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表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱在甲状腺癌诊断及临床分期中的应用 被引量:1
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作者 张静 卢秀波 +2 位作者 刘洋 徐桂安 李振宇 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2008年第1期123-125,共3页
目的:用表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析正常人和甲状腺癌患者血清蛋白指纹图谱的变化,建立能鉴别正常人和甲状腺癌及Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌和Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌患者的诊断模型。方法:应用SELDI-TOF-MS技术检测72例血清标... 目的:用表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析正常人和甲状腺癌患者血清蛋白指纹图谱的变化,建立能鉴别正常人和甲状腺癌及Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌和Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌患者的诊断模型。方法:应用SELDI-TOF-MS技术检测72例血清标本的蛋白质质谱,其中甲状腺癌40例(Ⅰ-Ⅱ期26例,Ⅲ-Ⅳ期14例),正常人32例。应用支持向量机和判别分析的方法分析质谱数据,建立甲状腺癌诊断模型并留一法交叉验证。结果:区分甲状腺癌和正常人的诊断模型交叉检验敏感性为100%,特异性为86%,总的符合率为93%;区分Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌和Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌患者的诊断模型对Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌检出的敏感性为77%,特异性为86%,对Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌检出的敏感性为86%,特异性为77%,总的符合率为80%。结论:应用SELDI-TOF-MS技术平台和生物信息技术建立的诊断模型为甲状腺癌的早期诊断及临床分期提供了新的手段。 展开更多
关键词 甲状腺癌 表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱 蛋白芯片 肿瘤标志物
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表面增强激光解析电离飞行时间质谱的质量控制 被引量:1
2
作者 陈蓉艳 兰小鹏 《医学研究生学报》 CAS 2009年第7期770-773,共4页
表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF MS)是快速、高通量的蛋白质组学分析技术;应用于临床的关键是必须具有可重复性,使其结果具有可信度。文中综述SELDI-TOF MS质量控制的相关问题。
关键词 表面增强激光解析电离飞行时间质谱 质量控制 蛋白质组学
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基质辅助激光解析电离飞行时间质谱检测β-内酰胺酶的研究进展 被引量:9
3
作者 余佳佳 俞静 刘瑛 《上海交通大学学报(医学版)》 CSCD 北大核心 2017年第4期566-570,共5页
基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)是一种检测微生物的新型工具,不仅可用于微生物的快速鉴定,而且还可以检测细菌的耐药机制。产β-内酰胺酶是革兰阴性杆菌耐β-内酰胺类抗菌药物的主要耐药机制,目前利用MALDI-TOF MS快... 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)是一种检测微生物的新型工具,不仅可用于微生物的快速鉴定,而且还可以检测细菌的耐药机制。产β-内酰胺酶是革兰阴性杆菌耐β-内酰胺类抗菌药物的主要耐药机制,目前利用MALDI-TOF MS快速检测细菌β-内酰胺酶的技术已被广泛报道,方法主要有检测β-内酰胺酶水解β-内酰胺类抗菌药物的活性,直接检测β-内酰胺酶分子、肽段或其相关蛋白以及检测β-内酰胺酶基因的单核苷酸多态性等。该文结合最新的研究成果对MALDI-TOF MS在β-内酰胺酶检测中的应用现状进行综述。 展开更多
