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锥栗优良无性系遗传多样性的EST⁃SSR分析被引量：2: 1; 作者杨金辉王一帆 +3 位作者李颖林江锡兵陈辉李煜《森林与环境学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期484-491,共8页; 为促进锥栗新品种的选育、种质资源的鉴定和锥栗产业的健康发展,以福建省建瓯市栽培的22个锥栗优良无性系为研究对象,利用开发的6对多态性表达序列标签-简单重复序列(EST⁃SSR)引物对其遗传多样性进行研究,并构建指纹图谱。结果表明,22... 展开更多; 关键词锥栗表达序列标签-简单重复序列无性系遗传多样性指纹图谱; 在线阅读下载PDF 职称材料

梅花鹿生茸区骨膜细胞基因片段测序分析: 2; 作者鲁晓萍孙红梅 +3 位作者褚文辉王大涛赵海平李春义《特产研究》 2013年第1期3-6,共4页; 在已经构建的梅花鹿生茸区骨膜细胞cDNA表达文库的基础上对文库中的噬菌斑进行随机挑取筛选,对筛选出来的噬菌斑进行质粒亚克隆、鉴定及表达序列标签序列测定和生物信息学分析。通过随机筛选及生物信息学分析的方法发现,在梅花鹿生茸区... 展开更多; 关键词鹿茸生茸区骨膜表达序列标签序列 CDNA文库基因克隆; 在线阅读下载PDF 职称材料

翘嘴鳜EST-SSR标记的开发及3个群体遗传多态性分析被引量：11: 3; 作者朱滔梁旭方 +2 位作者彭敏燕于海静皮达峰《暨南大学学报（自然科学与医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期347-352,共6页; 为保护野生翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)的种质资源以及遗传育种,本研究从翘嘴鳜的EST文库中开发微卫星并筛选出22对具有多态性的微卫星标记,对来自陆水水库(赤壁)和沅江流域(常德、怀化)的3个野生群体进行了遗传多样性分析.实验结果显示... 展开更多; 关键词翘嘴鳜表达序列标签一简单重复序列(EST-SSRs) 遗传多态性野生群体; 在线阅读下载PDF 职称材料

鹰嘴豆EST资源中SSR的信息分析被引量：2: 4; 作者王显生贾钰莹 +6 位作者顾汉艳何小玲张桦张巨松石书兵李建贵麻浩《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期137-141,共5页; 从NCBI公共数据库下载获得27904条鹰嘴豆表达序列标签EST,去除其中低质量的和冗余序列后得到全长为6198092bp的11224条无冗余EST.利用SSRIT(Simple sequence repeat identification tool)软件共在这些序列中发掘出982个SSR,它们分布于86... 展开更多; 关键词鹰嘴豆表达序列标签-简单重复序列频率特性; 在线阅读下载PDF 职称材料

华仁杏EST-SSR标记引物设计与开发被引量：2: 5; 作者秦玥傅大立 +4 位作者吴硕刘梦培朱高浦赵罕马履一《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期517-520,共4页; 随着生物科技的进步,ESTs(表达序列标签)已经成为开发SSR(简单重复序列)标记的重要资源。本文利用NCBI公共数据库下载蔷薇科EST序列22 458条,使用SSRHunter1.3软件进行了SSR搜索,从中获得22 527条SSR,应用Primer5.0软件设计并经由Oligo... 展开更多; 关键词华仁杏 EST序列(表达序列标签) SSR(简单重复序列)分子标记; 在线阅读下载PDF 职称材料

mRNA可变剪接问题的并行化研究: 6; 作者牛北方郎显宇 +1 位作者陆忠华迟学斌《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2008年第3期705-708,共4页; 对mRNA可变剪接问题进行了并行化分析和研究,解决了原AltSplice程序中Nbest参数选取欠合理的问题,结合实验实现了基于MPI平台的并行AltSplice版本MPI_AltSplice,并在5万亿次的联想深腾6800高性能计算机上获得了较好的运行性能。; 关键词可变剪接 AltSplice 并行化表达序列标签(EST)序列库消息传送接口; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于EST-SSR标记的MCID法鉴定冬瓜种质资源被引量：10: 7; 作者叶新如刘建汀 +2 位作者李永平朱海生温庆放《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期780-788,共9页; 种质资源鉴定是研究与利用冬瓜种质资源的基础。