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1株分离自云南省师宗县库蠓的新型西藏环状病毒
1
作者
杨振兴
谢佳芮
+6 位作者
李占鸿
李卓然
廖德芳
牛保生
姚萍芬
李乐
杨恒
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期166-176,共11页
西藏环状病毒(Tibet orbivirus, TIBOV)为环状病毒属的新成员,病毒于2009年首次从我国西藏墨脱县采集的圆斑按蚊中分离,目前,对该病毒的认识仍十分有限。本研究对1株分离自我国云南省师宗县库蠓的新型TIBOV毒株YNSZ/V290/2019进行了鉴定...
西藏环状病毒(Tibet orbivirus, TIBOV)为环状病毒属的新成员,病毒于2009年首次从我国西藏墨脱县采集的圆斑按蚊中分离,目前,对该病毒的认识仍十分有限。本研究对1株分离自我国云南省师宗县库蠓的新型TIBOV毒株YNSZ/V290/2019进行了鉴定,结果表明,病毒可在C6/36与BHK-21细胞上引起明显的细胞病变,电镜下观察,病毒粒子呈球形,直径55~75 nm,具有环状病毒属病毒典型形态特征。电泳结果显示,病毒基因组为十节段双链RNA,呈现“3-3-3-1”的电泳带型特征。对环状病毒属病毒高度保守的基因节段及其编码蛋白(Seg-3/T2)的序列分析显示,YNSZ/V290/2019为TIBOV的成员,与其他TIBOV毒株的核酸与氨基酸序列相似度分别为80.90%~81.70%与97.20%~97.30%。对决定环状病毒属病毒血清型的基因节段及其编码蛋白(Seg-2/OC1)的序列分析显示,YNSZ/V290/2019与已知TIBOV毒株的核酸与氨基酸序列相似度分别为26.90%~30.60%与28.50%~33.20%,表明该毒株可能是一种新血清型的TIBOV。对采集于师宗县牧场的40份黄牛与68份山羊血清进行血清中和试验,结果显示,新型TIBOV在牛、羊的阳性率分别为22.50%与4.41%。新型TIOBV在我国的发现,丰富了我国虫媒病毒的研究,为深入研究我国TIBOV的分布、致病性、感染宿主范围与诊断试剂的开发提供了基础。
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关键词
库蠓
病毒
分离鉴定
西藏环状病毒
序列分析
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职称材料
西藏环状病毒RT-PCR检测方法的建立
2
作者
元正菊
李楠
+2 位作者
何于雯
孟锦昕
王静林
《云南畜牧兽医》
2020年第3期10-13,共4页
建立西藏环状病毒(Tibet orbivirus, TIBOV)RT-PCR诊断方法。根据云南省新分离到的TIBOV Seg-7片段序列设计1套巢式引物为120S7F1/R1、120S7F2/R2。以TIBOV DH13C120株病毒核酸为模板,优化反应条件,建立巢式RT-PCR检测方法,并对云南省...
建立西藏环状病毒(Tibet orbivirus, TIBOV)RT-PCR诊断方法。根据云南省新分离到的TIBOV Seg-7片段序列设计1套巢式引物为120S7F1/R1、120S7F2/R2。以TIBOV DH13C120株病毒核酸为模板,优化反应条件,建立巢式RT-PCR检测方法,并对云南省新分离的9株TIBOV进行核酸检测。分别采用外引物(120S7F1/R1)和内引物(120S7F2/R2)对TIBOV DH13C120株进行RT-PCR扩增,退火温度分别为52℃和54℃,外引物扩增出片段大小为1 050 bp条带;内引物扩增出的片段大小为500bp,扩增条带大小与设计预期相一致。而蓝舌病毒(BTV)JCC12-7株和阴性对照两轮扩增均为阴性,采用该方法对云南省新分离的9株TIBOV、2株BTV和1株鹿流行性出血热病毒(EHDV)进行检测,9株TIBOV扩增均为阳性,而BTV、EHDV和阴性对照均为阴性。建立了TIBOV巢式RT-PCR检测方法,该方法可用于云南省目前动物或媒介中流行的TIBOV核酸检测。
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关键词
西藏环状病毒
巢式引物
RT-PCR检测方法建立
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职称材料
题名
1株分离自云南省师宗县库蠓的新型西藏环状病毒
1
作者
杨振兴
谢佳芮
李占鸿
李卓然
廖德芳
牛保生
姚萍芬
李乐
杨恒
机构
云南省畜牧兽医科学院云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期166-176,共11页
