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SELDI-TOF-MS筛选微小病变型肾病综合征尿液生物标志物 被引量：1
1
作者 林青 郑健 +1 位作者 陈蓉艳 艾斯 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第17期1842-1846,共5页
目的探讨应用优化的表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱(surface enhanced laser desorption/ionizationtime of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)进行微小病变型肾病综合征(minimal-changed nephrotic syndrome,MCNS)大鼠尿液... 目的探讨应用优化的表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱(surface enhanced laser desorption/ionizationtime of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)进行微小病变型肾病综合征(minimal-changed nephrotic syndrome,MCNS)大鼠尿液生物标志物筛选的意义。方法 SD大鼠30只随机分为正常对照组(n=10)、模型对照组(n=10)和强的松治疗组(n=10)。除正常对照组外,其余大鼠经尾静脉一次性注射阿霉素5.5mg/kg复制MCNS模型,造模10d后分别予以强的松和蒸馏水灌胃治疗。21d后收集大鼠尿液,经弱阳离子交换芯片CM10捕获蛋白质,应用SELDI-TOF-MS获取3组大鼠的尿液蛋白质指纹图谱,采用Biomarker wizard软件比对分析差异蛋白。结果优化实验条件后获得较理想的尿液蛋白质指纹图谱,质控峰强度的平均CV值为18.0%(7.50%～35.89%)。在模型对照组与正常对照组之间检测到不同质荷比处有33个具统计学意义的差异蛋白峰(P<0.05),其中21个蛋白表达上调,12个蛋白表达下调。在正常对照组、模型对照组与强的松治疗组之间有6个蛋白质表达存在差异(P<0.05),这些差异蛋白峰在模型对照组中高表达,而在强的松治疗组中蛋白表达下调,峰强度接近正常对照组。结论通过优化实验条件并实行质量控制,SELDI-TOF-MS可为MCNS大鼠尿液生物标志物的筛选提供一个可行的检测途径。所获得的差异性蛋白峰对MCNS的早期诊断、治疗监测和寻找药物治疗的靶目标具有重要的意义。 展开更多
关键词 表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱 微小病变型肾病综合征 尿液 生物标志物 质控
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胶质瘤脑脊液蛋白质指纹图诊断模型的建立及其在临床诊断中的应用 被引量：4
2
作者 刘建 郑树 +4 位作者 余捷凯 俞学斌 刘伟国 张建民 胡汛 《浙江大学学报（医学版）》 CAS CSCD 2005年第2期141-147,共7页
目的SELDI-TOF建立和评估区分脑胶质瘤与非脑肿瘤、脑胶质瘤与脑良性肿瘤的脑脊液蛋白指纹图诊断模型。方法收集脑胶质瘤、脑良性肿瘤和轻度脑外伤患者的脑脊液共75份,其中50份胶质瘤和非脑肿瘤脑脊液标本,随机分为训练组33份(17例胶质... 目的SELDI-TOF建立和评估区分脑胶质瘤与非脑肿瘤、脑胶质瘤与脑良性肿瘤的脑脊液蛋白指纹图诊断模型。方法收集脑胶质瘤、脑良性肿瘤和轻度脑外伤患者的脑脊液共75份,其中50份胶质瘤和非脑肿瘤脑脊液标本,随机分为训练组33份(17例胶质瘤,16例非脑肿瘤)和盲法测试组17份(5例胶质瘤,12例非脑肿瘤),检测结合在H4蛋白芯片上的蛋白质,获得脑肿瘤和非脑肿瘤的蛋白表达质谱图,用matlab操作平台的人工神经网络分析收集的数据,建立了区分脑胶质瘤与非脑肿瘤的脑脊液蛋白指纹图诊断模型。脑胶质瘤和脑良性肿瘤47份标本,随机分为训练集31份(13例胶质瘤,18例脑良性肿瘤)和盲法测试集16份(9例胶质瘤,7例脑良性肿瘤),运用同样方法分析收集的数据,建立了区分脑胶质瘤与脑良性肿瘤的蛋白指纹图诊断模型。同时运用支持向量机对上述人工神经网络的结果进行验证,二者结果非常相似。结果1建立了区分胶质瘤与非脑肿瘤的脑脊液蛋白指纹图诊断模型,盲法测试胶质瘤诊断的敏感性和特异性分别为100%和91.7%。2建立了区分胶质瘤与脑良性肿瘤的脑脊液蛋白指纹图诊断模型,盲法测试胶质瘤诊断的敏感性和特异性分别为88.9%和100%。结论研究建立的诊断模型为胶质瘤的临床诊断尤其是定性诊断提供了一条崭新的途径。 展开更多
