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题名人工智能赋能丝氨酸水解酶的设计进展
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作者
张一飞
丁于敬
佘傲
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机构
北京化工大学化工资源有效利用全国重点实验室
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出处
《华东理工大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第3期291-294,共4页
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基金
国家自然科学基金(32371325)
北京市自然科学基金(Z240030)
中国石油化工集团公司种子基金(223260)。
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文摘
近年来,人工智能技术在蛋白质结构预测与功能设计方面取得了突破性进展,为人工酶的从头设计提供了全新的方法和工具。丝氨酸水解酶因其催化机制明确,成为人工酶设计任务的代表性模型。本文综述了近年来开发的重要深度学习算法及其在人工酶设计中的典型应用,并重点介绍了人工丝氨酸水解酶的最新设计成果。这些突破性进展为创制具有更高催化效率和稳定性的人工酶铺平了道路,标志着酶设计领域迈入了新的阶段,有望带来生物制造相关产业的变革。
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关键词
人工智能
计算酶设计
深度学习
蛋白质工程
丝氨酸水解酶
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Keywords
artificial intelligence
computational enzyme design
deep learning
protein engineering
serine hydrolase
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分类号
Q81
[生物学—生物工程]
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题名计算机辅助蛋白结构预测及酶的计算设计研究进展
被引量：6
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作者
崔颖璐
吴边
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机构
中国科学院微生物研究所微生物生理与代谢工程院重点实验室
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出处
《广西科学》
CAS
2017年第1期1-6,共6页
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基金
国家自然科学基金项目(21603013)
中国博士后科学基金项目(2016M591090)资助
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文摘
随着不可再生资源的日益减少以及化学催化所带来的环境污染问题的日益严重,应用低污染的生物催化技术改造或取代传统化工工艺已经成为可持续发展的研究热点。酶作为一种重要的生物催化剂,具有高效无污染、专一性较强等优点,在化工、医药等领域具有巨大的应用潜力和良好的发展前景。但由于新功能酶的开发速度较慢,使其应用受到严重限制。酶的理性设计是新酶发现的一个重要来源,随着计算机技术的发展,蛋白质结构预测方法和新功能酶计算设计策略得到迅猛的发展,已成为酶功能改造的有力工具和新的研究前沿。本文就蛋白质结构预测方法、新功能酶计算设计方法和策略以及未来发展趋势进行简要介绍和讨论。
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关键词
生物催化
三维结构预测
计算酶功能设计
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Keywords
biomolecular catalysis
structure prediction
computational enzyme design
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分类号
Q518
[生物学—生物化学]
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题名计算机辅助设计酶
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出处
《现代化工》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第10期67-67,共1页
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文摘
美国和德国的科学家已成功地研制出一种生物催化剂NovoTim，它能进行一种通常是由磷酸丙糖异构酶完成的反应。他们用计算机预测从非活性蛋白质生成合成酶所需要的突变。
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关键词
生物催化剂
磷酸丙糖异构酶
合成酶
二羟基丙酮磷酸酯
甘油醛-3-磷酸酯
计算机辅助设计酶
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分类号
TQ426.97
[化学工程]
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