并给出了校正后的色谱总离子流图的相似度比较。相比其他方法更为简单快捷和流程化,具有高通量高灵敏度的优点。
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关键词
高效液相色谱-串级质谱
谱图校正
蛋白质分析
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Keywords
high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry（ HPLC-MS /MS）
spectrum alignment
protein analysis
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分类号
O658
[理学—分析化学]
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