关键词 表面加强解析/电离-飞行时间-质谱仪 神经网络(计算机) 支持向量机 诊断模型 脑肿瘤/诊断 神经胶质瘸/诊断 肿瘤标记物 生物学/脑脊液
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血清蛋白质指纹图谱结合生物信息学在大肠癌早期诊断中的应用 被引量：1
3
作者 陈益定 解磐磐 +2 位作者 余建伟 周俊 郑树 《浙江大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期470-477,共8页
目的:应用SELDI质谱仪建立大肠癌血清蛋白质指纹图谱的诊断模型。方法:测定182例血清标本(其中55例大肠癌、35例大肠腺瘤、92例健康人)的蛋白质指纹图谱,结合人工神经网络及支持向量机对这些数据进行处理,建立相应的指纹图谱诊断模型。... 目的:应用SELDI质谱仪建立大肠癌血清蛋白质指纹图谱的诊断模型。方法:测定182例血清标本(其中55例大肠癌、35例大肠腺瘤、92例健康人)的蛋白质指纹图谱,结合人工神经网络及支持向量机对这些数据进行处理,建立相应的指纹图谱诊断模型。结果:运用生物信息学方法从大肠癌与健康对照中筛选出了4个质荷比位于5 911 Da、8 922 Da、8 943 Da、8 817 Da(M/Z)峰,用它们建立的诊断模型的特异性为93.3%,敏感度为90.9%,Youden指数为0.84242。从大肠癌与大肠腺瘤中筛选出7个质荷比位于17 247 Da、18 420 Da、5 911 Da、9 294 Da、4 654 Da、21 694 Da、21 742 Da的峰值,建立模型的特异性为83.2%,敏感度为89.3%,Youden指数为0.72484。结论:该方法在大肠癌的诊断中较传统方法具有更高的敏感性和特异性。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤/诊断 肿瘤标记物 生物学/血液 表面加强解析/电离-飞行时间-质谱仪 神经网络(计算机) 诊断模型
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色谱纯化和质谱分析法研究牛骨源咸味肽 被引量：9
4
作者 李迎楠 刘文营 +1 位作者 张顺亮 成晓瑜 《肉类研究》 北大核心 2016年第3期25-28,共4页
以牛骨为研究对象,通过中空纤维超滤装置、Sephadex G-25凝胶色谱柱对相对分子质量小于5 000的酶解产物进行初步分离,选用制备型及分析型高效液相色谱分析仪对咸味肽进行纯化、收集及分析。结果表明:收集得到牛骨源咸味肽为单一组分;用... 以牛骨为研究对象,通过中空纤维超滤装置、Sephadex G-25凝胶色谱柱对相对分子质量小于5 000的酶解产物进行初步分离,选用制备型及分析型高效液相色谱分析仪对咸味肽进行纯化、收集及分析。结果表明:收集得到牛骨源咸味肽为单一组分;用基质辅助激光解析电离-飞行时间质谱仪对咸味肽进行分析,得到其为相对分子质量均小于1 000的短肽,其呈现咸味的物质质荷比值可能为679.510 9。 展开更多
关键词 咸味肽 凝胶色谱 高效液相色谱 基质辅助激光解析电离-飞行时间质谱仪
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2型糖尿病视网膜病变患者的血清低分子量蛋白质指纹图谱 被引量：2
5
作者 杨叶虹 鹿斌 +5 位作者 张烁 刘维薇 董雪红 宋晓艳 朱禧星 胡仁明 《复旦学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期1-5,共5页
