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小麦盐应答基因TaSR1的生物信息学鉴定及表达验证
被引量：
2
1
作者
白子彧
丁博
+5 位作者
李杨
陈小强
李迎霞
杜亚军
郭雨
谢晓东
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期307-311,共5页
为发掘小麦盐应答相关基因,利用Genevestigator在线生物信息学程序,分析了25个试验中118个样品的盐胁迫试验的转录组数据,筛选到2个盐应答候选基因。以中国春小麦为试验材料,将其三叶一心期幼苗根系置于200mmol·L^(-1)的NaCl溶液中...
为发掘小麦盐应答相关基因,利用Genevestigator在线生物信息学程序,分析了25个试验中118个样品的盐胁迫试验的转录组数据,筛选到2个盐应答候选基因。以中国春小麦为试验材料,将其三叶一心期幼苗根系置于200mmol·L^(-1)的NaCl溶液中,分别处理0、0.5、1、2、4和8h,分析候选基因的表达模式。结果表明,其中1个候选基因的表达模式与生物信息学分析结果相近,受盐胁迫诱导明显上调表达,命名为TaSR1。该基因编码区含有948个核苷酸,编码315个氨基酸。TaSR1蛋白含有KRTAP和PHA01732两个保守结构域,富含脯氨酸残基。
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关键词
小麦
生物信息学
盐应答基因
表达验证
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职称材料
题名
小麦盐应答基因TaSR1的生物信息学鉴定及表达验证
被引量：
2
1
作者
白子彧
丁博
李杨
陈小强
李迎霞
杜亚军
郭雨
谢晓东
机构
天津农学院农学与资源环境学院
出处
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期307-311,共5页
基金
国家大学生创新创业训练计划项目(201410061004
201510061047)
+1 种基金
天津市131创新型人才团队计划项目
天津市高校学科领军人才培养计划项目
文摘
为发掘小麦盐应答相关基因,利用Genevestigator在线生物信息学程序,分析了25个试验中118个样品的盐胁迫试验的转录组数据,筛选到2个盐应答候选基因。以中国春小麦为试验材料,将其三叶一心期幼苗根系置于200mmol·L^(-1)的NaCl溶液中,分别处理0、0.5、1、2、4和8h,分析候选基因的表达模式。结果表明,其中1个候选基因的表达模式与生物信息学分析结果相近,受盐胁迫诱导明显上调表达,命名为TaSR1。该基因编码区含有948个核苷酸,编码315个氨基酸。TaSR1蛋白含有KRTAP和PHA01732两个保守结构域,富含脯氨酸残基。
关键词
小麦
生物信息学
盐应答基因
表达验证
Keywords
Wheat
Bioinformatics
Salt-responsive gene
Expression validation
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
S330 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小麦盐应答基因TaSR1的生物信息学鉴定及表达验证
白子彧
丁博
李杨
陈小强
李迎霞
杜亚军
郭雨
谢晓东
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
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