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表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱在甲状腺癌诊断及临床分期中的应用 被引量:1
1
作者 张静 卢秀波 +2 位作者 刘洋 徐桂安 李振宇 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2008年第1期123-125,共3页
目的:用表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析正常人和甲状腺癌患者血清蛋白指纹图谱的变化,建立能鉴别正常人和甲状腺癌及Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌和Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌患者的诊断模型。方法:应用SELDI-TOF-MS技术检测72例血清标... 目的:用表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析正常人和甲状腺癌患者血清蛋白指纹图谱的变化,建立能鉴别正常人和甲状腺癌及Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌和Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌患者的诊断模型。方法:应用SELDI-TOF-MS技术检测72例血清标本的蛋白质质谱,其中甲状腺癌40例(Ⅰ-Ⅱ期26例,Ⅲ-Ⅳ期14例),正常人32例。应用支持向量机和判别分析的方法分析质谱数据,建立甲状腺癌诊断模型并留一法交叉验证。结果:区分甲状腺癌和正常人的诊断模型交叉检验敏感性为100%,特异性为86%,总的符合率为93%;区分Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌和Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌患者的诊断模型对Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌检出的敏感性为77%,特异性为86%,对Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌检出的敏感性为86%,特异性为77%,总的符合率为80%。结论:应用SELDI-TOF-MS技术平台和生物信息技术建立的诊断模型为甲状腺癌的早期诊断及临床分期提供了新的手段。 展开更多
关键词 甲状腺癌 表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱 蛋白芯片 肿瘤标志物
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表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术在白血病诊断中的应用 被引量:1
2
作者 黄华 陈林兴 +1 位作者 林美册 黄靖宇 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期1273-1277,共5页
本研究对白血病患者及健康对照者的血清样本进行检测分析,筛选新的生物标记物并建立白血病的蛋白质指纹图谱诊断模型。应用SELDI-TOF-MS技术检测40例白血病标本及37例健康对照标本,用Biomarker Wizard软件分析筛选新的生物标记物,使用Bi... 本研究对白血病患者及健康对照者的血清样本进行检测分析,筛选新的生物标记物并建立白血病的蛋白质指纹图谱诊断模型。应用SELDI-TOF-MS技术检测40例白血病标本及37例健康对照标本,用Biomarker Wizard软件分析筛选新的生物标记物,使用Biomarker Patterns 5.0软件进行标记物的比较判别,建立白血病决策树诊断模型。结果表明,蛋白质指纹图谱分析发现有22个差异显著的蛋白峰(P<0.05);由m/z为4650,8609及11660建立的决策树诊断模型对白血病的诊断灵敏度为97.5%(39/40),特异性为91.9%(34/37)。结论:由3个蛋白标记物构成的白血病蛋白质指纹图谱诊断模型为白血病的诊断提供了新的借鉴和参考。 展开更多
关键词 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 白血病 蛋白质指纹图谱
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表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术及其在器官移植领域中的应用 被引量:1
3
作者 陈雅斌 赵猛 兰小鹏 《医学研究生学报》 CAS 2010年第5期547-550,共4页