为了明确冬瓜种质资源遗传多样性,本研究基于表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)分子标记的人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法鉴定40份冬瓜种质资源。利用筛选出的7对引物对冬瓜种质资源进... 展开更多; 关键词冬瓜表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR) 人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法多态性; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名锥栗优良无性系遗传多样性的EST⁃SSR分析被引量：2: 1; 作者杨金辉王一帆李颖林江锡兵陈辉李煜; 机构福建农林大学林学院中国林业科学研究院亚热带林业研究所; 出处《森林与环境学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期484-491,共8页; 基金福建农林大学林学高峰学科建设项目(72202200205) 福建农林大学科技创新专项基金项目“锥栗疫病抗性的多群体遗传解析与分子标记辅助选择”(KFB23048)。; 文摘为促进锥栗新品种的选育、种质资源的鉴定和锥栗产业的健康发展,以福建省建瓯市栽培的22个锥栗优良无性系为研究对象,利用开发的6对多态性表达序列标签-简单重复序列(EST⁃SSR)引物对其遗传多样性进行研究,并构建指纹图谱。结果表明,22个锥栗无性系平均每对引物的等位基因数为2.667,平均有效等位基因数为2.038,平均观测杂合度为0.349,平均期望杂合度为0.447,平均Shannon信息指数为0.721,平均多态性位点数为11.500,平均多态性信息含量为0.434,表明锥栗无性系遗传多样性较高。遗传相似系数变化范围为0.754~1.000,平均值为0.856;在遗传相似性系数为0.860处,可将其划分为5个大类:第Ⅰ类仅包括HL19;第Ⅱ类包括HL5、HL6、HL8、HL21;第Ⅲ类包括HL17、HL18;第Ⅳ类包括HL12、HL13;第Ⅴ类包括HL1、HL2、HL3、HL4、HL7、HL9、HL10、HL11、HL14、HL15、HL16、HL20、HL22。利用3对多态性引物,共构建了22个锥栗无性系的指纹图谱。; 关键词锥栗表达序列标签-简单重复序列无性系遗传多样性指纹图谱; Keywords Castanea henryi EST⁃SSR clones genetic diversity fingerprint mapping; 分类号 S792.17 [农业科学—林木遗传育种]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名梅花鹿生茸区骨膜细胞基因片段测序分析: 2; 作者鲁晓萍孙红梅褚文辉王大涛赵海平李春义; 机构中国农业科学院特产研究所吉林省特种经济动物分子生物学省部共建国家重点实验室; 出处《特产研究》 2013年第1期3-6,共4页; 基金 973前期研究专项(2011CB111515) 国家自然科学基金(31070878) 吉林省自然科学基金(20101575); 文摘在已经构建的梅花鹿生茸区骨膜细胞cDNA表达文库的基础上对文库中的噬菌斑进行随机挑取筛选,对筛选出来的噬菌斑进行质粒亚克隆、鉴定及表达序列标签序列测定和生物信息学分析。通过随机筛选及生物信息学分析的方法发现,在梅花鹿生茸区骨膜细胞中有特殊意义的基因或者基因片段。随机挑选表达频率比较高的11个基因片段中有6个基因片段具有重要意义,对这6个基因片段进行了生物信息学分析,为进一步的鹿茸生物学研究打下了基础。; 关键词鹿茸生茸区骨膜表达序列标签序列 CDNA文库基因克隆; Keywords deer antler antlerogenic periosteum ESY sequences cDNA library gene clone; 分类号 Q785 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名翘嘴鳜EST-SSR标记的开发及3个群体遗传多态性分析被引量：11: 3; 作者朱滔梁旭方彭敏燕于海静皮达峰; 机构暨南大学生命科学技术学院生物工程学系; 出处《暨南大学学报（自然科学与医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期347-352,共6页; 基金广东省海洋渔业科技推广专项项目(A200899D02) 淡水健康养殖技术研究与集成示范项目(2012BAD25B00); 文摘为保护野生翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)的种质资源以及遗传育种,本研究从翘嘴鳜的EST文库中开发微卫星并筛选出22对具有多态性的微卫星标记,对来自陆水水库(赤壁)和沅江流域(常德、怀化)的3个野生群体进行了遗传多样性分析.