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秦巴山区丹参居群遗传与表观遗传多样性比较
被引量:
8
1
作者
张逸
褚会娟
张今今
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期142-148,206,共8页
以陕西省秦巴山区5个野生丹参居群为材料,分别采用AFLP和MSAP两种分子标记技术对秦巴山区丹参居群的遗传多样性和表观遗传多样性进行比较研究,为丹参种质资源评价和保护、引种驯化和优良品种选育及道地药材品质成因等研究提供依据。结...
以陕西省秦巴山区5个野生丹参居群为材料,分别采用AFLP和MSAP两种分子标记技术对秦巴山区丹参居群的遗传多样性和表观遗传多样性进行比较研究,为丹参种质资源评价和保护、引种驯化和优良品种选育及道地药材品质成因等研究提供依据。结果表明,丹参居群内的个体间在遗传背景和表观遗传多样性上具有较高的相似性。野生丹参居群间的亲缘关系与其地理分布之间有明显的相关性。来源于最东边的两个居群商南居群(SN)和丹凤居群(DF)亲缘关系最近。
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关键词
丹参
AFLP
MSAP
遗传
多样性
表观遗传多样性
居群
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职称材料
国外引进辣椒DNA表观遗传多样性分析
被引量:
2
2
作者
徐小万
夏碧波
+1 位作者
吴智明
田永红
《湖北农业科学》
2021年第6期76-81,共6页
从63对MSAP引物中筛选出9对重复性较好和条带清晰的引物,对30份国外引进的辣椒(Capsicum spp.)资源基因组DNA进行MSAP扩增。DNA甲基化模式分析表明,30份辣椒材料甲基化模式主要以全甲基化为主;但是MSP(Methylation-sensitive polymorphi...
从63对MSAP引物中筛选出9对重复性较好和条带清晰的引物,对30份国外引进的辣椒(Capsicum spp.)资源基因组DNA进行MSAP扩增。DNA甲基化模式分析表明,30份辣椒材料甲基化模式主要以全甲基化为主;但是MSP(Methylation-sensitive polymorphisms)聚类和MISP(Methylation-insensitive polymorphisms)聚类均比较离散,相关材料主坐标分析与其聚类分析结果基本一致,DNA甲基化研究并没有将一年生辣椒聚为1个类群。辣椒表观遗传变异相对于基因组遗传变异更为丰富。
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关键词
辣椒(Capsicum
spp.)
国外种质资源
表观遗传多样性
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职称材料
不同入侵地区黄顶菊DNA表观遗传多样性变化特征
被引量:
6
3
作者
全志星
田佳源
+5 位作者
张思宇
皇甫超河
刘红梅
杨殿林
常泓
王慧
《农业环境科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期625-634,共10页
从黄顶菊入侵的四个典型地区——邯郸市永年县(HDY)、沧州市献县(CZX)、衡水市衡水湖(HSH)和天津市静海县(TJJ)采集植物叶片,利用甲基化MSAP技术研究黄顶菊DNA表观遗传和多态性变化特征以及土壤环境因子与黄顶菊整体甲基化水平之间的相...
从黄顶菊入侵的四个典型地区——邯郸市永年县(HDY)、沧州市献县(CZX)、衡水市衡水湖(HSH)和天津市静海县(TJJ)采集植物叶片,利用甲基化MSAP技术研究黄顶菊DNA表观遗传和多态性变化特征以及土壤环境因子与黄顶菊整体甲基化水平之间的相关性。结果表明:13对引物共扩增出993条MSAP条带,引物多态性百分比为88.52%。四个地区黄顶菊种群的多态性位点百分比较高,在84.03%~92.31%之间,遗传分化系数(G_(st))为0.07,只有7%的遗传变异存在于不同地区黄顶菊种群间,93%的遗传变异则存在于种群内,基因流(N_m)为3.321(>1),表明四个不同入侵地区黄顶菊种群间存在广泛而频繁的基因交流。不同地区黄顶菊种群间遗传分化不显著,但甲基化模式差异显著,推测黄顶菊可能通过改变甲基化水平来维持自身对新环境的适应。MSP与MISP聚类结果表明TJJ与HDY亲缘关系最近,认为可能与两地土壤理化因子和所处地理位置相近有关,但相关性分析后发现黄顶菊甲基化水平与土壤因子之间的相关性并不显著(P>0.01),推测地区环境对黄顶菊表观遗传多样性的影响是受多重因素共同作用的结果,而非某个单一因子的作用。
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关键词
黄顶菊
表观遗传多样性
DNA甲基化
MSAP
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职称材料
松嫩平原异质生境芦苇的表观遗传多样性和结构
被引量:
4
4
作者
邱天
《生物学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期68-71,共4页
近年来表观遗传学不仅是生物学领域的研究热点,而且在植物生态学中的研究也越来越多。然而有关天然植物种群的表观遗传变异的范围和结构的报道还很少。采用甲基化敏感扩增多态(MSAPs)和毛细管电泳方法,对中国东北松嫩平原小空间尺度上...
