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茶银尺蠖触角转录组及相关嗅觉基因的分析
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作者 张方梅 尤伟晨 +5 位作者 郭世保 陈俊华 史洪中 耿书宝 周洲 乔利 《环境昆虫学报》 北大核心 2025年第2期504-514,共11页
本研究利用IIIumina Hiseq 4000高通量测序平台对茶银尺蠖Scopula subpunctaria(Herrich-Schaeffer)雌雄成虫触角进行转录组测序,共获得93335条unigenes,N50长度为1151 bp。通过基因功能注释,有23581条unigenes注释到六大公共数据库中,... 本研究利用IIIumina Hiseq 4000高通量测序平台对茶银尺蠖Scopula subpunctaria(Herrich-Schaeffer)雌雄成虫触角进行转录组测序,共获得93335条unigenes,N50长度为1151 bp。通过基因功能注释,有23581条unigenes注释到六大公共数据库中,其中注释到NR数据库的unigenes最多,占39.96%,且与家蚕Bombyx mori相似基因数目最多,占20.32%;10718条unigenes注释到GO数据库的生物过程、细胞组分和分子功能3个大类46个亚类;5464条unigenes注释到KEGG数据库的38个小类代谢通路,其中注释在信号传导通路的unigenes最多,占10.64%。根据注释信息,共筛选得到60个候选嗅觉基因,包含17个气味结合蛋白基因(Odorant binding protein genes,OBPs)、13个化学感受蛋白基因(Chemosensory protein genes,CSPs)、14个嗅觉受体基因(Olfactory receptor genes,ORs)、13个离子型受体基因(Ionotropic receptor genes,IRs)和3个感觉神经膜蛋白基因(Sensory neuron membrane protein genes,SNMPs)。利用FPKM值对SsubOBPs和SsubCSPs基因进行表达量分析发现,SsubOBP2和SsubOBP3在茶银尺蠖雌雄成虫触角中均高丰度表达(FPKM>2000),SsubCSP4、SsubCSP7和SsubCSP9在茶银尺蠖雌雄成虫触角中均高丰度表达(FPKM>900)。本研究首次获得了茶银尺蠖触角转录组数据,并鉴定出候选嗅觉相关基因,结果为进一步研究茶银尺蠖的嗅觉感受机制提供分子基础。 展开更多
关键词 茶银尺蠖 触角转录组 嗅觉相关蛋白 基因注释
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皂角豆象成虫触角转录组及嗅觉相关基因分析
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作者 彭启艳 潘秀奎 +2 位作者 张苏芳 武承旭 杨茂发 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1039-1049,共11页
【目的】本研究旨在建立皂角豆象Megabruchidius dorsalis雌雄成虫触角转录组数据库,挖掘皂角豆象嗅觉相关基因。【方法】采用高通量测序平台Illumina HiSeq对皂角豆象雌雄成虫触角进行转录组测序、序列组装、功能注释及差异表达基因分... 【目的】本研究旨在建立皂角豆象Megabruchidius dorsalis雌雄成虫触角转录组数据库,挖掘皂角豆象嗅觉相关基因。【方法】采用高通量测序平台Illumina HiSeq对皂角豆象雌雄成虫触角进行转录组测序、序列组装、功能注释及差异表达基因分析;通过qRT-PCR技术测定和验证皂角豆象雌雄成虫触角中部分高丰度表达基因的表达量。【结果】皂角豆象雌雄成虫触角转录组共获得42 053条unigenes, N50长度为2 066 bp。与NR, Swiss-Prot, Pfam, eggNOG, GO和KEGG六大公共数据库比对共注释到18 039条unigenes(占43.57%),其中注释到NR数据库的unigenes数量最多,为17 687条;注释到KEGG数据库的unigenes数量最少,为9 779条。