表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术是较有效的蛋白质组学研究手段,虽然目前尚未应用于临床常规实验室诊断,但已广泛应用于肿瘤、传... 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术是较有效的蛋白质组学研究手段,虽然目前尚未应用于临床常规实验室诊断,但已广泛应用于肿瘤、传染病、心血管病和神经系统疾病的研究。近年来,SELDI-TOF-MS技术试用于器官移植领域,如急性移植排斥反应的早期诊断、移植相关疾病的诊断、疾病相关蛋白的鉴定,探讨疾病的发生机制,展现了该技术在器官移植中的广阔应用前景。 展开更多
关键词 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 诊断 器官移植
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应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱联合磁珠技术寻找肺癌血清蛋白标志物 被引量:1
4
作者 谢静 朱乾坤 +5 位作者 朱莉思 肖刻 朱威 诸葛斯亮 朱朝晖 吴志宏 《协和医学杂志》 2016年第6期416-420,共5页
目的 建立肺癌蛋白质指纹图谱诊断模型,探讨用于肺癌早期诊断及手术疗效评估的血清蛋白标志物。方法 收集38例肺癌患者、12例肺部良性肿瘤患者及32名正常对照者的血清标本,应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface-enhanced lase... 目的 建立肺癌蛋白质指纹图谱诊断模型,探讨用于肺癌早期诊断及手术疗效评估的血清蛋白标志物。方法 收集38例肺癌患者、12例肺部良性肿瘤患者及32名正常对照者的血清标本,应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)联合磁珠技术,获得蛋白质指纹图谱,采用BPS分析软件对数据分组及相关性进行分析,初步建立肺癌的血清蛋白质指纹图谱诊断模型,并验证其诊断效率;同时对比肺癌患者手术前后的差异蛋白质谱,结合肺癌的诊断模型,选取合适的蛋白作为肺癌手术疗效的观察指标。结果 在质荷比为1000-50 000范围内,肺癌患者、肺部良性肿瘤患者和正常对照者之间共检测到215个蛋白质峰。其中,质荷比为1115.37、1929.70、3217.57、3246.34、3318.57、11 508.90的6个蛋白质峰表达差异具有统计学意义(P〈0.05)。决策树模型对肺癌的原始判别敏感性为92.11%(35/38),特异性为90.91%(40/44);交叉验证敏感性为86.67%(13/15),特异性为86.67%(13/15)。其中质荷比为1115.37、1929.70、3246.34和11 508.90的蛋白质峰在肺癌患者中明显升高(P〈0.05),当肺癌患者手术治疗后表达量较术前明显降低(P〈0.01),表明这4个蛋白质峰对肺癌的诊断及疗效判定具有潜在应用价值。结论 应用SELDI-TOF-MS技术建立的肺癌血清蛋白质指纹图谱诊断模型具有较高的敏感性和特异性,为发现肺癌早期生物标志物并判断疗效奠定基础。 展开更多
关键词 肺癌 肿瘤标志物 诊断 蛋白质组学 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱
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应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱筛选大肠癌血清特异标志物
5
作者 马明 宋鉴清 欧阳金鸣 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期209-211,共3页
目的采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测大肠癌患者与健康对照者血清中蛋白的差异,为大肠癌的早期诊断提供理论依据。方法应用SELDI-TOF-MS技术及弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)检测36例健康成人(对照组)和36例大... 目的采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测大肠癌患者与健康对照者血清中蛋白的差异,为大肠癌的早期诊断提供理论依据。方法应用SELDI-TOF-MS技术及弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)检测36例健康成人(对照组)和36例大肠癌患者(大肠组)血清中蛋白含量。结果在质荷比为2000Da~30000Da的范围内,两组样本检测到了对照组82个蛋白峰。其中3604.240Da蛋白峰大肠癌组明显高于对照组(P<0.05),而12861.368Da的蛋白峰对照组明显高于大肠癌组(P<0.05)。利用这两个蛋白筛查大肠癌的特异度为86.11%(31/36),敏感度为77.78%(28/36),阳性预测值为87.5%。结论质荷比为3604.240Da与12861.368Da的两个蛋白峰可以作为大肠癌早期诊断的备选标志物。 展开更多
关键词 大肠癌 表面增强激光解吸电离 飞行时间 质谱技术 弱阳离子蛋白质芯片 标志物
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基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱鉴定鲨鱼硒结合蛋白 被引量:2
