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鸡传染性支气管炎病毒河南流行毒株S1基因的变异分析 被引量:3
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作者 徐雪 赵军 +4 位作者 王川庆 王泽霖 杨霞 周欣 迪丽拜尔.阿木提 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期263-274,共12页
经鸡胚接种、反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)、气管环培养等方法从河南不同地区发病鸡群中先后共分离、鉴定出7株鸡传染性支气管炎病毒(IBV).应用RT-PCR方法对7株病毒以及IBVH120疫苗株的S1基因全序列进行扩增,并对其进行克隆测序及序... 经鸡胚接种、反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)、气管环培养等方法从河南不同地区发病鸡群中先后共分离、鉴定出7株鸡传染性支气管炎病毒(IBV).应用RT-PCR方法对7株病毒以及IBVH120疫苗株的S1基因全序列进行扩增,并对其进行克隆测序及序列分析.结果显示:8株IBV的S1基因全长分为4类,分别是1 632、1 6201、617和1 611 bp;序列相互之间存在多位点变异,同时存在型特异性的插入和缺失;其S蛋白裂解位点序列模式有HRRRR、RRFRR和RRSRR 3种;同源性及遗传进化分析显示Jin-13为呼吸型毒株,YI为ArkDPI型肾型毒株,HN/SG株与国内其他肾型分离株亲缘关系均较远;河南肾型分离株HN/HL、XP/1/09、XP/3、WZL与山东肾型分离株之间的同源性较高且其亲缘关系最近,而与河南HN99株的亲缘关系较远.说明河南地区存在不同的IBV流行毒株,这些流行毒株在主要保护性抗原蛋白S1基因上发生了一定的变异. 展开更多
关键词 传染性支气管炎病毒 肾型 呼吸型 序列分析 S蛋白 裂解位点 遗传进化分析
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2004年黑龙江省新城疫病毒分子流行病学分析 被引量:9
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作者 连宏军 刘培欣 +5 位作者 闫丽辉 曹殿军 孙建宏 梁宏志 韩正博 冉多良 《动物医学进展》 CSCD 2005年第7期91-97,共7页
2004年从黑龙江省部分鸡场疑似新城疫(ND)病死鸡和鸽体内分离到9株NDV。对这9株NDV生物学特性进行测定,并对其F基因包括裂解位点在内的540bp片段进行了克隆、测序和同源性分析。结果表明,9株NDV鸡胚平均死亡时间(MDT)和1日龄雏鸡脑内接... 2004年从黑龙江省部分鸡场疑似新城疫(ND)病死鸡和鸽体内分离到9株NDV。对这9株NDV生物学特性进行测定,并对其F基因包括裂解位点在内的540bp片段进行了克隆、测序和同源性分析。结果表明,9株NDV鸡胚平均死亡时间(MDT)和1日龄雏鸡脑内接种致病指数(ICPI)分别在47.8h~78.4h和1.51~2.00之间;8个分离株在F蛋白裂解位点氨基酸顺序为112RRQKRF117,1个分离株F蛋白裂解位点氨基酸顺序为112RRQRRF117,表明了它们全为ND中、强毒株。同源性分析显示,9株NDV分离株之间核苷酸与推导的氨基酸同源性分别为79.7%~99.7%和79.8%~100%;系统发生树分析表明,6株分离株与台湾株(TW98、TW99和TW2000等)遗传距离较近,可能有共同的起源,为基因Ⅶe型NDV,2株为鸽源NDV基因Ⅵ型,1株与我国特有的F48E9遗传距离最近,为基因Ⅸ型NDV。 展开更多
关键词 2004年 黑龙江省 流行病学分析 新城疫 病毒分子 同源性分析 裂解位点 氨基酸同源性 遗传距离 NDV 生物学特性 系统发生树 分离株 死亡时间 F蛋白 病死鸡 F基因 强毒株 核苷酸 分析表 顺序 鸡场 接种 日龄 鸡胚 鸽源
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禽流感血凝素基因的研究进展 被引量:2
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作者 郭松辉 张富强 《中国畜牧兽医》 CAS 2007年第7期106-108,共3页