依据注释信息分析,鉴定出183个皂角豆象候选嗅觉相关基因,包括25个气味结合蛋白(odorant binding protein, OBP)基因、 3个化学感受蛋白(chemosensory protein, CSP)基因、 126个气味受体(odorant receptor, OR)基因(包括125个典型OR基因和1个非典型OR基因)、 8个离子型受体(ionotropic receptor, IR)基因、 18个味觉受体(gustatory receptor, GR)基因和3个感觉神经元膜蛋白(sensory neuron membrane protein, SNMP)基因。通过比较皂角豆象雌雄成虫触角转录组,共筛选出357个差异表达基因,其中包含8个OR基因和1个IR基因;这357个差异表达基因中,152个基因在雌性触角中高表达,205个基因在雄性触角中高表达。此外,qRT-PCR验证结果显示,6个嗅觉相关基因(MdorCSP3,MdorIR2,MdorIR6,MdorGR10,MdorSNMP2和MdorSNMP3)在皂角豆象雌成虫触角中高表达,4个嗅觉相关基因(MdorOBP15,MdorOBP22,MdorORco和MdorGR8)在雄成虫触角中高表达。【结论】本研究获得了皂角豆象成虫触角转录组数据,并鉴定筛选出候选嗅觉相关基因,结果为进一步研究皂角豆象的基因功能及嗅觉感受机制奠定分子基础。 展开更多
关键词 皂角豆象 触角转录组 高通量测序 嗅觉相关基因 QRT-PCR
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双斑长跗萤叶甲雌虫、雄虫触角转录组及差异表达基因分析
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作者 何婉洁 孟涵颖 +1 位作者 支梦婷 陈静 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期984-995,共12页
【目的】建立双斑长跗萤叶甲成虫触角转录组数据库,筛选雌虫、雄虫触角中的差异表达基因并解析其涉及的生理功能,为进一步研究双斑长跗萤叶甲的基因功能分析及嗅觉感受机制奠定分子基础。【方法】采用Illumina高通量测序技术对双斑长跗... 【目的】建立双斑长跗萤叶甲成虫触角转录组数据库,筛选雌虫、雄虫触角中的差异表达基因并解析其涉及的生理功能,为进一步研究双斑长跗萤叶甲的基因功能分析及嗅觉感受机制奠定分子基础。【方法】采用Illumina高通量测序技术对双斑长跗萤叶甲雌虫、雄虫触角进行转录组测序,对获得的unigenes进行功能注释、通路富集等生物信息学分析,利用RT-qPCR技术检测气味结合蛋白基因在触角中的表达水平。【结果】双斑长跗萤叶甲雌、雄成虫触角转录组测序共获得73050条unigenes,Q30碱基百分比均在93.23%以上,34233条unigenes至少在1个数据库中获得注释。与双斑长跗萤叶甲雌虫触角相比,雄虫触角中检测到395个差异表达基因,其中288个基因上调表达,107个基因下调表达。【结论】在GO注释库中,差异表达基因富集最显著的功能为气味结合、嗅觉受体活性和嗅觉感知。气味结合蛋白基因在雌虫、雄虫触角中的相对表达水平趋势与转录组测序结果相符合,获得了双斑长跗萤叶甲成虫触角转录组数据库。 展开更多
关键词 双斑长跗萤叶甲 触角转录组 功能注释 差异表达基因
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绿豆象触角转录组及嗅觉相关基因的分析 被引量:28
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作者 郑海霞 张耀文 +1 位作者 张仙红 杨美红 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期168-177,共10页
【目的】建立绿豆象Callosobruchus chinensis触角转录组数据库,挖掘绿豆象的基因数据。【方法】采用高通量测序平台(Illumina Hiseq)对绿豆象成虫触角进行转录组测序、序列组装及生物信息学分析。【结果】共获得51.10 Gb的clean data(N... 【目的】建立绿豆象Callosobruchus chinensis触角转录组数据库,挖掘绿豆象的基因数据。【方法】采用高通量测序平台(Illumina Hiseq)对绿豆象成虫触角进行转录组测序、序列组装及生物信息学分析。【结果】共获得51.10 Gb的clean data(NCBI SRA数据库登录号:SRP119884)及83 535条unigenes,长度在1 kb以上的unigenes有15 075条,unigenes的N50为1 492 bp。