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朱砂叶螨几丁质脱乙酰基酶TecCDA5基因克隆及表达特征分析
被引量:
1
1
作者
宋莉红
丁超
+1 位作者
陈研
卜春亚
《北京农学院学报》
2021年第4期7-13,共7页
【目的】探明朱砂叶螨几丁质脱乙酰基酶家族的功能。【方法】克隆基因TecCDA5a、TecCDA5b、TecCDA5c,并运用实时荧光定量PCR技术进行表达特征的分析。【结果】克隆几丁质脱乙酰基酶基因TecCDA5a、TecCDA5b、TecCDA5c(GenBank:MK813905、...
【目的】探明朱砂叶螨几丁质脱乙酰基酶家族的功能。【方法】克隆基因TecCDA5a、TecCDA5b、TecCDA5c,并运用实时荧光定量PCR技术进行表达特征的分析。【结果】克隆几丁质脱乙酰基酶基因TecCDA5a、TecCDA5b、TecCDA5c(GenBank:MK813905、MN852245.1、MK813906);TecCDA5的最高表达水平是在成螨期,而最低的表达水平是在幼螨期,呈现先跌后升的趋势;同源性比较和发育树分析证实,TecCDA5属于几丁质脱乙酰基酶GroupⅣ。【结论】获得朱砂叶螨TecCDA5s,明确了其在螨不同发育时期差异性表达特征,为以CDA为靶标设计新型dsRNA杀螨剂提供依据。
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关键词
朱砂叶螨
几丁质脱乙酰基酶
基因克隆
表达特征分析
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职称材料
空心莲子草ApCAT基因家族鉴定和表达模式
2
作者
韩晓文
韩硕
+4 位作者
胡义锋
王梦如
陈中义
朱永兴
尹军良
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期2889-2901,共13页
过氧化氢酶(CAT)是可清除生物体内多余的过氧化氢(H_(2)O_(2))并将其还原成水和氧气的氧化还原酶,在植物响应胁迫的过程中发挥多种功能,保护植物细胞免受活性氧毒害。目前,尚缺乏对空心莲子草(Alternanthera philoxeroides)CAT基因家族...
过氧化氢酶(CAT)是可清除生物体内多余的过氧化氢(H_(2)O_(2))并将其还原成水和氧气的氧化还原酶,在植物响应胁迫的过程中发挥多种功能,保护植物细胞免受活性氧毒害。目前,尚缺乏对空心莲子草(Alternanthera philoxeroides)CAT基因家族成员的系统研究。本研究通过生物信息学分析,从空心莲子草中鉴定到20个ApCAT基因,根据系统发育关系将其依次命名为ApCAT1至ApCAT20。特征分析表明,所有ApCATs均为亲水性蛋白。亚细胞定位预测发现,所有ApCATs均预测定位于过氧化物酶体,个别ApCATs也预测有定位线粒体、叶绿体和细胞核的可能。表达模式分析表明,ApCAT成员受纬度、海拔、温度、光照、水分条件等的影响较小,表达水平相对稳定。除草剂药效测试发现,20%氯氟吡氧乙酸和13%噁草酮的防治效果最好;结合定量PCR分析发现,ApCAT家族成员在空心莲子草响应除草剂处理过程中显著差异表达,参与对除草剂胁迫的应答过程。本研究系统分析了ApCATs家族成员的基本特征和表达模式,揭示了其除草剂诱导表达特征,为进一步研究ApCATs在空心莲子草响应除草剂胁迫中的生物学功能奠定了基础。
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关键词
过氧化氢酶
生物信息学
转录组
表达特征分析
除草剂
活性氧
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职称材料
题名
朱砂叶螨几丁质脱乙酰基酶TecCDA5基因克隆及表达特征分析
被引量:
1
1
作者
宋莉红
丁超
陈研
卜春亚
机构
北京农学院生物与资源环境学院/农业农村部华北都市农业重点实验室
出处
《北京农学院学报》
2021年第4期7-13,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(31670648)
北京市自然科学基金资助项目(6162004)。
文摘
【目的】探明朱砂叶螨几丁质脱乙酰基酶家族的功能。【方法】克隆基因TecCDA5a、TecCDA5b、TecCDA5c,并运用实时荧光定量PCR技术进行表达特征的分析。【结果】克隆几丁质脱乙酰基酶基因TecCDA5a、TecCDA5b、TecCDA5c(GenBank:MK813905、MN852245.1、MK813906);TecCDA5的最高表达水平是在成螨期,而最低的表达水平是在幼螨期,呈现先跌后升的趋势;同源性比较和发育树分析证实,TecCDA5属于几丁质脱乙酰基酶GroupⅣ。【结论】获得朱砂叶螨TecCDA5s,明确了其在螨不同发育时期差异性表达特征,为以CDA为靶标设计新型dsRNA杀螨剂提供依据。
关键词
朱砂叶螨
几丁质脱乙酰基酶
基因克隆
表达特征分析
Keywords
Tetranychus cinnabarinus
chitin deacetylase
gene cloning
expression profile analysis
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
S433.7 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
空心莲子草ApCAT基因家族鉴定和表达模式
2
作者
韩晓文
韩硕
胡义锋
王梦如
陈中义
朱永兴
尹军良
机构
长江大学湿地生态与农业利用教育部工程研究中心/长江大学农学院/长江大学园艺园林学院
中南民族大学生命科学学院
出处
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期2889-2901,共13页
基金
长江大学湿地生态与农业利用教育部工程研究中心开放基金项目(KFT202305、KF201909)。
文摘
过氧化氢酶(CAT)是可清除生物体内多余的过氧化氢(H_(2)O_(2))并将其还原成水和氧气的氧化还原酶,在植物响应胁迫的过程中发挥多种功能,保护植物细胞免受活性氧毒害。目前,尚缺乏对空心莲子草(Alternanthera philoxeroides)CAT基因家族成员的系统研究。本研究通过生物信息学分析,从空心莲子草中鉴定到20个ApCAT基因,根据系统发育关系将其依次命名为ApCAT1至ApCAT20。特征分析表明,所有ApCATs均为亲水性蛋白。亚细胞定位预测发现,所有ApCATs均预测定位于过氧化物酶体,个别ApCATs也预测有定位线粒体、叶绿体和细胞核的可能。表达模式分析表明,ApCAT成员受纬度、海拔、温度、光照、水分条件等的影响较小,表达水平相对稳定。除草剂药效测试发现,20%氯氟吡氧乙酸和13%噁草酮的防治效果最好;结合定量PCR分析发现,ApCAT家族成员在空心莲子草响应除草剂处理过程中显著差异表达,参与对除草剂胁迫的应答过程。本研究系统分析了ApCATs家族成员的基本特征和表达模式,揭示了其除草剂诱导表达特征,为进一步研究ApCATs在空心莲子草响应除草剂胁迫中的生物学功能奠定了基础。
关键词
过氧化氢酶
生物信息学
转录组
表达特征分析
除草剂
活性氧
Keywords
catalase
bioinformatics
transcriptome
expression feature analysis
herbicides
reactive oxygen species
分类号
S451 [农业科学—植物保护]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
朱砂叶螨几丁质脱乙酰基酶TecCDA5基因克隆及表达特征分析
宋莉红
丁超
陈研
卜春亚
《北京农学院学报》
2021
1
在线阅读
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职称材料
2
空心莲子草ApCAT基因家族鉴定和表达模式
韩晓文
韩硕
胡义锋
王梦如
陈中义
朱永兴
尹军良
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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职称材料
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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