6
作者 王勇 李水明 何曼文 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第5期257-262,共6页
利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了原核表达的白鳍鲨硒结合蛋白。实验表明,硒结合蛋白肽段之一被错误指认为胰酶自水解峰和混合谱是影响其未进行串联质谱分析或不能被数据库搜索匹配的主要原因... 利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了原核表达的白鳍鲨硒结合蛋白。实验表明,硒结合蛋白肽段之一被错误指认为胰酶自水解峰和混合谱是影响其未进行串联质谱分析或不能被数据库搜索匹配的主要原因,同时还发现,虽然赖氨酸结尾肽段在MALDI源中信号强度普遍很低,但对它们进行串联质谱分析也可获得较好的谱图质量,部分数据可用于从头测序。考虑以上因素后,硒结合蛋白鉴定覆盖率由35%增至51%。 展开更多
关键词 硒结合蛋白 基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-tof tof) 蛋白质鉴定 数据库 搜索 手工解析
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SELDI-TOF-MS筛查乳腺癌患者血清特异性蛋白的探讨 被引量:6
7
作者 刘彩刚 路平 +5 位作者 赵祥 顾劲松 刘金龙 庞葵 朱晓宣 张瑞山 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2007年第13期728-730,共3页
目的:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术寻找乳腺癌患者血清特异性蛋白。方法:应用弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)及SELDI-TOF-MS技术检测12例正常人、10例乳腺良性病患者和22例乳腺癌患者血清中蛋白的相对含量。结果... 目的:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术寻找乳腺癌患者血清特异性蛋白。方法:应用弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)及SELDI-TOF-MS技术检测12例正常人、10例乳腺良性病患者和22例乳腺癌患者血清中蛋白的相对含量。结果:三组样本质荷比在2000~30000Da间3939.314Da与3960.478Da的2个蛋白峰有显著差异。结论:SELDI-TOF-MS技术对乳腺癌早期诊断和特异性肿瘤标记物的筛选等方面具有一定价值,值得推广。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 弱阳离子蛋白质芯片 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱
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SELDI-TOF-MS技术在口腔黏膜癌前病变和口腔鳞癌的唾液诊断模型中的应用 被引量:4
8
作者 平飞云 孙钢 何虹 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期203-208,共6页
目的:分析唾液中蛋白质组对口腔鳞癌患者的动态变化的意义,对口腔鳞癌和癌前病变的相关诊断模型的建立进行初步探索。方法:按标准提取唾液标本,采用SELDI-TOF-MS技术,对17例口腔鳞癌患者、7例区域性转移患者、8例白斑患者和15例健康志... 目的:分析唾液中蛋白质组对口腔鳞癌患者的动态变化的意义,对口腔鳞癌和癌前病变的相关诊断模型的建立进行初步探索。方法:按标准提取唾液标本,采用SELDI-TOF-MS技术,对17例口腔鳞癌患者、7例区域性转移患者、8例白斑患者和15例健康志愿者的唾液蛋白质指纹图谱进行比较,并采用整合性生物信息学方法建立诊断模型。结果:得到唾液诊断模型Ⅰ,为原发性口腔鳞癌患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为5797、2902、3883和4951的4个蛋白质峰。其中5797、2902和3883在原发性口腔鳞癌患者唾液中低表达。4951在原发性口腔鳞癌患者唾液中高表达。敏感性为93.33%,特异性为88.24%,总准确率为90.63%。唾液诊断模型Ⅱ,为OSCC区域性转移患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为5446、4934、4968、3296、4800和2901的6个蛋白质峰。其中5446、4934和3296在口腔鳞癌区域性转移患者唾液中高表达。4968、4800和2901在口腔鳞癌区域性转移患者唾液中低表达,敏感性为100.00%,特异性为85.71%,总准确率为95.45%。唾液诊断模型Ⅲ,为白斑患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为9515、2230、2238、5694和2646的5个蛋白质峰。其中9515和5694在白斑患者唾液中高表达。2230、2238和2646在白斑患者唾液中低表达,敏感性为93.33%,特异性为85.71%,总准确率为86.96%。结论:结合SELDI-TOF-MS和生物信息学方法,唾液对肿瘤的诊断意义将进一步发挥其价值。本研究根据口腔粘膜上皮癌前病变、癌变、转移的唾液蛋白质组的变化,初步建立了3个早期诊断模型。 展开更多