使用BLAST软件将绿豆象触角Unigene序列与公共数据库比对,共注释到22 148条unigenes,其中NR数据库注释的unigenes最多,为18 744条,且与赤拟谷盗Tribolium castaneum的相似基因最多,达39.57%。通过GO数据库注释,将unigenes功能分为细胞组分、分子功能与生物学过程三大类54个分支,其中参与代谢进程以及结合与催化活性的unigenes比例较大。KEGG代谢途径分析表明,9 084条unigenes形成289条代谢通路,其中核糖体代谢通路所含unigene最多,为516条。进一步基因注释分析筛选到140个嗅觉相关基因,包括12个气味结合蛋白(odorant binding protein,OBP)基因,4个化学感受蛋白(chemosensory protein,CSP)基因,116个气味受体(odorant receptor,Or)基因,1个离子型受体(ionotropic receptor,IR)基因和7个感觉神经元膜蛋白(sensory neuron membrane protein,SNMP)基因,并用FPKM值对基因表达量进行评估。【结论】本研究获得了绿豆象触角转录组数据,为进一步研究绿豆象的基因功能分析及嗅觉感受机制奠定分子基础。 展开更多
关键词 绿豆象 触角转录组 高通量测序 基因注释 嗅觉相关基因
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茶谷蛾成虫触角转录组及嗅觉相关基因分析 被引量:9
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作者 龙亚芹 罗梓文 +6 位作者 王雪松 龙丽雪 玉香甩 李金龙 曲浩 汪云刚 陈林波 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期553-563,共11页
为筛选茶谷蛾嗅觉相关基因,采用IlluminaHiSeq 4000高通量测序平台分别对茶谷蛾雌雄成虫触角进行转录组测序及生物信息学分析,共获得茶谷蛾触角转录组37708条unigenes。通过同源性比对,在NR数据库成功注释16027条unigenes;有11701条unig... 为筛选茶谷蛾嗅觉相关基因,采用IlluminaHiSeq 4000高通量测序平台分别对茶谷蛾雌雄成虫触角进行转录组测序及生物信息学分析,共获得茶谷蛾触角转录组37708条unigenes。通过同源性比对,在NR数据库成功注释16027条unigenes;有11701条unigenes得到GO注释,根据其功能可分为细胞组分、分子功能和生物过程三大类40亚类;有6047个unigenes得到KOG注释,按照功能分为25类;根据KEGG数据库,有12009条unigenes注释到283个通路。根据注释信息,挖掘到238个候选嗅觉相关基因,包括108个气味结合蛋白基因,55个气味/嗅觉受体基因,26个味觉受体基因、25个离子型受体基因、11个化学感受蛋白基因、4个感觉神经元膜蛋白基因、4个感官知觉基因、4个化学感受受体基因和1个气味降解酶基因。通过基因差异表达分析,筛选出12个气味结合蛋白基因、9个气味/嗅觉受体基因、4个信息素结合蛋白、3个味觉受体基因、1个化学感受蛋白基因和1个离子型受体蛋白基因。本研究获得了茶谷蛾触角转录组数据,并鉴定出候选嗅觉相关基因,为进一步研究茶谷蛾的基因功能及嗅觉感受机制奠定分子基础。 展开更多
关键词 茶谷蛾 触角转录组 高通量测序 基因注释 嗅觉相关基因
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点蜂缘蝽触角转录组及化学感受相关基因的分析 被引量:16
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作者 宋月芹 董钧锋 +2 位作者 陈庆霄 胡振杰 孙会忠 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期1120-1128,共9页