关键词 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 Β-内酰胺酶 水解试验 单核苷酸多态性
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表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术研究神经管缺陷胎儿母亲尿液中蛋白质谱改变规律 被引量:1
4
作者 刘振江 袁正伟 赵群 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期220-224,共5页
目的探讨表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术在筛选神经管缺陷胎儿母亲尿液中蛋白质标志物的应用。方法经超声确诊为神经管缺陷胎儿的孕妇20例和正常孕妇15例。神经管缺陷包括脊柱裂10例,无脑儿5例,脑积水5例。所有... 目的探讨表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术在筛选神经管缺陷胎儿母亲尿液中蛋白质标志物的应用。方法经超声确诊为神经管缺陷胎儿的孕妇20例和正常孕妇15例。神经管缺陷包括脊柱裂10例,无脑儿5例,脑积水5例。所有孕妇均取清晨空腹尿5ml,离心后取上清,选用CM10芯片检测。采用PBSⅡC型蛋白质芯片阅读机读取数据。设定优化相对分子质量范围1000~30000Da。数据分析使用Ciphergen protein chip 3.1.1软件。结果共检测到39个尿液差异蛋白质峰,有统计学意义的差异蛋白质峰5个。病例组中有4种蛋白质高表达,相对分子质量分别为8320,8209,9099,10567;1种蛋白质低表达,相对分子质量3458。建立决策分类树,得到带有3个终结点的决策分类树,获得2个标志性蛋白质,分子量为9096,8244。进行留一法交叉验证后,神经管缺陷诊断模型的灵敏度为80.0%,特异度为93.3%。结论应用SELDI-TOF-MS技术可以在孕妇尿液中筛查出神经管缺陷的特异性蛋白质标志物,进一步可用于神经管缺陷产前早期无创诊断。 展开更多
关键词 神经管缺陷 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 产前诊断 蛋白质标志物
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表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术在白血病诊断中的应用 被引量:1
5
作者 黄华 陈林兴 +1 位作者 林美册 黄靖宇 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期1273-1277,共5页
本研究对白血病患者及健康对照者的血清样本进行检测分析,筛选新的生物标记物并建立白血病的蛋白质指纹图谱诊断模型。应用SELDI-TOF-MS技术检测40例白血病标本及37例健康对照标本,用Biomarker Wizard软件分析筛选新的生物标记物,使用Bi... 本研究对白血病患者及健康对照者的血清样本进行检测分析,筛选新的生物标记物并建立白血病的蛋白质指纹图谱诊断模型。应用SELDI-TOF-MS技术检测40例白血病标本及37例健康对照标本,用Biomarker Wizard软件分析筛选新的生物标记物,使用Biomarker Patterns 5.0软件进行标记物的比较判别,建立白血病决策树诊断模型。结果表明,蛋白质指纹图谱分析发现有22个差异显著的蛋白峰(P<0.05);由m/z为4650,8609及11660建立的决策树诊断模型对白血病的诊断灵敏度为97.5%(39/40),特异性为91.9%(34/37)。结论:由3个蛋白标记物构成的白血病蛋白质指纹图谱诊断模型为白血病的诊断提供了新的借鉴和参考。 展开更多
关键词 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 白血病 蛋白质指纹图谱
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表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术及其在器官移植领域中的应用 被引量:1
6
作者 陈雅斌 赵猛 兰小鹏 《医学研究生学报》 CAS 2010年第5期547-550,共4页
表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术是较有效的蛋白质组学研究手段,虽然目前尚未应用于临床常规实验室诊断,但已广泛应用于肿瘤、传... 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术是较有效的蛋白质组学研究手段,虽然目前尚未应用于临床常规实验室诊断,但已广泛应用于肿瘤、传染病、心血管病和神经系统疾病的研究。近年来,SELDI-TOF-MS技术试用于器官移植领域,如急性移植排斥反应的早期诊断、移植相关疾病的诊断、疾病相关蛋白的鉴定,探讨疾病的发生机制,展现了该技术在器官移植中的广阔应用前景。 展开更多