关键词 口腔肿瘤 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 唾液 蛋白质组
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应用SELDI-TOF-MS筛选激素耐药型肾病综合征患儿尿液生物标志物 被引量:2
9
作者 阳梅 刘文君 +3 位作者 郭渠莲 陈军红 施翰 黄媚贤 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期183-186,共4页
目的应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片技术筛选激素耐药型肾病综合征(SRNS)患儿尿液生物标志物。方法激素敏感型肾病综合征(SSNS)组32例,SRNS组9例,正常对照组45例,应用金芯片检测各组尿液标本。结果SRNS... 目的应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片技术筛选激素耐药型肾病综合征(SRNS)患儿尿液生物标志物。方法激素敏感型肾病综合征(SSNS)组32例,SRNS组9例,正常对照组45例,应用金芯片检测各组尿液标本。结果SRNS有差异明显的生物标志物4个,相对分子量分别为6703、7212、11820、14356,其中7212、11820、14356差异表达蛋白质在SRNS呈高表达,在SSNS呈低表达,6703差异表达蛋白质在SSNS高表达,在SRNS低表达。4个蛋白质峰[6703、7212、11820、14356质荷比(m/z)]组合构建的诊断模型鉴别SRNS和SSNS,灵敏度为88.89%,特异度93.75%。结论SELDI-TOF-MS蛋白质芯片技术是一种无创、快速、简便易行、用量少和高通量分析方法,能直接筛选出SRNS患儿尿液中的生物标志物,具有较好的临床应用价值。 展开更多
关键词 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 尿蛋白质组学 肾病综合征 尿 激素
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SELDI-TOF-MS技术检测心绞痛患者血浆蛋白指纹图谱的研究 被引量:2
10
作者 何文娟 胡豫 +4 位作者 张小平 余捷凯 洪梅 郭涛 宋善俊 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期389-391,共3页
目的:采用表面增强激光解析/电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测心绞痛患者血浆蛋白质指纹图谱,从中筛选出特异的分子标志物。方法:应用SELDI-TOF-MS技术及金属离子螯合(IMAC-3)蛋白质芯片对20例心绞痛患者和29例正常对照者血浆样... 目的:采用表面增强激光解析/电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测心绞痛患者血浆蛋白质指纹图谱,从中筛选出特异的分子标志物。方法:应用SELDI-TOF-MS技术及金属离子螯合(IMAC-3)蛋白质芯片对20例心绞痛患者和29例正常对照者血浆样本进行检测,借助生物信息学工具(非线性的支持向量机,SVM)提出心绞痛的诊断模型,并运用留一交叉验证法来评估该模型的判别效能。结果:用SELDI-TOF-MS技术筛选出由3个有显著差异的蛋白质峰[质荷比(m/z)分别为2667.3、5914.0和6890.5]组合构建的诊断模型,可将20例心绞痛患者和29例正常人全部正确分组,诊断特异性和灵敏度均为100%。结论:SELDI-TOF-MS技术在心绞痛的诊断中具有较高灵敏度和特异性,发现的蛋白质峰可能在心绞痛的发病中起一定作用,血浆中分子标志物的发现有助于心绞痛的早期诊断。 展开更多
关键词 心绞痛 表面增强激光解吸/电离飞行时间质谱 蛋白质组
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基于SELDI-TOF-MS的冷却滩羊肉微生物差异蛋白分析 被引量:2
11
作者 胡倩倩 杨波 +2 位作者 罗瑞明 尤丽琴 李子欣 《肉类研究》 北大核心 2018年第2期33-39,共7页