【目的】点蜂缘蝽Riptortus pedestris主要为害豆科作物,成虫和若虫刺吸汁液,造成严重损失,目前对该虫的研究较少,基因信息缺乏。本研究旨在获得点蜂缘蝽的触角转录组数据,开发基于嗅觉防治害虫的新方法。【方法】利用Illumina Hi SeqTM... 【目的】点蜂缘蝽Riptortus pedestris主要为害豆科作物,成虫和若虫刺吸汁液,造成严重损失,目前对该虫的研究较少,基因信息缺乏。本研究旨在获得点蜂缘蝽的触角转录组数据,开发基于嗅觉防治害虫的新方法。【方法】利用Illumina Hi SeqTM4000高通量测序技术测定了点蜂缘蝽成虫触角转录组,并进行了生物学信息分析。【结果】共获得45 802 812条clean reads,包括6.87 Gb(Gen Bank登录号:SRR4429103)。拼接92 259条unigenes,平均长度为618 bp,N50为1 013 bp。在7大数据库中注释到21 365条unigenes。通过进一步转录组数据分析,我们鉴定出219个点蜂缘蝽化学感受相关基因,包括188个嗅觉受体、6个味觉受体、2个离子型受体、4个感觉神经元膜蛋白、8个气味结合蛋白和11个化学感受蛋白。氨基酸序列分析发现,RpedOBP1和RpedOBP2在第6个保守的半胱氨酸后又多了3个保守的半胱氨酸位点,属于加Plus-C气味结合蛋白家族。【结论】本研究获得了点蜂缘蝽触角转录组数据,并鉴定出嗅觉相关基因,结果为今后利用嗅觉基因靶标防治点蜂缘蝽提供了重要的分子生物学信息数据。 展开更多
关键词 点蜂缘蝽 触角转录组 高通量测序 基因注释 化学感受相关基因
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花椒窄吉丁触角转录组及嗅觉相关基因分析 被引量:14
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作者 巩雪芳 谢寿安 +5 位作者 杨平 郭莉 陈迪 车显荣 王延来 吕淑杰 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1159-1170,共12页
【目的】建立花椒窄吉丁Agrilus zanthoxylumi成虫触角转录组数据库,挖掘嗅觉相关基因,为今后研究其触角的化学感受机制及生物防控提供理论支撑。【方法】采用高通量测序平台Illumina NovaSeq 6000对花椒窄吉丁雌雄成虫触角进行转录组测... 【目的】建立花椒窄吉丁Agrilus zanthoxylumi成虫触角转录组数据库,挖掘嗅觉相关基因,为今后研究其触角的化学感受机制及生物防控提供理论支撑。【方法】采用高通量测序平台Illumina NovaSeq 6000对花椒窄吉丁雌雄成虫触角进行转录组测序,用Trinity软件对获得的高质量reads进行序列拼接与组装;使用BLAST软件将触角转录组数据比对NR,NT,Swiss-Prot,GO,KEGG,BLASTX,eggNOG,Pfam,TmHMM,SignalP,KO,Map,BLASTP和RNAMMER公共数据库;基于初步筛选到的花椒窄吉丁候选气味结合蛋白(odorant binding protein,OBP)和化学感受蛋白(chemosensory protein,CSP)以及其他鞘翅目昆虫的同源蛋白的核苷酸序列,利用MEGA软件进行系统进化分析。运用RPKM(reads per kilobase per million mapped reads)值对嗅觉相关基因表达量进行分析。【结果】花椒窄吉丁雌雄成虫触角转录组测序共获得36209条基因和90982条转录本,其N50分别为2103和2523 bp,组装完整性较高。注释到NR数据库的基因最多(41.62%),其中与赤拟谷盗Tribolium castaneum相似基因所占比例最高(19%)。在GO数据库中比对到11614个基因,按功能分为细胞组分、分子功能与生物学进程三大类57个分支,其中分子功能大类中的结合(70.57%)与催化活性(45.51%)相关基因占比最多;KEGG代谢途径分析表明,7427条基因参与了5类代谢通路,其中涉及信号转导的基因最多,为815条;筛选到7个候选OBP基因和5个具有全长开放阅读框的CSP基因,其编码蛋白均具有化学感受蛋白家族的典型特征。系统进化分析表明,花椒窄吉丁OBPs和CSPs分别与苹果小吉丁A.mali的OBPs和CSPs氨基酸序列一致性最高。RPKM值表明,嗅觉相关基因AzanOBP1和AzanOBP2在雌成虫触角中不表达,在雄成虫触角中微量表达;AzanOBP3在雄成虫触角中高丰度表达。【结论】首次获得了花椒窄吉丁成虫触角转录组数据,筛选到了花椒窄吉丁OBP,CSP,Or,IR和SNMP等的嗅觉相关基因。推测触角中高丰度表达的OBPs对雄成虫识别同类异性释放的信息素或寄主植物释放的挥发物起关键作用。研究结果可为花椒窄吉丁化学感受基因功能分析及嗅觉感受机制研究奠定分子基础。 展开更多
关键词 花椒窄吉丁 触角转录组 基因注释 气味结合蛋白 化学感受蛋白