关键词 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 诊断 器官移植
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应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱联合磁珠技术寻找肺癌血清蛋白标志物 被引量:1
7
作者 谢静 朱乾坤 +5 位作者 朱莉思 肖刻 朱威 诸葛斯亮 朱朝晖 吴志宏 《协和医学杂志》 2016年第6期416-420,共5页
目的 建立肺癌蛋白质指纹图谱诊断模型,探讨用于肺癌早期诊断及手术疗效评估的血清蛋白标志物。方法 收集38例肺癌患者、12例肺部良性肿瘤患者及32名正常对照者的血清标本,应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface-enhanced lase... 目的 建立肺癌蛋白质指纹图谱诊断模型,探讨用于肺癌早期诊断及手术疗效评估的血清蛋白标志物。方法 收集38例肺癌患者、12例肺部良性肿瘤患者及32名正常对照者的血清标本,应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)联合磁珠技术,获得蛋白质指纹图谱,采用BPS分析软件对数据分组及相关性进行分析,初步建立肺癌的血清蛋白质指纹图谱诊断模型,并验证其诊断效率;同时对比肺癌患者手术前后的差异蛋白质谱,结合肺癌的诊断模型,选取合适的蛋白作为肺癌手术疗效的观察指标。结果 在质荷比为1000-50 000范围内,肺癌患者、肺部良性肿瘤患者和正常对照者之间共检测到215个蛋白质峰。其中,质荷比为1115.37、1929.70、3217.57、3246.34、3318.57、11 508.90的6个蛋白质峰表达差异具有统计学意义(P〈0.05)。决策树模型对肺癌的原始判别敏感性为92.11%(35/38),特异性为90.91%(40/44);交叉验证敏感性为86.67%(13/15),特异性为86.67%(13/15)。其中质荷比为1115.37、1929.70、3246.34和11 508.90的蛋白质峰在肺癌患者中明显升高(P〈0.05),当肺癌患者手术治疗后表达量较术前明显降低(P〈0.01),表明这4个蛋白质峰对肺癌的诊断及疗效判定具有潜在应用价值。结论 应用SELDI-TOF-MS技术建立的肺癌血清蛋白质指纹图谱诊断模型具有较高的敏感性和特异性,为发现肺癌早期生物标志物并判断疗效奠定基础。 展开更多
关键词 肺癌 肿瘤标志物 诊断 蛋白质组学 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱
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应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱筛选大肠癌血清特异标志物
8
作者 马明 宋鉴清 欧阳金鸣 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期209-211,共3页
目的采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测大肠癌患者与健康对照者血清中蛋白的差异,为大肠癌的早期诊断提供理论依据。方法应用SELDI-TOF-MS技术及弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)检测36例健康成人(对照组)和36例大... 目的采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测大肠癌患者与健康对照者血清中蛋白的差异,为大肠癌的早期诊断提供理论依据。方法应用SELDI-TOF-MS技术及弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)检测36例健康成人(对照组)和36例大肠癌患者(大肠组)血清中蛋白含量。结果在质荷比为2000Da~30000Da的范围内,两组样本检测到了对照组82个蛋白峰。其中3604.240Da蛋白峰大肠癌组明显高于对照组(P<0.05),而12861.368Da的蛋白峰对照组明显高于大肠癌组(P<0.05)。利用这两个蛋白筛查大肠癌的特异度为86.11%(31/36),敏感度为77.78%(28/36),阳性预测值为87.5%。结论质荷比为3604.240Da与12861.368Da的两个蛋白峰可以作为大肠癌早期诊断的备选标志物。 展开更多