实验结果显示,这些标记在3个群体中均表现出了丰富的多态性;共检测到134个等位基因;各基因座观测等位基因数4～8个;平均等位基因数为6.090 1;观测杂合度0.675 4;期望杂合度0.748 7;多态信息含量0.701 0,表明3个翘嘴鳜群体在各检测位点中具有较好多态性.对数据进行F-检测,平均Fst值为0.038 3,说明群体间的遗传分化程度低;而群体遗传相似度和遗传距离的计算结果显示:常德和怀化群体的遗传相似度最大,遗传距离最小;而常德与赤壁群体的遗传相似度最小,遗传距离最大.这恰恰与翘嘴鳜群体的流域分布一致.; 关键词翘嘴鳜表达序列标签一简单重复序列(EST-SSRs) 遗传多态性野生群体; Keywords Siniperca chuatsi EST-SSRs genetic polymorphism nature population; 分类号 Q786 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名鹰嘴豆EST资源中SSR的信息分析被引量：2: 4; 作者王显生贾钰莹顾汉艳何小玲张桦张巨松石书兵李建贵麻浩; 机构南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室新疆农业大学农业生物技术重点实验室; 出处《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期137-141,共5页; 基金国家科技支撑计划项目(2006BAD09A04 2006BAD09A08 +4 种基金 2007BAC15B06) 科技支疆项目(200991254); 文摘从NCBI公共数据库下载获得27904条鹰嘴豆表达序列标签EST,去除其中低质量的和冗余序列后得到全长为6198092bp的11224条无冗余EST.利用SSRIT(Simple sequence repeat identification tool)软件共在这些序列中发掘出982个SSR,它们分布于865条EST中,出现频率为8.69%,平均长度为15.58bp,平均距离为6.31kb.在鹰嘴豆EST-SSR中,二核苷酸重复是最主要的重复类型(66.90%),其次是三核苷酸重复类型(30.75%),出现最多的重复基元类型是TA/AT(24.95%).; 关键词鹰嘴豆表达序列标签-简单重复序列频率特性; Keywords chickpea EST-SSR frequency characteristics; 分类号 S529.024 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名华仁杏EST-SSR标记引物设计与开发被引量：2: 5; 作者秦玥傅大立吴硕刘梦培朱高浦赵罕马履一; 机构中国林科院经济林研究开发中心北京林业大学; 出处《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期517-520,共4页; 基金国家林业局948项目(2011-4-37) 河南省重点攻关项目(92102110037); 文摘随着生物科技的进步,ESTs(表达序列标签)已经成为开发SSR(简单重复序列)标记的重要资源。本文利用NCBI公共数据库下载蔷薇科EST序列22 458条,使用SSRHunter1.3软件进行了SSR搜索,从中获得22 527条SSR,应用Primer5.0软件设计并经由Oligo7.0软件检测,共得到61对EST-SSR引物。利用这些引物对8个华仁杏品种进行了PCR扩增及检测,得到10对能产生清晰多态性条带的EST-SSR标记,标明了10对引物的序列,为进一步开展华仁杏SSR分子标记辅助育种研究奠定了基础。; 关键词华仁杏 EST序列(表达序列标签) SSR(简单重复序列)分子标记; Keywords Armeniaca cathayana EST（expressed sequence tag） SSR（simple sequence repeat）; 分类号 S662.2 [农业科学—果树学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名mRNA可变剪接问题的并行化研究: 6; 作者牛北方郎显宇陆忠华迟学斌; 机构中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心; 出处《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2008年第3期705-708,共4页; 基金国家“863”计划资助项目(2002AA104540) 国家自然科学基金资助项目(60533020) 国家科技部资助项目(2005DKA64002); 文摘对mRNA可变剪接问题进行了并行化分析和研究,解决了原AltSplice程序中Nbest参数选取欠合理的问题,结合实验实现了基于MPI平台的并行AltSplice版本MPI_AltSplice,并在5万亿次的联想深腾6800高性能计算机上获得了较好的运行性能。