目的研究2型糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)患者特异的血清低分子量蛋白质指纹图谱。方法应用表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)技术,选用H4蛋白质芯片,优化技术参数,对16例正常人,27例2型糖尿病不伴DR患者... 目的研究2型糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)患者特异的血清低分子量蛋白质指纹图谱。方法应用表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)技术,选用H4蛋白质芯片,优化技术参数,对16例正常人,27例2型糖尿病不伴DR患者及21例2型糖尿病伴DR患者的血清标本进行检测,应用Biomarker Wizard软件筛选DR患者血清中差异表达蛋白质。结果H4芯片在激光强度210,灵敏度为9的条件下可获得较理想的图谱。在m/z2 000至20 000范围内共出现31个蛋白质/多肽峰;其中有5个差异表达蛋白质或多肽,m/z为7 440,7 639,7 839,8 147和8 925(P<0.05)。结论SELDI-TOF-MS蛋白质芯片技术是一种快速、简便和高通量分析方法,能直接筛选出DR患者血清中的潜在标记物。 展开更多
关键词 2型糖尿病 糖尿病视网膜病变 表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱 指纹图谱
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滋阴清热方对阴虚内热证型系统性红斑狼疮患者外周血单—核细胞蛋白表达谱的影响 被引量：2
6
作者 程喜平 范瑞强 +4 位作者 赖梅生 陈明春 余捷凯 朱晓浚 许德清 《临床皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期11-14,共4页
目的:观察滋阴清热方对SLE阴虚内热证患者外周血单一核细胞(PBMC)蛋白表达谱的影响。方法:用滋阴清热含药血清与阴虚内热型SLE患者的PBMC共孵育,用表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)检测检测孵育后PBMC蛋白表达谱。结果... 目的:观察滋阴清热方对SLE阴虚内热证患者外周血单一核细胞(PBMC)蛋白表达谱的影响。方法:用滋阴清热含药血清与阴虚内热型SLE患者的PBMC共孵育,用表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)检测检测孵育后PBMC蛋白表达谱。结果:滋阴清热含药血清和空白对照比较,3个蛋白峰表达有统计学差异;滋阴清热含药血清和大鼠空白血清比较,1个蛋白峰表达有统计学差异。结论:滋阴清热含药血清对阴虚内热证型系统性红斑狼疮患者外周血单一核细胞蛋白表达谱的具有影响,SELDI-TOF-MS是寻找SLE患者PBMC表达差异蛋白的有效方法,结果对SLE研究具有积极意义。 展开更多
关键词 系统性红斑狼疮 蛋白表达谱 表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱 含药血清
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基于人工神经网络的血浆蛋白质谱在卵巢癌诊断中的应用性研究 被引量：2
7
作者 王伟 储洪娟 陶国仙 《中华中医药学刊》 CAS 2010年第12期2595-2597,共3页
目的:建立应用蛋白质芯片技术检测血浆蛋白质指纹图谱的方法,探讨基于人工神经网络的血浆蛋白质指纹图谱模型在卵巢癌诊断中的应用价值。方法:应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱仪测定卵巢癌和健康人血浆标本的蛋白质指纹图谱,并结... 目的:建立应用蛋白质芯片技术检测血浆蛋白质指纹图谱的方法,探讨基于人工神经网络的血浆蛋白质指纹图谱模型在卵巢癌诊断中的应用价值。方法:应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱仪测定卵巢癌和健康人血浆标本的蛋白质指纹图谱,并结合人工神经网络进行数据分析。将160例标本随机分成训练组120例(卵巢癌40例,健康人80例)和盲法测试组40例(卵巢癌20例,健康人20例)。利用从训练组得出的基于人工神经网络的血浆蛋白质指纹图谱模型,对40例未知血浆标本进行检测,并与CA125检测结果进行比较。结果:应用该方法对卵巢癌进行诊断的敏感性和特异性分别为95%(19/20),100%(20/20),明显高于CA125检测结果。结论:基于人工神经网络的血浆蛋白质指纹图谱模型在卵巢癌的诊断中较传统方法具有更高的敏感性和特异性,值得进一步研究与应用。 展开更多