关键词 大肠癌 表面增强激光解吸电离 飞行时间 质谱技术 弱阳离子蛋白质芯片 标志物
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基质辅助激光解析电离飞行时间质谱检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌δ-毒素的应用 被引量:5
9
作者 郭庆昕 杨滨 强华 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2019年第4期455-460,共6页
目的本研究采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOFMS)检测δ-毒素,评估其在耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的分型和毒力表达中的作用。方法使用Bruker microflex MALDI-TOF仪器,采集2000~20000Da质量范围内,以正线性模式采... 目的本研究采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOFMS)检测δ-毒素,评估其在耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的分型和毒力表达中的作用。方法使用Bruker microflex MALDI-TOF仪器,采集2000~20000Da质量范围内,以正线性模式采集图谱,使用仪器配套的MALDI Biotyper 2.0软件分析MRSA菌株的原始图谱,产生的峰列表直接使用flexAnalysis、clinProTools 3.0软件分析。结果本研究中共检测83株MRSA,共有39(47.0%)株MRSA检出(3005±5)m/z信号峰,其中HA-MRSA19(22.9%)株,CA-MRSA20(26.5%)株,P=0.766,两者之间无显著性差异;33(39.8%)株MRSA检出(3035±5)m/z信号峰,其中HA-MRSA9(10.8%)株,CA-MRSA24(28.9%)株,P=0.003,两者之间有显著性差异;11(13.%)株MRSA既未检出(3005±5)m/z信号峰也未检出(3035±5)m/z信号峰,全部为HA-MRSA菌株。spa分型中检出(3005±5)m/z信号峰,15(18.1%)株为t062型,8株为t015(9.6%)型,4株为t030(4.8%)株,P=0,有显著性差异;检出(3035±5)m/z信号峰,31(37.3%)株为t437型,2(2.4%)株t8660型,P=0,有显著性差异;(3035±5)m/z作为spat437型特征信号ROC曲线下面积0.89,P=0。11株未检出δ-毒素,6株分离自骨关节标本,3株分离自呼吸道标本,1株分离自慢性溃疡的分泌物标本,1株分离自血液;在血平板的菌落特征,6株MRSA菌落形态发生改变,5株菌落形态正常。结论MALDI-TOF MS使用常规方法即可快速检测MRSA的δ-毒素,其质谱峰为(3005±5)m/z和(3035±5)m/z两种;(3035±5)m/z是δ-毒素的同基因变异体(HldG10S)的质谱峰,该峰可快速鉴别spat437型;不产生δ-毒素的菌株是agr调控系统失调的表现,与慢性感染、小菌落形成、无明显β-溶血有关。 展开更多
关键词 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 δ-毒素
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基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱鉴定鲨鱼硒结合蛋白 被引量:2
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作者 王勇 李水明 何曼文 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第5期257-262,共6页
利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了原核表达的白鳍鲨硒结合蛋白。实验表明,硒结合蛋白肽段之一被错误指认为胰酶自水解峰和混合谱是影响其未进行串联质谱分析或不能被数据库搜索匹配的主要原因... 利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了原核表达的白鳍鲨硒结合蛋白。实验表明,硒结合蛋白肽段之一被错误指认为胰酶自水解峰和混合谱是影响其未进行串联质谱分析或不能被数据库搜索匹配的主要原因,同时还发现,虽然赖氨酸结尾肽段在MALDI源中信号强度普遍很低,但对它们进行串联质谱分析也可获得较好的谱图质量,部分数据可用于从头测序。考虑以上因素后,硒结合蛋白鉴定覆盖率由35%增至51%。 展开更多