高致病性禽流感(AI)是由禽流感病毒(AⅣ)引起的一种急性传染病,AⅣ呈球形,有囊膜。其表面主要有两种糖蛋白,其中血凝素(hemagglufinin,HA)具有重要功能:能凝集红细胞,属I型糖蛋白;具有株和亚型的特异性,是AⅣ型和亚型内新变种判断的主... 高致病性禽流感(AI)是由禽流感病毒(AⅣ)引起的一种急性传染病,AⅣ呈球形,有囊膜。其表面主要有两种糖蛋白,其中血凝素(hemagglufinin,HA)具有重要功能:能凝集红细胞,属I型糖蛋白;具有株和亚型的特异性,是AⅣ型和亚型内新变种判断的主要依据;能结合宿主唾液酸之类的细胞受体;HA在病毒吸附及穿膜过程中起关键作用,HA上裂解位点的序列直接影响AI病毒致病性的高低;HA的变异性很强,它的变异是AI病毒发生抗原变异的主要原因,HA是最主要的抗原物质。因此HA对AⅣ的生物学特征具有十分重要的意义。 展开更多
关键词 禽流感 血凝素 糖基化位点 裂解位点
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禽流感病毒RT-PCR检测方法的建立 被引量:1
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作者 马鸣潇 金宁一 +6 位作者 王振国 费东亮 郑敏 金扩世 夏志平 葛淑敏 金明兰 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期77-81,共5页
参照国内外已发表的禽流感病毒(Avian Influenza Virus, AIV)的基因序列和AIV相关的RT-PCR检测方法,根据AIV高保守、高特异的M蛋白基因设计了一套通用型引物,通过对相关病毒、棉拭子检测,建立了AIV通用型RT-PCR检测方法.根据AIV HA基因... 参照国内外已发表的禽流感病毒(Avian Influenza Virus, AIV)的基因序列和AIV相关的RT-PCR检测方法,根据AIV高保守、高特异的M蛋白基因设计了一套通用型引物,通过对相关病毒、棉拭子检测,建立了AIV通用型RT-PCR检测方法.根据AIV HA基因设计了H5、H7、H9亚型的联合RT-PCR引物,其上下游引物分别位于裂解位点两侧,在确定各亚型单项RT-PCR检测方法的反应条件和反应体系的基础上,建立、优化了三联RT-PCR检测方法的反应体系和反应条件,并通过相关病毒、质粒、棉拭子检测,建立了AIV三联RT-PCR检测方法.最终建立了AIV系列RT-PCR检测方法,该方法具有快速、敏感、特异等优点,为AIV检测、流行病学调查、致病性分析及疫苗使用等奠定了基础. 展开更多
关键词 PCR检测方法 禽流感病毒 流行病学调查 基因设计 反应体系 反应条件 AIV Virus PCR引物 基因序列 H9亚型 裂解位点 疫苗使用 通用型 国内外 相关 M蛋白 V系列 致病性 基础 三联
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鸭流感病毒4/2004-H6N2亚型毒株的血凝素基因全序列克隆与分析
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作者 顾节清 陈杰 +4 位作者 李晓成 杨增岐 吴发兴 张燕霞 黄保续 《中国动物检疫》 CAS 北大核心 2005年第5期31-33,共3页
2004初从正常鸭群中分离到一株鸭源禽流感病毒,命名为A/Duck/HN/4/2004(H6N2)。经对血凝素基因(HA)序列分析发现HA基因全长为1744bp,共编码566个氨基酸,在裂解位点仅含一个碱性氨基酸-精氨酸(R),符合LPAIV的标准。将所得基因序列与已发... 2004初从正常鸭群中分离到一株鸭源禽流感病毒,命名为A/Duck/HN/4/2004(H6N2)。经对血凝素基因(HA)序列分析发现HA基因全长为1744bp,共编码566个氨基酸,在裂解位点仅含一个碱性氨基酸-精氨酸(R),符合LPAIV的标准。将所得基因序列与已发表的同一亚型参考序列分析表明,与H6亚型流感HA基因同源性为89.2%~97.1%,经分子遗传演化分析表明本次分离株与香港分离株A/Duck/HongKong/3600/99(H6N2)、A/Duck/HongKong/3600/99(H6N2)最近。 展开更多
关键词 血凝素基因 亚型 全序列 克隆 毒株 禽流感病毒 碱性氨基酸 基因同源性 HA基因 序列分析 裂解位点 参考序列 基因序列 遗传演化 分析表 分离株 精氨酸 鸭源 鸭群 全长
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4株NDV分离株F基因的克隆与序列分析 被引量:7