近年来表观遗传学不仅是生物学领域的研究热点,而且在植物生态学中的研究也越来越多。然而有关天然植物种群的表观遗传变异的范围和结构的报道还很少。采用甲基化敏感扩增多态(MSAPs)和毛细管电泳方法,对中国东北松嫩平原小空间尺度上两种生境芦苇(Phragmites australis)天然种群的表观遗传多样性和结构进行了研究。生境分别是pH 8~8.5、有季节性积水的碱化草甸土(生境1,即H1)和pH 10以上的、没有积水的碱斑(生境2,即H2)。结果表明,在甲基化敏感位点(MSL)中,71.09%~88.38%是多态位点。在生境内水平,H1和H2的多态位点百分比分别是82.75%和79.93%,香浓维纳信息指数是0.3712和0.3580,H1均高于H2。分子方差分析证明生境间表观遗传分化达到了极显著水平(P<0.01)。单独个体的表观遗传变异可能给植株提供更多的表型和进化灵活性,生境间分化构成了表型差异的基础。总之,对小空间尺度芦苇在异质生境的生态适应问题进行分析,为芦苇表型进化和适应过程的探讨提供了实例参考。
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关键词
芦苇
甲基化敏感扩增多态
表观遗传多样性
表观
遗传
结构
生境
分子生态学
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职称材料
利用F-MSAP分析菜心表观遗传多样性
5
作者
史卫东
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期1357-1366,共10页
菜心杂交除了引起DNA序列变化,还可能引起不依赖于DNA序列的表观遗传变化,为揭示菜心表观遗传多样性形成机理,该文利用F-MSAP检测49份菜心的DNA甲基化水平和模式变化。结果表明:(1)F-MSAP检测效率较高,菜心DNA甲基化多态性较高,杂交可...
菜心杂交除了引起DNA序列变化,还可能引起不依赖于DNA序列的表观遗传变化,为揭示菜心表观遗传多样性形成机理,该文利用F-MSAP检测49份菜心的DNA甲基化水平和模式变化。结果表明:(1)F-MSAP检测效率较高,菜心DNA甲基化多态性较高,杂交可以提高DNA甲基化多态性。(2)菜心表观遗传多样性较低,均质化严重,大部分遗传变异来源于种内,自交增加自交系的表观遗传差异,杂交增加杂种的表观遗传差异。(3)49份菜心的DNA甲基化水平较高,以全甲基化模式为主,自交降低DNA甲基化水平,杂交通过DNA甲基化模式变化增加自交系杂种的DNA甲基化水平。(4)49份菜心分成五类,聚类分析和主成分分析结果基本一致,杂种倾向于按照母本亲缘关系分类。该研究利用F-MSAP检测菜心表观遗传多样性,提高了菜心的鉴定效率和准确性,为进一步开展杂交育种提供了理论基础和技术支持。
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关键词
菜心
自交
杂交
表观遗传多样性
F-MSAP
DNA甲基化
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职称材料
题名
秦巴山区丹参居群遗传与表观遗传多样性比较
被引量:
8
1
作者
张逸
褚会娟
张今今
机构
陕西师范大学生命科学学院
出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期142-148,206,共8页
基金
陕西省自然科学基金资助项目(SJ08C227)
中央高校基本科研业务费(GK201002026)
文摘
以陕西省秦巴山区5个野生丹参居群为材料,分别采用AFLP和MSAP两种分子标记技术对秦巴山区丹参居群的遗传多样性和表观遗传多样性进行比较研究,为丹参种质资源评价和保护、引种驯化和优良品种选育及道地药材品质成因等研究提供依据。结果表明,丹参居群内的个体间在遗传背景和表观遗传多样性上具有较高的相似性。野生丹参居群间的亲缘关系与其地理分布之间有明显的相关性。来源于最东边的两个居群商南居群(SN)和丹凤居群(DF)亲缘关系最近。
关键词
丹参
AFLP
MSAP
遗传
多样性
表观遗传多样性
居群
Keywords
Salvia miltiorrhiza
AFLP
MSAP
Genetic diversity
Epigenetic diversity
Population
分类号
S567.53 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
国外引进辣椒DNA表观遗传多样性分析
被引量:
2
2
作者
徐小万
夏碧波
吴智明
田永红
机构
广东省农业科学院蔬菜研究所/广东省蔬菜新技术研究重点实验室