以托盘密封包装的冷鲜滩羊肉为研究对象,基于组合蛋白芯片与表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)平台对滩羊肉表面微生物蛋白进行分析,区... 以托盘密封包装的冷鲜滩羊肉为研究对象,基于组合蛋白芯片与表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)平台对滩羊肉表面微生物蛋白进行分析,区分不同贮藏时间生物样本之间的差异。通过正交矫正偏最小二乘法判别分析判断模型第一主成分的得分值(VIP阈值>1),并结合学生氏t检验的P值(阈值<0.05)寻找差异性表达蛋白。结果表明:应用Biomarker Wizard软件分析找出差异蛋白峰132个,其中75个差异蛋白峰可根据质荷比经Swiss-Prot数据库检索出对应的蛋白质,其余57个差异蛋白峰对应的为未知蛋白;从上述差异蛋白中未找到酶类的差异蛋白,但是找到了可能和滩羊肉菌体有关联的19个菌体蛋白。SELDI-TOF-MS技术能够用于检测冷鲜滩羊肉不同贮藏阶段基因表达的各种蛋白质,从而发现大量具有价值的蛋白质标志分子。 展开更多
关键词 滩羊肉 微生物 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 差异蛋白
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SELDI-TOF-MS筛选微小病变型肾病综合征尿液生物标志物 被引量:1
12
作者 林青 郑健 +1 位作者 陈蓉艳 艾斯 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第17期1842-1846,共5页
目的探讨应用优化的表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱(surface enhanced laser desorption/ionizationtime of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)进行微小病变型肾病综合征(minimal-changed nephrotic syndrome,MCNS)大鼠尿液... 目的探讨应用优化的表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱(surface enhanced laser desorption/ionizationtime of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)进行微小病变型肾病综合征(minimal-changed nephrotic syndrome,MCNS)大鼠尿液生物标志物筛选的意义。方法 SD大鼠30只随机分为正常对照组(n=10)、模型对照组(n=10)和强的松治疗组(n=10)。除正常对照组外,其余大鼠经尾静脉一次性注射阿霉素5.5mg/kg复制MCNS模型,造模10d后分别予以强的松和蒸馏水灌胃治疗。21d后收集大鼠尿液,经弱阳离子交换芯片CM10捕获蛋白质,应用SELDI-TOF-MS获取3组大鼠的尿液蛋白质指纹图谱,采用Biomarker wizard软件比对分析差异蛋白。结果优化实验条件后获得较理想的尿液蛋白质指纹图谱,质控峰强度的平均CV值为18.0%(7.50%~35.89%)。在模型对照组与正常对照组之间检测到不同质荷比处有33个具统计学意义的差异蛋白峰(P<0.05),其中21个蛋白表达上调,12个蛋白表达下调。在正常对照组、模型对照组与强的松治疗组之间有6个蛋白质表达存在差异(P<0.05),这些差异蛋白峰在模型对照组中高表达,而在强的松治疗组中蛋白表达下调,峰强度接近正常对照组。结论通过优化实验条件并实行质量控制,SELDI-TOF-MS可为MCNS大鼠尿液生物标志物的筛选提供一个可行的检测途径。所获得的差异性蛋白峰对MCNS的早期诊断、治疗监测和寻找药物治疗的靶目标具有重要的意义。 展开更多
关键词 表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱 微小病变型肾病综合征 尿液 生物标志物 质控
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血清SELDI蛋白质指纹图谱在乳腺癌腋淋巴结转移中的应用研究 被引量:8
13
作者 庞达 杨艳梅 +3 位作者 张国强 马玉彦 唐雅莉 龚建平 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2008年第17期1010-1014,共5页
目的:应用SELDI技术和生物信息学方法从血清中筛选乳腺癌蛋白质标志物并构建检测模型,为预测腋淋巴结(axillary lymph nodes,ALN)转移等提供可能的简便易行的方法。方法:应用SELDI-TOF-MS作为蛋白质组学摘要目的:应用SELDI技术和生物信... 目的:应用SELDI技术和生物信息学方法从血清中筛选乳腺癌蛋白质标志物并构建检测模型,为预测腋淋巴结(axillary lymph nodes,ALN)转移等提供可能的简便易行的方法。方法:应用SELDI-TOF-MS作为蛋白质组学摘要目的:应用SELDI技术和生物信息学方法从血清中筛选乳腺癌蛋白质标志物并构建检测模型,为预测腋研究平台,采用CM10芯片,对乳腺癌的血清进行了检测,探讨了乳腺癌患者血清蛋白质指纹图谱与是否发生ALN转移的关系,并结合生物信息学方法建立了相应的检测模型。结果:通过对ALN有(无)转移的乳腺癌患者血清蛋白指纹图谱数据的比较,找到了11个差异蛋白质峰(P<0.05),M/Z为M2164.16,M3269.90和M3272.31的3个蛋白质峰被选择用于构建分类决策树模型,该模型的交叉验证(测试组)总准确率为81.8%,ALN有转移的乳腺癌患者检出率为83.3%,ALN无转移的检出率为80%。结论:构建的分类决策树模型能达到区分ALN是否有转移的最佳效果,SELDI技术在确定乳腺癌患者是否发生腋淋巴结转移方面有一定的意义。 展开更多