关键词 硒结合蛋白 基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF TOF) 蛋白质鉴定 数据库 搜索 手工解析
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基质辅助激光解析电离飞行时间质谱方法测定全氟烷基磺酸类化合物 被引量:2
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作者 汪宁 刘冬豪 +3 位作者 容俊楠 周庆琼 漆亚乔 戚平 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2022年第22期292-298,共7页
以α-氰基-4-羟基肉桂酸(α-cyano-4-hydroxycinnamic acid,HCCA)、2,5-二羟基苯甲酸、芥子酸3种常用基质作为基质,分析5种全氟烷基磺酸(全氟丁烷磺酸、全氟己烷磺酸、全氟庚烷磺酸、全氟辛烷磺酸、全氟癸烷磺酸)的基质辅助激光解析电... 以α-氰基-4-羟基肉桂酸(α-cyano-4-hydroxycinnamic acid,HCCA)、2,5-二羟基苯甲酸、芥子酸3种常用基质作为基质,分析5种全氟烷基磺酸(全氟丁烷磺酸、全氟己烷磺酸、全氟庚烷磺酸、全氟辛烷磺酸、全氟癸烷磺酸)的基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)信号,建立全氟烷基磺酸类化合物的MALDI-TOF MS快速检测方法,初步探究常用基质在负离子反射模式下产生的质谱峰及对待测物的干扰,为全氟烷基磺酸化合物MALDI-TOF MS定量分析及高通量检测方法的建立打下基础。以HCCA作为基质,建立了全氟辛烷磺酸的内标定量检测方法,解决了MALDI-TOF MS检测中定量难的问题。该研究结果表明,采用MALDI-TOF MS内标法测定水中全氟辛烷磺酸的重复性和灵敏度良好,在质量浓度为5~500 ng/mL时,线性相关系数R^(2)为0.9979,检出限为1 ng/mL,定量限为5 ng/mL,水样加标回收率为65%~106%,相对标准偏差为2.36%~17.7%,应用该方法检测水中的全氟辛烷磺酸,能有效实现环境水样中全氟辛烷磺酸的快速定量分析。 展开更多
关键词 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS) 负离子反射模式 全氟烷基磺酸类化合物 α-氰基-4-羟基肉桂酸 2 5-二羟基苯甲酸 芥子酸
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基于ACO-SVM的质谱数据分析 被引量:3
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作者 张蓉 冯斌 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期158-160,共3页
生物信息学应用领域存在高维小样本和内部空间疏散的特性,因而数据分析面临着巨大的挑战。基于此,在蚁群算法的搜索过程中将特征的信噪比作为先验信息,结合支撑向量用于筛选血清蛋白相关生物标记物,实验结果表明,该方法建立的癌症诊断... 生物信息学应用领域存在高维小样本和内部空间疏散的特性,因而数据分析面临着巨大的挑战。基于此,在蚁群算法的搜索过程中将特征的信噪比作为先验信息,结合支撑向量用于筛选血清蛋白相关生物标记物,实验结果表明,该方法建立的癌症诊断模型取得了较好的分类性能测试仿真结果,敏感度和特异度分别达到94%和92.4%。 展开更多
关键词 表面增强激光解析电离飞行时间质谱 蛋白质组学 蚁群优化算法 特征选择技术 生物标记物
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基于QPSO-SVM算法的SELDI-TOF质谱数据分析 被引量:1
13
作者 张蓉 冯斌 孙俊 《计算机应用与软件》 CSCD 2011年第1期57-60,共4页
生物信息学领域的微阵列分析、质谱数据分析等大规模机器学习问题的不断涌现,对已有的特征选择算法提出了严峻的挑战,迫切需要研究适应于高维小样本特征的、准确性和运行效率等综合性能较好的、新的特征选择算法。将基于量子粒子群算法(... 生物信息学领域的微阵列分析、质谱数据分析等大规模机器学习问题的不断涌现,对已有的特征选择算法提出了严峻的挑战,迫切需要研究适应于高维小样本特征的、准确性和运行效率等综合性能较好的、新的特征选择算法。将基于量子粒子群算法(QPSO)与SVM结合,并将建立的诊断模型用于生物标记物的选择。实验结果表明,新的基于量子粒子群算法建立的模型不仅具有良好的预测精度,而且在速度上有大幅的提高。 展开更多
关键词 表面增强激光解析电离飞行时间质谱 粒子群优化算法(PSO) 量子粒子群算法(QPSO) 特征选择技术 生物标记物
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人工解析提高串联质谱鉴定肽段的数据利用度