关键词 表面增强激光解析电离-飞行时间质谱 蛋白质芯片 卵巢癌
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4种蛋白质／多肽在结核病患者与健康人血清中的表达和意义
8
作者 刘志辉 刘玉美 +6 位作者 孟繁荣 谢贝 王楠 邓晓华 吴玲 张言斌 谭守勇 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2014年第23期3769-3771,共3页
目的:评价质荷比(m/z)分别为1 060、1 944、2 081和3 954的4种血清蛋白质/多肽(以下分别用A、B、C和D表示)区分结核病患者与健康人的能力。方法:应用表面增强激光解析-电离飞行时间质谱技术检测57例结核病患者和30例健康人的血清蛋白质... 目的:评价质荷比(m/z)分别为1 060、1 944、2 081和3 954的4种血清蛋白质/多肽(以下分别用A、B、C和D表示)区分结核病患者与健康人的能力。方法:应用表面增强激光解析-电离飞行时间质谱技术检测57例结核病患者和30例健康人的血清蛋白质谱,分析其A、B、C、D中的表达水平(用相对强度表示)并比较其差异,并应用诊断性试验评价方法分析其区分结核病患者群与健康人群的能力。结果:(1)A、B、C、D在结核病患者和健康人中的表达水平分别为1±11、1 597±3 102、460±765、1 208±1 003和123±201、47±98、36±93、397±355,两者差异显著。(2)以A、B、C、D血清表达水平为指标判定结核病患者和健康人的ROC曲线下面积分别为0.644、0.848、0.735和0.810,分界值分别为≤166、≥318、≥48和≥728。结论:B、C和D 3种血清蛋白质/多肽具有较好的区分结核病患者与健康人的能力,有望作为新型结核病诊断候选标志物。 展开更多
关键词 结核病 蛋白质/多肽 诊断性试验评价 表面增强激光解析-电离飞行时间质谱 (SELDI-TOF-MS)
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由质谱分析数据建立肝癌病人与健康人血清的分类模型 被引量：1
9
作者 徐琨 朱尔一 +1 位作者 杨芃原 刘银坤 《质谱学报》 EI CAS CSCD 2008年第5期268-273,共6页
通过对质谱数据处理和分析,建立肝细胞癌(HCC)病人与健康人的分类模型,可以用来判别样本是否来源于肝癌病人。运用表面加强激光解析电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)获取肝癌病人和健康人血清蛋白指纹图谱数据,并运用偏最小二乘(PLS)变... 通过对质谱数据处理和分析,建立肝细胞癌(HCC)病人与健康人的分类模型,可以用来判别样本是否来源于肝癌病人。运用表面加强激光解析电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)获取肝癌病人和健康人血清蛋白指纹图谱数据,并运用偏最小二乘(PLS)变量筛选法建立分类模型,最终得到分类模型的交叉检验相关系数达0.96以上,判别准确率大大提高。同时对模型进行分析,找出对肝癌病人和健康人的差异有重要影响的因素或变量。这些变量为30个质荷比区间内特定蛋白的峰强度值,反映这些质荷比区间内蛋白量的增加或减少与肝癌的形成有密切关系,可作为重要的生物标志物进一步加以研究。并且采用所得模型的拟合值等一些信息做分类图,能较好地表达回归模型的分类效果。 展开更多
关键词 肝细胞癌 表面加强激光解析电离-飞行时间质谱 偏最小二乘变量筛选 分类模型 海量数据建模
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