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七星瓢虫触角转录组及嗅觉相关基因分析 被引量:12
8
作者 杨雪娇 张蔓 +4 位作者 江宇航 唐启河 张棋麟 林连兵 陈均远 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期717-726,共10页
【目的】瓢虫科食性高度分化。本研究旨在通过建立七星瓢虫Coccinella septempunctata触角转录组数据库,探讨其触角嗅觉相关基因与食性分化的关系。【方法】采用Illumina HiSeq 4000高通量测序平台对七星瓢虫成虫触角转录组进行测序、... 【目的】瓢虫科食性高度分化。本研究旨在通过建立七星瓢虫Coccinella septempunctata触角转录组数据库,探讨其触角嗅觉相关基因与食性分化的关系。【方法】采用Illumina HiSeq 4000高通量测序平台对七星瓢虫成虫触角转录组进行测序、组装、注释,挖掘嗅觉相关基因,并与已发表的茄二十八星瓢虫Henosepilachna viginyioctopunctata转录组进行比较。【结果】共获得七星瓢虫触角转录组31775条unigenes,其中69.71%的序列得以注释,NR数据库中注释最多,为20539条。据注释信息,挖掘到27个嗅觉相关基因,包括1个气味结合蛋白(odorant binding protein,OBP)基因,13个化学感受蛋白(chemosensory protein,CSP)基因,4个气味受体(odorant receptor,OR)基因,7个味觉受体(gustatory receptor,GR)基因和2个感觉神经元膜蛋白(sensory neuron membrane protein,SNMP)基因。相对应地,在植食性茄二十八星瓢虫转录组中鉴定到38个嗅觉相关基因,包括七星瓢虫中未发现的1个离子型受体(ionotropic receptor,IR)基因。在各类型嗅觉相关基因中,茄二十八星瓢虫转录组的OBP基因比例(13.16%)高于七星瓢虫触角转录组的(3.70%),而七星瓢虫触角转录组的GR基因比例(25.93%)则高于茄二十八星瓢虫转录组的(13.16%)。【结论】触角嗅觉相关基因数目不是昆虫食性分化的主因。本研究获得了七星瓢虫触角转录组学资源,初步探讨了嗅觉相关基因同瓢虫食性分化的关系,为了解瓢虫乃至昆虫食性分化的分子基础提供了信息。 展开更多
关键词 七星瓢虫 触角转录组 食性分化 基因注释 嗅觉相关基因
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叉角厉蝽触角转录组及嗅觉相关基因分析 被引量:12
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作者 赵航 吴国星 +5 位作者 汤永玉 张曼 梁晨 邢孔政 兰明先 高熹 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2022年第5期1205-1217,共13页
叉角厉蝽Eocanthecona furcellata是一种在生物防治方面有重要作用和潜力的捕食性天敌昆虫,触角是昆虫进行信息交换的重要器官,而嗅觉相关基因则是调控天敌昆虫捕食行为的重要分子基础。为获得叉角厉蝽触角转录组数据库,挖掘叉角厉蝽嗅... 叉角厉蝽Eocanthecona furcellata是一种在生物防治方面有重要作用和潜力的捕食性天敌昆虫,触角是昆虫进行信息交换的重要器官,而嗅觉相关基因则是调控天敌昆虫捕食行为的重要分子基础。为获得叉角厉蝽触角转录组数据库,挖掘叉角厉蝽嗅觉相关基因,本研究利用Illumina高通量测序平台对叉角厉蝽雌雄成虫与5龄若虫触角进行转录组测序。成功构建了叉角厉蝽触角转录组,获得了67843条unigenes,N50长度为2300 bp。与七大公共数据库比对注释到27686条unigenes,其中NR数据库注释最多(33.33%),且与茶翅蝽Halyomorpha halys相似度最高(64.20%)。14258条注释到GO数据库中,分为生物过程、细胞组分和分子功能3个大类42个亚类;KEGG代谢途径分析表明,7703条形成282条代谢通路,其中被注释在信号传导通路中的unigenes最多(11.50%)。