关键词 乳腺癌 表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱 生物信息学 蛋白质组学 CM10芯片
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不同结核病患者群血清蛋白质谱分析与比较 被引量:2
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作者 黄业伦 刘玉美 +5 位作者 谭守勇 刘健雄 李昕洁 罗强生 曹翌明 刘志辉 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2012年第23期4001-4003,共3页
目的:比较分析菌阳肺结核与菌阴肺结核、肺结核与肺外结核患者的血清蛋白质谱,从蛋白质组学层面了解不同结核病患者群血清蛋白质谱的特征,为结核病诊断标志物的筛选提供指导。方法:应用表面增强激光解吸-电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS... 目的:比较分析菌阳肺结核与菌阴肺结核、肺结核与肺外结核患者的血清蛋白质谱,从蛋白质组学层面了解不同结核病患者群血清蛋白质谱的特征,为结核病诊断标志物的筛选提供指导。方法:应用表面增强激光解吸-电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片系统,采用弱阳离子交换蛋白质芯片(WCX)对54例菌阳肺结核、45例菌阴肺结核、18例肺外结核患者的血清蛋白质进行检测;应用ClinProTools分析软件依据各蛋白质的质谱峰面积计算相对强度表示该血清蛋白质的丰度,采用t检验(对Anderson-Darling检验P>0.05的正态分布者)或Wilcoxon检验(对Anderson-Darling检验P<0.05的非正态分布者)分析比较菌阳肺结核与菌阴肺结核、肺结核与肺外结核患者各血清蛋白质的平均丰度。结果:(1)在3种不同结核病患者人群中均捕获到102种相对分子质量在1011.41~9435.07的不同血清蛋白质,经Anderson-Darling检验,在菌阳肺结核、菌阴肺结核、肺外结核患者人群中分别有31、23和29种血清蛋白质呈正态分布。(2)正态分布的血清蛋白质在不同结核病患者人群间其水平未见显著差异。(3)非正态分布的血清蛋白质:在菌阳肺结核与菌阴肺结核患者人群间其水平未见显著差异;在肺结核与肺外结核患者人群间发现1个差异血清蛋白质(P=0.0251),其相对分子质量为5753.76,在肺结核与肺外结核患者人群血清中的平均丰度分别为15.42±4.86和28.29±14.08。结论:不同结核病患者群的血清蛋白质谱具有同质性,为普遍适用性结核病血清学诊断标志物的筛选提供了科学依据。 展开更多
关键词 结核 血清蛋白质 表面增强激光解吸-电离飞行时间质谱 弱阳离子交换蛋白质芯片
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基于人工神经网络的血浆蛋白质谱在卵巢癌诊断中的应用性研究 被引量:2
15
作者 王伟 储洪娟 陶国仙 《中华中医药学刊》 CAS 2010年第12期2595-2597,共3页
目的:建立应用蛋白质芯片技术检测血浆蛋白质指纹图谱的方法,探讨基于人工神经网络的血浆蛋白质指纹图谱模型在卵巢癌诊断中的应用价值。方法:应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱仪测定卵巢癌和健康人血浆标本的蛋白质指纹图谱,并结... 目的:建立应用蛋白质芯片技术检测血浆蛋白质指纹图谱的方法,探讨基于人工神经网络的血浆蛋白质指纹图谱模型在卵巢癌诊断中的应用价值。方法:应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱仪测定卵巢癌和健康人血浆标本的蛋白质指纹图谱,并结合人工神经网络进行数据分析。将160例标本随机分成训练组120例(卵巢癌40例,健康人80例)和盲法测试组40例(卵巢癌20例,健康人20例)。利用从训练组得出的基于人工神经网络的血浆蛋白质指纹图谱模型,对40例未知血浆标本进行检测,并与CA125检测结果进行比较。结果:应用该方法对卵巢癌进行诊断的敏感性和特异性分别为95%(19/20),100%(20/20),明显高于CA125检测结果。结论:基于人工神经网络的血浆蛋白质指纹图谱模型在卵巢癌的诊断中较传统方法具有更高的敏感性和特异性,值得进一步研究与应用。 展开更多
关键词 表面增强激光解析电离-飞行时间质谱 蛋白质芯片 卵巢癌
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食管癌淋巴结转移的蛋白质组学 被引量:7
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作者 冯笑山 王立东 +16 位作者 单探幽 郭涛 李吉林 范宗民 焦新英 常智慧 高社干 韩晶 宋昕 申秋 樊慧 王能超 李韶华 高珊珊 何欣 郭军辉 刘宝池 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2007年第3期397-399,共3页
