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基于开放染色质的全基因组水平转录调控元件的研究方法与进展
被引量:
4
1
作者
韩金磊
李占杰
王凯
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2017年第1期1-8,共8页
真核生物转录调控过程是大量的顺式调控元件与反式作用因子相互作用的结果.研究发现,这一调控过程与染色质核小体的动态定位相关,调控因子的结合需要裸露的无核小体的DNA区域,即开放的染色质位点.因此,高效精确地定位基因组上的开放染...
真核生物转录调控过程是大量的顺式调控元件与反式作用因子相互作用的结果.研究发现,这一调控过程与染色质核小体的动态定位相关,调控因子的结合需要裸露的无核小体的DNA区域,即开放的染色质位点.因此,高效精确地定位基因组上的开放染色质位点为成功地发掘基因组调控元件,乃至揭示基因表达调控机制提供了重要线索和有效手段.本文对开放染色质位点的定义、主要研究方法以及功能注释进行概述,希望对在基因组水平上调控元件的发掘,尤其是在植物中的应用提供借鉴.
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关键词
开放染色质位点
DNASE
I超敏感位点测序
调控因子印记
表观遗传修饰
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职称材料
题名
基于开放染色质的全基因组水平转录调控元件的研究方法与进展
被引量:
4
1
作者
韩金磊
李占杰
王凯
机构
福建农林大学海峡联合研究院基因组与生物技术研究中心
福建农林大学作物科学学院
福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心
出处
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2017年第1期1-8,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(31471170
31628013)
+1 种基金
福建农林大学人才引进启动项目(11899006004)
棉花生物学国家重点实验室开放课题(CB2015A05)
文摘
真核生物转录调控过程是大量的顺式调控元件与反式作用因子相互作用的结果.研究发现,这一调控过程与染色质核小体的动态定位相关,调控因子的结合需要裸露的无核小体的DNA区域,即开放的染色质位点.因此,高效精确地定位基因组上的开放染色质位点为成功地发掘基因组调控元件,乃至揭示基因表达调控机制提供了重要线索和有效手段.本文对开放染色质位点的定义、主要研究方法以及功能注释进行概述,希望对在基因组水平上调控元件的发掘,尤其是在植物中的应用提供借鉴.
关键词
开放染色质位点
DNASE
I超敏感位点测序
调控因子印记
表观遗传修饰
Keywords
open-chromatin site
DNase I hypersensitive site sequencing
regulator footprint
epigenetic modification
分类号
Q756 [生物学—分子生物学]
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作者
出处
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被引量
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1
基于开放染色质的全基因组水平转录调控元件的研究方法与进展
韩金磊
李占杰
王凯
《福建农林大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2017
4
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