进一步基因注释分析,鉴定得到134个候选嗅觉相关基因,32个化学感应蛋白基因(Chemosensory protein genes,CSP),10个气味结合蛋白基因(Odorant binding protein genes,OBP),21个气味受体基因(Gustatory receptor genes,GR),48个嗅觉受体基因(Olfactory receptor genes,OR),17个离子型受体基因(Ionotropic receptor genes,IR),6个感觉神经元膜蛋白基因(Sensory neuron membrane protein genes,SNMP)。通过比较叉角厉蝽5龄若虫、雌雄成虫触角转录组,共筛选出7324个差异表达基因,分析发现5龄若虫与成虫间的差异表达基因较多,雌雄成虫之间差异表达基因较少;利用FPKM值对OBP与CSP基因进行表达量分析发现,大部分OBP与CSP的表达量在雌雄间差异不大,而若虫与成虫相比基因表达量差异较大,除少部分基因在5龄若虫中高表达外,其余大部分基因均在雌雄成虫间高表达。本研究获得了叉角厉蝽触角转录组数据,并鉴定出候选嗅觉相关基因,结果为进一步研究叉角厉蝽的嗅觉感受机制及昆虫化学生态奠定分子基础。 展开更多
关键词 叉角厉蝽 触角转录组 基因注释 嗅觉相关基因 差异表达基因
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菜粉蝶成虫触角转录组及嗅觉相关基因分析 被引量:2
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作者 薛增昇 闫喜中 +5 位作者 赵劲宇 宋程飞 刘丹 王韩 郝赤 马力 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期642-652,共11页
【目的】建立菜粉蝶Pieris rapae成虫触角转录组数据库,利用生物信息学和分子生物学手段深入挖掘菜粉蝶基因数据信息。【方法】采用高通量测序平台(Illumina NovaSeq 6000)对菜粉蝶成虫触角进行转录组测序、序列组装、功能注释及差异表... 【目的】建立菜粉蝶Pieris rapae成虫触角转录组数据库,利用生物信息学和分子生物学手段深入挖掘菜粉蝶基因数据信息。【方法】采用高通量测序平台(Illumina NovaSeq 6000)对菜粉蝶成虫触角进行转录组测序、序列组装、功能注释及差异表达基因分析,对PrapOR1,PrapOR2,PrapOR5,PrapOBP1,PrapOBP4,PrapOBP5,PrapSNMP1,PrapSNMP2和PrapSNMP39个差异表达的嗅觉相关基因进行qRT-PCR验证。【结果】菜粉蝶成虫触角转录组共获得17.65 GB测序数据(NCBI登录号:PRJNA869896),经过滤和序列拼接共得到116317条转录本,随后进行Corset层次聚类获得43390条unigene,经BUSCO评估,拼接质量完整度好,准确性高。注释到的unigene数目从大到小排列的数据库依次为NT,NR,Pfam,GO,Swiss-Prot,KEGG和KOG/COG;进一步进行基因功能注释分析,筛选得到176个嗅觉相关基因,其中19个基因差异表达,包括在雌成虫触角中高表达的15个基因和在雄成虫触角中高表达的4个基因。qRT-PCR验证结果表明,PrapOR1和PrapOR2在雄成虫触角中高表达,PrapOR5,PrapOBP1,PrapOBP4,PrapOBP5,PrapSNMP1,PrapSNMP2和PrapSNMP3在雌成虫触角中高表达,与转录组测序结果相符。【结论】本研究建立了菜粉蝶成虫触角转录组数据库,筛选得到了嗅觉相关基因,并对嗅觉相关基因进行了差异表达分析,研究结果为进一步研究菜粉蝶的基因功能及嗅觉分子机制奠定了理论基础。 展开更多
关键词 菜粉蝶 触角转录组 高通量测序 嗅觉相关基因 QRT-PCR
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灭字脊虎天牛触角转录组中气味结合蛋白基因的鉴定及表达谱分析 被引量:10
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作者 吉帅帅 庄翔麟 刘乃勇 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期193-202,共10页