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作者 沈志强 管宇 +7 位作者 刘吉山 李峰 吴信明 赵蕾 王艳 徐守振 鲍卫超 王辉暖 《动物医学进展》 CSCD 2005年第4期78-83,共6页
对4 株具有一定代表性的NDV(新城疫病毒)分离株的F基因进行RT PCR(反转录聚合酶链反应)扩增和序列分析,根据基因裂解位点的氨基酸序列推测,其中1 株属于弱毒株,3 株属于强毒株;核苷酸序列及其推导的氨基酸序列比较结果表明,3株强毒株与C... 对4 株具有一定代表性的NDV(新城疫病毒)分离株的F基因进行RT PCR(反转录聚合酶链反应)扩增和序列分析,根据基因裂解位点的氨基酸序列推测,其中1 株属于弱毒株,3 株属于强毒株;核苷酸序列及其推导的氨基酸序列比较结果表明,3株强毒株与Clone30 基因核苷酸序列的同源性在83.6%~84.0%之间,与F48 E9典型NDV强毒株同源性在86.5.6%~88.3%之间,推导的氨基酸序列同源性与Clone 30 株在85.9%~87.0%之间,与F48E9典型NDV强毒株在89.1%~91.3%之间;利用MegAlign软件绘制了NDV 的系统发育进化树,结果表明, 3株分离强毒株为Ⅶ基因型,弱毒株为基因Ⅱ型。 展开更多
关键词 序列分析 NDV F基因 分离株 反转录-聚合酶链反应 系统发育进化树 核苷酸序列 克隆 RT-PCR 新城疫病毒 氨基酸序列 强毒株 序列同源性 裂解位点 序列比较 弱毒株 代表性 基因型 推导
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动物疫情快递
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《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期1285-1285,共1页
1.斯洛伐克共和国发生新城疫 2005年11月2日斯洛伐克向OIE报告了新城疫疫情。此次暴发始于2005年10月5日,确认于2005年10月26日,病原是禽副黏病毒Ⅰ型鸽变异株。疫情发生于Zilina的Lietavska Lucka,共有150只疑似鸽,其中病例1... 1.斯洛伐克共和国发生新城疫 2005年11月2日斯洛伐克向OIE报告了新城疫疫情。此次暴发始于2005年10月5日,确认于2005年10月26日,病原是禽副黏病毒Ⅰ型鸽变异株。疫情发生于Zilina的Lietavska Lucka,共有150只疑似鸽,其中病例14只,未发现死亡,该群已全部销毁。诊断包括临床诊断和实验室诊断。诊断试验在斯国家兽医实验室进行,项目有鸡胚分离(阳性)、HI试验(阳性)和序列测定(氨基酸序列裂解位点:111-Gly-Arg-Arg-Lys-Lys-Arg-Phe-119)。感染来源可能是与城镇鸽接触。根据欧盟相关法规采取了控制措施:(1)未经国家兽医和食品管理局许可,该地区禽类不得移动;(2)扑杀;(3)清洁和消毒。斯洛伐克上次暴发ND是在1980年。 展开更多
关键词 动物疫情 实验室诊断 兽医实验室 斯洛伐克 氨基酸序列 副黏病毒 疫情发生 临床诊断 诊断试验 裂解位点
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高致病性禽流感
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作者 文开新 张配配 《国外畜牧学(猪与禽)》 2017年第5期1-2,共2页
高致病性禽流感是世界动物卫生组织紧急疾病控制方案中在家禽上仅有的两种A类疾病之一。这种病毒性疾病可导致感染的家禽出现极高的死亡率,特别是火鸡。另外,官方的控制措施会影响来自疫区的禽产品贸易。禽流感的病因是一种病毒,属于正... 高致病性禽流感是世界动物卫生组织紧急疾病控制方案中在家禽上仅有的两种A类疾病之一。这种病毒性疾病可导致感染的家禽出现极高的死亡率,特别是火鸡。另外,官方的控制措施会影响来自疫区的禽产品贸易。禽流感的病因是一种病毒,属于正黏病毒A型,其致病性多变,分离株的命名原则为:血清型/宿主物种/暴发地/毒株编号/毒株分离年份/病毒亚型(H/N)。高致病性禽流感的病毒血清群通常为H5和H7,如果是H5或H7,目前可以通过在血凝素裂解位点编码多种碱性氨基酸的序列来鉴定。 展开更多
关键词 高致病性禽流感 禽产品 病毒性疾病 控制措施 病毒群 低致病性禽流感 裂解位点 脸部肿胀 结膜发炎 传染性喉气管炎
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