14
作者 王勇 李水明 +1 位作者 何曼文 冯里茹 《深圳大学学报(理工版)》 EI CAS 北大核心 2013年第5期538-544,共7页
为降低蛋白质鉴定的假阴性,利用标准蛋白和实际样品,探讨影响基质辅助激光解吸电离–串联飞行时间质谱数据利用度的原因.发现误差设置偏小、翻译后修饰、异常酶解和氨基酸突变等是导致蛋白质数据库检索不匹配目标肽段的主要原因.实验表... 为降低蛋白质鉴定的假阴性,利用标准蛋白和实际样品,探讨影响基质辅助激光解吸电离–串联飞行时间质谱数据利用度的原因.发现误差设置偏小、翻译后修饰、异常酶解和氨基酸突变等是导致蛋白质数据库检索不匹配目标肽段的主要原因.实验表明,典型情况下一级和二级质谱误差可设定在0.3Da.对未与数据库匹配的串联质谱进行亚胺离子辅助的人工解析发现,色氨酸双氧化、丝氨酸乙酰胺化和半胱氨酸丙酰胺化等不常见修饰,酪氨酸与苯丙氨酸、天冬氨酸与谷氨酸两两之间的突变和非特异性酶解等现象,该研究可提高质谱鉴定的数据利用度. 展开更多
关键词 蛋白质组学 数据库搜索 基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱 人工解析 亚胺离子
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Ni~Ⅱ-NTA修饰的银纳米粒/多孔硅芯片在线分离组氨酸标记蛋白和MALDI-TOF质谱检测(英文)
15
作者 颜红 王冲 +1 位作者 周小会 肖守军 《无机化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1642-1648,共7页
本文通过沉积在多孔硅表面的银纳米粒吸附对氨基苯硫酚和氨基的化学转化得到终端为NiII-Nα,Nα-二(羧甲基)-L-赖氨酸水合物-即NiⅡ-NTA体系的芯片。NiⅡ-NTA修饰的芯片被用于从高浓度的盐和助溶剂的缓冲体系中亲和捕获组氨酸标记的融... 本文通过沉积在多孔硅表面的银纳米粒吸附对氨基苯硫酚和氨基的化学转化得到终端为NiII-Nα,Nα-二(羧甲基)-L-赖氨酸水合物-即NiⅡ-NTA体系的芯片。NiⅡ-NTA修饰的芯片被用于从高浓度的盐和助溶剂的缓冲体系中亲和捕获组氨酸标记的融合蛋白:thioredoxin-urodilatin和SUMO-hu-aprotinin,并进行在线的MALDI-TOF质谱检测,克服了MALDI-TOF质谱中直接点样污染物妨碍样品与基质共结晶的问题,避免了繁琐的离线样品预处理。芯片在线分离、纯化和MALDI-TOF质谱分析体系有望在复杂或原始体液的溶液中分析目标分子。 展开更多
关键词 基质辅助激光解析电离时间飞行质谱 NiⅡ- -二(羧甲基)-L-赖氨酸水合物 银纳米粒/多孔硅芯片 组氨酸标记的融合蛋白
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SELDI-TOF-MS筛查乳腺癌患者血清特异性蛋白的探讨 被引量:6
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作者 刘彩刚 路平 +5 位作者 赵祥 顾劲松 刘金龙 庞葵 朱晓宣 张瑞山 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2007年第13期728-730,共3页
目的:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术寻找乳腺癌患者血清特异性蛋白。方法:应用弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)及SELDI-TOF-MS技术检测12例正常人、10例乳腺良性病患者和22例乳腺癌患者血清中蛋白的相对含量。结果... 目的:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术寻找乳腺癌患者血清特异性蛋白。方法:应用弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)及SELDI-TOF-MS技术检测12例正常人、10例乳腺良性病患者和22例乳腺癌患者血清中蛋白的相对含量。结果:三组样本质荷比在2000~30000Da间3939.314Da与3960.478Da的2个蛋白峰有显著差异。结论:SELDI-TOF-MS技术对乳腺癌早期诊断和特异性肿瘤标记物的筛选等方面具有一定价值,值得推广。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 弱阳离子蛋白质芯片 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱
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SELDI-TOF-MS技术筛查预测乳腺癌患者曲妥珠单抗耐药的生物标志物 被引量:3