仲恺农业工程学院园艺园林学院
出处
《湖北农业科学》
2021年第6期76-81,共6页
基金
广东省自然科学基金资助项目(2018A030313020)
广东省科技专项资金(“大专项+任务清单”)资助项目(2019N007)
+2 种基金
广东省科技创新平台类项目(2020A1414050033)
广州市农村科技特派员资助项目(GZKTP201914)
广东省农业科学院院长基金资助项目(201811)。
文摘
从63对MSAP引物中筛选出9对重复性较好和条带清晰的引物,对30份国外引进的辣椒(Capsicum spp.)资源基因组DNA进行MSAP扩增。DNA甲基化模式分析表明,30份辣椒材料甲基化模式主要以全甲基化为主;但是MSP(Methylation-sensitive polymorphisms)聚类和MISP(Methylation-insensitive polymorphisms)聚类均比较离散,相关材料主坐标分析与其聚类分析结果基本一致,DNA甲基化研究并没有将一年生辣椒聚为1个类群。辣椒表观遗传变异相对于基因组遗传变异更为丰富。
关键词
辣椒(Capsicum
spp.)
国外种质资源
表观遗传多样性
Keywords
hot pepper(Capsicum spp.)
foreign germplasms
epigenetic diversity
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
不同入侵地区黄顶菊DNA表观遗传多样性变化特征
被引量:
6
3
作者
全志星
田佳源
张思宇
皇甫超河
刘红梅
杨殿林
常泓
王慧
机构
山西农业大学生命科学学院
农业部环境保护科研监测所
出处
《农业环境科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期625-634,共10页
基金
国家自然基金青年科学基金项目(31401811)
天津市应用基础与前沿技术研究计划(青年项目
15JCQNJC15300)
文摘
从黄顶菊入侵的四个典型地区——邯郸市永年县(HDY)、沧州市献县(CZX)、衡水市衡水湖(HSH)和天津市静海县(TJJ)采集植物叶片,利用甲基化MSAP技术研究黄顶菊DNA表观遗传和多态性变化特征以及土壤环境因子与黄顶菊整体甲基化水平之间的相关性。结果表明:13对引物共扩增出993条MSAP条带,引物多态性百分比为88.52%。四个地区黄顶菊种群的多态性位点百分比较高,在84.03%~92.31%之间,遗传分化系数(G_(st))为0.07,只有7%的遗传变异存在于不同地区黄顶菊种群间,93%的遗传变异则存在于种群内,基因流(N_m)为3.321(>1),表明四个不同入侵地区黄顶菊种群间存在广泛而频繁的基因交流。不同地区黄顶菊种群间遗传分化不显著,但甲基化模式差异显著,推测黄顶菊可能通过改变甲基化水平来维持自身对新环境的适应。MSP与MISP聚类结果表明TJJ与HDY亲缘关系最近,认为可能与两地土壤理化因子和所处地理位置相近有关,但相关性分析后发现黄顶菊甲基化水平与土壤因子之间的相关性并不显著(P>0.01),推测地区环境对黄顶菊表观遗传多样性的影响是受多重因素共同作用的结果,而非某个单一因子的作用。
关键词
黄顶菊
表观遗传多样性
DNA甲基化
MSAP
Keywords
Flaveria bidentis
epigenetic diversity
DNA methylation
MSAP
分类号
S45 [农业科学—植物保护]
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职称材料
题名
松嫩平原异质生境芦苇的表观遗传多样性和结构
被引量:
4
4
作者
邱天
机构
长春师范大学生命科学学院
东北师范大学植被生态科学教育部重点实验室
东北师范大学分子表观遗传学教育部重点实验室
出处
《生物学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期68-71,共4页
基金
国家自然科学基金项目(31670427,31570412)
长春师范大学自然科学基金项目(长师大自科合字[2017]第012号)。
文摘