基金
国家重点研发计划(2016YFD0500908)
国家重点研发计划(2017YFC1200505)
+1 种基金
国家公益性行业(农业)科研专项(201303035)
云南省中青年学术和技术带头人后备人才培养项目(2017HB055)。
文摘
西藏环状病毒(Tibet orbivirus, TIBOV)为环状病毒属的新成员,病毒于2009年首次从我国西藏墨脱县采集的圆斑按蚊中分离,目前,对该病毒的认识仍十分有限。本研究对1株分离自我国云南省师宗县库蠓的新型TIBOV毒株YNSZ/V290/2019进行了鉴定,结果表明,病毒可在C6/36与BHK-21细胞上引起明显的细胞病变,电镜下观察,病毒粒子呈球形,直径55~75 nm,具有环状病毒属病毒典型形态特征。电泳结果显示,病毒基因组为十节段双链RNA,呈现“3-3-3-1”的电泳带型特征。对环状病毒属病毒高度保守的基因节段及其编码蛋白(Seg-3/T2)的序列分析显示,YNSZ/V290/2019为TIBOV的成员,与其他TIBOV毒株的核酸与氨基酸序列相似度分别为80.90%~81.70%与97.20%~97.30%。对决定环状病毒属病毒血清型的基因节段及其编码蛋白(Seg-2/OC1)的序列分析显示,YNSZ/V290/2019与已知TIBOV毒株的核酸与氨基酸序列相似度分别为26.90%~30.60%与28.50%~33.20%,表明该毒株可能是一种新血清型的TIBOV。对采集于师宗县牧场的40份黄牛与68份山羊血清进行血清中和试验,结果显示,新型TIBOV在牛、羊的阳性率分别为22.50%与4.41%。新型TIOBV在我国的发现,丰富了我国虫媒病毒的研究,为深入研究我国TIBOV的分布、致病性、感染宿主范围与诊断试剂的开发提供了基础。
关键词
库蠓
病毒
分离鉴定
西藏环状病毒
序列分析
Keywords
Culicoides
virus isolation and identification
Tibet orbivirus(TIBOV)
sequence analysis
分类号
S852.65 [农业科学]
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职称材料
题名
西藏环状病毒RT-PCR检测方法的建立
2
作者
元正菊
李楠
何于雯
孟锦昕
王静林
机构
云南省畜牧兽医科学院云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室
出处
《云南畜牧兽医》
2020年第3期10-13,共4页
基金
云南省科技厅重点基金项目(2019FA015)
国家自然科学基金项目(31660714,31460669)
+1 种基金
国家重点研发计划项目(2016YFD0500303)
云南省科技人才和平台计划项目(2018HB046)。
文摘
建立西藏环状病毒(Tibet orbivirus, TIBOV)RT-PCR诊断方法。根据云南省新分离到的TIBOV Seg-7片段序列设计1套巢式引物为120S7F1/R1、120S7F2/R2。以TIBOV DH13C120株病毒核酸为模板,优化反应条件,建立巢式RT-PCR检测方法,并对云南省新分离的9株TIBOV进行核酸检测。分别采用外引物(120S7F1/R1)和内引物(120S7F2/R2)对TIBOV DH13C120株进行RT-PCR扩增,退火温度分别为52℃和54℃,外引物扩增出片段大小为1 050 bp条带;内引物扩增出的片段大小为500bp,扩增条带大小与设计预期相一致。而蓝舌病毒(BTV)JCC12-7株和阴性对照两轮扩增均为阴性,采用该方法对云南省新分离的9株TIBOV、2株BTV和1株鹿流行性出血热病毒(EHDV)进行检测,9株TIBOV扩增均为阳性,而BTV、EHDV和阴性对照均为阴性。建立了TIBOV巢式RT-PCR检测方法,该方法可用于云南省目前动物或媒介中流行的TIBOV核酸检测。
关键词
西藏环状病毒
巢式引物
RT-PCR检测方法建立
分类号
S852.659.4 [农业科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
1株分离自云南省师宗县库蠓的新型西藏环状病毒
杨振兴
谢佳芮
李占鸿
李卓然
廖德芳
牛保生
姚萍芬
李乐
杨恒
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
西藏环状病毒RT-PCR检测方法的建立
元正菊
李楠
何于雯
孟锦昕
王静林
《云南畜牧兽医》
2020
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