目的对河南省林州地区食管癌高发区食管鳞癌患者(食管癌组)和健康人血清(对照组)蛋白质组进行比较研究,确立食管癌的蛋白质指纹诊断模型,并筛选与食管癌淋巴结转移相关的蛋白质。方法采用IMAC3芯片及表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技... 目的对河南省林州地区食管癌高发区食管鳞癌患者(食管癌组)和健康人血清(对照组)蛋白质组进行比较研究,确立食管癌的蛋白质指纹诊断模型,并筛选与食管癌淋巴结转移相关的蛋白质。方法采用IMAC3芯片及表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)检测61例食管癌患者和50例健康人血清,用Bio-MarkerWizard软件对芯片检测得到的蛋白质相对含量进行处理及方差分析。并对25例发生淋巴结转移的食管癌患者(转移组),36例无淋巴结转移患者(未转移组)与对照组进行了对比分析。结果以相对分子质量(Mr)为9439.58、6627.21、2867.65、4494.08、7762.68、6835.32、4095.947种蛋白质组建立的决策树模型,对食管癌测试的准确率、敏感度和特异度分别为85.6%、88.5%和82.0%。转移组、未转移组与对照组3组相比,有15种蛋白差异有统计学意义。其中转移组和未转移组相比有2种蛋白差异有统计学意义(Mr分别为11742.48、9294.44)。结论以上述7种蛋白质建立的诊断模型用于食管癌的诊断,具有较高灵敏度和特异度;筛选出2种与食管癌转移密切相关蛋白质,后者为进一步建立食管癌转移相关肿瘤标志物提供了重要线索。 展开更多
关键词 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术 食管肿瘤 鳞状细胞癌 淋巴结转移 蛋白质组学
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2型糖尿病视网膜病变患者的血清低分子量蛋白质指纹图谱 被引量:2
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作者 杨叶虹 鹿斌 +5 位作者 张烁 刘维薇 董雪红 宋晓艳 朱禧星 胡仁明 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期1-5,共5页
目的研究2型糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)患者特异的血清低分子量蛋白质指纹图谱。方法应用表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)技术,选用H4蛋白质芯片,优化技术参数,对16例正常人,27例2型糖尿病不伴DR患者... 目的研究2型糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)患者特异的血清低分子量蛋白质指纹图谱。方法应用表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)技术,选用H4蛋白质芯片,优化技术参数,对16例正常人,27例2型糖尿病不伴DR患者及21例2型糖尿病伴DR患者的血清标本进行检测,应用Biomarker Wizard软件筛选DR患者血清中差异表达蛋白质。结果H4芯片在激光强度210,灵敏度为9的条件下可获得较理想的图谱。在m/z2 000至20 000范围内共出现31个蛋白质/多肽峰;其中有5个差异表达蛋白质或多肽,m/z为7 440,7 639,7 839,8 147和8 925(P<0.05)。结论SELDI-TOF-MS蛋白质芯片技术是一种快速、简便和高通量分析方法,能直接筛选出DR患者血清中的潜在标记物。 展开更多
关键词 2型糖尿病 糖尿病视网膜病变 表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱 指纹图谱
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滋阴清热方对阴虚内热证型系统性红斑狼疮患者外周血单—核细胞蛋白表达谱的影响 被引量:2
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作者 程喜平 范瑞强 +4 位作者 赖梅生 陈明春 余捷凯 朱晓浚 许德清 《临床皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期11-14,共4页
目的:观察滋阴清热方对SLE阴虚内热证患者外周血单一核细胞(PBMC)蛋白表达谱的影响。方法:用滋阴清热含药血清与阴虚内热型SLE患者的PBMC共孵育,用表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)检测检测孵育后PBMC蛋白表达谱。结果... 目的:观察滋阴清热方对SLE阴虚内热证患者外周血单一核细胞(PBMC)蛋白表达谱的影响。方法:用滋阴清热含药血清与阴虚内热型SLE患者的PBMC共孵育,用表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)检测检测孵育后PBMC蛋白表达谱。结果:滋阴清热含药血清和空白对照比较,3个蛋白峰表达有统计学差异;滋阴清热含药血清和大鼠空白血清比较,1个蛋白峰表达有统计学差异。结论:滋阴清热含药血清对阴虚内热证型系统性红斑狼疮患者外周血单一核细胞蛋白表达谱的具有影响,SELDI-TOF-MS是寻找SLE患者PBMC表达差异蛋白的有效方法,结果对SLE研究具有积极意义。 展开更多