17
作者 郑弘宇 陈慧菁 +3 位作者 吴凡 黄伟炜 陈强 叶韵斌 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期368-373,共6页
目的:应用表面加强激光解析电离化飞行时间质谱技术(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)比较乳腺癌曲妥珠单抗治疗耐药患者与非耐药患者血清蛋白质谱的差异,筛选预测乳腺癌... 目的:应用表面加强激光解析电离化飞行时间质谱技术(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)比较乳腺癌曲妥珠单抗治疗耐药患者与非耐药患者血清蛋白质谱的差异,筛选预测乳腺癌患者曲妥珠单抗耐药的标志蛋白。方法:选择福建省肿瘤医院2008年1月至2009年10月曲妥珠单抗治疗的乳腺癌患者35例,以临床界定标准将患者分为耐药组(11例)和非耐药组(24例)。应用SELDI-TOF-MS技术检测两组患者外周血蛋白质表达谱的差异,以差异蛋白峰值比1.5为耐药的蛋白界定标准,以此标准判定患者耐药与否。分析该蛋白界定标准评判曲妥珠单抗耐药的灵敏度、特异度以及阳性预测值、阴性预测值。结果:以临床界定标准评判的曲妥珠单抗耐药的发生与患者年龄、分期、腋窝淋巴结转移和ER/PR双阴无关。临床耐药组和非耐药组患者外周血蛋白质表达谱比较显示,耐药患者的蛋白质峰7971Da、9284Da显著降低(P<0.05)。以蛋白界定标准评判患者曲妥单抗耐药与非耐药,7971Da评判时的灵敏度为81.82%(9/11)、特异度为83.33%(20/24)、阳性预测值为69.23%(9/13)、阴性预测值为90.91%(20/22);以9284Da评判时的灵敏度为72.73%(8/11)、特异度为79.17%(19/24)、阳性预测值为61.54%(8/13)、阴性预测值为86.36%(19/22)。结论:应用SELDI-TOF-MS技术检测的差异蛋白质峰7971Da、9284Da似可作为预测乳腺癌患者曲妥珠单抗耐药的生物标志物。 展开更多
关键词 表面加强激光解析电离飞行时间质谱技术 乳腺肿瘤 曲妥珠单抗 耐药 生物标志物
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SELDI-TOF-MS技术在口腔黏膜癌前病变和口腔鳞癌的唾液诊断模型中的应用 被引量:4
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作者 平飞云 孙钢 何虹 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期203-208,共6页
目的:分析唾液中蛋白质组对口腔鳞癌患者的动态变化的意义,对口腔鳞癌和癌前病变的相关诊断模型的建立进行初步探索。方法:按标准提取唾液标本,采用SELDI-TOF-MS技术,对17例口腔鳞癌患者、7例区域性转移患者、8例白斑患者和15例健康志... 目的:分析唾液中蛋白质组对口腔鳞癌患者的动态变化的意义,对口腔鳞癌和癌前病变的相关诊断模型的建立进行初步探索。方法:按标准提取唾液标本,采用SELDI-TOF-MS技术,对17例口腔鳞癌患者、7例区域性转移患者、8例白斑患者和15例健康志愿者的唾液蛋白质指纹图谱进行比较,并采用整合性生物信息学方法建立诊断模型。结果:得到唾液诊断模型Ⅰ,为原发性口腔鳞癌患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为5797、2902、3883和4951的4个蛋白质峰。其中5797、2902和3883在原发性口腔鳞癌患者唾液中低表达。4951在原发性口腔鳞癌患者唾液中高表达。敏感性为93.33%,特异性为88.24%,总准确率为90.63%。唾液诊断模型Ⅱ,为OSCC区域性转移患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为5446、4934、4968、3296、4800和2901的6个蛋白质峰。其中5446、4934和3296在口腔鳞癌区域性转移患者唾液中高表达。4968、4800和2901在口腔鳞癌区域性转移患者唾液中低表达,敏感性为100.00%,特异性为85.71%,总准确率为95.45%。唾液诊断模型Ⅲ,为白斑患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为9515、2230、2238、5694和2646的5个蛋白质峰。其中9515和5694在白斑患者唾液中高表达。2230、2238和2646在白斑患者唾液中低表达,敏感性为93.33%,特异性为85.71%,总准确率为86.96%。结论:结合SELDI-TOF-MS和生物信息学方法,唾液对肿瘤的诊断意义将进一步发挥其价值。本研究根据口腔粘膜上皮癌前病变、癌变、转移的唾液蛋白质组的变化,初步建立了3个早期诊断模型。 展开更多
