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题名蛋白质结构动力学研究进展
被引量：2
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作者
孙卫涛
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机构
清华大学周培源应用数学研究中心
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出处
《力学进展》
EI
CSCD
北大核心
2009年第2期129-153,共25页
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基金
清华大学骨干人才支持计划(2007)资助项目~~
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文摘
蛋白质是生物体赖以存在和生长的重要大分子有机化合物,由20种不同的氨基酸通过肽键连接成线性高分子链,具有特殊的三维空间结构.蛋白质生物功能与结构动力学特征紧密相关,不同结构运动模式决定了蛋白质在生化过程中的不同生物功能.给定一种蛋白质的空间结构,通过建立结构动力学模型,进而得到蛋白质结构的运动轨迹,或者将结构整体运动分解为不同频率振动模态的叠加,能够帮助进一步理解蛋白质生物活性点在配体结合、催化过程中的运动特征.阐述了蛋白质结构动力学研究的最新进展,分析了3种蛋白质结构动力学的物理模型和求解方法,详细讨论了谐波模型中的原子模态分析、弹性网络模型等动力学方法,并介绍了蛋白质结构动力学在生物研究领域的应用.蛋白质结构动力学方法的研究和发展表明,从物理原理和简化模型出发的理论分析方法,能够为生物学前沿研究提供有力帮助,是蛋白质折叠和结构预测中的一个重要研究方向.
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关键词
蛋白质
结构动力学
分子动力学
谐波动力学
随机动力学
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Keywords
protein, structure dynamics, molecular dynamics, harmonic dynamics, stochastic dynamics
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分类号
Q510.1
[生物学—生物化学]
TU311.3
[建筑科学—结构工程]
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题名利用土壤温度估算土壤有效热导系数和水流通量
被引量：1
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作者
黄金廷
马洪云
张俊
董佳秋
王冬
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机构
中国地质调查局西安地质调查中心
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出处
《地质通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期2074-2082,共9页
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基金
国土资源部公益性行业科研专项(编号:201311076)
陕西省自然科学基金(编号:2014JQ5187
2015kjxx-69)
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文摘
土壤有效热导系数和水流通量是研究大气-土壤系统水分转化的重要变量。采用动态回归模型(DHR)获取土壤温度的振幅和相位变化,联合土壤水热耦合方程的解析解估算土壤有效热导系数和土壤水流通量,并将该方法应用于毛乌素沙地的土壤水流通量估算中。结果显示,实例研究估算获得的有效热导系数在10^(-7)m^2/s数量级变化,且随振幅比的增加呈指数增加,随相位差的增加呈指数衰减。当土壤含水率小于0.08时,有效热导系数呈线性增加;当土壤含水率大于0.08时,接近恒定值(定量0.08),土壤水流通量随土壤含水率的变化无明显的线性关系。
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关键词
土壤温度
非饱和带
水流通量
动力学谐波分析
毛乌素沙地
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Keywords
soil temperature
unsaturated zone
soil water flux
dynamic harmonic analysis
Mu Us Desert
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分类号
X143
[环境科学与工程—环境科学]
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