关键词 系统性红斑狼疮 蛋白表达谱 表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱 含药血清
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帕金森病相关血清蛋白质标志物的筛选及鉴定 被引量:2
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作者 周婷 刘池波 +1 位作者 徐小辉 梁海燕 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期664-669,共6页
目的:探讨并初步鉴定帕金森病患者血清中相关蛋白质作为特异标志物的可能性。方法:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)结合纳米磁珠技术检测44例帕金森病和60例健康对照的血清标本,应用生物信息学方法筛选差异蛋白峰,... 目的:探讨并初步鉴定帕金森病患者血清中相关蛋白质作为特异标志物的可能性。方法:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)结合纳米磁珠技术检测44例帕金森病和60例健康对照的血清标本,应用生物信息学方法筛选差异蛋白峰,经高效液相色谱(HPLC)分离出差异蛋白,酶解后进行液质联用串联质谱(LC-MS/MS)分析,利用Xcalibur的程序组件BioWorks 3.2完成蛋白质序列数据库鉴定分析。结果:经SELDI-TOF-MS结合纳米磁珠技术筛选出质荷比m/z位于8 937的蛋白质在帕金森病中高表达(帕金森病组表达强度为27.47±16.58,正常组表达强度为5.01±3.47),有显著差异(P<0.01);6 636和8 697的蛋白质在帕金森病中低表达(帕金森病组表达强度为5.43±2.66和20.22±9.57,正常组表达强度为18.85±7.56和51.13±26.22),有显著差异(P<0.01)。联合上述3种潜在蛋白质标志物,可区分帕金森病组和对照组,其中帕金森病患者检出率为90.0%(27/30),健康者检出率为92.5%(37/40)。对m/z为6 636、8 697和8 937的标志物进行鉴定,结果分别为载脂蛋白C-I、载脂蛋白C-III和补体成分3a。结论:鉴定出的载脂蛋白C-I、载脂蛋白C-III和补体成分3a在帕金森病的诊断中具有一定价值,值得进一步研究和探讨。 展开更多
关键词 帕金森病 蛋白质组 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 液相色谱-质谱联用串联质谱
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蛋白质指纹图谱在乳腺癌诊断与随访中的应用研究 被引量:1
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作者 胡跃 余捷凯 +2 位作者 张苏展 刘建 郑树 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期700-704,共5页
目的:应用表面加强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)和CM10蛋白质芯片检测乳腺癌患者血清蛋白质指纹图谱,筛选候选肿瘤标志物,建立、验证诊断模型并初步探讨其在术后随访监测中的价值。方法:SELDI-TOF-MS技术及CM10芯片检测63... 目的:应用表面加强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)和CM10蛋白质芯片检测乳腺癌患者血清蛋白质指纹图谱,筛选候选肿瘤标志物,建立、验证诊断模型并初步探讨其在术后随访监测中的价值。方法:SELDI-TOF-MS技术及CM10芯片检测63例乳腺癌和40例健康人的指纹图谱,ZJU-PDAS软件筛选标志物、建立模型,在另23例乳腺癌和20例健康人中盲法验证模型;并检测16份术后标本以探索其随访监测价值。结果:质荷比(m/z)为3.9kD和5.6kD的2个蛋白质峰(分别命名为BC1和BC2)构建的模型诊断乳腺癌灵敏度为87.30%(55/63)、特异度为95.00%(38/40);盲法验证灵敏度为95.65%(22/23)、特异度为85.00%(17/20);对不同病期患者具有相同诊断效力(P>0.05)。BC1手术后表达升高;BC2手术后表达降低,且复发转移组表达高于无瘤生存组(P<0.05)。结论:该方法在乳腺癌的诊断、术后随访及肿瘤标志物筛选等方面具有一定价值,值得进一步研究。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 表面增强激光解吸/电离飞行时间质谱 蛋白质组
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