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根据基因表达谱与基因功能模块研究大鼠抑郁症发病的分子机制
1
作者
杨达
钟国才
+7 位作者
李崇前
吕莹丽
张敏
王栋
王海敏
李强
郝晓峰
郭政
《高技术通讯》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期529-534,共6页
用Willner法构造大鼠抑郁症模型,由基因芯片检测8例模型和8例正常大鼠的基因表达谱,识别差异表达基因,寻找差异表达基因功能模块并构建基因表达相关网络,研究大鼠抑郁症模型的分子病理机制。在基因本体（GO）功能体系中寻找显著富集差...
用Willner法构造大鼠抑郁症模型,由基因芯片检测8例模型和8例正常大鼠的基因表达谱,识别差异表达基因,寻找差异表达基因功能模块并构建基因表达相关网络,研究大鼠抑郁症模型的分子病理机制。在基因本体（GO）功能体系中寻找显著富集差异表达基因的疾病相关功能模块,提取疾病相关功能模块中的基因构造表达相关网络,从中选择显著多地与其它基因共表达的基因定义为HUB基因,并进一步研究其与疾病的关系。筛选得到207个差异表达基因及13个差异表达基因功能模块,主要涉及神经肽激素活性、信号传导通路、核糖体生成以及蛋白质转运与降解。在共表达相关网络中进一步识别了4个差异表达的HUB基因。利用基因功能模块和表达相关网络研究疾病机制的结果显示,抑郁症的发病可能涉及单胺递质的释放、信号传导以及神经肽激素调节等通路协同作用。
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关键词
抑郁症
基因本体
基因
表达
谱
功能模块
表达相关网络
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职称材料
题名
根据基因表达谱与基因功能模块研究大鼠抑郁症发病的分子机制
1
作者
杨达
钟国才
李崇前
吕莹丽
张敏
王栋
王海敏
李强
郝晓峰
郭政
机构
哈尔滨医科大学生物信息学系
成都康弘集团博士后工作站
同济大学生命科学与技术学院
出处
《高技术通讯》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期529-534,共6页
基金
国家自然科学基金（30370388.30670539）.863计划（2002AA-222052）和哈医大211工程“十五”建设项目资助.
文摘
用Willner法构造大鼠抑郁症模型,由基因芯片检测8例模型和8例正常大鼠的基因表达谱,识别差异表达基因,寻找差异表达基因功能模块并构建基因表达相关网络,研究大鼠抑郁症模型的分子病理机制。在基因本体（GO）功能体系中寻找显著富集差异表达基因的疾病相关功能模块,提取疾病相关功能模块中的基因构造表达相关网络,从中选择显著多地与其它基因共表达的基因定义为HUB基因,并进一步研究其与疾病的关系。筛选得到207个差异表达基因及13个差异表达基因功能模块,主要涉及神经肽激素活性、信号传导通路、核糖体生成以及蛋白质转运与降解。在共表达相关网络中进一步识别了4个差异表达的HUB基因。利用基因功能模块和表达相关网络研究疾病机制的结果显示,抑郁症的发病可能涉及单胺递质的释放、信号传导以及神经肽激素调节等通路协同作用。
关键词
抑郁症
基因本体
基因
表达
谱
功能模块
表达相关网络
Keywords
depression, gene ontology, gene expression profile, functional module, co-expression network
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
根据基因表达谱与基因功能模块研究大鼠抑郁症发病的分子机制
杨达
钟国才
李崇前
吕莹丽
张敏
王栋
王海敏
李强
郝晓峰
郭政
《高技术通讯》
CAS
CSCD
北大核心
2007
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