; 关键词可变剪接 AltSplice 并行化表达序列标签(EST)序列库消息传送接口; Keywords alternative splicing AhSplice parallelization EST（ expressed sequence tag） sequences data set MPI（ message passing interface）; 分类号 TP311.52 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于EST-SSR标记的MCID法鉴定冬瓜种质资源被引量：10: 7; 作者叶新如刘建汀李永平朱海生温庆放; 机构福建省蔬菜遗传育种重点实验室福建省农业科学院作物研究所/福建省农业科学院蔬菜研究中心; 出处《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期780-788,共9页; 基金福建省属公益类科研院所基本科研专项(2018R1026-2) 福建省农业科学院科技创新团队建设项目(STIT2017-1-2) +1 种基金国家特色蔬菜产业技术体系福州综合试验站(GARS-24-G-07)。; 文摘种质资源鉴定是研究与利用冬瓜种质资源的基础。为了明确冬瓜种质资源遗传多样性,本研究基于表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)分子标记的人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法鉴定40份冬瓜种质资源。利用筛选出的7对引物对冬瓜种质资源进行PCR扩增,应用MCID法构建冬瓜品种鉴定图。结果表明,利用7对引物扩增的特征性谱带能够将冬瓜品种在分子水平上区分开,同时能够构建40份冬瓜种质资源的品种鉴定图。利用Ntsys2.10e软件进行聚类分析,在遗传相似系数0.77处,将冬瓜资源分为3个类群。品种鉴定图能够快速地找到区分品种的引物,比聚类图更加直观。基于EST-SSR标记的MCID法是一种有效的冬瓜资源鉴定方法。本研究对冬瓜资源鉴定具有重要意义。; 关键词冬瓜表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR) 人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法多态性; Keywords wax gourd expressed sequence tag s-simple sequence repeat(EST-SSR) manual cultivar identification diagram(MCID) polymorphic; 分类号 S642.3 [农业科学—蔬菜学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	锥栗优良无性系遗传多样性的EST⁃SSR分析	杨金辉王一帆李颖林江锡兵陈辉李煜	《森林与环境学报》 CSCD 北大核心	2024	2	在线阅读下载PDF 职称材料
2	梅花鹿生茸区骨膜细胞基因片段测序分析	鲁晓萍孙红梅褚文辉王大涛赵海平李春义	《特产研究》	2013	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	翘嘴鳜EST-SSR标记的开发及3个群体遗传多态性分析	朱滔梁旭方彭敏燕于海静皮达峰	《暨南大学学报（自然科学与医学版）》 CAS CSCD 北大核心	2013	11	在线阅读下载PDF 职称材料
4	鹰嘴豆EST资源中SSR的信息分析	王显生贾钰莹顾汉艳何小玲张桦张巨松石书兵李建贵麻浩	《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心	2010	2	在线阅读下载PDF 职称材料
5	华仁杏EST-SSR标记引物设计与开发	秦玥傅大立吴硕刘梦培朱高浦赵罕马履一	《植物研究》 CAS CSCD 北大核心	2013	2	在线阅读下载PDF 职称材料
6	mRNA可变剪接问题的并行化研究	牛北方郎显宇陆忠华迟学斌	《计算机应用研究》 CSCD 北大核心	2008	0	在线阅读下载PDF 职称材料
7	基于EST-SSR标记的MCID法鉴定冬瓜种质资源	叶新如刘建汀李永平朱海生温庆放	《核农学报》 CAS CSCD 北大核心	2021	10	在线阅读下载PDF 职称材料