【目的】发掘灭字脊虎天牛(Xylotrechus quadripes Chevrolat)成虫触角中的OBP基因,明确OBP基因在成虫不同组织的表达情况。【方法】采用Illumina HiSeq^(TM) 2000测序平台对灭字脊虎天牛的触角进行转录组测序,利用BLAST同源搜索的方法... 【目的】发掘灭字脊虎天牛(Xylotrechus quadripes Chevrolat)成虫触角中的OBP基因,明确OBP基因在成虫不同组织的表达情况。【方法】采用Illumina HiSeq^(TM) 2000测序平台对灭字脊虎天牛的触角进行转录组测序,利用BLAST同源搜索的方法鉴定OBP基因,采用RT-PCR技术研究OBP基因的表达谱。【结果】从灭字脊虎天牛的触角转录组中共鉴定到24个OBP基因,所有OBP基因均具有全长开放阅读框(123~180个氨基酸)和信号肽序列(16~23个氨基酸)。多序列比对结果表明,不同OBP间一致性较低,其平均值为19.4%。序列比对和进化树分析结果表明,9个OBP具有6个保守的半胱氨酸,属于Classic OBPs家族;15个OBP具有4个保守的半胱氨酸,属于Minus-C OBPs家族。RT-PCR结果表明,Xqua OBP4、OBP8、OBP18和OBP21在触角特异表达;Xqua OBP2、OBP3、OBP7和OBP20在触角高表达,另外在其他组织中也有表达;其他OBPs基因在检测的两个或多个组织中均有不同程度的表达。【结论】从灭字脊虎天牛触角转录组中共鉴定得到24个OBP基因,其中部分基因在触角特异或高表达,很可能参与嗅觉功能;部分基因在非嗅觉组织中有表达,很可能具有非嗅觉功能。 展开更多
关键词 灭字脊虎天牛 触角转录组 气味结合蛋白 表达谱
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悬铃木方翅网蝽触角气味结合蛋白基因鉴定 被引量:2
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作者 杨海博 胡镇杰 +2 位作者 李定旭 朱品红 董钧锋 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期1121-1131,共11页
【目的】悬铃木方翅网蝽Corythucha ciliata是专性危害悬铃木属Platanus植物的外来入侵害虫,本研究旨在获得该害虫触角中气味结合蛋白(OBPs)基因信息,以期寻求有效控制害虫的嗅觉分子靶标。【方法】利用Illumina HiSeq^(TM) 4000高通量... 【目的】悬铃木方翅网蝽Corythucha ciliata是专性危害悬铃木属Platanus植物的外来入侵害虫,本研究旨在获得该害虫触角中气味结合蛋白(OBPs)基因信息,以期寻求有效控制害虫的嗅觉分子靶标。【方法】利用Illumina HiSeq^(TM) 4000高通量测序技术对悬铃木方翅网蝽雌雄成虫触角进行转录组测序并对测序结果进行生物信息学分析;通过实时荧光定量PCR(qPCR)方法,分析OBP基因在悬铃木方翅网蝽雌雄成虫触角中的表达模式。【结果】对悬铃木方翅网蝽雌雄成虫触角6个样品的转录组测序,共获得40.87 Gb clean reads,各样品的序列长度均达到6.31 Gb。转录组数据分析共鉴定出26个推测的悬铃木方翅网蝽OBP基因,其编码蛋白中24个(CcilOBP1-24)属于Classic OBPs,CcilOBP25/26属于Plus-C OBPs;与半翅目其他昆虫相关OBPs系统发育分析表明,大部分CcilOBPs形成独立一簇,少数与其他半翅目昆虫OBPs直系同源。qPCR分析显示,有11个OBP基因在雌雄成虫触角中表达量差异显著,其中有9个OBP基因(CcilOBP5/6/9/10/17/18/21/24/25)在雄成虫触角中显著高表达,有2个OBP基因(CcilOBP14/16)在雌成虫触角中显著高表达。【结论】本研究获得了悬铃木方翅网蝽成虫触角气味结合蛋白基因信息,研究结果为生物控制该害虫提供了重要基础数据和候选分子靶标。 展开更多
关键词 悬铃木方翅网蝽 触角转录组 高通量测序 气味结合蛋白 实时荧光定量PCR
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点蜂缘蝽滞育和非滞育对嗅觉相关基因表达的影响
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作者 谢明惠 钟永志 +3 位作者 林璐璐 张光玲 赵伟 陈浩梁 《植物保护》 北大核心 2025年第4期98-108,共11页