近年来表观遗传学不仅是生物学领域的研究热点,而且在植物生态学中的研究也越来越多。然而有关天然植物种群的表观遗传变异的范围和结构的报道还很少。采用甲基化敏感扩增多态(MSAPs)和毛细管电泳方法,对中国东北松嫩平原小空间尺度上两种生境芦苇(Phragmites australis)天然种群的表观遗传多样性和结构进行了研究。生境分别是pH 8~8.5、有季节性积水的碱化草甸土(生境1,即H1)和pH 10以上的、没有积水的碱斑(生境2,即H2)。结果表明,在甲基化敏感位点(MSL)中,71.09%~88.38%是多态位点。在生境内水平,H1和H2的多态位点百分比分别是82.75%和79.93%,香浓维纳信息指数是0.3712和0.3580,H1均高于H2。分子方差分析证明生境间表观遗传分化达到了极显著水平(P<0.01)。单独个体的表观遗传变异可能给植株提供更多的表型和进化灵活性,生境间分化构成了表型差异的基础。总之,对小空间尺度芦苇在异质生境的生态适应问题进行分析,为芦苇表型进化和适应过程的探讨提供了实例参考。
关键词
芦苇
甲基化敏感扩增多态
表观遗传多样性
表观
遗传
结构
生境
分子生态学
Keywords
Phragmites australis
methylation-sensitive amplified polymorphisms
epigenetic diversity
epigenetic structure
habitat
molecular ecology
分类号
Q943 [生物学—植物学]
Q948 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
利用F-MSAP分析菜心表观遗传多样性
5
作者
史卫东
机构
广西壮族自治区农业科学院蔬菜研究所
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期1357-1366,共10页
基金
国家自然科学基金(31360481)
广西农业科学院基本科研业务专项(2015YT71,2021YT108)。
文摘
菜心杂交除了引起DNA序列变化,还可能引起不依赖于DNA序列的表观遗传变化,为揭示菜心表观遗传多样性形成机理,该文利用F-MSAP检测49份菜心的DNA甲基化水平和模式变化。结果表明:(1)F-MSAP检测效率较高,菜心DNA甲基化多态性较高,杂交可以提高DNA甲基化多态性。(2)菜心表观遗传多样性较低,均质化严重,大部分遗传变异来源于种内,自交增加自交系的表观遗传差异,杂交增加杂种的表观遗传差异。(3)49份菜心的DNA甲基化水平较高,以全甲基化模式为主,自交降低DNA甲基化水平,杂交通过DNA甲基化模式变化增加自交系杂种的DNA甲基化水平。(4)49份菜心分成五类,聚类分析和主成分分析结果基本一致,杂种倾向于按照母本亲缘关系分类。该研究利用F-MSAP检测菜心表观遗传多样性,提高了菜心的鉴定效率和准确性,为进一步开展杂交育种提供了理论基础和技术支持。
关键词
菜心
自交
杂交
表观遗传多样性
F-MSAP
DNA甲基化
Keywords
Chinese flowering cabbage
selfing
hybridization
epigenetic diversity
F-MSAP
DNA methylation
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
秦巴山区丹参居群遗传与表观遗传多样性比较
张逸
褚会娟
张今今
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
8
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职称材料
2
国外引进辣椒DNA表观遗传多样性分析
徐小万
夏碧波
吴智明
田永红
《湖北农业科学》
2021
2
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职称材料
3
不同入侵地区黄顶菊DNA表观遗传多样性变化特征
全志星
田佳源
张思宇
皇甫超河
刘红梅
杨殿林
常泓
王慧
《农业环境科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
6
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职称材料
4
松嫩平原异质生境芦苇的表观遗传多样性和结构
邱天
《生物学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
4
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职称材料
5
利用F-MSAP分析菜心表观遗传多样性
史卫东
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2022
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职称材料
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