关键词 口腔肿瘤 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 唾液 蛋白质组
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SELDI-TOF-MS筛选微小病变型肾病综合征尿液生物标志物 被引量:1
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作者 林青 郑健 +1 位作者 陈蓉艳 艾斯 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第17期1842-1846,共5页
目的探讨应用优化的表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱(surface enhanced laser desorption/ionizationtime of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)进行微小病变型肾病综合征(minimal-changed nephrotic syndrome,MCNS)大鼠尿液... 目的探讨应用优化的表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱(surface enhanced laser desorption/ionizationtime of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)进行微小病变型肾病综合征(minimal-changed nephrotic syndrome,MCNS)大鼠尿液生物标志物筛选的意义。方法 SD大鼠30只随机分为正常对照组(n=10)、模型对照组(n=10)和强的松治疗组(n=10)。除正常对照组外,其余大鼠经尾静脉一次性注射阿霉素5.5mg/kg复制MCNS模型,造模10d后分别予以强的松和蒸馏水灌胃治疗。21d后收集大鼠尿液,经弱阳离子交换芯片CM10捕获蛋白质,应用SELDI-TOF-MS获取3组大鼠的尿液蛋白质指纹图谱,采用Biomarker wizard软件比对分析差异蛋白。结果优化实验条件后获得较理想的尿液蛋白质指纹图谱,质控峰强度的平均CV值为18.0%(7.50%~35.89%)。在模型对照组与正常对照组之间检测到不同质荷比处有33个具统计学意义的差异蛋白峰(P<0.05),其中21个蛋白表达上调,12个蛋白表达下调。在正常对照组、模型对照组与强的松治疗组之间有6个蛋白质表达存在差异(P<0.05),这些差异蛋白峰在模型对照组中高表达,而在强的松治疗组中蛋白表达下调,峰强度接近正常对照组。结论通过优化实验条件并实行质量控制,SELDI-TOF-MS可为MCNS大鼠尿液生物标志物的筛选提供一个可行的检测途径。所获得的差异性蛋白峰对MCNS的早期诊断、治疗监测和寻找药物治疗的靶目标具有重要的意义。 展开更多
关键词 表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱 微小病变型肾病综合征 尿液 生物标志物 质控
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家蚕微孢子虫蛋白水解酶的活性检测及质谱鉴定和序列分析 被引量:2
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作者 党晓群 马强 +5 位作者 林立鹏 龙梦娴 李春峰 李田 潘国庆 周泽扬 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期281-287,共7页
微孢子虫的蛋白水解酶类不仅参与代谢活动,而且可能作为一种潜在的侵染宿主的毒力因子。为了研究家蚕微孢子虫蛋白水解酶的种类及蛋白质结构特点,将家蚕微孢子虫总蛋白经非变性凝胶电泳后与底物酪蛋白孵育,检测到可水解酪蛋白的蛋白酶... 微孢子虫的蛋白水解酶类不仅参与代谢活动,而且可能作为一种潜在的侵染宿主的毒力因子。为了研究家蚕微孢子虫蛋白水解酶的种类及蛋白质结构特点,将家蚕微孢子虫总蛋白经非变性凝胶电泳后与底物酪蛋白孵育,检测到可水解酪蛋白的蛋白酶类的活性。采用质谱法分析该类蛋白酶主要是锌离子依赖型的细胞质型亮氨酰氨肽酶和丝氨酸蛋白酶。细胞质型亮氨酰氨肽酶序列是由1 515个碱基编码的505个氨基酸组成,无信号肽,有2个潜在的锌离子结合部位,属于金属蛋白酶M17家族;丝氨酸蛋白酶具有肽酶S8结构域和跨膜域。通过序列比对发现在兔脑炎微孢子虫、蝗虫微孢子虫、蜜蜂微孢子虫、肠道微孢子虫和比氏肠道微孢子虫中均有这2种酶,且相似度较高,其进化较为保守。 展开更多
关键词 家蚕微孢子虫 蛋白水解酶 酶活性 基质辅助激光解析电离-飞行时间质谱 序列特征
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