有研究表明滞育和非滞育点蜂缘蝽Riptortus pedestriS对聚集信息素的感受存在显著差异,本研究拟通过测定滞育和非滞育点蜂缘蝽触角转录组,寻找表达差异的嗅觉相关基因,分析与滞育关联的信息素识别机制。利用高通量测序平台BGISEQ-500对... 有研究表明滞育和非滞育点蜂缘蝽Riptortus pedestriS对聚集信息素的感受存在显著差异,本研究拟通过测定滞育和非滞育点蜂缘蝽触角转录组,寻找表达差异的嗅觉相关基因,分析与滞育关联的信息素识别机制。利用高通量测序平台BGISEQ-500对滞育和非滞育点蜂缘蝽雌、雄成虫触角进行转录组测序,筛选差异表达基因并进行通路富集分析,同时对差异表达的嗅觉基因进行RT-qPCR验证。点蜂缘蝽触角转录组共获得57648条unigenes,其中61.05%在七大公共数据库中成功注释。注释到NR数据库的基因最多(52.90%),匹配到茶翅蝽Halyomorpha halys的序列最多,为55.83%。通过转录组数据分析,与非滞育雌虫相比,滞育雌虫触角中共筛选到2222个差异表达基因,其中上调表达基因1288个,下调表达基因934个;与非滞育雄虫相比,滞育雄虫触角中共筛选到2293个差异表达基因,其中上调表达基因1410个,下调表达基因883个;雌、雄虫触角间差异基因较少,分别为315个(滞育)和584个(非滞育)。进一步对嗅觉相关基因进行分析发现:滞育和非滞育雌虫触角间10个化学感受蛋白(chemosensory proteins,CSPs)基因和11个气味结合蛋白(odorant-binding proteins,OBPs)基因差异表达;滞育和非滞育雄虫触角有7个CSPS基因和11个OBPS基因差异表达;滞育雌、雄成虫仅有1个OBP基因表达出现差异;非滞育雌、雄虫间有4个CSPS基因和3个OBPS基因差异表达。从差异表达的嗅觉相关基因中选取10个基因(4个OBPS,4个CSPS2个ORS)进行RT-qPCR验证,结果与转录组测序相符。研究结果将为今后点蜂缘蝽识别聚集信息素的分子机制及研发更为高效的化学通讯调控技术提供参考。 展开更多
关键词 点蜂缘蝽 触角转录组 生殖滞育 嗅觉相关基因 差异表达基因
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绿芫菁成虫触角中气味结合蛋白和化学感受蛋白基因的鉴定和表达分析 被引量:6
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作者 刘盼静 魏洪义 +2 位作者 郭坤 马广源 张涛 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期927-936,共10页
【目的】建立绿芫菁Lytta caraganae成虫触角转录组数据库,并挖掘和鉴定其成虫触角中嗅觉识别相关的气味结合蛋白(odorant-binding proteins,OBPs)和化学感受蛋白(chemosensory proteins,CSPs)基因。【方法】采用Illumina HiSeq平台对... 【目的】建立绿芫菁Lytta caraganae成虫触角转录组数据库,并挖掘和鉴定其成虫触角中嗅觉识别相关的气味结合蛋白(odorant-binding proteins,OBPs)和化学感受蛋白(chemosensory proteins,CSPs)基因。【方法】采用Illumina HiSeq平台对绿芫菁成虫触角进行转录组分析,比对NR,NT,KO,Pfam,Swiss-Prot,GO和KOG数据库进行基因注释,根据注释信息筛选绿芫菁OBP和CSP基因;利用ClustalX 1.83和MEGA 7.0软件分别分析OBP和CSP基因结构特点及进化关系;通过qRT-PCR技术测定绿芫菁雌雄成虫触角中OBP和CSP基因的表达量。【结果】从绿芫菁成虫触角转录组中共获得51028条transcripts和41998条unigenes;基因注释结果表明,在NR数据库中匹配度最高(87.3%)的物种是赤拟谷盗Tribolium castaneum;筛选到22个OBP基因和7个CSP基因,序列比对结果显示,有13个LcarOBPs包含6个保守的半胱氨酸残基,属于classic OBPs;系统进化树表明,绿芫菁的OBPs和LcarCSPs分别与眼斑沟芫菁Hycleus cichorii和大斑沟芫菁H.phaleratus的OBPs和CSPs序列氨基酸一致性最高,表明进化关系最近;qRT-PCR结果显示,2个LcarOBPs基因和2个LcarCSP基因在绿芫菁雄成虫触角中高表达,10个LcarOBP基因和2个LcarCSP基因在雌成虫触角中高表达。【结论】本研究首次鉴定了绿芫菁成虫触角中的OBP和CSP基因,为进一步研究绿芫菁嗅觉识别机制提供了理论基础。 展开更多
关键词 绿芫菁 触角转录组 嗅觉识别 气味结合蛋白 化学感受蛋白
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